Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_1 (1123313), страница 156
Текст из файла (страница 156)
№г. Веп Свисс. 4, 99Л вЂ” 111А Использование генома человека, чтобы проследить сто эволюцию. Вийозч!е, В., )ойияоп, М.Р., Ггыег, С.М., Гл)ййсоп, Т)1., МшсЬ, К.Я., А СЬа!сгаЬогсу, К. (2005) Сепес!с апа1умя ап«1 асспйисюп о( вктаЬ!а1 (огепякз езййеисе. Спг. Впз МктоЬзай 31, 233 — 254. Как биотехнология исгюл ьзуется для борьбы с биотерраризмом. Сытой, Я.В. (2003) Сепес!ся апй сЬе ваЫай о( Ното изритм. Кайле 422, 849 — 857. СЫвраихее Яез)иепспзй апй Апа1узт Сопзагбизп. (2005) 1шС!а! яециепсе о1 СЬе сйппрапгее йепове апй соврапюп итсЬ сЬе Ьшпап йепопзе.
Лгасиш 427, 69 — 87. Сойиз, ЕЯ., Сгееп, Е.Р., СнбзпасЬег, А.Е., 4 Сиуег, Млй (2003) Л чзйоп (ог сЬе Ьниге о( йепошсся геяеагсЬ. Хапае 422, 835 — 847. Решзт, С. (2005) ВгапсЫпд оис. Хисиге 437, 17 — 19. Как мы можем узнать больше о себе, секве пируя геном приматов. НШ, К.Я. йз Ъа)яй, С.А. (2005) Мо!еси)аг !пя!8Ься !ийз Ьивап Ьгып ечо1 ш!оп. Лгийие 437, 64 — 66. Как можно испол лювать геном ика для понимания особенностей человека и его эволюции.
Ьйегпабопа1 Ншпап Сенате Яециепапй Сопзогбшп (2004) Г!п!яЬ!п8 сЬе еисЬгопзабс зсциепсе о1 сйе Ьивап йепове. №вв 431, 931 — 945. Коогйп, Е«К (2005) ОгсЬо1ойя, рагйойз, апй счо1ибопагу йепов!сз. Алли. Впз Селег. 39, 309 — 338. Хорошее описание некоторых основ сравнительной гсномики. 1апйег, Е.Я., Бийш, Е.М., Витеп, В., ХияЬанв, С., Хойу, М.С., ВаЫвчп, 1., Речив, К., Резчаг, К., Роу!е, М., Н»СсНийЬ, Тсз., еС а1. (2001) 1шба1 яециепсвй апг1 апв1уяЫ о1 сЬе Ьипшп йеповс. Лгавв 409, 860 — 921.
Обсужлсние предварительной икледоватсльности генома, собранной воедино в междунаролном проекте «Геном челонека». В этом номере много других полезных статей. Уепгег,.!.С., Айваз, М.Р., Муегз, Е.ТЬ!, 1з, Р »С'., Мша!, К,!., Янбоп, С.С., ЯпнСЬ, Н.О., Уапйей, М., Ечапз, С.А., Но!1, К.А., еС а1. (2001) ТЬс ясциепсе о( сЬе Ьивап йсповс. 56епсе 291, 1304 — 1351.
Описание предварительного плана иаследавателыюсти генома человека, прелложецного Се)ега Согрогзсюп. Многие другие статьи вэтом же выпуске способствуют пониманию и предоставляют дополнительную информацию. Протсомика Рапйеу, А. А Мани, М. (2000) Ргосеопися в ясийу йепея апй йепопкя. Ыайле 405, 837 — 846. Исключительно хорошее описание различных подходов и метолов определения белков и их функций. ЯйзийЬСоп, К.В. (2005) Лрр11сасюпя о1 РХА вкгоагвуя ш Ью(ойу, Алли. Впз ВазсЬет. 74, 53 — 82. 2Ьи, Н., Вйй!п, М., А Бпуйег, М. (2003) Ргоссоппся. Аппи. Впз Вюгйет. 72, 783 — 812.
Использование биотехнологии Гозсег, Е.А., !оЫ!ий, М.А., Тау1ог, РС., Роппейу, Р, йе Кш)(Т, Р, М!егевеС, К., Хег)а), Т., 8 ТУ!ее-Япйбз, С. (1999) ТЬс ТЬовая )е((егяоп расепису саяе. Файззе 397, 32. Послелняя статья из серии о расследовании интересного дела, в которой демонстрируется исиольжиание биотехнологии для ответа на исторические вопросы. Напзеп, С. йз %68ЬС М.Я. (1999) Кесепс айчапсея си сЬе свпбоппасюп о1 р1апся. Тти(с Р1ипс 5сй 4, 226 — 231. слрйаги, Е.
зг., Коапп, С., А Ъесв,.!. (1996) Сепебс й!яспл пипабоп: рсгярсссгчея о1 сопмзвегя. 56елсе 274, 621-624. «Плюсы» и «минусы» знания о своем генаме. [482] Часть!. 9. Технологии на основе инфориации нз ДПК Майаиа!П, М.В., >гегр, М.Я., Л Аппегаоп, К.К. (1998) Оепейс совпав! ш8: с1ш!еа1 ап<1 е<Ь>са1 сЬайепяе . Авпи. Ви< Севе<. 32, 547 559. ОНА!и, Е.Н., Кайо!о, К.К., Яп, Л Нйои, Я.О.
(2000) Огвя <1!хсавегу !и <Ье пех< пвйеппшш. Аппо. В<в< Р7агтаоо1. Тш>ео!. 40, 177- 19!. ТЬошраоп„). 8. Оопйега!вой).А. (1992) х-(Сагьохуа)йу!) апопо аа<)а: осевггепсе, ауп<йеай, ап<! (вне<шва Аппп. Веп Вюг)<ет. 61, 517 — 557. Основные сведения о структуре и биологических функпяях оппвов. >геппа, 1.М. 8 Т4<ш<ппап, МЛЭ. (2005) Оспе <Ьегару: «геп<у-Пеп селенгу шайс!пе.
Агти. Веп Ввс7<ет. 74, 7! ! — 738. Хорошее опнгапяе перспектив в актуальных пграввчепвй технологии. Вопросы и задачи 1. Клонирование. При соединении двух или более фрагментов ДНК ученые могут подбирать последовательность в месте слияния множеством хитроумных способов, рассл<атриваемых в следующих упражнениях. а) Изобразите структуру каждого конца линейного фрагмента ДНК, образуемого при рестрикции ферментом Есоп! (включая последоватслыюсти, ос<ающиеся от гайта узнавания Есоп!).
Г>) Изобразите структуру, получающуюся в результате реакции этой концевой последовательности с ДНК-полимеразой 1 и четырьмя дезоксинуклеозидтрифосфатами (см. рис. 8-33). в) Приведите послсловатсльность, получающуюся в месте стыковки двух концов с полученной в (б) структурой при их сшивке (слс рис. 25-17). г) Изобразите структуру, получакн пук>ся, сели па структуру из (а) воздействовать нуклеазой, разрушающей только одноцепочсчную ДНК л) Приведите послеловатсльность стыка при сшивке конца со структурой (б) с концом со структурой (г). е) Изобразите структуру конца линейного фрагмента ДНК, образованного при рестрикции ферментол< Иип (рассмотрите последовательности, остающиеся от последовательности распознавания г.<>ип). ж) Приведитс последовательность стыка при спшвке конца со структурой (б) с концом со структурой (е).
з) «Синтезируйте» короткий фрагмент двуцспочечной ДНК с любой последовательностью на ваше усмотрение. На основе этого синтетического фрагмента и методов из пунктов от (а) до (ж) разработайте схему улаления из молекулы ДНК сайта рестрикции ЕсоК! и встраивания нового сайта рестрикции ВаглН! примерно в том же месте (см. рис. 9-3). и) Предложите четыре различных коротких синтетических фрагмента двухнитевой ДНК, которые позволили Г>ы сшить структуру (а) с фрагл<ентом ДНК, образованным прн рестрикции ферментом Рх!1. Водном из э п<х фрагментов скопструируйтс послсдовательн<кть, так чтобы и конечном соединении были последовательности распознавания как ЕсоК!, так и Рм !.
Во втором и третьем фрагментах сконструпруйте послед<>ватсльностп так, чтобы соединение с<>лержало последовательность распознавания либо Есоп!. лиГю Рат! соответственно. В четвертом фрагменте разработайте последовательность так, чтобь> в конечном соединении не бьшо ни сайта рестрикции ЕсоК1, ни Рм!. 2. Отбор рекомбинантных плазмид. При клонировании фрагмента чужеродной ДНК в плазмиде часто бывает полезно вставлять фрагмент па участке, нарушаихцем цезостность селектпрусмоп> маркера (например, геп устойчишюти к тетрацикзину плазмилы рВК322). Потерю своей функции нарушенным геном можно использовать лля обнаружения клонов, содержащих рекомбинантные плазмиды с чужеродной ДНК.
В случае вектора на основе бактериофвщ Х в этом нег необходимости, поскольку можно легко отличить векторы с огромными фрагментами чужеродной ДН К от тех, у которых их цет. Как такие рекомбинантные векторы идентифицируют? 3. Клонирование ДНК. Илазмидный клониру<ощий вектор рВВ322 (см. рнс.
9-4) разрезается энлонуклеазой рестрикции Рх<1. Взятый из эукариотического генома фрагмент ДНК (также полученный разрезанием Рхп) вставляется в приготовленный вектор и сп<ивается. Раствор сшитых таким абразом ДНК затем используется для трансформации бактерий, а бактерии с плазмидами отбирав>тся выращиванием в присутствии тетрациклина. а) Кроме искомой рекомбинантной плазмиды какие еще типы плазмид можно обнаружить среди трансформированных бактерий, устойчивых к тетрациклину? Как их можно различить? б) Фрагмент клонируемой ДНК имеет длину в 1000 и, н., а сайт ЕсоК1 расположен на расстоянии Вопросы и задачи !483! в 250 п.
н. от одного из концов. Три разных рекомбинантных плазмидьз разрезают ЕССК1 и шализируют гель-электрофореэом, дающим приведенные патгерны. Что можно сказать о клонируемой ДНК на основании каждого из патгернов? Имейте в виду что в рВВ322 участки рестрикции Рзг1 и ЕССИ находятся на расстоянии 750 п. н. друг от друга.
Вся плазмида целиком без клонируемой вставки имеет длину 4361 п. н. По маркерам размеров на дорожке 4 можно оценить длину нуклеотидного фрагмента. КОАИЧЕЕТВО вуклестилов 1 500 1 000 750 500 250 4. Идентификация гена белка с известной амивокислотной последовательностью. Используя рис. 27-7 для трансляции генетического кода, предложите ДНК-зонд, который позволил бы идентифицировать ген белка со следующей И-концевой аминокислотной последовательностью. Зонд должен иметь длину от 18 до 20 амияокислот — размер, который обеспечивает надлежащую специфичность, сели имеется достаточная гомология между геном и зондом.