McCammon, Harvey - Dynamics of Proteins and Nucleic Acids (522918), страница 22
Текст из файла (страница 22)
5.8. Сотте!а?1оа геахгат Гот йе св1си1атед апд ехреппгептв! ча!иев оГ ?Ье ачегвхе ппв втопнс роядоп Иыстивдоп Гот еасЬ гез!Иие ш сутосЬготе с (?Яот?Ьгар ет а!., 1981). ТЬе сотге!ат?оп сое?Иаеаг !в Я = 0.73. (Гепге1 ег Ба!епипе, 1985). СотпрИсатюпв а1во апве ш тЬе детаоед !пгетргегагюп оГ ?Ье гчго геппв аг апу вгчеп тешрегагиге. ТЬе сопГоппагюпа! — гдЬгагюпа? гепп гв ?споччп то чагу вошеччЬа! чч?тЬ йе стузта? аттис!иге; соптаств Ьетчтееп 8гоирв Ггош пе!8ЬЬопп8 рготе?пз Иепегаоу ?еад го гедисед ашр!Видев оГ шогюп Гог ?Ье 8тоирз !пчо?чед.
реп?Г ет а1. (1985) Ьаче шггодисед а ше?Ьод го соггесг арргохнпаге1у !ог йе еоеств оГ висЬ соптасгв, во гЬат а Ьеттег девспргюп оГ йе !пгт?пас Иех!Ь!Игу оГ а рготеш сап Ье оЪга?пед Ггогп йе сгувта! дага. Оеар?те ?Ье ротепда! д1?Иси11?ев шд?сатед аЬоче, ивеЫ сошрапвопв Ьаче Ьееп шаде Ьеггчееп йе агопис совр!асешептв !пГеггед Ггош Х-гау дага апд йове оЬга)пед Ггош шо!еси1аг дупаписв вппи!адопв. ЯисЬ сотпрапвопв дерепд оп йе говоп1ег сопгпЬигюп Ье!п8 Гап1у сопвгапт йгои8Ьоиг ?Ье рготеш, во йат И сап Ье виЬггасгед оит (РгаиепГе1дег, Регв?то ег Твегпое?ои, 1979; Ь?ог?Ьгир ет а!., ! 980) ог !геагед ав а сопвтапт ЪавеИпе.
1п 8епега1, йе рова!ЬИИу оГ поппи!Гопп товогдег пшвг Ье сопв!дегед (Аггуш?и?т ет а!.,!979; Р!пхе! ег Ба!епппе, 1985). ТЬе аввшпртюп оГ ипйопп говогдег арреагв то Ье а геазопаЫе опе !п воше савев, Ьогчечег; е.8., Гог пгуо81оЬ!и сгувга1в, йеге !в зоше еч?депсе ?Ьаг вгагтс говогдег дие то готатюпа! ш?ваИ8пшепт оГ йе пю!еси!ев ?в япао (Р!апипео, ТЬог?тодвеп й Впо, !980). 1п висЬ сазея йе япаИ арратепт чападоп оГ ?Ье говогдег гепп аоотчз опе го ездпгате ((Лт)'),, апд ша?те Яези!тягот рготетиз сотрапзоп тч!|Ь т)упаписа1 вппи1аПоп геви1|в.
Сошрапзопв Ьавед оп а 32 рв зппп!аПоп оГ сутосЬгоп|е с (Ыог|Ьтир ет а!., 1980, 1981) апт( оп а зеНев оГ 25 рв в!ши!ат)опв оГ шуо8!оЪ|п (1.ечу ет а1., 1985; 1.ечу 8т Кеерегв, 1986) вЬотчет! геавопаЫу 8оот) а8геешепт Ьеттчееп йе йеогеПса! апт! ехрепп|епта1 тези!тв; сГ. 68иге 5.8. ТЬе в|пш1атюпз шау ечеп ргоч)т)е а шоте ассигате т)езсг)рт)оп оГ йе атопис Пистиатюпв йап 1в ипрПет) Ъу йе аЪоче сошрапвопв. 1т Ьав гесепт!у Ьееп вЬотчп йат йе втапдагт) тесЬп)т)иев !ог штегргетш8 Х-гау т!ага тепт) то ипт)егевт)шаге йе ашрП- тит(ев оГ атопис Йзр)асешепт, еврее!аПу Гог йове атошв «|1|Ь йе!аг8езт Йзр!асешептв (1 ечу й Кеерегв, 1985; 1.ечу ет а!., 1986). ТЬеве тесЬпщиев ргодисе Йвтогт!опз випПаг то йе раттегп зееп ш 68иге 5.8, !п рагс Ьесаиве йеу шсогрогате йе аввшпртюп оГ Ьаппоп|с атопис пютюп.
ТЬе а8гееп|епт Ьет«тееп в)пш1атюп апт! Х-гау тези!|в |в регЬарв вигрНв)п8 ш чтечт оГ |Ье тИГегепт типе вса1ев тпчо)чей %ЬПе рготешв с!еаг1у т)о пот вашр1е аП оГ |Ье в|пи1аг соп!оппатюпа! в|атея |Ьат шаЬе ир йе паПче я!гас!иге дипп8 рет!от)в оГ а Гетч т)океп рв (сГ. весПоп 5.2.2), Ь тпау Ье йат |Ьеу сап зап|р1е а Га)г)у гергевептаПче зиЬзет оГ йеве втатез. Моте ппрогтапт! у, йе поппа! шот)е вшйез т)евсг)Ьед !п вестюп 5.2.2 шаЬе с!еаг йат 1отч Гтщиепсу аттис|ига) ч)Ьгатюпв (аз ЙвПпст Ггош втгистига1 тгапяПопв) ассоипт Гог а в!гаЫе рагс оГ |Ье атопис Писшатюп ша8ти!идея. %псе йе )отчевт Ггет!иепс)ев епсоиптегед (оГтеп аЪоит 3 сш-') соггезроп|1 то пютюпв тч)тЬ репот)в оГ аЬоит 10 рв, апу зипи!аПоп!оп8ег |Ьап тЬ!в сап Ье ехрестет! |о ватпр!е пювт оГ йе ч)ЬгаПопаПу асеева)Ые врасе, ечеп |Т |Ье вашрИп8 оГ йе врасе ассевв|Ые Ьу !гааз)тюпа |з шсошр1ете.
Коше ейогт Ьаз Ьееп шаде то 8о Ьеуопт! йе випр!е аввишрт)опв оГ Но|гор|с апт) Ьаппошс пюПоп |и йе апа1ув|в оГ ехрегппепта( тези!|в. ТЬеве шс!ит)е Х-гау втгисппе гейпешептв тч!|Ь рагПа! ог Г«П апа1ув)в оГ йе атопис Йвр!асешепт ашвотгору (Агтутп)«1с ет а(., 1979; Коппег! |Ь Непт!т)с)своп, 1980; Сг!очег ет а!.„!983).
ТЬе тези!|в оЬ|а!пет! |о дате аге сопз)втепт «1|Ь |Ье |ЬеогеПса! Ппт()п8 йат йе атопис пюПоп !в, |и 8епега!, т!и(те ап|зотгор)с. Ехрег(шепт ап|1 йеоту аге а!во ш а8гее|пепт |и сопс!ийп8 йат соПесПче шотюпз тч(тЬ!и рготе|пз тепе то «авЬ оит йе согге!аПопв |Ьат гй8Ы Ье ехрестет( Ьеттчееп !оса! я|гас|иге апт) |Ье ргеГегге|1 Йгестюп оГ атопис Йвр!асеп|епт. Птит)(ев оГ |Ье тетпрегатиге Перепдепсе оГ йе е1естгоп депв)ту реаЬ тч)т)тЬв ргоч)т)е ча!иаЫе !пГогп|атюп оп йе сЬагастег оГ |Ье ейест|че ротепт|а1в сопвтга|п|п8 |Ье а|оп|в то йеЬ тпеап ров(т!опз (РгаиепГеЫег ет а!., ! 979; Нагтшапп ет а!., 1982). ЯисЬ втийез вЬотч йат йе атопис йяр!асе|пептв аге 8епегаП у апЬаппоп)с |и сЬагастег.
