Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1090326), страница 42

Файл №1090326 Диссертация (Структурные и каталитические свойства ферментов перекисного окисления липидов – 1215-липоксигеназ) 42 страницаДиссертация (1090326) страница 422018-01-18СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 42)

Imaging the migration pathways forO2, CO, NO, and Xe inside myoglobin // Biophys. J. 2006. V. 91. P. 1844–1857.251.Saam J., Ivanov I., Walther M., Holzhütter H.-G., Kuhn H. Molecular dioxygenenters the active site of 12/15-lipoxygenase via dynamic oxygen access chanels// Proc. Natl. Acad.

Sci USA 2007. V. 104. P. 13319–13324.252.Moin S.T., Hofer T.S., Sattar R., Ul-Haq Z. Molecular dynamics simulation ofmammalian 15S-lipoxygenase with AMBER force field // Eur. Biophys. J. 2011. V.40. P. 715–726.253.Krissinel E., Henrick K. Inference of macromolecular assemblies from crystallinestate // J.

Mol. Biol. 2007. V. 372. V. 774–797.254.Ivanov I., Di Venere A., Horn T., Scherer P., Nicolai E., Steling S., SkrzypczakJankun E., Mei G., Maccarrone M., Kühn H. Tight association of N-terminal andcatalytic subunits of rabbit 12/15-lipoxygenase is important for protein stabilityand catalytic activity // Biochim. Biophys. Acta 2011. V. 1811. P. 1001–1010.255.Cauët E., Rooman M., Wintjens R., Liévin J., Biot C. Histidine-aromaticinteractions in proteins and protein–ligand complexes: quantum chemical study ofX-ray and model structures // J. Chem.

Theory Comput. 2005. V.1. P. 472–483.227256.Churchill C.D., Wetmore S.D. Noncovalent interactions involving histidine: theeffect of charge on pi–pi stacking and T-shaped interactions with the DNAnucleobases // J. Phys. Chem. B 2009. V. 113.

P. 16046–16058.257.Bhattacharyya R., Samanta U., Chakrabarti P. Aromatic–aromatic interactions inand around alpha-helices // Protein Eng. 2002. V. 15. P. 91–100.258.Kannan N., Vishveshwara S Aromatic clusters: a determinant of thermal stabilityof thermophilic proteins // Protein Eng.

2000. V. 13. P. 753–761.259.Shang W., Ivanov I., Svergun D.I., Borbulevych O.Y., Aleem A.M., Stehling S.,Jankun J., Kühn H., Skrzypczak-Jankun E. Probing dimerization and structuralflexibility of mammalian lipoxygenases by small angle X-ray scattering // J. Mol.Biol. 2011. V. 409.

P. 654-663.260.Yang J.T., Wu C.S., Martinez H.M. Calculation of protein conformation fromcircular dichroism // Methods Enzymol. 1986. V. 130. P. 208–269.261.Lami H., Glasser N. Indole's solvatochromism revisited // J. Chem. Phys. 1986. V.84. P. 597–604.262.Valeur B., Weber G. Resolution of the fluorescence excitation spectrum of indoleinto the 1La and 1Lb excitation bands// Photochem. Photobiol. 1977.

V. 25. P.441–444.263.Callis P.R. 1La and 1Lb transitions of tryptophan: applications of theory andexperimental observations to fluorescence of proteins // Methods Enzymol. 1997.V. 278. P. 113–150.264.Di Venere A., Mei G., Gilardi G., Rosato N., De Matteis F., McKay R., Gratton E.,Finazzi-Agrò A.

Resolution of the heterogeneous fluorescence in multi-tryptophanproteins: ascorbate oxidase // Eur. J. Biochem. 1998. V. 257. P. 337–343.265.Mei G., Pugliese L., Rosato N., Toma L., Bolognesi M., Finazzi-Agrò A. Biotin andbiotin analogues specifically modify the fluorescence decay of avidin // J. Mol.Biol. 1994. V. 242. P. 559–565.228266.Gan Q.-F., Browner M.F., Sloane D.L., Sigal E. Defining the arachidonic acidbinding site of human 15-lipoxygenase //J. Biol. Chem.

1996. V. 271. P. 25412–25418.267.Ivanov I., Schwarz K., Holzhütter H.G., Myagkova G., Kühn H., Omega-oxidationimpairs oxidizability of polyenoic fatty acids by 15-lipoxygenases: consequencesfor substrate orientation at the active site // Biochem. J. 1998. V. 336. P. 345–352.268.Suardíaz R., Masgrau L., Lluch J.M., González-Lafont A. Regio- andstereospecificity in the oxygenation of arachidonic acid catalyzed by Leu597mutants of rabbit 15-lipoxygenase: a QM/MM study // Chemphyschem.

2014. V.15. P. 2303-2310.269.Suardíaz R., Masgrau L., Lluch J.M., González-Lafont A. An insight into theregiospecificity of linoleic acid peroxidation catalyzed by mammalian 15lipoxygenases // J. Phys. Chem .B. 2013. V. 117. P. 3747-3754.270.Di Venere A., Horn T., Stehling S., Mei G., Masgrau L., González-Lafont A., KühnH., Ivanov I. Role of Arg403 for thermostability and catalytic activity of rabbit12/15-lipoxygenase // Biochim. Biophys. Acta 2012.

V. 1831. P.1079–1088.271.Pace C.N. Determination and analysis of urea and guanidine hydrochloridedenaturation curves // Methods Enzymol. 1986. V. 31. P. 266–280.272.Sudharshan E., Rao A.G. Involvement of cysteine residues and domaininteractions in the reversible unfolding of lipoxygenase-1 // J. Biol. Chem.

1999.V. 274. P. 35351–35358.273.Myers J.K., Pace C.N., Scholtz J.M. Denaturant m values and heat capacitychanges: relation to changes in accessible surface areas of protein unfolding //Protein Sci. 1995. V. 4. P. 2138–2148.274.Courtenay E.S., Capp M.W., Saecker R.M., Record Jr M.T. Thermodynamicanalysis of interactions between denaturants and protein surface exposed onunfolding: interpretation of urea and guanidinium chloride m-values and theircorrelation with changes in accessible surface area (ASA) using preferential229interaction coefficients and the local-bulk domain model // Proteins 2000. Suppl.4.

P. 72–85275.Schwarz K., Borngräber S., Anton M., Kuhn H. Probing the substrate alignment atthe active site of 15-lipoxygenases by targeted substrate modification and sitedirected mutagenesis. Evidence for an inverse substrate orientation //Biochemistry 1998. V. 37. P. 15327–15335.276.Krissinel E., Henrick K. Inference of macromolecular assemblies from crystallinestate // J. Mol.

Biol. 2007. V. 372. P. 774–797.277.Lagarde M., Croset M., Authi K.S. Crawford N. Subcellular localization and someproperties of lipoxygenase activity in human blood platelets // Biochem. J. 1984.V. 222. P. 495–500.278.Petoukhov M.V., Svergun D.I. Global rigid body modelling of macromolecularcomplexes against small-angle scattering data //. Biophys. J. 2005. V.

89. P.1237–1250.279.Ivanov I., Shang W., Toledo L., Masgrau L., Svergun D.I., Stehling S., Gomez H.,Di Venere A., Mei G., Lluch J.M., Skrzypczak-Jankun E., Gonzalez-Lafont A.,Kuhn H. Ligand-induced formation of transient dimers of mammalian 12/15lipoxygenase: A key to allosteric behavior of this class of enzymes? // Proteins.2012. V. 80. P. 703–712.280.Konarev P.V., Volkov V.V., Sokolova A.V., Koch M.H.J., Svergun D.I. PRIMUS: aWindows PC-based system for small-angle scattering data analysis // J.

Appl.Crystallogr. 2003. V. 36. P. 1277–1282.281.Di Venere A., Nicolai E., Ivanov I., Dainese E., Adel S., Angelucci B.C., Kuhn H.,Maccarrone M., Mei G. Probing conformational changes in lipoxygenases uponmembrane binding: Fine-tuning by the active site inhibitor ETYA // Biochim.Biophys. Acta. 2014. V. 1841. P. 1–10.282.Kühn H., Holzhütter H.G., Schewe T., Hiebsch C., Rapoport S.M. The mechanismof inactivation of lipoxygenases by acetylenic fatty acids // Eur.

J. Biochem. 1984.V. 139. P. 577–583230283.Alber T. Structure of the leucine zipper // Curr. Opin. Genet. Dev. 1992. V. 2. P.205–210.284.Nikolaev Y., Pervushin K. Rethinking leucine zipper—a ubiquitous signaltransduction motif. Nat. Preced. 2009. hdl:10101/npre.2009.3271.1.286.Guerois R., Nielsen J.E., Serrano L. Predicting changes in the stability of proteinsand protein complexes: a study of more than 1000 mutations. J. Mol. Biol. 2002.V. 320.

P. 369–387.287.Simons K.T., Kooperberg C., Huang E., Baker D. Assembly of protein tertiarystructures from fragments with similar local sequences using simulated annealingand Bayesian scoring functions // J. Mol. Biol. 1997. V. 268. P. 209–225.288.Sloane D.L., Dixon R.A., Craik C.S., Sigal E. Expression of cloned human 15lipoxygenase in eukaryotic and prokaryotic systems // Adv ProstaglandinThromboxane Leukot.

Res. 1991. V. 21A. P. 25–28.289.Chaitidis P., Adel S., Anton M., Heydeck D., Kuhn, H., Horn, T. Lipoxygenasepathways in Homo neanderthalensis: functional comparison with Homo sapiensisoforms // J. Lipid Res. 2013. V. 54. P. 1397–1409.290.Adel S., Kakularam K.R., Horn T., Reddanna P., Kuhn H., Heydeck D.Leukotriene signaling in the extinct human subspecies Homo denisovan andHomo neanderthalensis.

Structural and functional comparison with Homo sapiens// Arch. Biochem. Biophys. 2015. V. 565. P. 17–24.291.Pekarova M., Kuhn H., Bezakova L., Ufer C., Heydeck D. Mutagenesis of triaddeterminants of rat Alox15 alters the specificity of fatty acid and phospholipidoxygenation // Arch. Biochem. Biophys. 2015. V. 571. P. 50–57.292.I. Ivanov, H. Kuhn, D. Heydeck / Molekular and structural biology of arachidonicacid 15-Lipoxygenase (ALOX15) // Gene, 2015. doi: 10.1016/j.gene.2015.07.073.293.Horn T., Ivanov I., Di Venere A., Kakularam K.R., Reddanna P., Conrad M.L.,Richter C., Scheerer P., Kuhn H.

Molecular basis for the catalytic inactivity of a231naturally occurring near-null variant of human ALOX15 // Biochim. Biophys. Acta2013. V. 1831. P. 1702–1713.294.Watson S.C., Eastman J.F. Colored indicators for simple direct titration ofmagnesium and lithium reagents J. Organomet. Chem. 1967. V. 9. P. 165–168.295.Houben-Weyl Methods of Organic Chemistry Vol. IX, 4th Edition, Thieme Verlag1955. P. 1009.296.Keimatsu S., Yokota K., Satoda I. Organoselenium Compaunds// YakugakuZasshi 1933.

V. 53. P. 994–1046.297.Humphrey W., Dalke A., Schulten K. VMD-visual molecular dynamics // J. Mol.Graphics 1996. V. 14. P. 33-38.298.LougheedT.,BorisenkoV.,HennigT.,Rück-BraunK.,WoolleyA.Photomodulation of ionic current through hemithioindigo-modified gramicidinchannels // Org Biomol. Chem.

Характеристики

Список файлов диссертации

Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее