Автореферат (1144819), страница 10
Текст из файла (страница 10)
Они достаточно просты в использовании и благодаря своейуниверсальности уже получили широкое применение в практике (Глотов и др., 2005, 2007, 2008).Сегодня можно констатировать, что в методах диагностики мутаций достигнут определенныйконсенсус – технология биочипов больше подходит для реализации скрининговых программ, аактивно развивающееся NGS секвенирование – для проведения научных и специальныхдиагностических исследований.Используются несколько подходов для оценки риска МФЗ. С одной - классический подход,основанный на идентификации новых генов и аллелей риска заболеваний. Он включает: а) поиск исравнительный анализ частот аллелей и комбинации аллелей генов-кандидатов, б)корреляционный анализ между вариантами кандидатных генов и «основными» клиническимипроявлениями заболевания, в) математическое моделирования риска.
С другой стороны - подход,основанный на принципах системной генетики. Он включает построение генных сетей,нацеленных на выявление ключевых (триггерных) маркеров патологии и новых метаболическихпутей каждого заболевания, а также комплексное изучение новых маркеров заболевания нагеномном (полногеномное секвенирование), транскриптомном (исследование уровня микроРНК) и28эпигеномном уровнях (исследование метилирования промоторных регионов) реализациигенетической информации.Итогом работы можно считать новый дополненный список генов Г, АГ и МС, которыйпозволяет сделать некоторые обобщения.
Во-первых, с помощью генных сетей удалосьподтвердить наличие общих молекулярно-генетических механизмов у Г, АГ и МСО, то есть ихсинтропность. В пользу генетической близости этих заболеваний свидетельствует наличие у них«общих» генов, часть из которых представлена генами «артериального давления»: ACE, ADRB2,LPL, REN. Во-вторых, нам не удалось подтвердить вклад GWAS-маркеров в патогенез МФЗ нанашей выборке, что свидетельствует о важности наличия собственной выборки пациентов покаждой нозологии и необходимости более «осторожной трансляции» результатов зарубежныхисследований на российские популяции. В-третьих, показано, что генетическое тестированиегенов-кандидатов на современном этапе развития предиктивной медицины не позволяет делатьдолгосрочных индивидуальных прогнозов здоровья, но позволяет сформировать группу риска потому или иному МФЗ.
Для этого можно использовать как традиционные оценки - коэффициентотношения шансов (OR), так и расчет риска на основании MDR и GLM моделей. При отсутствиианамнестических и клинических данных, целесообразно использовать метод MDR, тогда как приналичии таковых – лучше применять GLM моделирование. В-четвертых, необходимо отметить,что таргетное NGS секвенирование нуклеотидной последовательности гена-кандидата (ACVR2A для гестоза) позволяет выявить новые маркеры заболевания, перспективные для развитияперсонализированной медицины.
В-пятых, секвенирование и анализ спектра микроРНК являетсяперспективным подходом для понимания механизмов эпигенетической регуляции функции генов.Анализ спектра 14-ти микроРНК может быть использован для оценки риска одного из подтиповгестоза (на фоне АГ). В-шестых, нужно отметить определенный скепсис относительноэпигеномных исследований метилирования как перспективного направления предиктивноймедицины. Поскольку в настоящей работе данный подход не дал никаких результатов.
В-седьмых,в ходе выполнения работы были выявлены не только маркеры риска патологии, но ипротективные маркеры заболевания, тестирование которых не менее важно и до настоящеговремени мало учитывается.Таким образом, влияние генетических факторов на экспрессию и пенетрантностьфенотипических признаков (на примере Г, АГ и МСО) в значительной мере обусловлено наличием«качественного» генетического полиморфизма, связанного с однонуклеотидными заменами.Модели для прогноза риска МФЗ могут быть созданы только на основании исследованияполиморфизма ДНК и тестирования экспрессии.
Как следует из проведенной работы, перспективыдальнейших исследований наследственной предрасположенности к МФЗ связаны с комплексныманализом стандартизированных образцов биобанков, включающим проведение NGSсеквенирования генов (генома), изучение данных экспрессионных и эпигенетических профилей сучетом состояния их метаболических путей. Наш многолетний опыт показывает, что только спозиции системной генетики удастся создать компьютерные модели, которые позволят не толькооценить уникальные особенности тканей и органов конкретного человека, но и откроют новыевозможности для более точного прогноза индивидуального риска МФЗ, для оптимизациидосимптоматической диагностики и эффективного персонализированного лечения.ВЫВОДЫ1.Показана эффективность применения оригинальных гелевых биочипов для анализааллельногополиморфизмагенов-кандидатов,ассоциированныхснаследственнойпредрасположенностью к таким частым мультифакторным заболеваниям как гестоз, артериальнаягипертензия и метаболический синдром с ожирением.2.Определенные аллели генов ренин-ангиотензиновой системы, свертывания крови иметаболизма липидов, ассоциированные с риском гестоза у женщин, артериальной гипертензии иметаболического синдрома с ожирением у детей.
Эти аллели и их комбинации являютсяфакторами риска развития исследуемых мультифакторных заболеваний, и могут выступать вкачестве протективных маркеров, снижающих вероятность развития этих патологий.3.Комбинации аллелей генов ренин-ангиотензиновой системы и метаболизма липидовкоррелируют с клиническими показателями у детей, больных артериальной гипертензией.4.При отсутствии анамнестических и клинических данных моделирование рискамультифакторных заболеваний предпочтительно проводить методом множественного сниженияразмерности (MDR), а при их наличии - с помощью линейных моделей (GLM).295.Тестирование аллелей генов ренин-ангиотензиновой системы, свертывания крови иметаболизма липидов, дополненное расчетами коэффициента соотношения шансов и оценкойриска на основании MDR и GLM моделей, позволяет сформировать группы риска по этиммультифакторным заболеваниям.6.Генетические маркеры гипертонии, выявленные на основании полногеномного анализаассоциаций, не являются факторами риска развития данного заболевания у детей СевероЗападного региона РФ.7.Ассоциативные сети позволяют выявлять не только общие, но и специфичные факторыриска сочетанных патологий (МФЗ).8.Целевое NGS секвенирование позволяет идентифицировать новые маркеры заболевания.Значимыми молекулярными маркерами риска гестоза являются аллели rs145399059С,rs17692648С, инсерция insAA в позиции 148642724 гена ACVR2A.
Протективным маркеромгестоза является аллель rs17742573G гена ACVR2A.9.Маркером гестоза на фоне гипертонической болезни является изменение уровня микроРНКплаценты.ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ1.Для повышения эффективности скрининга генетически обусловленных нарушений работысистем свертывания крови и регулирования артериального давления целесообразно использовать«Фибр-биочип» и «Кардиочип».2.Для формирования группы риска гестоза необходимо проводить исследование следующихмолекулярно-генетических маркеров: rs11091046 гена AGTR2, rs1801133 гена MTHFR, rs1799768гена SERPINE1, rs1799963 гена F2, rs7412 гена APOE, rs145399059, rs17692648, инсерция insAA впозиции 148642724 гена ACVR2A.3.Для формирования группы риска артериальной гипертензии у девочек необходимопроводить исследование следующих молекулярно-генетических маркеров: rs7412 гена APOE,rs1799983 гена NOS3, rs699 гена AGT; артериальной гипертензии у мальчиков - rs11091046 генаAGTR2, rs5186 гена AGTR1, rs7412 гена APOE, rs1799983 гена NOS3, rs1801133 гена MTHFR.4.Для формирования группы риска метаболического синдрома и ожирения у девочекнеобходимо проводить исследование следующих молекулярно-генетических маркеров: rs11091046гена AGTR2, rs328 гена LPL, rs7412 гена APOE и rs1799722 гена BR1 (BDKRB2), у мальчиков rs7412 гена APOE, rs699 гена AGT.5.При наличии только генетических данных формирование группы риска МФЗ целесообразнопроводить на основании расчета коэффициента соотношения шансов (OR) и MDR моделей.
Приналичии анамнестических, клинических и генетических данных расчет риска гестоза у женщин иартериальной гипертензии у мальчиков целесообразно осуществлять, используя GLMмоделирование.ОСНОВНЫЕ ПУБЛИКАЦИИ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИПатенты РФ:1.Глотов А.С., Вашукова Е.С., Бикмуллина Д.Р., Зайнуллина М.С., Баранов В.С., АйламазянЭ.К. Способ прогнозирования риска развития гестоза на основе генетических маркеров.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
