Главная » Просмотр файлов » Конформационная динамика нуклеиновых кислот при взаимодействии с лигандами

Конформационная динамика нуклеиновых кислот при взаимодействии с лигандами (1098269), страница 41

Файл №1098269 Конформационная динамика нуклеиновых кислот при взаимодействии с лигандами (Конформационная динамика нуклеиновых кислот при взаимодействии с лигандами) 41 страницаКонформационная динамика нуклеиновых кислот при взаимодействии с лигандами (1098269) страница 412019-03-13СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 41)

— Pp. 470–3.74. Micklefield J. Backbone modification of nucleic acids: synthesis, structure andtherapeutic applications. // Curr Med Chem. — 2001. — Aug. — Vol. 8, no.10. — Pp. 1157–79.75. Joyce G. Evolution. Toward an alternative biology.

// Science. — 2012. —Apr. — Vol. 336, no. 6079. — Pp. 307–8.76. Pinheiro V. [et al.] Synthetic genetic polymers capable of heredity and evolution. // Science. — 2012. — Apr. — Vol. 336, no. 6079. — Pp. 341–4.27277. Schoning K. [et al.] Chemical etiology of nucleic acid structure: the alphathreofuranosyl-(3'–>2') oligonucleotide system. // Science.

— 2000. —Nov. — Vol. 290, no. 5495. — Pp. 1347–51.78. Zhang L., Peritz A., Meggers E. A simple glycol nucleic acid. // J Am ChemSoc. — 2005. — Mar. — Vol. 127, no. 12. — Pp. 4174–5.79. Lescrinier E. [et al.] Solution structure of a HNA-RNA hybrid. // ChemBiol. — 2000. — Sept. — Vol. 7, no. 9. — Pp.

719–31.80. Allart B. [et al.] D-Altritol Nucleic Acids (ANA): Hybridisation Properties,Stability, and Initial Structural Analysis // Chemistry – A European Journal. —1999. — Vol. 5, no. 8. — Pp. 2424–2431.81. Nielsen P. [et al.] Sequence-selective recognition of DNA by strand displacement with a thymine-substituted polyamide. // Science. — 1991. — Dec.

—Vol. 254, no. 5037. — Pp. 1497–500.82. Betts L. [et al.] A nucleic acid triple helix formed by a peptide nucleic acidDNA complex. // Science. — 1995. — Dec. — Vol. 270, no. 5243. —Pp. 1838–41.83. Ovaere M. [et al.] How does hydroxyl introduction influence the double helicalstructure: the stabilization of an altritol nucleic acid:ribonucleic acid duplex. //Nucleic Acids Res. — 2012. — Aug. — Vol. 40, no. 15. — Pp. 7573–83.84. Topham C., Smith J.

Orientation preferences of backbone secondary amidefunctional groups in peptide nucleic acid complexes: quantum chemical calculations reveal an intrinsic preference of cationic D-amino acid-based chiralPNA analogues for the P-form. // Biophys J. — 2007. — Feb. — Vol. 92, no.3. — Pp. 769–86.27385. Soliva R. [et al.] Molecular Dynamics Simulations of PNADNA andPNARNA Duplexes in Aqueous Solution // Journal of the American Chemical Society. — 2000. — Vol.

122, no. 25. — Pp. 5997–6008. — eprint: http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja000259h.86. Sen S., Nilsson L. Molecular Dynamics of Duplex Systems Involving PNA:Structural and Dynamical Consequences of the Nucleic Acid Backbone // Journal of the American Chemical Society.

— 1998. — Vol. 120, no. 4. — Pp. 619–631. — eprint: http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja972234x.87. Shields G. C., Laughton C. A., Orozco M. Molecular Dynamics Simulation ofa PNADNAPNA Triple Helix in Aqueous Solution // Journal of the AmericanChemical Society. — 1998. — Vol. 120, no. 24. — Pp. 5895–5904. — eprint:http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja9723444.88. Denning E.

[et al.] Impact of 2'-hydroxyl sampling on the conformationalproperties of RNA: update of the CHARMM all-atom additive force field forRNA. // J Comput Chem. — 2011. — July. — Vol. 32, no. 9. — Pp. 1929–43.89. Case D. [et al.] The Amber biomolecular simulation programs. // J ComputChem. — 2005. — Dec.

— Vol. 26, no. 16. — Pp. 1668–88.90. Cornell W. D. [et al.] A Second Generation Force Field for the Simulation ofProteins, Nucleic Acids, and Organic Molecules // Journal of the AmericanChemical Society. — 1995. — Vol. 117, no. 19. — Pp. 5179–5197. — eprint:http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ja00124a002.91. Beššeoví I. [et al.] Simulations of A-RNA duplexes.

The effect of sequence,solute force field, water model, and salt concentration. // J Phys Chem B. —2012. — Aug. — Vol. 116, no. 33. — Pp. 9899–916.27492. Ode H. [et al.] Force field parameters for rotation around chi torsion axis innucleic acids. // J Comput Chem. — 2008. — Nov. — Vol. 29, no. 15. —Pp. 2531–42.93. Yildirim I. [et al.] Reparameterization of RNA chi Torsion Parameters forthe AMBER Force Field and Comparison to NMR Spectra for Cytidine andUridine. // J Chem Theory Comput. — 2010.

— May. — Vol. 6, no. 5. —Pp. 1520–1531.94. Yildirim I. [et al.] Revision of AMBER Torsional Parameters for RNA Improves Free Energy Predictions for Tetramer Duplexes with GC and iGiC BasePairs. // J Chem Theory Comput. — 2012. — Jan. — Vol. 8, no. 1. — Pp. 172–181.95. Ditzler M. [et al.] Molecular dynamics and quantum mechanics of RNA: conformational and chemical change we can believe in. // Acc Chem Res.

—2010. — Jan. — Vol. 43, no. 1. — Pp. 40–7.96. Baníš P. [et al.] Can We Accurately Describe the Structure of Adenine Tractsin B-DNA? Reference Quantum-Chemical Computations Reveal Overstabilization of Stacking by Molecular Mechanics // Journal of Chemical Theoryand Computation. — 2012. — Vol. 8, no. 7. — Pp. 2448–2460. — eprint:http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/ct3001238.97. Miller M. [et al.] Hydration is a major determinant of the G-quadruplexstability and conformation of the human telomere 3' sequence ofd(AG3(TTAG3)3).

// J Am Chem Soc. — 2010. — Dec. — Vol. 132,no. 48. — Pp. 17105–7.27598. Zheng K. [et al.] Molecular crowding creates an essential environment for theformation of stable G-quadruplexes in long double-stranded DNA. // NucleicAcids Res. — 2010. — Jan.

— Vol. 38, no. 1. — Pp. 327–38.99. Fujimoto T. [et al.] The effects of molecular crowding on the structure andstability of g-quadruplexes with an abasic site. // J Nucleic Acids. — 2011. —June. — Vol. 2011. — P. 857149.100. Webba da Silva M. Geometric formalism for DNA quadruplex folding. //Chemistry. — 2007. — June.

— Vol. 13, no. 35. — Pp. 9738–45.101. Crnugelj M., Sket P., Plavec J. Small change in a G-rich sequence, a dramaticchange in topology: new dimeric G-quadruplex folding motif with unique looporientations. // J Am Chem Soc. — 2003. — July. — Vol. 125, no. 26. —Pp. 7866–71.102. Strahan G., Keniry M., Shafer R. NMR structure refinement and dynamics ofthe K+-[d(G3T4G3)]2 quadruplex via particle mesh Ewald molecular dynamics simulations. // Biophys J.

— 1998. — Aug. — Vol. 75, no. 2. — Pp. 968–81.103. Smith F., Feigon J. Quadruplex structure of Oxytricha telomeric DNA oligonucleotides. // Nature. — 1992. — Mar. — Vol. 356, no. 6365. — Pp. 164–8.104. Haider S., Parkinson G., Neidle S. Crystal structure of the potassium form ofan Oxytricha nova G-quadruplex. // J Mol Biol. — 2002.

— July. — Vol. 320,no. 2. — Pp. 189–200.105. Stefl R. [et al.] Molecular dynamics of DNA quadruplex molecules containinginosine, 6-thioguanine and 6-thiopurine. // Biophys J. — 2001. — Jan. — Vol.80, no. 1. — Pp. 455–68.276106. Spacková N. [et al.] Theoretical study of the guanine –> 6-thioguanine substitution in duplexes, triplexes, and tetraplexes. // J Am Chem Soc. — 2004.

—Nov. — Vol. 126, no. 44. — Pp. 14642–50.107. Lee M. [et al.] Large-scale conformational dynamics of the HIV-1 integrasecore domain and its catalytic loop mutants. // Biophys J. — 2005. — May. —Vol. 88, no. 5. — Pp. 3133–46.108. Koller A. [et al.] Aromatic N versus aromatic F: bioisosterism discoveredin RNA base pairing interactions leads to a novel class of universal baseanalogs. // Nucleic Acids Res.

— 2010. — May. — Vol. 38, no. 9. — Pp. 3133–46.109. Pronk S. [et al.] Copernicus: A new paradigm for parallel adaptive moleculardynamics // High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis(SC), 2011 International Conference for. — Nov. 2011. — Pp. 1–10.110. Lindorff-Larsen K. [et al.] How fast-folding proteins fold. // Science. —2011. — Oct. — Vol. 334, no.

6055. — Pp. 517–20.111. Hünenberger P., McCammon J. Effect of artificial periodicity in simulationsof biomolecules under Ewald boundary conditions: a continuum electrostaticsstudy. // Biophys Chem. — 1999. — Apr. — Vol. 78, 1-2. — Pp. 69–88.112. Klein D. [et al.] The kink-turn: a new RNA secondary structure motif. // EMBOJ. — 2001.

— Aug. — Vol. 20, no. 15. — Pp. 4214–21.113. Rázga F. [et al.] Hinge-like motions in RNA kink-turns: the role of the seconda-minor motif and nominally unpaired bases. // Biophys J. — 2005. — May. —Vol. 88, no. 5. — Pp. 3466–85.277114. Schroeder K. [et al.] A structural database for k-turn motifs in RNA. //RNA. — 2010. — Aug. — Vol. 16, no. 8. — Pp. 1463–8.115. Shankar N. [et al.] The NMR structure of an internal loop from 23S ribosomal RNA differs from its structure in crystals of 50s ribosomal subunits. //Biochemistry. — 2006. — Oct. — Vol. 45, no. 39. — Pp.

11776–89.116. Reblove K. [et al.] An RNA molecular switch: Intrinsic flexibility of 23S rRNAHelices 40 and 68 5'-UAA/5'-GAN internal loops studied by molecular dynamics methods. // J Chem Theory Comput. — 2010. — Jan. — Vol. 2010,no. 6. — Pp.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6451
Авторов
на СтудИзбе
305
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее