Синтез мономеров полиамидных миметиков нуклеиновых кислот и исследование их свойств (1091937)
Текст из файла
Министерство образования и науки Российской ФедерацииФедеральное государственное бюджетное образовательное учреждениевысшего профессионального образования«Московский государственный университет тонких химических технологийимени М.В Ломоносова»на правах рукописиУДК 577.113.4Деженков Андрей Владимирович«СИНТЕЗ МОНОМЕРОВ ПОЛИАМИДНЫХ МИМЕТИКОВНУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ И ИССЛЕДОВАНИЕ ИХ СВОЙСТВ»02.00.10 «Биоорганическая химия»Диссертация на соискание ученой степени кандидата химических наукНаучный руководительД.х.н., проф., акад. РАНВ.И.
ШвецМосква 2015ОглавлениеСписок сокращений .......................................................................................................................3Введение .........................................................................................................................................6Литературный обзор ......................................................................................................................8Метилфосфонаты .....................................................................................................................10Общая характеристика .........................................................................................................10Синтез метилфосфонатов .....................................................................................................10Свойства и применение метилфосфонатов ........................................................................12Фосфотиоаты ............................................................................................................................
16Общая характеристика .........................................................................................................16Синтез фосфотиоатов ...........................................................................................................17Свойства и применение фосфотиоатов ...............................................................................21«Замкнутые» нуклеиновые кислоты ......................................................................................23Общая характеристика .........................................................................................................23Синтез «замкнутых» нуклеиновых кислот .........................................................................25Свойства и применение «закрытые» нуклеиновых кислот ..............................................27Миметики на основе морфолина ............................................................................................
28Общая характеристика .........................................................................................................28Синтез миметиков на основе морфолина ...........................................................................29Свойства и применение миметиков на основе морфолина...............................................31Полиамидные миметики нуклеиновых кислот .....................................................................33Общая характеристика .........................................................................................................33Синтез полиамидных миметиков нуклеиновых кислот ....................................................35Свойства и применение полиамидных миметиков нуклеиновых кислот .......................37Заключение ...............................................................................................................................
42Теоретическая часть ....................................................................................................................44Синтез пуринсодержащих мономеров ПНК. .........................................................................45Синтез защищенных гетероциклических оснований ........................................................45Синтез мономеров ОЗ ПНК .................................................................................................50Подтверждение региоселективности реакции алкилирования пуринсодержащихгетероциклов.
............................................................................................................................ 54Определения оптической чистоты тиминсодержащих мономеров. ....................................57Определение конформаций хиральных ПНК. .......................................................................61Исследование биологической активности полученых гуанинсодержащих производных.....................................................................................................................................................68Экспериментальная часть ...........................................................................................................70Синтез защищенных гетероциклических оснований ........................................................... 71Синтез мономеров полиамидных миметиков нуклеиновых кислот ...................................72Синтез тиминсодержащих энантиомеров ..............................................................................79Синтез димера на основе дейтерированного глицина.
.........................................................82Биологические испытания .......................................................................................................86Выводы. ........................................................................................................................................87Список литературы ......................................................................................................................88Приложения .................................................................................................................................992Список сокращенийАТФ – аденозинтрифосфатВИЧ – вирус иммунодефицита человекаГПНК – гуанидинсодержащие полиамидные миметикиГЭБ – гемато-энцефалический барьерS-ДНК – фосфотиоатыДНК – дезоксирибонуклеиновая кислотаДНКсс – суперскрученная ДНКДМФА – диметилформамидЗНК – “замкнутые” нуклеиновые кислотыКД – круговой дихроизмМО – “морфолино” олигомерыМИД – минимальная инактивирующая длинаНК – нуклеиновые кислотыОЗ ПНК – отрицательно-заряженные ПНКОН – олигонуклеотидыОДН – олигодезоксинуклеотидыПАТ – природные антисмысловые транскриптыПНК – полиамидные миметики нуклеиновых кислот (”пептидно-нуклеиновые кислоты”)рПНК – фосфонатные ПНКПЦР – полимеразная цепная реакцияПЭГ – полиэтиленгликольРНК – рибонуклеиновая кислотаРНКаза – рибонуклеазамРНК – матричная рибонуклеиновая кислотаТГФ – тетрагидрофуранТопо I – топоизомераза IТФС – твердофазный синтезЯМР – ядерный магнитный резонансА(Ade) – аденинAc – ацетилaeg – аминоэтилглицинAll – аллилB(Base) – гетероциклическое основание3Boc – трет-бутилоксикарбонилBn(Bzl) – бензилBT – бензотриазолилBz – бензоилС(Сyt) – цитозинCbz – карбобензоксикарбонилСE – цианоэтилCOSY – гомоядерная корреляционная спектроскопияdba – (E, E)-дибензилиденацетонDEAD – диэтилазодикарбоксилатDCC – дициклогексилкарбодиимидDCE – дихлорэтанDCM – дихлорметанDhbtOH – 3-гидрокси-1,2,3-бензотриазин-4(3H)-онDIEA – диизопропилэтиламинDMTr – диметокситритилDPC – дифенилкарбамоилDQF – двухквантовая фильтрацияG(Gua) – гуанинGFP – зелёный флуоресцентный белокGly – глицинHMBC – гетероядерная многосвязная корреляцияHRMS – масс-спетрометрия высокого разрешенияHSQC – гетероядерная одноквантовая корреляцияHSV – вирус простого герпесаHypНК – гидроксипролиновые ПНКIBCF – изо-бутилхлорформиатМе – метилMmt – монометокситритилМОЕ – метоксиэтилMs – мезил- (метилсульфонил-)NMM – N-метилморфолинNs – орто-нитробензолсульфонилIBCF – изо-бутилхлорформиатiBu – изо-бутирил4Im – N-метилимидазолiPr – изопропилPg – защитная группаSNP – полиморфизм единичного нуклеотидаT(Thy) – тиминtBu – трет-бутилTEA – триэтиламинTEDT – тетраэтилтиурам дисульфидTFA – трифторуксусная кислотаTMSOTf – триметилсилилтрифторсульфонатTPP – трифенилфосфинU(Ura) – урацил5ВведениеСовременные биохимические и биомедицинские технологии направлены на поискмолекулярных инструментов для диагностики и лечения различных заболеваний.
Характеристики
Тип файла PDF
PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.
Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.