Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 7
Текст из файла (страница 7)
Спапде йе ргодгагп $п висп а $чау йа1 йе бедепегасу о1 епегду $ече$ 1 ес)иа(з 1+ !. уупа1 бо уои вее? 3. Мобду йе ргодгагп $п висп а чгау йа1 йе оссира1юп о1 йе епегду $ече(з ав гге$$ ав йе раг1$1$оп (ипс($оп (г$) $в са(си)а1еб 1ог а Ье1его пис(еаг $$пеаг го1ог ча(й тотеп1 о1 (петра 1. Сотраге уоиг гезий а$1Ь йе арргох(та1е гезий г$ =— 21 (2,3.П) В г„2 1ог б)((егеп1 1етрега1игев. Ъ)о1е йа1 йе епегду (ече(в о1 а $(пеаг го1ог аге Т„2 й=н+!)— 21 (2.3.12) млй ) = О, $,2, ", оо. Т$1е бедепегасу о1 (ече$ ) ес(иа(з 2) + !. Ехегс)ве 3 (Соир1еб Наппоп(с Овс(11агогв) Сопвк!ег а вув1егп о1 Ы Ьагпюп(с озс$$!а1огз чг(й а 1о1а$ епегду й. А з(пд)е Ьагтоп(с озс($$а1ог пав епегду (ече(в О, с,2с, ", оо (с > О).
А$! Ьаггпоп$с овс$$(а1огв $п йе вув1егп сап ехспапде епегду. 1. )пчеп1 а сотри1а1$опа! вспете 1о ирба1е йе вув1егп а1 сопв!ап1 1о1а! епегду (й). Сотраге уоиг вспете а(1Ь йе зспете йа1 $в $псогрога1еб $п йе сотри1ег собе йа1 уои сап Япб оп йе Ьоо(с'в чгеЬв$1е (вее йе 1$(е )гатттгоп(сД. 2. Ма)ге а р(о1 о1 йе епегду б(в1г(Ьи1$оп о1 йе Вгв1 овс$$)а1ог аз а 1ипс1юп о1 йе пигпьег о1 озс($)а1огз 1ог а сопв1ап1 ча)ие о1 (1/ъ$ (оигриъг(аг).
ууЫсп б(в1пЬи1$оп $з гесочегеб $чпеп ~Ч Ьесогпев (агде? уупа1 $з йе (ипс($оп о1 йе ойег ~Ч вЂ” $ Ьагтоп(с овс$да1огз? Ехр(а(п. 3. Сотраге 1Ыв б)в1г(Ьи1$оп и(й йе сапоп(са$ б(з1г(ЬиПоп о1 а в(пд(е овс($$а1ог а1 йе вате ачегаде епегду (изе йе ор1$оп ННТ). 4. Нов боев й(в ехегс(ве ге!а1е 1о йе бепча1юп о1 йе Во()гтапп б(згг(- Ьиг(оп (ог а зув1ет а1 1егпрега1иге Т? 22 С)гаргег 2. ага)(ег(еа( МесИап(ее Ехегс)ве 4 1$сапдогп Иа1)с оп а 1Р Еа111се) Сопз1бегйе гапбогп ччаПс о1 а в)пд(е рагбс!е оп а Ппе.
ТЬе рагПс!е рег(оггпз )итра о1 11хеб!епдй1 . Авзи$п)пд 1Ьа1 1Ье ргоЬаЫП1у 1ог 1огччагб ог Ьас(сччагб 1итрв )з ес)иа!, йе гиеап-вс)иагеб сПвр!асегиеп1 о1 а рагвс)е а$$ег Ь$1игпрз !з ес)иа! 1о Ь$. ТЬе ргоЬаЬППу 1Ьа1, а$$ег )Ч )игпрз, йе пе1 сПв1апсе сочегеб Ьу йе раг11с1е ес)иа)в п )з д!чеп Ьу 1 Г2ч п' 1п (Р (п, )Ч )] и — 1п ~ — ) — —. 2 1,л1М) 2$Ч ' 1.
