1625913344-8903f4a71ad640872a209e228a3a0bd4 (531148), страница 104
Текст из файла (страница 104)
Фермент — димер,поэтому у гетерозигот видны три зоны активности. Средняя зона — гибридный фермент.Г — маликэнзим мыши Mus musculus. Фермент — тетрамер, состоящий из идентичныхсубъединиц: 1, 3 — гомозиготы; 2 — гетерозигота, дающая вследствие случайнойкомбинаторики субъединиц пять изозимов.Д — мышечная лактатдегидрогеназа кеты Oncorhynchus keta.Видны две группы изозимов (показаны фигурными скобками). В каждой группе —ферменты-тетрамеры, кодируемые двумя генами. Гены LDH I I — в гомозиготе. Поодному из двух генов, кодирующих LDH I, — гетерозиготность АА': 1 и 2 — гомозиготы,3 — гетерозигота. Поскольку при использованном методе положение ряда изозимовперекрывается, у гетерозигот обнаружено 9 полос вместо 15.Данные получены разными методами. Во всех случаях стрелка указывает стартГлава 20.
Генетические основы эволюции. Генетика популяций557ков (см. гл. 16, рис. 16.17). Особенно сложно выявить в гетерозиготетак называемые нулевые аллели, несущие нонсенс-кодоны и вследствие этого не представленные активными ферментными молекулами в изозимном спектре. Существуют и другие причины отсутствияферментативной активности.Разрешающая способность анализа электрофоретических вариантов может быть повышена, если сравнивать подвижность не целыхмолекул фермента, а его пептидов, полученных после протеолитического расщепления. При этом применяют не только одномерный, нои двумерный форез или хроматографию.
Так удается обнаружить дополнительные различия, ускользающие при использовании методаобычного электрофореза целых белков. Наконец, с появлением меченых зондов — клонированных копий отдельных генов — стал возможен анализ непосредственно вариантов самих генов, сравнениеэлектрофоретической подвижности фрагментов геномной ДНК, расщепляемой той или иной рестриктазой. При этом конкретные геныи их фрагменты выявляют по гибридизации с мечеными зондами —клонированными фрагментами ДНК.
Подобный подход позволяетучитывать гетерогенность популяции по длине рестрикционныхфрагментов (rflp — restriction fragments length polymorphism) и дажевыявляет замены отдельных нуклеотидов (snp — single nucleotidespolymorphism).Методы зимограмм, rflp, snp для оценки генетической гетерогенности популяций получили широкое распространение. Исследоватьсотню особей из популяции, например, по двум десяткам ферментовстало вполне реальным делом.
Как при этом оценивать полученныерезультаты количественно? Для этого существуют две величины: полиморфизм (Р) и гетерозиготность (Н).Полиморфизм (Р) популяции оценивают долей полиморфных локусов из всех исследованных. Так, из 30 локусов, изученных у калифорнийского морского червя Phoronopsis viridis, в 18 обнаруженыаллельные варианты, а в 12 вариаций не зарегистрировано. В этомслучае Р = 18:30 = 0,60.На материале нескольких популяций одного вида можно вычислить средний полиморфизм.
Например, величина Р была определенаеще для трех популяций P. viridis (табл. 20.4) и составляла соответственно 0,50; 0,53; 0,47. Тогда средний полиморфизм будет:Рср = (0,60 + 0,50 + 0,53 + 0,47)/4 = 0,525.Вероятность обнаружения дополнительных полиморфных локусов среди тех, которые уже были исследованы (например, в табл. 20.4),558 &Часть 5. Генетика и эволюцияТаблица 20.4Полиморфизм (Р) в четырех популяциях Phoronopsis viridis (Ф. Айала, 1984)Число исследованных локусовРПопуляцияполиморфныхвсего1183018/30 = 0,602153015/30 = 0,503163016/30 = 0,534143014/30 = 0,47Рср0,525Таблица 20.5Вычисление средней гетерозиготности популяции (Ф.
Айала, 1984)Число исследованных особейНЛокусгетерозиготвсего1251000,252421000,42391000,09401000Н ср0,19может быть пропорциональна увеличению выборки. В то же времяуровень полиморфизма по разным локусам может быть неодинаков.В связи с этими обстоятельствами возникают вопросы: какую долюполиморфности по данному локусу принимать за значимую? Каквелика должна быть выборка для окончательного суждения? Объективно ответить на эти вопросы трудно. Можно только условнопринять определенный уровень значимости получаемых величин.Поэтому необходимо также сравнивать частоты гетерозиготности(Н) по разным локусам в популяции.Гетерозиготность (Н ) по данному локусу определяют как отношение числа гетерозигот к общему числу исследованных особейпопуляции.На основе данных по отдельным локусам определяют среднююгетерозиготность популяции Нср (табл. 20.5).Реальные представления об уровне гетерозиготности трех популяций дают результаты, полученные Ю.
П. Алтуховым для четырехлокусов у горбуши Oncorhynchus gorbusha (рис. 20.3). Величина Нколеблется между значениями 4 и 20 % .Поскольку популяции, несомненно, различаются по степени панмиксии (например, перекрестноопыляющиеся и самоопылители),Глава 20. Генетические основы эволюции. Генетика популяцийРис. 20.3. Гетерозиготность (Н),выраженная в процентах по генам,контролирующим четыре ферментагорбуши Oncorhynchusgorbusha(Ю. П. Алтухов, 1985)MDH — малатдегидрогеназа, AGP —а -глицерофосфатдегидрогеназа, PGD —6-фосфоглюконатдегидрогеназа, PGM —фосфоглюкомутаза.1, 2, 3 — три разные популяции$3559а также по селективном ценности гетерозигот, то и реальнаягетерозиготность в них будетразличной даже при одинаковыхчастотах аллелей.
С учетом этогообстоятельства вычисляют такназываемую ожидаемую гетерозиготность на основе условногопредположения, что в популяциях всегда осуществляется полнаяпанмиксия. Тогда при наличиичетырех аллелей одного гена счастотами / ;, f 2, f 3, f 4 частота ихгомозигот ожидается как / / , / / ,f / , f 42, а ожидаемая гетерозиготность будет составлять:нет= 1 -(/7+//+//+/ЛСредний полиморфизм (Р)и средняя гетерозиготность (Н)определены для многих видов(рис.
20.4). Беспозвоночные всреднем более генетически изменчивы, чем позвоночные.Нср = 13,4% для первых и 6,0%для вторых. Перекрестноопыляющиеся растения значительно изменчивее, чем самоопылители (Нср = соответственно 19% и 6%).По данным электрофореза, средняя гетерозиготность человеческихпопуляций 6,7 %. Интересно рассмотреть, что означает эта величинадля человека. Примем, что геном человека включает 30 ООО структурных генов. Тогда некоторый средний индивидуум гетерозиготенне менее чем по 30000 х 0,067 = 2010 генам. Следовательно, потенциально такая полигетерозигота могла бы образовать 22010, или около1065 различных типов гамет.
Эта потенциальная комбинативная изменчивость никогда не реализуется ни у отдельного человека, ни увсего человечества. Для сравнения скажем, что по оценкам физиковчисло протонов и нейтронов во Вселенной составляет около 1076.Этот пример показывает, что потенциальные возможности комбинативной изменчивости, основанной на естественной гетерозиготности популяций и видов, составляют колоссальный резервэволюционного процесса.
Таким образом, все развитие генетикипопуляций подтвердило выводы, сделанные в 1926 г. С. С. Четвери-560$?2-о?х3оXо00соосоCDLOЧасть 5. Ггнетика и эволюцияПлодовыемушки__________ОсыДругиенасекомыеМорскиебеспозвоночныеНаземныемоллюскиРыбыаэ-ОX"3оXоЗемноводныеРептилиисосооПтицыМ лекопитающиеБеспозвоночныеазТЗПазазхазCLОПозвоночныеСамоопыляющиесярастения__________________________________|_____________________________________________Перекрестноопыляемые растения------- ----------- 1----------1------- 1------------1--------- 1------ 1-----------Г0369121518Средняя гетерозиготность Нср, %Рис.
20.4. Масштабы изменчивости в генофондах различных организмов - средняягетерозиготность (Дж. Стеббинс, Ф. Айала, 1985)ковым о генетическом полиморфизме природных популяций, о высоком уровне их гетерозиготности.20.6. Элементарное эволюционное событие - изменениечастот аллелей в популяцииИзменение и дивергенция биологических форм во времени, какбыл определен в начале этой главы процесс эволюции, основываются на двух главных явлениях: изменчивости и изменении частот аллелей и генотипов.
Изменение частот аллелей и генотипов в популяции составляет сущность элементарного эволюционного события.Мы убедились, что сам по себе отбор в чистых линиях, т. е. в отсутствие генетической гетерогенности, не создает новых форм. Вме-Глава 20. Генетические основы эволюции. Генетика популяций561сте с тем и наследование в гетерогенной популяции само по себе неизменяет частот аллелей. К изменению частот аллелей и генотипов вгенетически гетерогенной популяции приводит отбор.Изменение частот аллелей и генотипов возможно не только вследствие отбора, но и в результате мутаций, миграции особей, случайного дрейфа генов, изоляции, а также избирательного, или ассортативного скрещивания.
Все эти факторы, действующие в популяциях,называют факторами динамики популяций.ОтборГенетическая гетерогенность, широко распространенная в природных популяциях, составляет основу эффективности дарвиновского естественного отбора.Прямую корреляцию между уровнем гетерогенности популяциии скоростью эволюционного изменения вследствие естественногоотбора математически обосновал Р. А. Фишер (1930) в своей основной теореме естественного отбора : скорость увеличения приспособленности какой-либо популяции в любой отрезок времени равнаее генетической изменчивости по приспособленности в это же время.
В этом случае под приспособленностью понимают относительную скорость воспроизводства.Эта теорема строго приложима только к варьированию засчет аллелей одного локуса и только при определенных условиях среды. Тем не менее понятно, что чем больше изменчивыхгенов и чем больше аллелей каждого гена существует, тем больше шансов для изменения частоты одних аллелей за счет другихпри отборе.Естественный отбор действует на разные группы организмов впопуляции в зависимости от их приспособленности (W). Сравниваяприспособленность нескольких групп особей, наибольшую принимают за единицу, а приспособленность остальных групп выражаютв долях единицы.
Например, если приспособленность для гомозиготАА и гетерозигот Аа равна 1, а для гомозигот аа — 0,9, то интенсивность естественного отбора, или коэффициент отбора (S), вычисляется как S - Wao = 1 - 0,9 = 0,1.Тогда в популяции диплоидных организмов при условии полного доминирования можно рассчитать частоты аллелей в следующемпоколении после начала действия отбора. Распределение генотиповбудет соответствовать представленному в таблице 20.6.Частота аллели А в F, после отбора будет:Р, = (Ро + Ро- S ?/)•562 #Часть 5. Генетика и эволюцияТаблица 20.6Изменение частот генотипов в течение одного поколения при коэффициенте отбора,равном SАААаааСуммадо отбораРо22Ро ЯоЯ,,21в F, после отбораРо22Ро Яо< 7 /0 - S )ГенотипыСоотношениеi - s ^Примечание.
р„ и q,t — частоты аллелей А и а до отбора. Отбор действует противрецессивных гомозиготИзменение частоты аллели А за поколение составит:&Р = Р , ~Ро = (Ро2 + Ро 0оУ О - s Я о )-Р о = $Ро Яо2/ (1 - S я ЛПри малых значениях Sq2A p ~ S p o q 2.Например, если р 0 = 0,9, a qQ= 0,1,то при S = 0,1 Ар ~ 0,1 х 0,9 х 0,12 = 0,00009; р , = 0,9009.При крайних значениях частот аллелей отбор действуетнаименее эффективно. Наиболееэффективен отбор при среднихзначениях р и q. Эту закономерность иллюстрируют кривые нарисунке 20.5, показывающие изменения частоты аллели a (Aq)при отборе против<b>Текст обрезан, так как является слишком большим</b>.