Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_1 (1123313), страница 158
Текст из файла (страница 158)
Чтобы разрешить эту проблему, Келли и Смит определяли 5'-концевые последовательности фрагментов ДНК, образующихся при расщеплении нуклеазой. Для этого был предложен следующий протокол. 1. Обработка ДНК фага Т7 ферментом рестрикции. 2. Обработкаобразуюшихсяфрагмептовщелочной фосфатазой для удаления 5'-фосфатных групп. 3. Обработка полученных на стадии 2 фрагментов полицуклеотидкиназой в присутствии Т-1ккр]АТР лля введения метки в 5'-концы фрагментов ДИК.
4. Обработка меченых фрагментов ДНКазами с целью превращения фрагментов ДНК в смесь моно-, ди- и тринуклеотидов. 5. Определение последовательности меченых моно-, ди- и трипуклеотидов путем их сравнения с олигонуклеотидами с известной последователыюстью с помощью метода тонкослойной хроматографии. Среди меченых продуктов были обнаружены следующие: мононуклеотиды А и С, динуклеотиды 5'-рАрА-3' и 5'-рСрА-3', тринуклеотиды 5'-рАрАрС-3' и 5'-рОрАрС-3'. д) Какая гипотеза о способе расщепления последовательности ДНК нуклеазой согласуется с полученными результатами? Объясните свои рассуждения. Келли и Смит занялись определением Зч концевых последовательностей фрагментов, образующихся при расщеплении ДНК нуклеазой.
Они обнаружили смесь 5'-рТрС-3' и 5'-рТрТ-3'. Им не удалось определить последовательности ни одного тринуклеотида на 3'-конце фрагментов, е) На основании этих данных определите последовательность, узнаваемую нуклеазой, и укажите точное место расщепления нити ДПК внутри этого фрагмента. В качестве модели лля своего ответа используйте табл.
9-2. Литература Кейу, Т,Т. е Яппт(т, Н.О. (1970) А таксист(оп спгуп>е Ггоп> Нестор!>!!ик <и!Тиепгие: Н, Ваке кецпепсе о( <Ьс гесойгпггпп Иге. !. Мо!. Впй. 51, 393 — 409. Я>тйт)>, Н.О. 8 %'11сох, КЛт'. (1970) А пктг(с6оп епауше (гоп> !!актау>Ти!ик т)Тие>так 1. Рпи6сас>пп ап<1 яепега1 рг<>- рег<1ск,!. Мо( Вт( 51, 379-391. ир, отделенный от солеобразующих оснований, был растворен в кипшце спирте.
После охлаждения раствора были получены очень чистые кристал лм, которые были подвергнуты изучению. Поскольку это вещество пока ещ е было описано, я предложил назвать его маргарином — от греч. жемчуг х ках оно имеет некоторое внешнее сходство с перламутром при разноо разных комбинациях солеобразующих оснований в его составе. Мишель-Эжен Шеврель. Р)п1озор)пса1 Мапаг1пе, зВ Липиды 10.1.
Запасные липиды 10.1. Запасные липиды 487 10.2. Структурные липиды в мембранах 496 10.3. Лициды как сигнальные вещества, кофанторы и пигменты 506 10.4. Методы анализа липидов 515 Б иологические липилы прелставляют собой химически разноролную группу соединений, общим и определяющим свойством которых является нерастворимость в воде. Биологические функции лицилов столь же разнообразны, как и их химический состав.
Жиры и масла относятся к главным запасаемым формам знерпги во многих организмах. Фосфолипилы и гтернны — основные структурные элементы биологических мембран. Другие липилы, хотя и присутствуют в относительно малых количествах, играют ключевыс роли в качестве кофакторов ферментов, переносчиков электронов, свстопогзощающих пигментов, гидрофобных якорей лля белков, «шаперонов», способствующих укладке (фоллннгу) мембранных белков, эмульгаторов в пнгцсварительном тракте, гормонов и внутрнклеточных мессенлжеров. Эта глава познакомит нас с прелставнтелями липнлов каждого тина, уделив особое внимание их химической структуре и физическим свойствам.
Порядок изложения материала в ланной главе отражает функциональную организацию лнпилов, однако следует сказать, что су~пествует и лругой способ классификации, в соо'гветствин с которым около тысячи известных лнпилов распрелелям>тся по восьми катего- риям в соответствии с химической структурой и другими критериями (см. табл. 10-3). Окисление линилов — процесс, поставляющий энсргинх мы обсудим в гл.
17, а их синтез — в гл. 21. Жиры и масла, используемые почти универсально в качестве резервуаров энергии в живых организмах, являются произволными жирных кислот. Жирные кислоты — производные углеводородов, находящиеся в таком же низкоокисленном (т. е. высоковосстановленном) состоянии, как и углеволоролы нефтяных и газовых месторождений. Клеточное окисление жирных кислот (ло СОг и Н;О), полобно контролируемому сгоранию бензина в лвигатсле внутреннего сгорания, высокозкзсргонично.
Ниже мы обсудим строение и номенклатуру жирных кислот, наиболее часто встречаннцихся в живых организмах. Чтобы проиллюстрировать разнообразие структуры и физических свойств в атом классе соединений, будут описаны лва типа содержащих жирные кислоты веществ — триглицерилы и носки. Жирные кислоты— производные углеводородов Жирные кислоты — это карбоновые кислоты с углеволоролными цепями длиной от 4 ло 36 угле- родных атомов (ф— См). У некоторых жирных кислот углеролная цепь нсразветвленная и пол- 1488) Часть 1.
10. Липиды Распюрпмость при 30 'С (мг/г растворителя) Трйвйааьйое Систематическое название Температура название *' (происхождение) Йзавлспня ('С) Углеродный Структурна скелет формуда " Вода Бей$«ол 0,063 2600 44,2 12:0 СН$(СН2)КСООН и-2222;$2 Каноаая к$1слога 14:0 СН $(СН2)$2СООН Й' Гатрзд«'к2ик$ззЯ КЙС, К2$З 0,0083 348 16:0 ('Н2$(СН2) „СООН к- Гек$1ь«е кино за я кпелОта 18 0$ СНЗ(СНЗ)КСООН 0.0031 124 22-Окч згюкзпоаая $,$$с кпз 69.6 СН 1( С 1 12 )ЙСО ОН 22"Е$$$К$$2«Я$$ОВЗЯ кнея$пз СН2(СН2)22СООН к-Те1 ргпюззяовзя кислота 16121 ($«) СНЬ(СН' )5СН СН(СН2)2СООН 18."1 (ДК) СН1(СН2)1СН СН(СН,)$(.ООН ц$«с-9-1йксз2$$ вековая кпелОтз Ояеаюззя кислота (ла$2 Ыеию м асею) Лпполыая кислота ($.рсч Е$ЙОЙ вЂ” .$е$$) цй«.-9-О$сг2$2$$ $$сЙовяя юк:лота 16:1 (2~212) СН,(СНЗ)$СНСНС Н2=-:- СН(СЙЗ)«СООН 188(ак$З11) СН,СНЗСН СНСН«СНСЛ 1(С1!2)2СООН 20:4 (2$$Я2$.$«)СНЗ(СН«),СН'- СНСНЗСН=- СНСН.,СН=— СНСН,СН -= С Н(с)12)ЗСО ОП 21222.-„2$Я«2-9.12- Ок$злекздяЕЙОКЗЯ К ЯС2Ю $ З цкс-,цй« ..«122$ -9,12, а-ЛЙ$юлекоззя «ея0$юя $оклОта цл«'чцй«'-,цй«'-, 2$1$2$х$$З«$$к)ЙЯЯ ц$«с-92.8,11,14- к$$е«1тз Эйкемагетрз'е кивая кнелО$а «Все кислоты представлены в неионизо ванной форме.
Прн рН 7 карбокс ильная $руппа всех жирных кислот ионизована. Заметим, что нумерация углеродных атомов начинается с карбоксильного углерола. '* «Й-» обозначает нормальную нерззветвленную структуру. Например, «лодекановая» просто указывет на 12 углеролпых атомов, которые могут давать разные разветвленные формы; «и-лодекаиовая» обозначает линейную, неразветвленную форму. Для ненасыщенных жирных кислот указываетея конфигурация каждой двойной связи; биологические жирные кислоты почти всегла имеют цис-конфгп урацню.
постыл насыщенная (не содержит двойных связей); у других содержит одну или более лвойных связей (табл. 10-1). В состав некоторых соединений входят трехуглеродные кольца, гидроксильные группы или боковые метильные группы. Лзур$пюйзя кпслога (ОТ.$31. Е«2222125 лая 12) МЙ1яктйкова$1 киел$1тз ($$1 лзт. Л(2221ьт2«п, Яил и« скю посо Ореха) 11зльмпт$$кОвзя кислот;:(а 2$ак 12221«Я«2 — пальма) С«езрйяоззя киюютз (ОТ Г$$ЕЧ. ИЕО2' 1ЙЯ$слый жй($) Лрзма«гжа аклотз (от лгпе дп22йек вил «к»32 а) Л$$Г$юц«1ж$ювзя юк лота (лат. 129222«Й$ -- зе1$ык е С$ ха — КОЕК) уиаьмктОясико$3ю$ кн« лоза КЛЮЧЕВЫЕ ДОГОВОРЕННОСТИ.
Упрощенная номенклатура этих соединений основана на длине цепи и количестве двойных связей; соответствующие числа разделяют двоеточием (рис. 10-1, а); например, содержащая 16 углеродных атомов на- 10.1 Запасные липиды [499] О, 4 а 1971(дз) цис-9-Октацепеновая кислота ж 0 ! ! 4 О О 7 О О гО г! П 74 М 74 44 гг 7« И ГО ч ! 7 О Б 4 О О ! б 20:01дз з гг 44 гг) Эйнозапентненовая кислота (ЭПК), омега-3 жирная кислота Рис. 10-1.
Два типа номенклатуры жирных кислот. а) В соответствии со стандартной номеннпатурой номером один обозначают атом углерода карбонсняьной группы (0-1). Положение наждой двойной связи указывают с помощью буквы дельта (б) с надстрочным инденсом, соответствующим атому углерода при двойной связи, ноторый имеет наименьший номер.
б) Для попнненасыщенных кислот используется другая система записи, в которой атомы углерода нумеруются в обратном порядке. Номер один приписывают атому углерода метильной группы на конце цепи; этот атом углерода также обозначают буквой «омегаз (ег, последняя буква греческого алфавита). Положение двойных связей указывают по отношению н ° г-углероду. сыщепная пачьмитиновая кислота сокращенно обозначается 16:О, а 18-углсродная олеиновая кислота с одной двойной связью — 18:1.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
