Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002 (523144), страница 15
Текст из файла (страница 15)
(ш) Ассер1 йе 1г1а! гпоче в!й ргоЬаЬ$$$1у асс(о — ~ и) = поп [1,ехр [ — !3 [($ (и) — ($ (о)))) . 01 соигве, и; саппо1 Ьесогпе педа1)че$ 1. Роев й)в вспегпе оЬеу бе1а)1еб Ьа1апсе впеп и; = О? 60 С)гаргег 3. Мопсе Саг)о Яти)аг]опт 2. )в йе а1допйт зПП соггес1 чгиеп 1г1а) пючев аге рег(оппеб йа1 сЬапде и; чг1й а гапбот )п(едег !гоги йе $п(егча1 ( — 5,5]? ууЬа1 Ьаррепз ччпеп оп]у 1г1а! точев аге рег(огтеб йа1 сЬапде и; сМй е1йег $3 ог -$-3? 3.
Аввигие йа1 М =! апб с; = е. ууг!1е а вгпаП Мои1е Саг]о ргодгат 1о са]си!а1е (и;) ав а 1ипс11оп о1 5е. Сотраге уоиг гезий чч!й йе апа]у11са] зо!и(юп. 4. Мос)Пу йе ргодгагп 1п висЬ а ччау йа1 йе ачегадез аге по1 ирба1еб ччЬеп а 1гаП точе !в ге)ес1еб. ууиу боев й)в ]еаб 1о еггопеоиз гази!1в? А1 ччЬ)сЬ ча(иев о1 6 боев й1в еггог Ьесогпе тоге ргопоипсеб? 5. МобПу йе ргодгат !п зисЬ а ччау йа1 йе сПв1пЬибоп о1 и! $з са)си1а1еб аз чгеП. Сотраге й1в сПз1пЬидоп чч)й 1Ье апа)у11са) ехргезз)оп.
Ехечс(зе 8 (Моп1е Саг!о 5$ти!а!!оп о! а Ееппасб-)опез Бузсет) 1и й1в ехегс$ве, чге з1ибу а 30 $ еппагб;)спев зув1егп. Яее а1зо Саве 31ибу 1. 1. 1п йе собе йа1 уои сап Ппб оп йе ЬооК'з аеЬв!1е, йе ргеззиге о1 йе зув1егп $з по1 са)си]а1ес$. МоЖу йе собе 1и висЬ а ччау йа1 йе ачегаде ргеввиге сап Ье са]си!а1еб. Уои ччП1 оп]у Ьаче 1о таКе зогпе сЬапдев 1п йе зиЬгоидпе епег~ 2. Рег(огт а з]гпи1а11оп а1 Т = 2.0 апб а1 чагюив бепв11)ев.
цр 1о чгпа1 бепзПу 1в йе )беа) дав !ачч (3.5.2) 6р$ р а дооб арргох!та11оп? 3. ТЬе ргодгат ргобисез а зес(иепсе о1 зпарвио1з о1 йе з1а1е о1 йе зув1ет. Тгу 1о ч1зиадзе 1Ьезе зпарзпо1з ив1пд, 1ог ехагпр)е, йе ргодгаги МОЕМО!., 4. Рог 1Ье Ьеа1 сарас11у а1 сопв1ап1 чо1игпе опе сап бепче (ц2) (ц)2 1с Тз ]и ччЬ]сЬ ц $в йе 1о1а! епегду о1 йе зув1ет. Оепче а 1оггии1а 1ог йе б]тепе!оп!вез Ьеа1 сарасПу.
Мобду йе ргодгагп (оп!у 1и огсогоЯ 1и висЬ а чгау йа1 С, $в са!си!а1еб. 5. 1пз1еаб о1 ребогт]пд 1па] точев 1и ччи!сЬ опе рапбс)е а1 а 1]те!в б)ар!асеб, опе сап таКе 1па1 точев й чгЬ)сЬ аП раг(!с!ее аге сПвр]асеб. Согпраге йе тах1тит сПзр1асегпеп1з о1 йеве гпочез ччпеп 50ЗЗ о1 аП б1вр]асетеп1з аге ассер1еб. 6. 1пз1еаб о1 из1пд а ипдогги)у сПз1пЬи1еб б]зр]асегпеп1, опе сап а)зо изе а 8аизз1ап сПзр!асегпеп1, 0оез й)з ]псгеаве йе е($1с1епсу о1 йе з1ти!а1юп? СЬар1ег 4 Мо1есп1аг Рупаппсь Япш.1а6опя Мо1еси1аг Рупат!са япш1а6оп )а а ЕесЬп!г)ие Еог сотриг)пи ЕЬе ес)ш1!Ъ- пшп апй ггапарог) ргорегг!еа оЕ а с)ааа!са) тапу-Ьос1у ауяет. 1п ЕЬ!а сопГехс ГЬе и ог6 с)ааа)са! теапа )Ьа! ЕЬе пис1еаг пю6оп оЕ )Ье сопа6)иеп! раг- Г!с)ев оЬеуа ЕЬе )агчь оЕ с)ааа!са) тесЬашся Т)иь !а ап ехсе!)еп) арргохипа6оп Еог а м Ые где оЕ гпагепа1я Оп1у тчЬеп ъче сопа)аег ЕЬе )гапь)аг)опа) ог го)а6опа) то6оп оЕ!фЬ! агота ог то)еси!еа (Не, Нъ Рг) ог ч!Ьга6опа1 то!!оп юЫЬ а Егес)иепсу ч аисЬ )Ьаг М ) 1саТ аЬои)д гче тчоггу аЬоиг г)иапгшп е)Еесга.
ОЕ сошке, оиг 6!асина!оп оЕ ЕЬ!а чае! виЬ)ес) !а песеаааг!)у тсотр)еге. ОГЬег аьресга оЕ ЕЬе Мо1еси1аг Рупат!св ГесЬпи)иев сап Ье Еоипд !и (19, 39-4Ц. 4.1 Мо1есп1ак Рупаппса! Т1)е 1деа Мо)еси1аг Рупат!са а!ти)а)!ось аге )п тапу геаресга чегу ятПаг Го геа1 ехрегнпеп)я реп ъче регЕопп а геа1 ехрептепс ъче ргосеес1 ав Ео))оъчя Хе ргераге а аагпр)е оЕ ГЬе та)ег!а) ГЬа! юе ъч!аЬ Го аигбу. ) 'че соппесг ЕЬ!а аатр)е го а теааипщ !пвггитеп! (е.и., а ЕЬегтотегег, тапотегег, ог ч!асов!те)ег), ап6 и~е гпеавиге ЕЬе ргорег)у оЕ !п)егер) 6иппд а сег)ат 6те ийегча). И оиг теааигетеп)а аге аиЬ)ес! Ео а)а6ь)!са! погае (аь тоаг теавигетепга аге), )Ьеп ЕЬе )опдег гче ачегаце, )Ье тоге ассигаге оиг теааигетепг Ьесотея 1п а Мо1еси1аг Рупаписа япш1а6оп, и~е Ео))ои~ ехасг)у бге вате арргоасЬ. рпя, и е ргераге а аатр)е: и~е ве)ее! а тоде) аувгет сопа)вг!щ оЕ Ь) раг6с)еа ап6 ъче ьо)че Кем!оп'а ес)иаг!опа оЕ пю6оп Еог ГЬ)а ауа)ет ипг!) ЕЬе ргорег6ев оЕ ЕЬе ьуагет по )опдег сЬапае и ЬЬ Г!те (ъче СЬартег 4.
МоЕеси!ат О лат(св 5(ти!ат(опв (4.1.1) 1п а в(пти!абоп, тче иве ЕЬ!в ес!иабоп ав ап орегайопа1 йейпйюп оЕ ЕЬе тептрегатиге. 1п ргасйсе, лче лчои16 тпеавиге ЕЬе тога! )ипет!с епегцу оЕ ЕЬе вувтегп апс1 сйчтйе йив Ьу ЕЬе пшпЪег оЕ т!еегеев оЕ Егеес(огп Ме (= ЗЬ) — 3 Еог а вувтетп оЕ М рагбс1ев лч1ЕЬ йхес1 тота1 пютпептшпт). Ав ЕЬе тога! (опет(с епегцу оЕ а вувтегп йистиатев, во боев ЕЬе 1пвтаптапеоив тептрегатиге: 2 Т(т) = Е "'лчл ('), )св%е с=! (4.1.2) ТЬе ге1айче йистиа6опв 1п ЕЬе Еетпрегатигеъчй! Ье оЕ оп)ег !УъЯ~.