РгаиепГе)т!ег ет а!. (!979) Ьаче сЬагастеНгед |Ье е!Гест(че атопис ротепт|а1в Ъу вппр!е ро«ег !а«ехргеввюпз. Апюп8 о|Ьег Ппйп8в, йеу яЬотч йат йе ротепт!а!з оГ |пеап Готсе |ог атопис Йзр!асетеп! пеаг 100 оотг ите йупаткв йе рго1е!и вигГасе оГГеп Ьаче а вс)иаге и е!! сЬагас!ег, !и а8геетепГ идй йеогедса! 6пд(п8в. Чап Оипз!егеп ег а!.
(1983) сагпед оиг а 20рз яппи)агюп оГ а Ги!1 ипЬ се!1 сопгашш8 Гоиг ВРТТ пю!еси1ез а1оп8 идгЬ зо!чеп! уча!ег то!еси1ез, апд зЬовед гЬаг йе ехресгед д16гасгюп Ггот !Ыв тоде! сгув!а1 и ав )п геазопаЫе ассоп1 илгЬ ехрег(тепга1 геви!!в. ТЬЬ рюпеепп8 в!иду та1сев с1еаг !Ьаг йе (пгегргегагюп оГ Х-гау дага сап Ье !тргочед Ьу из(п8 (пГоппадоп Ггогп в)ти!а!!опв оп йе ап(ю!горк апд апЬаппотс па!иге оГ агоппс тогюпв.
ТЫв ро)пг !з сбясизвед Гигйег т сЬаргег 9. Хис!еаг та8педс гевопапсе 1в рагдси!аг1у ча!иаЫе ав а ргоЬе оГ ргогеш дупаписз. ТЬе тегЬод сап Ье ивед оп йе поппа1 во!игюп в!аге оГ ргогешв апд, аз а гевиЬ оГ гесепГ дече!ортепгв !п зресГга! авз18птепГ !есЬпщиез, сап ргоч!де в!гас!ига! апд дупаписа! !пГоппа!юп оп зрес16с раггв оГ ргосе!и пю!еси)ез. Могеочег, йе тегЬод !з ивеГи1 Гог в!иду оГ Ьой Гав! апд в)ои !оса! пю!!опв. Рав! тодопв тоди1а!е йе та8педс епч(гоптеп! оГ пис1е! а! Ггег(иепс(ев !Ьа! айпи!а!е пис1еаг та8дедс ге!ахадоп.
Т1шв, йеве Гав! пюдопв аге гебес!ед !и ХМК ге!аха!юп !ппев апд !и йе пис!еаг ОчегЬаизег епЬапсетепг (ХОЕ) Гасгогз 1Ьаг сЬагас!едхе !Ье егозя ге!ахадоп оГ врес!6с ра(гв оГ пис!еЬ 8гид)ев оГ "С пис1е1 Ьаче Ьееп рагдси!аг1 у изеГи1, Ьесаиве йе та8педс беЫ 6исгиагюпя аге обеп допппагед Ъу йе ге)адче тогюп оГ ргогопв !Ьаг аге Ьопдед го йе сагЬоп идй а чче!1 сЬагас!епхед 8еоте!гу, ТЬе геопепга!юп оГ С вЂ” Н Ьопдв оссигв оп вечега1 дте яса!ев (1.ечу, Кагр!ив ег МсСапппоп, 1981). Рагда! геопепгагюп оссигв оп гЬе гппе вса!е оГ а Гечг рв аз а геви!г оГ в!гас!ига! 6исгиа!юпв оГ гЬе Ыпд девспЬед еаг!)ег 1п гЫз сЬар!ег.
