Диссертация (1145736), страница 22
Текст из файла (страница 22)
В тканях головы, семенников и яичников D. melanogaster гену sbr соответствуютальтернативныетранскриптысразличнымипромоторамиисайтамиполиаденилирования. Среди идентифицированных нами 19 возможных транскриптовгена sbr 3 встречаются только в семенниках, 2 – в тканях головы и 3 – в яичниках.2. Эволюционно-консервативной особенностью гена Nxf1 у разных организмов являетсясохранение гомологичного интрона в одном из транскриптов. В количественномотношении транскрипты гена sbr (Dm nxf1) с сохранённым интроном 5 в тканях головысоставляют значительную часть всех транскриптов гена (до 40%). В семенниках какD.
melanogaster, так и M. musculus интрон-содержащий транскрипт составляет минорнуюфракцию.3. В семенниках D. melanogaster обнаружена новая изоформа SBR-t (137-672 ак), котораясинтезируется с транскриптов, начинающихся в интроне 3. В коротком семенниковоспецифичном белке SBR-t по сравнению с SBR отсутствует N-терминальная часть белкас сигналом ядерной локализации.4. В яичниках и тканях головы D.
melanogaster идентифицирована новая изоформа SBR-ir(1-327 + 5 ак). Белок SBR-ir транслируется с транскрипта с сохранённым интроном 5. ВSBR-ir отсутствуют С-терминальные домены NTF2-like и UBA.95Список условных обозначенийАПА – альтернативное полиаденилированиеБСА – бычий сывороточный альбуминнкРНК – некодирующие РНКОТ-ПЦР – ПЦР с обратной транскрипциейПЦР-РВ – ПЦР в реальном времениРНП – рибонуклеопротеин, рибонуклеопротеиновыйТФ – транскрипционный факторЯПК – ядерный поровый комплексARE – AU-rich elementsCAGE – cap analysis of gene expressionCBP80 – cap-binding proteinCPSF – cleavage and polyadenylation specificity factorCRM1 – chromosome region maintenance 1CS – cleavage siteCstF – cleavage stimulation factorCTE – constitutive transport elementDPE – downstream promoter elementDSE – downstream sequence elementEJC – exon-junction complexEST – express sequence tagFMRP – fragile X mental retardation proteinLRR – leucine-rich repeatMEX67 - messenger RNA export factor of 67 kDa molecular weightNES – nuclear export signalNLS – nuclear localization signalNMD – nonsense-mediated mRNA decayNTF2-like – nuclear transport factor 2 - likeNXF – nuclear mRNA export factorORF – open reading framePAS – polyadelylation siteRACE-PCR – rapide amplification of cDNA ends PCRRBD – RNA-binding domainsbr – small bristlesSR – Ser/Arg-rich96TAP – Tip-associated proteinTDD – translation-dependent mRNA decayTREX – transcription-coupled exportTSS – transcription start siteUBA – ubiquitin associateduORF – upstream ORFUSE – upstream sequence elementUTR – untranslated region97Список литературы1.
Аванесян Э.О. 2009. Характеристика экспрессии гена small bristles (Dm nxf1) в норме и умутантов Drosophila melanogaster. Магистерская диссертация, СПбГУ.2. Ацапкина А.А., Голубкова Е.В., Касаткина В.В., Аванесян Э.О., Иванкова Н.А., МамонЛ.А. 2010. Особенности сперматогенеза у Drosophila melanogaster: роль основноготранспортного рецептора мРНК (Dm NXF1). Цитология. 7: 574-9.3. Голубкова Е.В., Пугачева О.М., Демина Е.П., Шершабова А.Н., Мусорина А.С., МамонЛ.А. 2004. Стерилизующий эффект мутантного аллеля sbr10 (l(1)ts403) в компаунде снулевым аллелем у самок Drosophila melanogaster. Генетика. 40(4): 469-77.4. Голубкова Е.В., Ацапкина А.А., Мамон Л.А.
2015. Роль гена sbr/Dm nxf1 всинцитиальные периоды развития у Drosophila melanogaster. Цитология. 57(4): 294-304.5. Касаткина В.В. 2007. Изучение роли мутантного аллеля sbr12 в определениистерильности самцов Drosophila melanogaster. Магистерская диссертация, СПбГУ.6. Кьергаард А.В., Мамон Л.А. 2007.
Действие гипертермии на мейоциты самцовDrosophila melanogaster индуцирует появление потомков с нарушением набора нетолько отцовских, но и материнских половых хромосом. Генетика. 43: 1379-87.7. Мамон Л.А., Кливер С.Ф., Просовская А.О., Гинанова В.Р., Голубкова Е.В. 2013.Интрон-содержащий транскрипт – эволюционно-консервативная особенность геновортологов nxf1 (nuclear export factor). Экологическая генетика. 11(3): 3-13.8. Мамон Л.А., Мазур Е.Л., Чуркина И.В., Барабанова Л.В. 1990. Влияние высокойтемпературы на частоту нерасхождения и потерь половых хромосом у самок Drosophilamelanogaster линии l(1)ts403 с дефектом в системе белков теплового шока.
Генетика.26(3): 554-6.9. Никитина Е.А., Комарова А.В., Голубкова Е.В., Третьякова И.В., Мамон Л.А. 2003.Полудоминантное влияние мутации l(1)ts403 (sbr10) на нерасхождение половыххромосом в мейозе у самок Drosophila melanogaster при тепловом воздействии.Генетика. 39: 269-75.10. Никитина Е.А., Токмачева Е.В., Савватеева-Попова Е.В. 2003б. Тепловой шок в периодразвития центральных структур мозга дрозофилы: формирование памяти у мутантаl(1)ts403 Drosophila melanogaster. Генетика. 39: 33-40.11. Никулина А.О.
2011. Роль гена Dm nxf1 в формировании и функционировании нервнойсистемы у Drosophila melanogaster. Магистерская диссертация, СПбГУ.12. Alberts B, Johnson A, Lewis J, Raff M, Roberts K, Walter P. 2008. Molecular biology of thecell; 5th edition. New York, Garland Science.9813. Aldridge AC, Benson LP, Seigenthaler MM, Whigham BT, Stowers RS, Hales KG.
2007. Rolefor Drp1, a dynamin-related protein, and milton, a kinesin-associated protein, in mitochondrialsegregation, unfurling and elongation during Drosophila spermatogenesis. Fly (Austin). 1: 3846.14. Allen FW. 1941. The biochemistry of the nucleic acids, purines, and pyrimidines. AnnualReview of Biochemistry.
10: 221–44.15. Anand S, Batista FD, Tkach T, Efremov DG, Burrone OR. 1997. Multiple transcripts of themurine immunoglobulin epsilon membrane locus are generated by alternative splicing anddifferential usage of two polyadenylation sites. Mol Immunol. 34(2): 175-83.16. Andersen PK, Jensen TH, Lykke-Andersen S.
2013. Making ends meet: coordination betweenRNA 3'-end processing and transcription initiation. Wiley Interdiscip Rev RNA. 4(3): 233-46.17. Anderson P, Kedersha N. 2006. RNA granules. J Cell Biol. 172(6): 803-8.18. Andreassi C, and Riccio A. 2009. To localize or not to localize: mRNA fate is in 3'UTR ends.Trends Cell Biol.
19: 465-74.19. Ashraf SI, McLoon AL, Sclarsic SM, Kunes S. 2006. Synaptic protein synthesis associatedwith memory is regulated by the RISC pathway in Drosophila. Cell. 124(1): 191-205.20. Atsapkina AA, Golubkova EV, Kasatkina VV, Avanesyan EO, Ivankova NA, Mamon LA.2010. Peculiarities of spermatogenesis in Drosophila melanogaster: role of main transportreceptor of mRNA (Dm NXF1). Cell and Tissue Biology. 4: 1–7.21. Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M,Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E. 2000. The C-terminal domain of TAP interactswith the nuclear pore complex and promotes export of specific CTE-bearing RNA substrates.RNA.
6: 136–58.22. Baines MG, and Thorpe R. 1992. Purification of immunoglobulin g (IgG). Methods Mol Biol.10: 79-104.23. Barbee SA, Estes PS, Cziko AM … Ramaswami M. 2006. Staufen- and FMRP-containingneuronal RNPs are structurally and functionally related to somatic P bodies. Neuron. 52(6):997-1009.24. Barbosa C, Peixeiro I, Romão L. 2013. Gene expression regulation by upstream open readingframes and human disease. PLoS Genet.
9: e1003529.25. Barreau C, Benson E, Gudmannsdottir E, Newton F, White-Cooper H. 2008. Post-meiotictranscription in Drosophila testes. Development. 135: 1897–902.26. Barreau C, Paillard L, Osborne HB. 2005. AU-rich elements and associated factors: are thereunifying principles? Nucleic acids research. 33(22): 7138-50.27. Bartel DP. 2009. MicroRNAs: target recognition and regulatory functions. Cell.
136: 215-33.9928. Bear J, Tan W, Zolotukhin AS, Tabernero C, Hudson EA, Felber BK. 1999. Identification ofnovel import and export signals of human TAP, the protein that binds to the CTE element ofthe type D retrovirus mRNAs. Mol Cell Biol. 19: 6306–17.29. Beaudoing E, Freier S, Wyatt JR, Claverie J-M, Gautheret D. 2000.
Patterns of variantpolyadenylation signal usage in human genes. Genome Res. 10(7): 1001-10.30. Besse F, Ephrussi A. 2008 Translational control of localized mRNAs: restricting proteinsynthesis in space and time. Nat Rev Mol Cell Biol. 9(12): 971-80.31. Bicknell AA, Cenik C, Chua HN, Roth FP, Moore MJ. 2012. Intron in UTRs: why we shouldstop ignoring them. Bioessays.
34: 1025-34.32. Bolognani F, and Perrone-Bizzozero NI. 2008. RNA-protein interactions and control of mRNAstability in neurons. J Neurosci Res. 86: 481-9.33. Bolognani F, Contente-Cuomo T, Perrone-Bizzozero NI. 2010 Novel recognition motifs andbiological functions of the RNA-binding protein HuD revealed by genome-wide identificationof its targets. Nucleic Acids Res. 38(1): 117-30.34. Braun IC, Herold A, Rode M, Izaurralde E. 2002. Nuclear export of mRNA by TAP/NXF1requires two nucleoporin-binding sites but not p15. Mol Cell Biol. 22(15): 5405-18.35.
Braun IC, Herold A, Rode M, Conti E, Izaurralde E. 2001. Overexpression of TAP/p15Heterodimers Bypasses Nuclear Retention and Stimulates Nuclear mRNA Export. J BiolChem. 276: 20536-43.36. Brown SL, and Morrison SL. 1989. Developmental regulation of membrane and secretory Iggamma 2b mRNA. J Immunol. 142(6): 2072-80.37. Bustin SA, Benes V, Garson JA, Hellemans J, Huggett J, Kubista M, Mueller R, Nolan T,Pfaffl MW, Shipley GL, Vandesompele J, Wittwer CT. 2009.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
