McCammon, Harvey - Dynamics of Proteins and Nucleic Acids (522918), страница 25
Текст из файла (страница 25)
ТЬе геавоп Гог йеве Й!Гегепсев |и йе апЬаппошсЫев оГ а|опас тио|юпв оГ рготе!пв апт! пис!е|с аск)в В по| с1еаг, а!йои8Ь йе ехр)апаВоп ишят Ье ге!атей |о йе в|гас|ига! Гас|огв гевропя!Ые Гог йе т)!Йегепсев |и ап|яо|гор|ея, ая т)!всиввед 1и йе ргеч)оив рага8гарЬ.
5.3.2 Нут)то8еп Ьопт) Ыуиаинсв Сег|ап сопипоп дупаш)с Геа|игев оГ Ьудго8еп Ъопдв Ьаче Ьееп герогтед !и врите оГ |Ье !3ХА в)пш!а6опя апт) |п йе тКЪ!А япш!а|юп. Р!гвт, йеге В а согге!акоп Ье||чееп йе ачега8е !еп81Ь оГ а Ьудго8еп Ъопд апд йе атр11|ит!е оГ йе !)истиат!опв !и йе Ъопт) !еп8|Ь ГРгаЪЬа)|агап ет а!., 1983; 81п8Ь е| и!., 1985). !и йе саве оГ |КХА, Ь !я по| вигрпяп8 |Ьа| весопт)агу в|гас|иге Ьудго8еп Ъопт)в аге Ьо|Ь вЬог|ег апд вт!!Гег йап |егВагу в!гас|иге Ьудго8еп Ъопдв, в)псе |Ье Готтиег сопяв| оГ яе|в оГ |и о Ъсмн)я !!п А-1) Ъаяера!гя) ог йгее Ъопт)я (!и Ст-С Ьаяера|гв), тчЫ!е |папу оГ йе сегт)агу Ъопт)я аге !во!атет) я)п8!е Ъопс)я. ТЫя раттегп а1яо ге!)еств йе ге!аВче в|аЬ!!йев оГ йеяе Ъопт)в 1и |Ье аЬяепсе оГ |иа8пеяши (Сго|Ьегв, 1979; )оЬпятоп "и Кет)Г|е1|1, 1979).
ТЬе чету ЬтцЬ согге!а|юп тч1|Ь тЬе с1авя оГ Ъопдв апд йе Гас| |Ьа| а в!ш!!аг согге1а|юп Ь вееп |п 3|ттатяоп-Сг!сЬ Ьут)то8еп Ъопт)я Ы РХА аге чету втг!1ап8, !и йе саве оГ |ВША, а Гигйег согге1ат)оп Ь оЬвегчед Ьеттчееп йе атпр11|ит)е оГ йис|иаВопв 1и йе 1еп8й оГ а Ьут)го8еп Ъопт! апд йе ге!ахаВоп |пие Гог йе т)есау оГ йе аитосогге!ат)оп Гипс|юп Гог йа| !еп8|Ь. ТЬ|в |я апойег гейест!оп оГ йе я|1)Гпевя оГ йе Ьут)го8еп Ъопт), апд |Ыв согге!аВоп ь рте|1!стеб Гог апу Ьап8еч1п овс|Па|ог !Вег)сотч!|х ст МсСаиииоп, 1981).
1| Ьая Ъееп оЪветчет) Гог а чапе|у оГ Йяр!асешепт согге!акоп ГипсВопв |и рто|е|ив ГБ|чапипа|Ьап е| и!., 1982) ап|! |и тКЪ!А (РгаЪЬа$сагап ет а)., ! 983), Бесиос, |чЬеп йе согге1аВоив |п 1еп8йв оГ ра|тв оГ Ьут)го8еп Ъопдв аге ехаш!пе|1, ап |п|егевВп8 ра||егп етиет8ея,!| |чоиЫ Ье ехрестет) йа| ттчо Ьут)го8еп Ъопт!я Ы йе вате Фатяоп — Сг)с)т Ъаверат яЬоц!д вЬотч согте!атет) то|юпя, апд висЬ согге1аВопв аге оЪяетчед Гог Ъопт)я !п А-!) апт) А-Т Ъаяера|гв апт) Гог а|Цасеп| Ьопт)в !и Ст-С Ъаяера)тя Г еч!|т, ! 983тт'; Натчеу е| и!., ! 984; 81п8Ь е| а!., ! 985), !и йе саяе оГ |Ье оитет ттчо 1гези(ги Гог лис1е1г асй(з Ьопдз 1п йе О-С Ъазерыг, вгпаИ, ИепегаИу пе8аИче согге!аИоп сое(Ис1- епгз аге оЪзегчед (Нагчеу ег а(., 1984; Яп8Ь ег а!., 1985).
Тассо (пг!!чЫиаИу, йеве сое(Ис(епгв аге пог вгаИвг(саИу я8тйсапЬ Ьиг йе аррИсагюп оГ а вопр!е в18п Сев! Го йе ччЬо1е вег оГ сое(Ис!епгв учев а Ы8Ыу вгаИвИсаИу оп(Исаи! геви11 !и ГЬе !КО саве, в(псе 1! оГ йе 12 сое(Ис(епгв аге пе8аИче (Р < 0.01). А!1Ьои8Ь йе вагпр!е !в гоо япаИ го ргочауе вгаИвИса! я8п(йсапсе (п йе ЭХА сазе, аИ Гоиг сое(Ис(епгв аге пе8аг(че. ТЬеве геви(гв сап Ье ехр!ашер Ьу 1Ье !п-р!апе госЫп8 оГ Сг-С Ьавера(гв, взгегсЫп8 опе оиГв(г!е Ьуйго8еп Ъопд ччЫ!е вЬоггеп(п8 йе ойег. Мо1еси!аг г!упат(св яти!аИопз до пог 8епегаИу ргодисе вропгапеоив Ьгеа$га8е оГ Ьавера(гв швЫе ойегилве (пгасГ г!оиЫе ЬеИсев, во 1Ьеу г!о пог ргочЫе Йгесг шГоппаГюп оп йе Нов оГ вггисгигев йаг тау Ье гевропяЫе Гог ргогоп ехсЬап8е. ТЬеве вггисшгев Ьаче Ъееп зГийег! Ьу ойег тейосЬ (весИоп 6.4).
5,3.3 Оупаткз оГ Ьас(гЬопе гогзюпа1 ап81ез Ав а 8епега! ги!е, товг Ъас1сЪопе Гогвюп ап8!ев Ьаче ча!иев йаС Иисгиаге ш а паггочч гап8е; йе ггапяИопв Ьегччееп ггапз, 8аисЬе+ апд гаисЬе — сопИ8игаИопв аге гаге. ТЬе атрИгийев оГ йезе ИисгиаГюпв Ьаче Ьееп герогГеб Со Ье !и ГЬе гап8е 6-! 2' Ъу Ееч(11 (1983г() апд Ьу Нагчеу ег а6 (1985а), гчЫ(е Яп8Ь ег а1. (1985) герог1ей ИисгиаИопв очег а гап8е 9-21'. ТЬе воигсе оГ йеве гИ(уегепсев 1в поС с1еаг. Рог согпрапвоп, йе гоог теап зциаге ИисгиаИопз Гог йе 4 апг! 1г ЬасЬЬопе гогяопв ш ргоге(пз аге 14-23' (чап СгипвГегеп 6г Кагр!из, 19826; 1.еч111, 1983Ь). ТЬеге аге виЬвгапИа! Ййегепсев 1п 1Ье ге!аИче июЬ(ИИев оГ йе гИИегепг Ъас1сЬопе гогвюпв 1ог йе !КО апг( ГУЬ(А випи!агюпв. ТЬе пювг !пгегев11п8 геви!1 сопсегпв д, йе 1огяоп чпгЫп йе пЬове пп8.
1п йе !КО япш1аИоп (Нагчеу еГ а(., 1985а), !1 1в ГЬе товг геви1сГей Согяоп ап81е, ччЫ!е (п йе сотрагаЫе ГЗХА яти!агюп, ичйоигехрИс(гсоипгегюпв (Яп8Ь еС а!., 1985), !1 1в ГЬе весопг) гповг гпоЪ!1е гогвюп. 11 Ы ровяЫе йаг 1Ыз сИ!Тегепсе геИесгв йе дерепг!епсе оГ 6 оп ящаг рис1сег, Ьесаизе сЬап8ев 1п рис1сег 1ог СЗ'-епг(о ящагз ргог!исе тисЬ вгпаИег сЬап8ев ш д йап до чапаИопв (п рис1сег Гог С2'-еиг1о ви8агв. ТЫв 1еабз го а рис1сег-г(ерепг!еп1 Иех(Ь!1Ку 1ог д, нлй СЗ'-ее1о зи8агв ге!аИче!у тоге г!816 йап С2'-епг(о ящагв (ччевгЬоГ ег БипдагаИп8ат, 1983а,Ь).
А г$егаИед ехагтпаИоп оГ йе вие оГ 1Ье ИисгиаИопв 1п Ъас1сЬопе гога(опв ш Е-ЭХА Ьаз зЬоччп йас йе пю!еси1е 1в ш купат(с ег(иИ(Ьпигп Ьемееп вечега1 вггис1игев, !пс!игИп8 йе сгувгаИо8гарЫсаИу оЬвегчед У, апд Е„Гоппв (чч'ап8 ег а1., 1979; КатвГе1п 8г 1.еп8, 1980). 1п йе то1еси!аг купат(св випи!аИоп оГ ЧГезгЬоГ ег а6 (1986), 11 «ав оЬвегчед йа1 йозе 112 Яьогт ттттте с(упаттсв тога)опв йат вЬоччед тЬе яиа!1евт ппв Иистиатюпв аге йове тчЬове ча)иев т)о пот сЬапде пшсЬ оп дотпд Гготп йе У., то 1Ье Е„сопйдигат(оп, тчЬегеав тЬе тогяопв ччЬове ча1иев Ьаче тЬе!агдевт т)1ГГегепсев Ьеттчееп тЬе 2, апт) Ев Гоппв ате йе ваше опев йат вЬотч тЬе 1агдевт Иистиат)опв тп тЬе пю1еси1аг т(упаписв ятпи!аИоп.
ТЬеге аге а пишЬег оГра)гв оГ тогвюпа! апд!ев чтЬове птотюпв аге Гоипт) то Ье согге!атет! тп йе РХА япш!атюпв (Ееч!11, 1983т(; ЯпдЬ ет а1., 1985). Апюпд йове ра)гв тЬат аге верагатет) Ьу опе Ьопт), педаИче согге!атюп сое(Ис!ептв тчои!6 Ье ехрестет) Гог сгап1твЬай готатюпв, вЫсЬ вЬои!т1 оссиг тТ йе тогвюп Гог тЬе 1псегчешпд Ьопт) В 1п йе тгааз сопддигатюп (0!хоп, !98!). Ап ехаптр!е оГ йтв !в а сгап)свЬай готатюп аЪоит тЬе 05' — С5' Ъопт), ш ъчЬЫЬ тЬе ратг оГ тогвюпв (и, у) доев Ггопт а (даис)те —, даисде+ ) сопйдигатюп то а (ттаттв, тгапз) сопйдигатюп.
ТЫв тпоИоп Ьав Ьееп виддевтед со оссиг тп йе В то Е тгапв16оп (01воп, 1981; Бипт)агаИпдаш 8т %евтЬоГ, !981; Нагчеу, 1983) апт( ав рагс оГ йе !опд(тийпа) втгетсЫпд йат верагатев Ьавераттз !п тЬе Гоппатюп оГ (птегса!аИоп ытез (Та)тивадатча й Веппап, 1983; Раппе ет а1., 1985). Ечеп ш тЬе аЬвепсе оГ ГиП тгапвЬИопв Гготп йе даистте то тталз сопйдигатюпв, йе т!упапис Иистиатюпз ш тт апб у до вЬоя йе ехрестет) педатгче согге1аИоп сое(Ис(епт (ЯпдЬ ет а1., !985), 1п ат)тИИоп, вшсе з 1в ш йе сгаиз сопИдигатюп ш В РХА, а вши1аг геви!т тчои16 Ье ргет(!стет( Гог тЬе ра(г (д,(), апт) тЫв педаИче согге!атюп !в а!во оЪвегчет). ТЬеге В опе ровЫче согге!аИоп сое(Ис)епт оГ поте, 1ог йе ратг Щ д), Ьит тЬе штегчепшд тогзюпа! апд!е, у, тв даисде+ гайег йап !гааз, во по стаи)свЬаГт тпоИопв тчоиЫ Ье ехрестет).
ТЬе сгап1свЬай согге1атюп (и, у) 1в а1во герогтет( тп а втат(вИса! апа1увтв оГ йе согге!аИопв оГ ратгв оГ втаИс ча1иев оГ тогвюпа! апд)ев ш а тВЬ!Ач"' сгувта! аттис!иге (КИапшга, М(типо, АпиваЫ, Топи!а й ВаЬав, !984). Ойег ра)гв оГ апд!ев чтЬозе тпотюпв аге ргетИстед со Ье согге!атей ш тЬат втаИвИса! апа!уяв аге (а,р), (д, з), апт! (з, Д, апт) тЬеве аге а!во ашопд йе ргедош(пап! согге1атюпв оЬвегчет( ш тЬе ШЧА тпо!еси!аг т)упаш)св внпи!аИоп оГ ЯпдЬ ет а1.
(1985). 5.3.4 Г)упаттсз оГ'т(оиГт(е !те!те а! тедтот А1йоидЬ йе ЙЬег гИИгастюп втигдез оп РЬ!А в!гостите 1ет) то т!оиЫе Ьедса! пюре!в тчЬеге аП Ьавератгв Ьат! ЫепИса! деошетпев (%атвоп ет СПс1с, 1953; Агпоя ет а1., 1976), И 1в потч с1еаг йат тЬе т!оиЫе Ьедх Ьав 1оса! чапаИопв йат т!ерепт! оп вес)иепсе.
ТЬеве ейеств Ьаче Ьееп оЬьетчеИ ЬотЬ сгувтадодгарЫсаПу апт) 1п во!иИоп втит)тев, апт) тЬеу Ьаче 1ед то а пшпЬег оГтЬеогеИса! вшгдев аипет) ат ипдегвтапт!1пд тЬе ги!ев йат дочегп тЬе вет)иепсе-т)ерепт)епсе оГ йе !оса! деошетгу оГ тЬе т)оиЫе ЬеИх (Са11ат)1пе, 1982; сгат(п1 ет а!., 1982; КаЬвсЬ, даст)ет 9. Тт!Гопоч, 1982; КевиИв Гог лис(еГс асгй 113 Р1с1гегвоп, 1983; Нагап, Вег)соч)сЬ-"г"еП)п ег БЬа!г!сед, !984; Тип8 8г Нагчеу, 1984, !986а,Ь).
ТЬе дупапнсв ордоиЫе ЬеИса! ге8!опв оГ пас!его ас!дв сап Ье ехресвед ю дерепд ввгоп81у оп очегаП сопГоппаГ!оп, Ье!п8 дПГегепг Гог КХА апд А-, В-, апд У.-РМА. М1Ып а 8!чеп в!гас!иге, йеу вЛои!д а!во вЬочч воте г!ерепдепсе оп вег!иепсе. ТЬе товг ехгепв)че апа1уяв оГ йе дупапис авресгв оГ ЬеИх в!гас!иге 1в гЬе поппа1 тоде апа! уяв оГ 1Ьгее РХА Ьехатегз Ьу Т!дог ег а6 (1983). ТЬеу ивед гЛе вате рогепда! Гипсдоп Гог а 60 рв гпо!еси!аг дупаписв яти!адоп оп д(СОСОСО), ш 1Ье В сопГоппадоп апд Гог а поппа! пводе апа!уяв оГ1Ыв вате в!гас!иге.
ОЫаш!п8 в)пи!аг геви1гз Гог а чаддегу оГ тодопв ш йеве гччо вгид)ев, йеу сопс!идед гЬас йе Ьаппотс а рргохппагюп ргоч!дев а геавопаЫе арргоасЬ Гог 1пчевг!Иаг!п8 то!!опв ш РХА аг гоот гетрегагиге. гог сотрагадче ригровев, йеу сагпед оиг погта! гподе апа!увез оп 1Ье вате Ьехатег ш гЬе У. сопГогтагюп апд оп д(ТАТАТА), 1п йе В сопГоггпаг!оп. ТЬе тоде! оГ Тк)ог ег аУ. !1983) гИд по! )пс1ш!е ехр!юИ Ьудго8еп агота ехсерг Гог йове йаг сап Гогт Ьудго8еп Ьопдя Сопвех)иепг!у, аП Ъш а Ьипдуи! оГ йе 8!6 поппа! тодев оГ йе В Гоггп дГСОСОСО), Ьаче Ггси кепс!ев Ье!ои 2000 сгп '. ТЬе Гас! йаг гЬе теап я)иаге авпр!Виде оГ йе а!от!с то!!оп !в )пчегве!у ргорогдопа1 го йе Ггес)иепсу (Гог випПаг ейесдче таввев) санаев йе 50 !оччевг Ггециепсу гподев со ассоипг Гог очег 80"„' оГ йе тогюп.
ТЬеве Пег!иепс!ев аП Ие Ье!очг 100 стп-' Гт = 0.3 рв), апд йе !оччевг Ггег!иепсу тоде Гог аП йгее апа!увез !в пеаг 10 ст-' (г = 3 рз). Весаиве гЬезе 1очг Ггециепсу поггпа1 тоде пюдопв аге соПесдче тодопв, апд Ъесаиве йеу до ассоипг 1ог тов! оГ йе гподоп оГ аП йе авотв, йеу чдП гейесг йе 1!те вса!е оГ Писгиав!опв ш йе!оса! 8сотеггу оГ йе доиЫе ЬеИх.
Спев 1Ье вгадвдса! вагпрИп8 ргоЫет (У~чапа!8 ег АПагчад1, 1969), то!еси1аг дупаписв в!ти1аг!опв ччои1д Ьаче !о сочег вечега1 сепв оГ рв го ехапипе согге!аг!опв апд сЬагасгедвдс гппев 1ог йеве пюдопв. ТЬас йе тодев !и гЬе 10 стп '-100 ст ' гап8е геаПу до ассоипг Гог ЬеИх дупаписз В тоя ч)ч!д1у вееп ш пючдев оГ йеве тодев. Атоп8 1Ье пюдопз героггед Ъу Т)дог ег а!. (1983), айег ехапип!п8 висЬ пюч)ев, иеге ЬепгИп8 апд гчг)вг!п8 оГ йе ЬеИх, !оп8!1ид!па! овсП!агюпв чдй зиссевяче Ьазера!гв пюгдп8 оиг оГ рЬаве, Ьаве вИд!п8, Ьавера)г ЬисЫш8, ргореПег ич)вг)п8, апд а чапесу оГ Ъас$сЪопе тодев.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
