Диссертация (1140107), страница 14
Текст из файла (страница 14)
5, рис 25) в микробиоте пациентов с болезньюПаркинсона в сравнении со здоровым контролем преобладали бактерииSphingomonadaceae,Succinivibrionaceae,Staphylococcaceae,Synergistaceae,Chlorobiaceae, а также Nautiliaceae и Gracilibacteraceae. Микробиота пациентов сдругиминеврологическимизаболеваниямихарактеризоваласьснижениемпредставленности семейств Gracilibacteraceae и Porphyromonadaceae по сравнениюс пациентами с болезнью Паркинсона и ростом содержания Sphingomonadaceae иSuccinivibrionaceae по сравнению с контрольной группой.86Рисунок 24 — график содержания отрядов микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки).
Стороныграфиков отображают кривые плотности распределения содержания микроорганизмов, краснаячерта показывает медиану представленности микроорганизмов, фиолетовая точка показываетсреднее значение представленности микроорганизмов, разброс показывает стандартноеотклонение содержания микроорганизмов. * — по сравнению с контролем, # — по сравнению сдругими неврологическими заболеваниями, p<0,05.87Таблица 5.
Различия в содержании микроорганизмов на уровне семействСемействоОбразцов, Образцов, ОТЕ,ОТЕ,контроль БПконтроль БПSphingomonadaceae2458106Succinivibrionaceae73423203Staphylococcaceae320350Synergistaceae64436193Nautiliaceae5171250Gracilibacteraceae6371590Chlorobiaceae5251154Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с болезнью ПаркинсонаСемействоОбразцов, Образцов, ОТЕ, БП ОТЕ,БПДругие НЗДругиеНЗGracilibacteraceae3759018Porphyromonadaceae95312404520Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиСемействоОбразцов, Образцов, ОТЕ,ОТЕ,контроль Другие НЗ контроль ДругиеНЗSuccinivibrionaceae792377Sphingomonadaceae210828Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиlogFCp-значения1,18610,00011,04550,01260,99010,00030,94900,02870,74030,04660,73130,04660,71160,0126содержания ОТЕ уlogFCp-значения-1,01470,0083-0,76000,0022содержания ОТЕ уlogFCp-значения1,23790,00830,97030,0016содержания ОТЕ уНа уровне бактериальных родов (таб.
6, рис. 26-28) микробиота кишечникапациентовсболезньюпредставленностиПаркинсонаKlebsiella,характеризоваласьSphingomonas,Enterococcus,повышениемSuccinivibrio,Staphylococcus, p-75-a5, Cloacibacillus, Catonella, Lebetimonas, Peptoniphilus,Christensenella и снижением содержания Dethiosulfatibacter по сравнению сконтрольной группой. В микробиоте пациентов с другими неврологическимизаболеваниямиповышеносодержаниебактерийSuccinivibrio,Klebsiella,Sphingomonas, Peptostreptococcus, Gardnerella по сравнению с контрольнойгруппой, а также Gardnerella и Blautia по сравнению с пациентами с болезньюПаркинсона.
В то же время у пациентов с другими неврологическимизаболеваниями снижена представленность родов Dethiosulfatibacter, Victivallis,MethanosphaeraпосравнениюсконтрольнойгруппойиParabacteroides по сравнению с пациентами с болезнью Паркинсона.Desulfovibrio,88Рисунок 25 — график содержания семейств микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки).
Стороныграфиков отображают кривые плотности распределения содержания микроорганизмов, краснаячерта показывает медиану представленности микроорганизмов, фиолетовая точка показываетсреднее значение представленности микроорганизмов, разброс показывает стандартноеотклонение содержания микроорганизмов.