Оег!че й1в ес)иа11оп из!пд 81!гвпд'в арргох1гпаПоп 1ог 1пх1. 2. Сотраге уоиг пигпепса) гевиП 1ог йе гоо1 гпеап-вс)иагеб сПвр1асегиеп1 чч1й йе йеоге11са! ргесПсбоп (йе согпри1ес) 1ипс11оп Р(п,)Ч), вее йе 1Пе оигриг.г(аг). уупа1 $в йе б!$$ив)ч!1у о1 й1в вуз1егп? 3. Моб!$у йе ргодгагп 1п висЬ а ччау йа1 йе ргоЬаЬППу 1о )игпр 1п йе 1огччагб сПгес11оп ес)иа)в 0.8. ИФа1 Ьаррепв? Ехегс)ве 5 (Еапбогп 'чуа))с оп а 2О Еа111се) Сопв1бег йе гапбогп чча!)с о1 Ь$ раг11с1ев оп а М х М )а$$1се. Тччо рагбс1ез саппо1 оссиру йе вате!а111се вПе. Оп 1Ыв )а$$1се, репосПс Ьоипбапев аге ивеб.
ТЫз гпеапв йа1 ччпеп а раг11с1е (еачев йе )а$$1сев П ге1игпв оп йе орровйе в!бе о1 йе )а$$!се; 1.е., йе соогсПпа1ев аге д!чеп гиоби!о М. 1. чупа! $в йе 1гасбоп о1 оссир$еб ввез (О) о1 йе 1а)Псе ав а 1ипс1юп о1 М апб Ь$? 2. МаКе а р1о1 о1 йе с$!$$ив)ч!$у 0 ав а 1ипс1юп о1 О 1ог М = 32. Еог 1очч ча!иез о1 О, йе б!$$ив1ч!$у сап Ье арргох1та1еб Ьу $) $:) (! — П) . чупу )в й(з ес)иа1!оп геавопаЫе а1!очч бепв1Пев? ууЬу боев Ь Ьгеа(с боччп а1 Ь$дЬег бепв!1!ев? 3.
Моб!$у йе ргодгат!и висЬ а ччау йа1 йе ргоЬаЫП1у 1о 1игир 1и опе б!гес1!оп $в!агдег йап йе ргоЬаЫП1у 1о !игпр !и йе ойег сПгесПоп. Ехр!а$п йе геви!1з. 4. МобПу йе ргодгагп )п висЬ а ччау йа1 репоб1с Ьоипбагу сепсис!1!сиз аге ивеб 1и опе б!гесбоп апб ге11есПпд Ьоипбагу сопб!1!опз 1и йе ойег. уупа1 Ьаррепз? СЬар1ек 3 Мопеде Сак1о Япш1а6опв 1п йе ргевеп! сЬаргег, ~че с(евсг!Ье йе Ьаяс рппс!р1ев о1 !Ье Мопге Саг1о гпейос).
1п раг6си1аг, и е (осив оп япш1аг!опв о1 вувгетпв о1 а 6хес) пигпЬег оЕ рагбс1ев (Ь() 1п а е!ъ еп чо1игпе (Ъ') а! а гепгрега!иге (Т). 3.1 'ПТЕ МОПЕДЕ СаГ1О МЕ1ЬОй 1п йе ргеч!оив сЬаргег, тле !пггос(исес( вогпе оЕ йе Ъаяс сопсер!в о! (с1авяса1) ага!!вбса! гпесЬап!св. Оиг пех! аип !в !о !п6!саге хЬеге йе Моп!е Саг1о гпейод согпев !п. ЪЧе вгаг! !гоги йе с1авяса1 ехргеябоп Еог йе раг6!!оп 6п~с6оп Я, ес)иабоп (2.2.5): Я = с с1р" с1г" ехр( — Н(г~ р )/)свТ), (3.1.!) и'Ьеге гг~ в!апс(в 1ог йе соогс1!пагев о( а11 )х) рагбс1ев, апс1 р'4 1ог йе соггевропсйпе гпогпеп!а. ТЬе 1ипс!!оп 'Н(г)г", р~ ) !в !Ье Напи1!оп!ап о1 йе вувгегп, 1! ехргеввев йе гога! епегду о1 ап )во!а!ес) вувгегп ав а 1ипс6оп оЕ йе соогг)!па!ев апс1 гпогпепга о1 йе сопвг!!иеп! раг6с1ея 'Н = К+ П, и'Ьеге К 1в гЬе Ыпе6с епегеу о1 гЬе вув!егп апд Ы !в !Ье рогепба1 епегву.
Р!па11у, с )в а сопвгап! о1 ргорог6опа1!!у, сЬовеп висЬ гЬа! йе япп оиег с)иап!игп в!а!ев !и ег)иабоп (2.1.15) арргоасЬев !Ье с1авяса1 раг!Июп 1ипс6оп Ьг йе бпи!Л вЂ” > О. Рог !пв!апсе, Еог а вув!егп о1 И !6еп6са! а!огпв, с = !ДЬв'~1Ч!). ТЬе с1авяса1 ес)иабоп соггевропсИпд го ес(иаг!оп (2.2.1) 1в 1' брас)г~4 А(р"", г"" ) ехр[ — фН(р~~, г~ )) 1 ЙР~дг'4 ехР( — (3Я(Рг", г'")) ь~Ьеге (1 = !/)свТ. 1п 6ив ес)иа!!оп, !Ье оЪвегчаЫе А Ьав Ьееп ехргевве6 ав а Еипс6оп о1 соогс(!пагев апс) пюгпеп!а.
Ав К !в а с)иадгабс 1ипс!!оп о1 С)ггтргег 3. Могт!е Саг!о 5гти!а1!опя йе пютпеп!а тЬе 1птедга!!оп очег тпотпеп!а сап Ье саггтес1 оит апа(убса11у. Непсе, ачегаВеа о( Ьтпс6опв йат г(ерепс1 оп пютпепта оп1у аге ивиа1!у еаяу то еча1иате.' ТЬе 618!си!1 ргоЫетп !я 6те сотритат!оп о( ачегадеь оЕ Еипс6опа А(гтг ). Оп1у тп а теъч ехсер6опа1 сааеа сап йе пш166ппепяопа1 тптеега! очег раг6с1е соогйлатев Ье сотпри!ед апа1у6са11у; )п а!1 о6тег сааев пшпепса1 тесЬп(г!иев топит Ье иаей НаъбпВ тЬиа де!атее тЬе па!иге о( 61е пшпепса1 ргоЫетп йат ъче тпиат ао!че, 1ет иа пехт 1оо1с ат рояяЫе ао1и6опя И тп(ВЬт арреаг тЬат йе пюя атга(ВЬ6огъчагс1 арргоасЬ ъчои16 Ъе то еча1иате (А) 1п ес)иатюп (33.2) Ьу пшпепса1 т)иас1гаптге, Еог )пЯапсе ияпВ 51тпрвоп'я пт1е.
11 1а еаау то аее, Ьоъчечег, йат яисЬ а тпейод 1а сотпр1ете1у пас!ела ечеп !! йе пшпЬег о! 1пс1ерепс1епт соогс11па!еа 0)Ч (!3 1а йе 6!тпепяопа11ту о! йе вуЯетп) 1а Я!11 ъегу япа11 0(100). Вирроае йат ъче р1ап то сапу оит тЬе тртас1гатиге Ьу еча!паба йе зптедгапс1 оп а тпеьЬ о! ройте тп йе 0)ъ)-61тпепяопа! сопйдига6оп зрасе. 1.ет иа аьаитпе йат ъче та1се пъ ет)и!6!агап! ро)птв а1опВ еасЬ соог6!пате ах(я ТЬе тота1 пшпЪег оЕ ро(п!а а! ъчЫсЬ йе 1птеВтап6 пшЯ Ье еча!иате6 1а йеп ет(иа1 то пРтг.
Рог а11 Ъит йе япа11евт ауатепта й!а пшпЬег Ьесотпеа аатгопописа11у 1агВе, еъ'еп !ог япаП ъ а1иеа оЕ тп, Рог иьтапсе, 11 ъче та1се ! 00 рагбс1ев тп йгее с1ппепяопв, апд пт = 5, йеп ъче ъчои(д Ьаъ е то еча(пате тЬе 1птеВгап6 ат ! 02'о ро!пта! Сотприта6опв оЕ ятсЬ тпаВтитис1е саппот Ье регтоттпед ш !Ье )аюъчп ипйегае, Апд тЫв !а Еог!ипате, Ьесаиае йе апвъчег йат ъчои16 Ье оЬтайе6 ъчои16 Ьаче Ьееп еиЬ)ес! то а (агВе атаВа6са1 еггог. Ат!ег а11, пшпепса1 т)иадгатигеа ъчог(с Ьеат оп Еипсбопа 61ат аге япоо61 очег т(1ьтапсев соггеаропйщ то тЬе тпевЬ яге.
Ви! !ог пюат 1птегпю!еси1аг ротепба1я 6те Во)тхтпапп (астог 1п ес(иабоп (3.1.2) !з а гар161у чату1пВ типсбоп о! 6те рагбс1е соогйтпатея Непсе ап ассигате с(иадгаптге тес)шгеа а япа11 тпеаЬ врасйВ (1.е., а 1агВе ча1ие о1 тп). Могеочег, ъчЬеп еъ а1иат(пВ 61е 1птеВгап6 Еог а депре 1!т(и16 (аау), тче ъчои1г1 Впг( йат тот йе очегтчЬе1пппВ тпа!опту оЕ рой!а й(а Во1т2тпапп Еастог 1ь ъ аЫаЫпВ1у япа11.
Рог тпЯапсе, !ог а Вша оЕ 100 Ьагд арЬегеа а! йе Егееайд ро!п6 61е ВоИлтпапп !астог ъчои16 Ье поившего Еог 1 ои! о! ечегу ! Отао сопВВша6опа! ТЬе ргесе61пВ ехатпр1е с(еаг1у детпопатгатев йат Ъебег пшпепса1 тесЬ- пи(иев аге пеедед то сотприте 6теппа1 аъегаВея Опе яисЬ а тесЬп)т)ие 1а йе Мопте Саг1о тпейод ог, пюге ргес)ае1у, йе Мопте Саг1о 1тпрогтапсеватпр1тпВ а1доп6ип й!годисед гп 1953 Ъу МетгороВа е! гт!.
[б1. ТЬе арр1тса6оп оЕ й(в тпе61ос1 то 61е пшпепса1 япш1абоп оЕ депре тпо1еси1аг вувтетв 1а 6те виЬ)ест оЕ йе ргеяеп! сЬартег. 3.1.1 1птрот$апсе ЬатпрИп~ Ве(оге дЬюиаяпВ ипрогтапсе ватпрйпд, !ет ив !!тат !оо1с а! йе ятр1еЯ Моп!е Саг!о !есЬтис(ие, йат 1я гапдотп аатпр!!пд. Виррове ъче ъч!аЬ !о еча1иа!е ттяя и пот ГЬе саяе ъгЬеп Ьаггт сопятга1птя аге пяей, яее яесиап П.2.1. 25 3.! Т(те Мои!е Сат! о Мебтод пшпепсаИу а опе-д(гпепв(опа! ИттеВта1 1: (3.1.3) 1пвтеас1 о1 ивйд а сопчеп6опа! с(иадгатиге ъчЬеге 1Ье штеВтапд 1в еча!иа1ед ат ргес1етегпипед ъ а1иев о1 6те аЬвс(вва, ъче сои1д до вотпедипд е1ве.