Направленный мутагенез пенициллинацилазы из Escherichia coli для изменения каталитических свойств и стабильности (1105631), страница 28

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 28)

«Биоинформатический анализ семейства ПА»С целью установления наиболее различающихся остатков внутри семейства ПА иустановления их аминокислотного распределения был проведен биоинформатический анализв программе Zebra [141]. На основании анализа множественного выравнивания былиполучены различные разбиения на подгруппы (п/гр), одно из них представлено в таблице БА1(приведены только позиции, рассматриваемые в данной работе). Позиции отсортированы поуменьшениюспецифичности.характеризующаясяидентичнымСпецифичнойпозициейаминокислотнымсоставомназываетсявнутрипозиция,подгруппы,норазличным внутри группы.200Таблица БА1.

Биоинформатический анализ семейства ПА (с добавлением ГА и АГЛА). Нумерация соответствует ecПА.позиция ранкZPп/гр 1 (ecПА)п/гр 2 (afПА)п/гр 3 (abПА)п/гр 4 (bmПА)п/гр 5*(ГА)п/гр 6* (АГЛА)bF2412,11,0F(100%)F(90%) M(10%)Q(100%)V(100%)L(100%)F(76%) Y(18%)bF7181,89,9·10-1F(80%) A(20%)P(90%) M(10%)S(100%)Y(100%)T(56%) G(18%)T(76%) S(21%)bW154181,68,8·10-1W(100%)W(100%)W(100%)Y(100%)W(38%) Y(34%)W(77%) S(7%)bN388251,65,6·10-1N(100%)N(60%) R(30%)Q(100%)D(100%)н.д.н.д.bI177261,65,2·10-1I(85%) V(15%)I(100%)I(100%)L(100%)F(90%) Y(4%)V(93%) F(4%)bD484481,55,8·10-3D(50%) N(50%)N(80%) D(20%)F(90%) Y(10%)H(100%)A(76%) S(8%)Q(93%) M(5%)bW500501,47,0·10-3 W(50%) V(40%)C(100%)C(100%)F(100%)M(26%) Y(20%)Q(31%) R(25%)bM485561,41,6·10-3M(65%) L(35%)R(90%) K(10%)R(80%) Q(20%)Y(100%)A(56%) M(20%)V(40%) A(20%)bR533621,31,1·10-3R(25%) K(30%)C(100%)C(100%)F(100%)L(46%) F(24%)W(67%) L(22%)aS149*680,45,8·10-7S(16%) A(32%)T(75%) Y(25%)A(80%) S(8%)N(75%) I(25%)S(39%) N(37%)G(100%)bE2661161,03,8·10-7E(80%) V(10%)E(100%)E(90%) A(10%)Q(100%)R(65%) Q(19%)F(51%) G(14%)bI3291500,85,4·10-8I(35%) M(40%)M(50%) Q(20%) K(90%) R(10%)L(100%)Q(36%) E(18%)R(41%) T(21%)bR2971540,81,5·10-8R(90%) G(10%)R(90%) D(10%)R(100%)N(75%) H(25%)D(88%) E(8%)D(22%) E(18%)bL2201960,53,1·10-8L(20%) M(35%)I(80%) V(10%)F(90%) L(10%)F(100%)Y(24%) T(20%)I(68%) L(14%)bE482276-0,2 7,3·10-2E(100%)E(80%) Q(20%)A(90%) L(10%)E(100%)Y(38%) W(33%)Y(86%) F(9%)bF256324-0,6 9,3·10-1F(45%) I(35%)Y(70%) M(10%)S(90%) A(10%)Y(50%) F(25%)P(90%) L(4%)Q(43%) R(18%)bQ292352-0,9Q(10%) A(40%)S(60%) A(20%)S(90%) A(10%)A(100%)R(72%) Q(8%)R(33%) E(25%)1,0* - приведены данные из различных разбиений.

Z - очки за специфичность, в соответствии с нормальным распределением. P статистическая значимость результата..

Характеристики

Список файлов диссертации