Диссертация (1140107), страница 12
Текст из файла (страница 12)
Красной линией (совпадающей по цвету с контрольной группой) обозначеныграницы контрольной группы (95% ДИ), болотно-зеленой линией (совпадающей по цвету сгруппой пациентов с болезнью Паркинсона) обозначены границы группы пациентов с болезньюПаркинсона (95% ДИ), розовой линией обозначены границы группы пациентов с другиминеврологическими заболеваниями (95% ДИ).71Рисунок 14 — графики многомерного неметрического шкалирования микробиотыкишечника в пространстве первой и третьей главных координат.Красными кружками обозначены пациенты контрольной группы, оранжевым квадратомобозначен пациент с деменцией с тельцами Леви, болотно-зелеными треугольникамиобозначены пациенты с болезнью Паркинсона, ярко-зелеными квадратами обозначеныпациенты с идиопатической семейной дистонией, бирюзовыми квадратами обозначеныпациенты с эссенциальным тремором, голубыми квадратами обозначены пациенты срассеянным склерозом, синим квадратом обозначен пациент с диагнозом множественнаясистемная атрофия, фиолетовым квадратом обозначен пациент с диагнозом острый рассеянныйэнцефаломиелит.
Красной линией (совпадающей по цвету с контрольной группой) обозначеныграницы контрольной группы (95% ДИ), болотно-зеленой линией (совпадающей по цвету сгруппой пациентов с болезнью Паркинсона) обозначены границы группы пациентов с болезньюПаркинсона (95% ДИ), розовой линией обозначены границы группы пациентов с другиминеврологическими заболеваниями (95% ДИ).72Рисунок 15 — графики многомерного неметрического шкалирования микробиотыкишечника в пространстве второй и третьей главных координат.Красными кружками обозначены пациенты контрольной группы, оранжевым квадратомобозначен пациент с деменцией с тельцами Леви, болотно-зелеными треугольникамиобозначены пациенты с болезнью Паркинсона, ярко-зелеными квадратами обозначеныпациенты с идиопатической семейной дистонией, бирюзовыми квадратами обозначеныпациенты с эссенциальным тремором, голубыми квадратами обозначены пациенты срассеянным склерозом, синим квадратом обозначен пациент с диагнозом множественнаясистемная атрофия, фиолетовым квадратом обозначен пациент с диагнозом острый рассеянныйэнцефаломиелит.
Красной линией (совпадающей по цвету с контрольной группой) обозначеныграницы контрольной группы (95% ДИ), болотно-зеленой линией (совпадающей по цвету сгруппой пациентов с болезнью Паркинсона) обозначены границы группы пациентов с болезньюПаркинсона (95% ДИ), розовой линией обозначены границы группы пациентов с другиминеврологическими заболеваниями (95% ДИ).733.1.4 Анализ корреляционных сетей в микробиоте кишечникаДля оценки степени кооперации внутри бактериальных сообществ,составляющих микробиоту кишечника у лиц здорового контроля и пациентов сболезньюПаркинсона,рассчитывалисьпопарныекорреляциимеждупредставленностями бактерий на родовом и видовом уровнях.
На базе попарныхкорреляций составлялись корреляционные графы (или сети). На уровне родов, вобъединенную корреляционную сеть (рис 16) вошли 47 узлов, представляющихотдельные бактериальные рода, и 95 ребер, представляющих корреляционныесвязи между ними. Графы, имеющие менее трех вершин, исключали, припроведении анализа сети граф рассматривали как ненаправленный. Коэффициенткластеризации в объединенной сети составил 0.499.
Диаметр объединенной сетисоставил 6, радиус сети составил 1. Централизация объединенной сети составила0.135, среднее число соседей составило 4.043. Плотность сети имела значение0.088, гетерогенность сети составила 0.616.74Рисунок 16 — корреляционная сеть микробиоты объединенной группы пациентов сболезнью Паркинсона и лиц контрольной группы на уровне родов.Узлы сети (отмечены прямоугольниками) представляют отдельные бактериальные рода. Ребрасети представляют корреляционные связи между родами (зеленый цвет — прямаякорреляционная связь, красный цвет — обратная корреляционная связь). В сеть включали парыбактерий со значением rho Спирмена не менее 0,5 по модулю и со значимостью корреляциир<0.05 после применения поправки Бенджамини-Хохберга на множественные сравнения.При включении в расчет только пациентов контрольной группы размеркорреляционной сети вырос: в нее вошло 52 узла, представляющих отдельныебактериальные рода и 194 ребра, представляющих корреляционные связи междуними (рис 17).
Коэффициент кластеризации при этом снизился до 0.492. Диаметри радиус сети увеличились, диаметр до 8, а радиус сети до 4. Также возросла ицентрализация сети до 0.317, и практически вдвое увеличилось среднее числососедей — 7.462. Плотность и гетерогенность сети также увеличились до 0.146 и0.918 соответственно.75Рисунок 17 — корреляционная сеть микробиоты лиц контрольной группы на уровнеродов. Узлы сети (отмечены прямоугольниками) представляют отдельныебактериальные рода.Ребра сети представляют корреляционные связи между родами (зеленый цвет — прямаякорреляционная связь, красный цвет — обратная корреляционная связь).
В сеть включали парыбактерий со значением rho Спирмена не менее 0,5 по модулю и со значимостью корреляциир<0.05 после применения поправки Бенджамини-Хохберга на множественные сравнения.Всвоюочередь,припроведениикорреляционногоанализадлябактериальных родов, входящих в состав микробиоты кишечника при болезниПаркинсона, отмечалось уменьшение размера сети и числа корреляционныхсвязей между ее компонентами (рис.
18). Так, в сеть вошли 36 узлов,представляющих отдельные бактериальные рода и 51 ребро, представляющеекорреляционные связи между ними. Коэффициент кластеризации по сравнению сконтрольной группой и смешанной выборкой вырос и составил 0.531. Диаметр,радиус и централизация сети снизились по сравнению с сетью, построенной дляпациентов контрольной группы (диаметр сети 7, радиус сети 1, централизациясети 0.156). Среднее число соседей, плотность и гетерогенность сети снизились76по сравнению с контрольной и объединенной группой (среднее число соседей2.833, плотность 0.081, гетерогенность 0.579).
Также в данной сети отмечаетсяналичие отрицательных корреляционных связей между парами бактерийCatonella-Neiseria, Catonella-Vagococcus и Catonella-Oribacterium.Рисунок 18 — корреляционная сеть микробиоты пациентов с болезнью Паркинсона науровне родов. Узлы сети (отмечены прямоугольниками) представляют отдельныебактериальные рода.Ребра сети представляют корреляционные связи между родами (зеленый цвет — прямаякорреляционная связь, красный цвет — обратная корреляционная связь).
В сеть включали парыбактерий со значением rho Спирмена не менее 0,5 по модулю и со значимостью корреляциир<0.05 после применения поправки Бенджамини-Хохберга на множественные сравнения.На уровне видов в объединенной корреляционной сети насчитывалось 18узлов,представляющихотдельныебактериальныевиды,и26ребер,представляющих корреляционные связи между ними (рис. 19).
Коэффициенткластеризации в объединенной сети составил 0.372. Диаметр объединенной сетисоставил 5, радиус сети составил 1. Централизация объединенной сети составила0.140, среднее число соседей составило 2.889. Плотность сети имела значение0.170, гетерогенность сети составила 0.515.77Рисунок 19 — корреляционная сеть микробиоты объединенной группы пациентов сболезнью Паркинсона и лиц контрольной группы на уровне видов.Узлы сети (отмечены прямоугольниками) представляют отдельные бактериальные виды. Ребрасети представляют корреляционные связи между видами (зеленый цвет — прямаякорреляционная связь, красный цвет — обратная корреляционная связь). В сеть включали парыбактерий со значением rho Спирмена не менее 0,5 по модулю и со значимостью корреляциир<0.05 после применения поправки Бенджамини-Хохберга на множественные сравнения.Корреляционная сеть, составленная для лиц контрольной группы, имела всвоем составе 30 узлов, представляющих отдельные бактериальные виды, и 66ребер,представляющихкорреляционныесвязимеждуними(рис.20).Коэффициент кластеризации при этом увеличился до 0.502.
Диаметр сетиувеличился до 6, а радиус сети не изменился. Централизация сети возросла до0.317, также увеличилось среднее число соседей до 4.4. Плотность сети снизиласьи составила 0.152, гетерогенность сети увеличилась до 0.703. В сети отмечалисьотрицательные корреляционные связи между парами бактерий [Eubacterium]dolichum-Prevotella copri и Prevotella copri-Bacteroides uniformis.78Рисунок 20 — корреляционная сеть микробиоты лиц контрольной группы на уровневидов.Узлы сети (отмечены прямоугольниками) представляют отдельные бактериальные виды. Ребрасети представляют корреляционные связи между видами (зеленый цвет — прямаякорреляционная связь, красный цвет — обратная корреляционная связь).
В сеть включали парыбактерий со значением rho Спирмена не менее 0,5 по модулю и со значимостью корреляциир<0.05 после применения поправки Бенджамини-Хохберга на множественные сравнения.В микробиоте у пациентов с болезнью Паркинсона на уровне видов припостроении корреляционной сети сохраняется тенденция на снижение числа узлов(до 24) и ребер (до 24) в сравнении с лицами контрольной группы (рис.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