Ав Ь(е (в тур(са11у оп ЕЬе огт(ег оЕ ! 02-1 Ов, ЕЬе в!а!!айса! йисШайопв 1п ЕЬе тептрег- атиге аге оп ЕЬе огс1ег оЕ 5-10%. То еет ап ассигате ев6тпате оЕ ЕЬе тетпрега- тиге, опе вЬои!6 ачегаее очег тпапу йистиайопв. 4.2 Мо1еся1аг Рупаппсй: А Ргодгагп ТЬе Ъев! штгос(ист(оп то Мо1еси!аг Рупаписв япш)ат1опв !в Ео сопв(йег а випр1е ргодгат. ТЬе ргоцгатп тче сопвтйег (в (сер! ав ятпр1е ав рова(Ые то 61ив!тате а пшпЬег оЕ ипрогтапт Ееа!игев оЕ Мо1еси1аг Рупаписв япш1а6опв. ТЬе ргойгатп (в сопвтгистес! ав Еойолчв: 1, ЪЧе геас) тп ЕЬе рагатпетегв ЕЬат врес1Еу ЕЬе сопс16юпв оЕ ЕЬе плп (е.йо ии6а1 тетпрегатиге, пшпЬег оЕ раг6с!ев, т(епв()у, типе втер).
тАсгпа1!у, (Е гее деапе ЕЬе!епгрегатпге оЕ а пг(сгосапоп(са! епаепг)л!е т)тгопд)г (1саТ) ( д 1п с ггсд Е), г)геп гее Егпс( г)тат, Еог а д-с! ппепяопа! ауатегп о( )ст а!оспа сг!ЕЬ дхес( гога! тпоспепплпл, 1са т !а есрла! го 2ег'(ст()с) — 1) — 2). ес(ий)Ъгате ЕЬе вувтегп). Айег ет)ш! 1Ъгайоп, тче регЕопп ЕЬе астиа1 тпеавигегпепп 1п Еаст, вопле оЕ ЕЬе плов! сопипоп тп(в!а)сев ЕЬаЕ сап Ье тиас(е лчЬеп регЕогпт(пй а сотпритег ехрейгпепт аге чету япи!аг то Ейе пт(вта)сев йтат сап Ье птас(е 1п геа! ехрег(тпепЕв (е.е., ЕЬе ватпр1е Ев пот ргерагес1 соттесйу, ЕЬе тпеавигегпепт (в Еоо вЬогт, !Ье вув)епт ипйегеоев ап 1ггечегяЫе сЬапйе г(иг(пи ЕЬе ехрептпепй ог тче с(о пот тпеавиге лчЬа! лче ЕЬийс).
То тпеавиге ап оЬвегчаЫе с!иапйту лп а Мо1еси1аг Рупаписв япш1а6оп, тче пшв! Е!гв! оЕ а11 Ье аЫе то ехргевв ЕЫв оЬвегт аЫе ав а !иост)оп оЕ ! Ье рояйопв апт( пютпепта оЕ !Ье рагйс1ев (п йте вувЕепт. рог швтапсе, а сопчеплеп! йейпйюп оЕ Ейе тептрегатиге пт а (с1авяса!) гпапу-Ьос1у вувтетп тпа1сев иве оЕ ЕЬе ет!шрагтйюп оЕ епегду очег а11 с(еегеев оЕ Егеес)отп ЕЬа! ептег с(иас(гатгса11у лп ЕЬе Натпйтоп)ап оЕ ЕЬе вувтетп. 1п рагбси1аг Еог ЕЬе ачегаце )с!пейс епегйу рег с(ецгее оЕ Егеес)опт, лче Ьаче 4.2 Мо1еси!аг Оупат(св: А Ргоегат А1аог11Ьтп 3 (А 51тр1е Мо1есп!аг !Эупапйсв Ргодгат! ягор(е М() ргодгагп (п(((а)(тат(оп рходхапт агй са11 вптх с=о с)о ыП11е ( х.1х.глпах) са11 тоссе(х,еп) са11 тпсецхахе(й,еп) Х=х+гте1Х са11 еагар1е е от)до есор епд М() (сор т(етеггп(пе (Ье 1огсев )п(едга(е еоиа!)опв о( гпотюп вагпр(е ачегадев Соттеп( (о Я(в а!чог!Йт: 1.
5и!ггоит!пев Тпз.с, йохсе, Тпседхасе, апй ваптр1е то!!! !те г(евсг!!тег( !и А1еог(Ятв 4, 5,ап4 б, геврес(гое1у. 5и!ггоидпе ваатр1е !в ивег1)о са(си!а(е аоетачев 1йе ргеввиге ог (стреха(иге. 2. Хе т11(а1(ае (Ье вувтет !1.е., и е ве1ест (п!6а! рояПопв апд че!осй(ев). 3. Хе сотрите (Ье 1огсев оп а11 раг6с1ев. 4.
гЧе (п1едгате Мети!оп'в ет(па!!опв о1 то6оп. ТЫв втер апс1 (Ье ргеч1- опв опе тпа1се пр тЬе соте о! тЬе япш!а6оп. ТЬеу аге гереатед пп61 и е Ьаче сотрптес1 тЬе типе ечо!п6оп о1 бте вувтет 1ог (Ье с!евсей 1епфЬ о1 6те. 5. Айег сотпр1е6оп о1 (Ье сеп(га1 1оор, ъче сотрте апс1 рпп! (Ье ачегацев оЕ тпеавпгей с(пап611ев, апс1 втор. А!дог!Йпп 3 1в а вЬогт рвепт(о-а1доптЬт бтат сагпев опт а Мо1есп!аг Т)у- паппсв япш1а6оп 1ог а вппр1е атоппс вувтет.
'гЧе с1!вспвв бте с(Негепт ор- ега6опв пт (Ье ргоцгат !п тоге с(ета11. 4.2.1 1пт!та1иа!1оп То втагт тЬе япш1а6оп, тче вЬоп16 авв!дп т!6а! роя6опв апс1 че1ос16ев то а11 раг6с1ев т тЬе вувтет. ТЬе рагНс1е ровраопв вЬоп16 Ъе сЬовеп сотра6Ые тч!1Ь (Ье втптстпге 6тат иге аге апп(пд то япш!ате. 1п апу ечепт, (Ье раг6с1ев вЬоп16 пот Ъе роя6опес1 ат роя6опв бтат гевп!т 1п ап арргестаЫе очег1ар о1 (Ье атоппс ог то1есп1аг согев. О1(еп (Ьтв (в асЬтечес1 Ъу (п(11а11у р1ас(пд бб СЬар)ег 4. Мо!еси!аг Оупат)ся 5!ти!а6опя А!допгЬгп 4 (1п16аИха6оп оЕ а Мо!еси1аг 1Эупапх!ся Ргоагагп) !п)!)а))ха))оп о! МО ргодгагп выпгоытхпе хп1Г вопч=о яыгач2=0 бо 1=1,пратт х11) =1асгхсе роя!1) ч11) =!гасе!) -О.
5) яцпсч=яыпгч.~. г 11 ) выпч2=яыпч2+ч!1)**2 япдбо яыгач=вопч/праге. вывчх=яыпгч2/пратт Ге=ос)гт(З~тевгр/яыагч2) до 1=1,пратс г11)=!ч11)-яыпч)*Гв хгя11)=х11)-ч!х)*с1г р)асе ГЬе рагбс1ев оп а!а)Г)се даче гапбот че)ос)г)ев че1осду сеп)ег о! спаяв К1пе)!с епегду че)ос))у сепгег о! тавв гпеап-вциагеб че)осду вса1е !асгог о1 йе че)ос)Г)ев ве) беягеб К)пе))с епегду апб ве! че1ос))у сеп)ег о! спаяв !о хвго ров!Г!Оп ргегдоив депе в)ер Соттепгя го )Ь!я а!аог!!Ьт: 1.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