* — по сравнению с контролем, # — по сравнению сдругими неврологическими заболеваниями, p<0,05.89Таблица 6. Различия в содержании микроорганизмов на уровне родовОбразцов, Образцов,ОТЕ,ОТЕ,контрольБПконтрольБПKlebsiella146066613Sphingomonas2458106Enterococcus216571361Succinivibrio73423203Staphylococcus320350p-75-a564019152Cloacibacillus64436193Catonella185763244Lebetimonas5171250Peptoniphilus9332187Christensenella154933150Dethiosulfatibacter10262652Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с болезнью ПаркинсонаОТЕ,Образцов, Образцов,РодОТЕ, БП ДругиеБПДругие НЗНЗDesulfovibrio551436469Parabacteroides95312338500Gardnerella1191818Blautia9532175029937Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиОТЕ,Образцов, Образцов,ОТЕ,РодДругиеконтроль Другие НЗ контрольНЗSuccinivibrio792377Klebsiella141766100Dethiosulfatibacter105268Sphingomonas210828Peptostreptococcus8161641Victivallis32104Methanosphaera832414Gardnerella49718Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиРодlogFCp-значения1,27340,01961,18610,00021,09230,00191,04550,01650,99010,00040,96480,01650,94900,02610,75150,03670,74030,04210,72170,03630,71720,0167-0,63990,0173содержания ОТЕ уlogFCp-значения-0,89530,0250-0,75120,00360,64910,02060,57710,0421содержания ОТЕ уlogFCp-значения1,23790,01021,08010,0167-0,99170,00020,97030,00170,95290,0006-0,78880,0041-0,76220,03630,65140,0165содержания ОТЕ у90Рисунок 26 – графики содержания родов микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки).
Стороныграфиков отображают кривые плотности распределения содержания микроорганизмов, краснаячерта показывает медиану представленности микроорганизмов, фиолетовая точка показываетсреднее значение представленности микроорганизмов, разброс показывает стандартноеотклонение содержания микроорганизмов. * — по сравнению с контролем, p<0,05.91Рисунок 27 – графики содержания родов микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки).
Стороныграфиков отображают кривые плотности распределения содержания микроорганизмов, краснаячерта показывает медиану представленности микроорганизмов, фиолетовая точка показываетсреднее значение представленности микроорганизмов, разброс показывает стандартноеотклонение содержания микроорганизмов. * — по сравнению с контролем, # — по сравнению сдругими неврологическими заболеваниями, ^ - по сравнению с пациентами с болезньюПаркинсона, p<0,05.92Рисунок 28 — графики содержания родов микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки). Стороныграфиков отображают кривые плотности распределения содержания микроорганизмов, краснаячерта показывает медиану представленности микроорганизмов, фиолетовая точка показываетсреднее значение представленности микроорганизмов, разброс показывает стандартноеотклонение содержания микроорганизмов.
* — по сравнению с контролем, # — по сравнению сдругими неврологическими заболеваниями, p<0,05.На видовом уровне (таб. 7, рис. 29-30) микробиота пациентов с болезньюПаркинсона отличалась ростом представленности бактерий Bifidobacterium breve,Lactobacillus mucosae, Sphingomonas yabuuchiae, Staphylococcus epidermidis,93Bifidobacterium bifidum и Pseudomonas veronii по сравнению с контрольнойгруппой и Bacteroides eggerthii, [Eubacterium] cylindroides, Bifidobacterium breveпо сравнению с пациентами с другими неврологическими заболеваниями.
В своюочередь, у пациентов с другими неврологическими заболеваниями отмечалосьповышение представленности Sphingomonas yabuuchiae и снижение содержанияVictivallis vadensis и Prevotella pallens по сравнению с контрольной группой.Таблица 7. Различия в содержании микроорганизмов на уровне видовВидОбразцов,контрольОбразцов,БПОТЕ,контрольОТЕ,БПBifidobacterium2426128breveLactobacillus165889522mucosaeSphingomonas2458106yabuuchiaeStaphylococcus320350epidermidisBifidobacterium156571382bifidumPseudomonas313627veroniiПоложительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с болезнью ПаркинсонаВидОбразцов,Образцов,ОТЕ, БПОТЕ,БПДругие НЗДругиеНЗBacteroides58831240eggerthii[Eubacterium]32616516cylindroidesBifidobacterium42512812breveПоложительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиВидОбразцов,Образцов,ОТЕ,ОТЕ,контрольДругие НЗ контрольДругиеНЗSphingomonas210828yabuuchiaeVictivallis vadensis32104Prevotella pallens94178Положительные значения logFC свидетельствуют о повышениипациентов с другими неврологическими заболеваниямиlogFCp-значения1,59230,00001,25100,02691,18610,00010,99010,00030,78510,03530,70890,0200содержания ОТЕ уlogFCp-значения-1,43460,0008-1,36570,0032-0,80390,0168содержания ОТЕ уlogFC0,9703p-значения0,0011-0,78880,0030-0,57270,0269содержания ОТЕ у94Рисунок 29 — графики содержания видов микроорганизмов в микробиоте кишечника.На графике отображена представленность микроорганизмов в группах пациентов с болезньюПаркинсона (БП, зеленые точки), лиц с другими неврологическими заболеваниями (Другие НЗ,синие точки) и пациентов контрольной группы (Контроль, оранжевые точки).