Боте адд)Гюпа! геог!ептяюп оссигв оп а !оп8ег Гппе вса1е ав йе рго1е)п затр)ев 866егеп! Ьи! гдпп!аг сопГоппа!юпа) виЬв!а!ев. Рог рго!е)пя !и во!и!юп, согпр!е!е геог(епгагюп оссигв очег гипев оГ а Гею паповесопдв аз а геви!г оГ очегаП гога!юпа! с66ивюп оГ йе пю1еси!е. ТЬе ехгепг оГ геопепгадоп ргодисед Ьу!пгегпа! тодоп сап Ье сЬагасгег)гед Ъу ап огдег рагатегег У' Гог еасЬ С вЂ” Н Ьопд, (5.8) Неге, йе ап8и!аг Ьгас1се!в (пгбсаяе а Гппе ачега8е, г (в !Ье С вЂ” Н Ьопд )еп8!Ь, апд йе У',„аге йе весопд-огдег врЬедса1 Ьаппотс Гшк!!опв оГ йе С вЂ” Н Ьопд опеп!адоп ш а пю1еси(е-бхед Гтте.
ТЬе г!иапйу 5' га1сев ча!иея гапфп8 Ггот хего го опе; йезе 11т!гя соггеяропд !о)воггорк пюдоп апд !о по геопепгадоп, гевресдче!у. 1п са!си1адп8 огдег рагатегегв Ггот пю1еси!аг дупаписв яппи!ад опз и Ьеге ехр 1 1 с 6 гпей у! Ьудго8еп агота Ьаче по! Ьееп 1пс!идед, йе огдег рагатегег оГ ег(иадоп (5 8) Рзеьи(гь рог ргоге(гт 101 (а) о.ь ; 0,5 )- оя-о. '; 0.2 )- 0.1 г- г и. |вг и. |вь и |ьг и. пь аьп лигг аььо аььв маьг им |в (ь) 1 |г 6 А|а|в |.0 го.в '- ., Оьв '- 1 Оив а 0.2 $- г ь а*|ь и мг и*гвь и |ьг япь а*гг а*гг авива л| ьв ммьг ьмьв Р$8. 5.9. Са(си!а|е|$ ап|$ ехрегппепза! Ъ(МК огь)ег рага|пе|егв Гог |Ье зпе|Ьу! 8гоирв ш ВРТ1 (айег $.$раг$ е| а(., 1982).
ТЬе оп)ег рагазпе|ег 5в В |Ьаз Гог |Ье ах(ь ь)ейпе|$ Ъу |Ье |пейу! сагЪоп ап|$ йе Ьеачу а|о|па |о мгЬ(сЬ з|!в )о!пез$. ТЬе ехрепзпеп|а! ча)мев вге ьЬогчп |и (гз). ТЬе ча!иев са)си!азе|$ Гго|п а 96 рь п|о)ест!аг з)упапз(сь зппп!а6оп аге вЬо чп 1п (Ь). Соруг(8Ь( © !982, Маспп)!ап )опгпа!ь $.$|$. Керппзе|$ Ъу реппяяоп, сап Ье г)есо|прове|$ $п|о йе ргойзс| оГ (1) йе соп(пЬпВоп Ггозп гоза(юпв аЬош йе Ьопд соппесВп8 йе зпейу! 8гопр зч($Ь гев( оГйе пю1есп1е ап($ (2) йа| з(пе зо |потопа оГ йВ Ьоп($ з(ве!Г (1.ечу е| а(., 1985). ТЬе Гоппег |в згеазе($ ав а сопи(ап|, ччЬ$!е йе!а|зег сап Ье са!сп1а(е($ Ггоп| йе япш!аВоп. Ь(раг(, ЯгаЬо й Ьечу (1982) Ьаче со|прозе($ огз)ег рагазпесегв Гог зчие!че |пейу! 8гопрв Ггозп а 96 рв япш!а|юп оГ ВРТ! ап($ Ьаче со|праге($ йеве |о ча! пев оГ 5в ехзгасзе($ Ггозп )ч)МК ге!аха(юп ()а(а (К(сЬагг, )в(а8ауазпа й %й(Ьг(сЬ, !980; $.$рап' 8ь БгаЬо, 1982). ТЬе гевп!(в аге ($(ьр!ауе|$ зп В8пге 5.9.












