Тимин О.А. Лекции по общей биохимии2020 (832729), страница 16
Текст из файла (страница 16)
Пероксидазы – оксидоредуктазы, катализирующие реакции с пероксидом водорода в качестве акцептора электронов.Систематическое название образуется:Донор электронов : акцептор электронов – оксидоредуктаза.Пример 1Систематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторыХарактеристика ферментаАлкоголь:НАД-оксидоредуктазаАлкогольдегидрогеназа1. ОксидоредуктазыНикотинамидадениндинуклеотид. Железо или цинк.Ферменты74Пример 2Характеристика ферментаСукцинат:ФАД-оксидоредуктазаСукцинатдегидрогеназа1.
ОксидоредуктазыФлавинадениндинуклеотидСистематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторПример 3Характеристика ферментаФенилаланин.Тетрагидробиоптерин:кислород-оксидоредуктазаФенилаланин-4-монооксигеназа1. ОксидоредуктазыТетрагидробиоптерин. Железо.Систематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторыIIК ЛАСС .ТР АНС ФЕР АЗЫКатализируют реакции переноса различных групп от одного субстрата (донор) к другому(акцептор), участвуют в реакциях взаимопревращения различных веществ, обезвреживанияприродных и чужеродных соединений. Коферментами являются пиридоксальфосфат, коэнзим А, тетрагидрофолиевая кислота, метилкобаламин.
Класс подразделяется на 9 подклассов.В подклассы выделяются группы ферментов в зависимости от состава переносимойгруппы (одноуглеродные фрагменты, альдегидные и кетогруппы, азотсодержащие группы,фосфорсодержащие). На подподклассы деление производится в зависимости от вида переносимой группы – метил, карбоксиметил или формил, аминогруппы.Распространенным рабочим названием трансфераз является термин киназы. Кним относят ферменты, переносящие фосфатную группу от АТФ к какому-либосубстрату (моносахарид, белок).biokhimija.ruТимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)75Систематическое название образуется:Донор группы : акцептор группы – переносимая группа трансфераза.Пример 1Характеристика ферментаАТФ:D-гексоза-6-фосфотрансферазаГексокиназа2. ТрансферазыМагнийСистематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторПример 2Характеристика ферментаL-Аспартат:2-оксоглутарат-аминотрансферазаАспартатаминотрансфераза2.
ТрансферазыПиридоксальфосфатСистематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторПример 3Характеристика фермента5-метилтетрагидрофолат:L-гомоцистеинS-метилтрансферазаМетионинсинтаза2. ТрансферазыКобаламин. Цинк.Систематическое названиеРабочее названиеКлассКофакторIIIКЛ АСС.Г ИДРОЛ АЗЫГидролазы – ферменты, осуществляющие разрыв внутримолекулярных связей в субстрате путем присоединения элементов Н2О, подразделяются на 13 подклассов.
Коферментыотсутствуют. Ввиду сложности многих субстратов у ряда ферментов сохранены тривиальныеназвания, например, пепсин, трипсин. Исторически названия гидролаз складывались из названия субстрата с окончанием "-аза" – коллагеназа, амилаза, липаза, нуклеаза, ДНК-аза.Ферменты76Примером подклассов служат группы ферментов, действующие на сложные эфиры, напростые эфиры, на пептиды, на углерод-углеродные связи.Гидролазы представлены ферментами желудочно-кишечного тракта (пепсин, трипсин,липаза, амилаза и другие) и лизосомальными ферментами.
Осуществляют распад макромолекул, образуя легко адсорбируемые мономеры.Наиболее часто встречаются следующие рабочие названия гидролаз:1. Эстеразы – гидролиз сложноэфирных связей.2. Липазы – гидролиз нейтральных жиров.3. Фосфатазы – отщепление фосфатов от фосфорилированных соединений.4. Гликозидазы – гидролизуют О- и S-гликозидные связи.5.
Протеазы, пептидазы – гидролиз белков и пептидов.6. Нуклеазы – гидролиз нуклеиновых кислот.В подклассы выделяют группы ферментов, катализирующие гидролиз, например, сложных эфиров, пептидов, углерод-углеродных связей, связей фосфор-азот и т.п. Среди подподклассов выделяют, например, гидролазы карбоновых кислот, гидролазы фосфомоноэфиров.Систематическое название образуется:Гидролизуемый субстрат : отделяемая группа гидролаза.Пример 1Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика ферментаТриацилглицерол:ацилгидролазаТАГ-липаза3.
ГидролазыПример 2Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика фермента-D-глюкозид:глюкогидролазаМальтаза3. Гидролазыbiokhimija.ruТимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)77Пример 3Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика ферментаАцетилхолин:ацетил-гидролазаАцетилхолин эстераза3. ГидролазыIVК ЛАСС.Л ИАЗ ЫЛиазы – ферменты, катализирующие разрыв С-О, С-С, C-N и других связей, а также обратимые реакции отщепления различных групп негидролитическим путем. Выделяют 7 подклассов.
Эти реакции сопровождаются образованием двойной связи или присоединениемгрупп к месту двойной связи. Лиазы являются сложными ферментами. Коферментами служатпиридоксальфосфат, тиаминдифосфат, участвует магний, кобальт.Примером подклассов являются ферменты, например, действующие на углерод-углеродные связи, углерод-кислородные связи, углерод-азотные связи. Среди подподклассов выделяют карбокси-лиазы, гидро-лиазы.Систематическое название образуется:Расщепляемый субстрат : отделяемая группа – лиазаПример 1Систематическое названиеРабочее названиеКлассКоферментХарактеристика фермента2-оксокислота:карбокси-лиазаПируватдекарбоксилаза4.
ЛиазыТиаминдифосфатПример 2Систематическое названиеРабочее названиеКлассКоферментХарактеристика ферментаГистидин:карбокси-лиазаГистидин-декарбоксилаза4. ЛиазыПиридоксальфосфатФерменты78Пример 3Характеристика ферментаАТФ:дифосфат-лиаза (циклизующая)Аденилатциклаза4. ЛиазыСистематическое названиеРабочее названиеКлассVКЛ АСС .ИЗО МЕР АЗЫИзомеразы – ферменты, катализирующие изомерные превращения в пределах одной молекулы. Изомеразы – сложные ферменты.
К их коферментам относятся пиридоксальфосфат,дезоксиаденозилкобаламин, глутатион, фосфаты моносахаридов (глюкозо-1,6-дифосфат) идр.Подклассы выделяют в зависимости от типа реакции. Например, выделяют рацемазы(обратимое превращение L- и D-стереоизомеров) и эпимеразы (превращения D,L-изомеров,имеющих более одного центра асимметрии, например, -D-глюкозу в -D-глюкозу), другиеподклассы – цис-транс-изомеразы, внутримолекулярные трансферазы (мутазы), внутримолекулярные оксидоредуктазы.
Среди подподклассов выделяют действующие на аминокислотыи их производные, на углеводы и их производные, перемещающие С=С-связи.Систематическое название образуется:Субстрат – [ ] – реакция, где [ ] – обозначение, отражающее суть реакции, например, "номер изменяемого атома углерода", изменение "цис-транс", изменение "кето-енол", изменение"альдозо-кетозо".Пример 1Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика ферментаD-рибулозо-5-фосфат-3-эпимеразаРибулозофосфат-3-эпимераза5.
ИзомеразыПример 2biokhimija.ruСистематическое названиеРабочее названиеКлассТимин О.А. Лекции по общей биохимии (2020г)79Характеристика ферментаD-глицеральдегид-3-фосфат-альдозо-кетозо-изомеразаТриозофосфат-изомераза5. ИзомеразыПример 3Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика фермента-D-глюкозо-1,6-фосфомутазаФосфоглюкомутаза5. ИзомеразыVIК ЛАСС.Л ИГ АЗЫЛигазы (синтетазы) – ферменты, катализирующие присоединение друг к другу двух молекул с использованием энергии высокоэнергетических связей АТФ (или других макроэргов).Лигазы – сложные ферменты. Они содержат нуклеотидные (УТФ), биотиновые (витамин Н),фолиевые коферменты.
Выделяют 6 подклассов.Примером подклассов служат группы ферментов по виду образуемой связи: углеродкислород, углерод-сера, углерод-азот, углерод-углерод. Среди подподклассов выделяют ферменты, синтезирующие соединения типа кислота-тиол, амиды.а. Систематическое название образуется:Субстрат 1 : субстрат 2 – лигазаПример 1Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика ферментаL-глутамат:аммиак-лигазаГлутаминсинтетаза6.
ЛигазыПример 2Систематическое названиеРабочее названиеКофакторыХарактеристика ферментаПируват:карбокси-лигаза (АДФ-образующая)ПируваткарбоксилазаБиотин. Магний. Цинк.Ферменты80Пример 3Систематическое названиеРабочее названиеКлассХарактеристика ферментаСукцинат:КоА-лигазаСукцинил-КоА-синтетазаСукцинат-тиокиназа6. ЛигазыО Б ЩИ Е П УТ И Б ИО Л О ГИ Ч ЕСК О ГОО КИС Л ЕНИ ЯМетаболизм представляет собой высоко координированную и целенаправленную клеточную активность, обеспеченную участием многих взаимосвязанных ферментативных систем.Он выполняет три специализированные функции:1. Энергетическая – снабжение клетки химической энергией,2. Пластическая – синтез макромолекул как строительных блоков,3.