Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1144700), страница 4

Файл №1144700 Диссертация (Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей saccharomyces cerevisiae) 4 страницаДиссертация (1144700) страница 42019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 4)

Схема амилоидогенеза и прионогенеза. Красный круг – мономер белкав исходной конформации. Зелѐный квадрат – мономер того же белка вамилоидной конформации.Примерно так же происходит формирование патологических амилоидов иприонов, за исключением того, что в данном случае этот процесс индуцируетсяаномальнымповышениемнарушениемегоконцентрациивзаимодействиясамилоидогенногофункциональнымибелка,илипартнѐрами.Образовавшиеся протофибриллы собираются в фибриллы и более крупныеагрегаты.Каждый новый неинфекционный амилоидный агрегат (прион) образуетсянезависимо от предсуществующего. Иначе обстоит дело в случае прионогенеза.Амилоидные прионные агрегаты, в отличие от неинфекционных амилоидов,расщепляются на олигомеры (рис.4, этап 2), каждый из которых являетсяматрицей для присоединения новых мономеров.

Образовавшийся олигомер растѐт23и вновь расщепляется на олигомеры, что приводит к возникновению циклаприонной конверсии (рис. 4). У дрожжей расщепление агрегатов обеспечиваетвозникновение воспроизводящегося цикла прионной конверсии и позволяетмелким агрегатам передаваться в дочерние клетки, то есть стабильнонаследоваться.Поскольку в случае прионизации белок входит в состав амилоидныхагрегатов, это приводит к его полной или частичной инактивации.

Прионнаяинактивация белка может приводить к наследуемому изменению признака уодноклеточных организмов. Именно в этом заключается феномен «белковойнаследственности» впервые сформулированный Ридом Викнером – в случаеприонизации возникает наследуемое изменение признака без каких бы то ни былоизменений в геноме [Wickner, 1994; Wickner et al., 1999].

Кроме того, открытиеприонов привело к констатации ещѐ одного феномена – один и тот же белок видентичных условиях может быть представлен в организме как минимум в двухальтернативных конформациях. Инфицирование организма прионным агрегатом,или возникновение приона de novo, в результате лишь временного повышенияконцентрации белка, вызывает наследуемое у микроогранизмов, или стабильновоспроизводящееся в организме высших эукариот, изменение конформации иактивности белка. В отличие от прионов, неинфекционные патологическиеамилоиды могут поддерживаться только в случае постоянной сверхпродукциисоответствующих белков.

Например, показано, что ряд мутаций, способствующихповышенному уровню секреции амилоидного пептида бета (Aβ), вызываютнаследственные формы болезни Альцгеймера [Goate and Hardy, 2012].Отличие прионов от неинфекционных амилоидных агрегатов удобнопроиллюстрировать на следующем примере – прион [PSI+] (прионная формадрожжевого белка Sup35) стабильно наследуется, поскольку шаперон Hsp104расщепляет прионные агрегаты, обеспечивая тем самым цикл прионнойконверсии [Kushnirov and Ter-Avanesyan, 1998]. Делеция HSP104 или егоинактивация приводит к потере прионных агрегатов, так как в отсутствие этого24шаперона агрегаты продолжают расти, но не расщепляются и крупные агрегатыне передаются в дочерние клетки, то есть становятся неинфекционными[Borchsenius et al., 2001; Kryndushkin et al., 2003; Kushnirov et al., 2007].

В этомслучае, в отсутствие конформационной матрицы (прионных агрегатов) в дочернихклеткахвновь синтезируемыйбелокSup35представленв мономернойконформации. В зависимости от активности Hsp104 белок Sup35 можетформировать в дрожжах как прионные, так и неприонные агрегаты. Такимобразом, как ни тонка грань между прионами и неинфекционными амилоидами,но она существует.Доказать или опровергнуть наличие прионных свойств амилоидовмлекопитающих значительно сложнее. Для того, чтобы утверждать, что однаждыинъецированный агрегат размножается (т.е.

запускает цикл прионной конверсии)необходимо использовать модельных животных или культуры клеток, у которыхисследуемый белокстабильно поддерживается в нормальной клеточнойконформации. Некоторые авторы не могут устоять перед соблазном назватьисследуемый ими амилоид прионом, не имея для этого серьѐзных оснований. Такв целом ряде работ используется следующая логика: условный белок «Х»формирует амилоидные фибриллы in vitro. Добавление этих фибрилл к раствору,содержащему мономеры белка «Х» ускорят процесс агрегации.

На основанииэтих данных авторы делают вывод, что исследуемый белок обладает прионнымисвойствами [Raveendra et al., 2013; Ren et al., 2009; Prusiner, 2013]. В связи сбольшим количеством таких работ нужно отметить, что ускорение процессаагрегациимономеровзасчѐтдобавленияпредсуществующегоагрегатахарактерно для любого амилоида, да и не только амилоида (достаточно вспомнитьиз школьной программы пример с добавлением кристалла соли в насыщенныйраствор). Предполагается, что данные эксперименты доказывают способностьагрегатов к самовоспроизведению, но на самом деле происходит подменапонятий. Самовоспроизведение это увеличение количества агрегатов, а неувеличение их размеров.

Очевидно, что эксперименты, рассмотренные напримерегипотетическогобелка«Х»,доказываютувеличениеразмера25предсуществующихагрегатов,нонесвидетельствуютобихсамовоспроизведении.Амилоидные агрегаты некоторых белков, подобно прионам, могуттранспортироваться из клетки в клетку, в частности, в составе секреторныхвезикул [Joshi et al., 2015; Medina and Avila, 2014]. Более того, показано, чтоинъекцияамилоидныхфибриллбелкавмозгтрансгенныхмышей,сверхпродуцирующих этот белок, может ускорять процесс амилоидогенеза [Eiseleet al., 2010; Morales et al., 2012; Rosen et al., 2012]. Здесь важно сказать, что вусловиях сверхпродукции эти белки могут образовывать агрегаты и без инъекции.В данном случае нельзя утверждать, что именно инъекция приводит к появлениюальтернативной формы белка.

Ускорение амилоидогенеза может быть вызваноростом введѐнных в организм фибрилл.Вместе с тем, совсем недавно были получены доказательства прионныхсвойств амилоидных конформеров белков альфа-синуклеин и tau, агрегациякоторых вызывает нейродегенеративные заболевания. Амилоидные фибриллыбелка альфа-синуклеин, полученные in vitro, при инъекции в мозг мышам дикоготипа, индуцируют нейродегенерацию, связанную с амилоидогенезом [Luk et al.,2012].

Данных о возникновении патологии в результате инъекции полученных invitro фибрилл tau пока нет, но появление агрегатов tau и развитиенейродегенерации были показаны при инъекции мышам дикого типа гомогенатаиз мозга человека, содержащего олигомеры tau и пептида Aβ [Lasagna-Reeves, etal., 2012]. Отметим, что в контроле (без инъекции фибрилл альфа-синуклеина илигомогената, содержащего олигомеры tau) эти белки в мозге мышей дикого типа неагрегируют.26Таблица1.Прионныеиамилоидныесвойстванекоторыхбелковмлекопитающих, агрегация которых вызывает патологию.Индукция амилоидогнегенза у модельных животных врезультате инъекции амилоидных фибриллбезизмененияпоследовательности иуровняпродукциисоответствующегобелка в организмехозяине(прионныесвойства)На фоне сверхпродукции и(или)измененияпоследовательностисоответствующего белка ворганизме-хозяине(амилоидные свойства)БелокПатологияPrPПрионныезаболеваниямлекопитающих++альфасинуклеинБолезньПаркинсона++TauРазличныетаутопатии+*+AAСистемныйамилоидоз АА-+AБолезньАльцгеймера-+HungtingtinБолезньХангтингтона-+Sod1Латеральныйсклероз-+* - В случае с исследованием прионных свойств белка tau, нейродегенерация,связанная с агрегацией tau была вызвана инъекцией белкового лизата из мозгачеловека, умершего от болезни Альцгеймера [Lasagna-Reeves, et al., 2012].Для доказательства прионных свойств необходимо показать, что прифизиологических условиях, без сверхпродукции белка, инъекция его агрегатовприводит к формированию самовоспроизводящихся агрегатов.

Не претендуя наабсолютную истину, мы будем рассматривать в качестве прионов только те27амилоиды млекопитающих, для которых чѐтко доказаны инфекционные свойстваи способность агрегатов к воспроизведению (см. Табл.1).1.3.Функциональные и патологические амилоиды1.3.1. Функциональные амилоидыВ качестве функциональных амилоидов наибольшую известность получилибелкиспидроинифиброин,являющиесяосновнымикомпонентамисоответственно паутины и шѐлка, из которого состоят домики куколок тутовогошелкопряда и некоторых других видов насекомых.

До сих пор структура этихприродных амилоидов почти не охарактеризована. Процесс образования данныхамилоидных фибрилл происходит в секреторных железах за счѐт быстрогоснижения pH и обезвоживания секрета желѐз [Kenney et al., 2002]. Фиброин на80% состоит из глицина, аланина и серина. Бета слои формируютсяповторяющейся последовательностью (Gly-Ala-GIy-AIa-GIy-Ser)n [Ruan et al.,2008]. В случае спидроина бета структуры формируют повторяющиесяпоследовательности аланина, расположенные в центральной части белка[Humenik et al., 2015].Функциональные амилоиды обнаружены также у бактерий [по: Syed andBoles, 2014]. Большинство из них является необходимым компонентомэкстраклеточнойбиоплѐнки,котораясоединяетклеткибактерийприопределѐнных условиях внешней среды.

Помимо этого, некоторые бактериисекретируют амилоидные олигомеры, токсичные для клеток организма-хозяина,клеток грибов, или для других бактерий. Примеры охарактеризованныхбактериальных амилоидов приведены в таблице 2 [по: Syed and Boles, 2014].Микроцин E492 в амилоидной изоформе выполняет как минимум две функции.Продукция этого белка и его секреция в виде амилоидных олигомеров отмеченана стадии экспоненциального роста культуры Klebsiella pneumoniae. Олигомерытоксичны для клеток организма – хозяина, а при понижении pH олигомеры28собираются в нетоксичные амилоидные фибриллы, которые необходимы дляформирования биоплѐнки. Этот процесс обратимый – при повышении pHфибриллы вновь расщепляются на токсичные олигомеры [Biéler et al., 2005].Таблица 2.

Характеристики

Список файлов диссертации

Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей saccharomyces cerevisiae
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6489
Авторов
на СтудИзбе
303
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее