Диссертация (1145883), страница 27
Текст из файла (страница 27)
Различие фенотипов Isp+ и Isp– не связано с биогенезом рибосом, контролируемым белком Sfp1.5. В клонах фенотипа Isp– репрессированы гены, контролирующие импортионов железа в клетку и метаболизм аминокислот, однако такое изменение экспрессии не имеет фенотипического проявления и может бытьсвязано с общим ингибированием роста таких клонов.6. Изменение нормального соотношения компонентов аппарата трансляции, происходящее за счёт приобретения дополнительной хромосомы,может увеличивать выраженность нонсенс-супрессорного фенотипа.143Список сокращений и условных обозначенийаа-тРНК — аминоацил-тРНКАТФ — аденозинтрифосфатГТФ — гуанозинтрифосфатГДФ — гуанозиндифосфатКФ — кислая фосфатазаОТ-ПЦР-РВ — количественная ПЦР в режиме реального времени на матрице реакционной смеси для обратной транскрипцииПГЛ — Петергофские генетические линии S.
cerevisiaeп. н. — пар нуклеотидовПЦМ — проточная цитофлуорометрияПЦР — полимеразная цепная реакцияТФ — транскрипционный факторabslogFC — абсолютное значение двоичного логарифма отношения средних значений экспрессииDAPI — 4’,6-диамино-2-фенилиндолDEG — гены с различающейся экспрессиейGuHCl — гидрохлорид гуанидинаRiBi — биогенез рибосом (от англ. Ribosome Biogenesis)RP — рибосомные белки (от англ. Ribosomal Proteins)SMC — синтетическая среда на основе раствора солей (от англ.
SyntheticMinimal Complete)SC — синтетическая среда на основе YNB (от англ. Synthetic Complete)SNV — однонуклеотидное различие (от англ. Single Nucleotide Variations)ORF — открытая рамка считывания (от. англ Open Reading Frame)Q/N-богатый — обогащённый остатками глутамина и аспарагинаv/v — объём к объёмуYNB — дрожжевая азотная основа (от англ. Yeast Nitrogen Base)В работе использованы стандартные однобуквенные обозначения нуклеотидов, а также однобуквенные и трёхбуквенные обозначения аминокислот(IUPAC-IUB JCBN., 1984).144Список литературы1.
Аксенова А. Ю., Волков К. В., Ровинский Н. С., Свитин А. В., МироноваЛ. Н. Фенотипическое проявление эпигенетического детерминанта[ISP+ ] зависит от комбинации мутаций в генах SUP45 и SUP35 //Молекулярная биология. — 2006. — Т. 40, № 5. — С. 844—849.2. Аксенова А. Ю. Идентификация и характеристика генов, влияющихна поддержание и фенотипическое проявление прионоподобногодетерминанта [ISP+ ], у дрожжей Saccharomyces cerevisiae: дис. ...
канд.биол. наук: 03.02.07. — СПб., 2006. — 140 с.3. Волков К. В., Ильмов Е. А., Миронова Л. Н., Инге-Вечтомов С. Г.Свойства мутантного фактора [PSI] — прионоподобного элементадрожжей // Доклады академии наук. — 1997. — Т. 357, № 1. —С. 123—125.4. ВолковК.В.НовыйприоноподобныйдетерминантдрожжейSaccharomyces cerevisiae, вовлеченный в контроль трансляции: дис. ...канд. биол. наук: 03.00.15. — СПб., 2000.
— 130 с.5. Галкин А. П. Идентификация и анализ взаимодействия прионов иамилоидов в протеоме дрожжей Saccharomyces cerevisiae: дис. ... докт.биол. наук: 03.02.07. — СПб., 2015. — 205 с.6. Гогинашвили А. И., Волков К. В., Миронова Л. Н. Использованиеэкспрессионной библиотеки для идентификации генов, сверхэкспрессиякоторых приводит к индукции прионоподобного детерминанта [ISP+ ]у дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Вестник Санкт-Петербургскогоуниверситета. Серия 3.
— 2009. — Т. 4. — С. 94—104.7. Дроздова П. Б., Радченко Э. А., Рогоза Т. М., Хохрина М. А., МироноваЛ. Н. Ген SFP1 контролирует терминацию трансляции у дрожжейSaccharomyces cerevisiae путем регуляции количества белка Sup35(eRF3) // Молекулярная биология. — 2013. — Т. 47, № 2. — С. 275—281.8. Журавлева Г. А., Петрова А.
В. Нарушение псевдогифального ростау мутантов по фактору терминации трансляции eRF1 дрожжей145Saccharomyces cerevisiae // Доклады академии наук. — 2010. — Т. 433,вып. 5. — С. 707—709.9. Захаров И. А., Кожин С. А., Кожина Т. Н., Федорова И. В.Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов / под ред. М. Н.Мейселя. — Л.: Наука, 1984.10. Инге-ВечтомовС.Г.НовыегенетическиелиниидрожжейSaccharomyces cerevisiae // Вест. Ленинградского ун-та. — 1963. —Т. 21, № 4. — С.
117—125.11. Инге-Вечтомов С. Г. Точность реализации генетической информации //Вестник РАН. — 1969. — Т. 8, № 25. — С. 25—30.12. Инге-Вечтомов С. Г. Идентификация некоторых групп сцепления уПетергофских генетических линий дрожжей // Генетика. — 1971.
— Т.VII, № 9. — С. 113—124.13. Инге-Вечтомов С. Г., Андрианова В. М. Рецессивные суперсупрессорыу дрожжей // Генетика. — 1970. — Т. VI, № 11. — С. 103—115.14. Инге-ВечтомовС.Г.,КарповаТ.С.Частнаягенетикадрожжей-сахаромицетов / под ред. Л. Н. Мироновой. — ИздательствоС.-Петербургского университета, 1993. — С.
252.15. Инге-Вечтомов С. Г., Тиходеев О. Н., Карпова Т. С. Селективныесистемы для получения рецессивных рибосомных супрессоров удрожжей сахаромицетов // Генетика. — 1988. — Т. 24, № 7. —С. 1159—1165.16. Кондрашкина А. М., Антонец К. С., Галкин А. П., Нижников А. А.Прионоподобный детерминант [NSI + ] Saccharomyces cerevisiae снижаетэкспрессию гена SUP45 // Молекулярная биология. — 2014. — Т. 48, №5.
— С. 790—796.17. Коченова О. В., Сошкина Ю. В., Степченкова Е. И., Инге-ВечтомовС. Г., Щербакова П. В. Участие ДНК-полимераз репликативногообхода повреждений в поддержании целостности хромосом у дрожжейSaccharomyces cerevisiae // Биохимия. — 2011. — Т. 76, № 1. — С. 62—75.18. Матвеенко А. Г., Землянко О. М., Журавлева Г. А. Идентификация геновSaccharomyces cerevisiae, влияющих на синтетическую летальность146приона [PSI + ] с мутациями в гене SUP45 // Молекулярная биология. —2013.
— Т. 47, № 4. — С. 609—617.19. Москаленко С. Е., Журавлева Г. А., Соом М. Я., ШабельскаяС. В., Волков К. В., Землянко О. М., Филипп М., Миронова Л. Н.,Инге-Вечтомов С. Г. Характеристика миссенс-мутаций в гене SUP45дрожжей Saccharomyces cerevisiae, кодирующем фактор терминациитрансляции eRF1 // Генетика. — 2004. — Т. 40, № 5.
— С. 1—8.20. Мурина О. А., Москаленко С. Е., Журавлева Г. А. Сверхэкспрессиягенов, кодирующих тРНКTyr и тРНКGln , повышает жизнеспособностьнонсенс-мутантов по гену SUP45 дрожжей Saccharomyces cerevisiae //Молекулярная биология. — 2013. — Т. 44, № 2. — С. 301—310.21. НижниковА.А.,МагомедоваЗ.М.,СайфитдиноваА.Ф.,Инге-Вечтомов С. Г., Галкин А. П. Выявление генов, кодирующихпотенциально амилоидогенные белки, участвующих в регуляциинонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae // Экологическаягенетика.
— 2011. — Т. IX, № 4.22. Падкина М. В., Краснопевцева Н. Г., Петрашень М. Г., КожинС. А., Смирнов М. Н. Генетико-биохимическое изучение кислыхфосфатаз Saccharomyces cerevisiae. Сообщение I. Характеристикакислых фосфатаз разных штаммов // Молекулярная биология. — 1974. —Т. 10, № 11. — С. 101—110.23. РадченкоЭ.А.РольгенаSFP1вконтролеэффективностинонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae: дис.
... канд.биол. наук: 03.02.07. — СПб., 2014. — 140 с.24. Рогоза Т. М., Викторовская О. В., Родионова С. А., Иванов М. С.,Волков К. В., Миронова Л. Н. Поиск генов, влияющих на поддержаниеантисупрессорного прионоподобного детерминанта [ISP+ ] у дрожжей, спомощью инсерционной библиотеки генов // Молекулярная биология. —2009. — Т. 43, № 3. — С. 392—399.25. Самбук Е.
В., Тер-Аванесян М. Д. Восстановление активности кислойфосфатазы I и фосфорибозиламиноимидазолкарбоксилазы в результатесупрессии охр-мутаций в генах pho1 и ade2 у дрожжей Saccharomycescerevisiae // Генетика. — 1980. — Т. XVI, № 5. — С. 833—839.14726. Aigle M., Lacroute F. Genetical aspects of [URE3], a non-mitochondrial,cytoplasmically inherited mutation in yeast // Molecular & generalgenetics. — 1975.
— Vol. 136, no. 4. — Pp. 327–235.27. Akhmaloka S. P., Subandi M. F. Mutation at tyrosine in AMLRY (GILRYlike) motif of yeast eRF1 on nonsense codons suppression and bindingaffinity to eRF3 // Int J Biol Sci. — 2008. — Vol. 4. — Pp. 87–95.28. Aksenova A., Muñoz I., Volkov K., Ariño J., Mironova L. The HAL3-PPZ1dependent regulation of nonsense suppression efficiency in yeast and itsinfluence on manifestation of the yeast prion-like determinant [ISP+ ] //Genes to cells.
— 2007. — Vol. 12, no. 4. — Pp. 435–45.29. Alberti S., Halfmann R., King O., Kapila A., Lindquist S. A systematicsurvey identifies prions and illuminates sequence features of prionogenicproteins // Cell. — 2009. — Vol. 137, no. 1. — Pp. 146–58.30. Alksne L. E., Anthony R. A., Liebman S. W., Warner J. R. An accuracycenter in the ribosome conserved over 2 billion years // PNAS U. S. A. —1993. — Vol. 90, no. 20. — Pp. 9538–9541.31. Andrews S. FastQC. A quality control tool for high throughput sequencedata. 2010.
— 2010. — URL: http : / / www. bioinformatics . bbsrc . ac . uk /projects/fastqc/.32. Atkin A. L., Roy K., Bell J. Construction of an opal suppressor byoligonucleotide-directed mutagenesis of a Saccharomyces cerevisiae tRNA(Trp) gene. // Molecular and cellular biology. — 1990. — Vol. 10, no. 8. —Pp. 4379–4383.33.
Balakrishnan R., Park J., Karra K., Hitz B. C., Binkley G., Hong E. L.,Sullivan J., Micklem G., Cherry J. M. YeastMine–an integrated datawarehouse for Saccharomyces cerevisiae data as a multipurpose tool-kit //Database. — 2012. — Vol. 2012. — bar062.34. Bankevich A. et al. SPAdes: a new genome assembly algorithm and itsapplications to single-cell sequencing // Journal of computational biology. —2012. — Vol. 19, no.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
