Отзыв официального оппонента 2 (1097593), страница 2
Текст из файла (страница 2)
В Заключении работы автор приводят основные результаты работы и делает выводы по применению разработанных компьютерных методов для оценки эффективности лекарственных препаратов, направленных на ингибирование клеточных рецепторов и протеи-киназ в сигнальных путях раковых клеток с различным набором онкомутаций. Диссертация также содержит 4 приложения, в которых автор приводит подробные математические выводы уравнений, полученных в диссертации и ряд результатов биоинформацинного анализа экспериментальных данных. Замечания по работе: В целом работа написана ясным и четким научным языком, на современном уровне, полученные теоретические результаты обоснованы и подтверждены экспериментально.
Однако, есть отдельные замечания. Существенное замечание относится к задачам и положениям, выносимых на защиту. 1. Так четвертая задача сформулирована некорректно в отношении теоретической направленности диссертации: «Разработка методов комбинированной лекарственной терапии с целью подавления резистентности к ингибиторам клеточных рецепторов при различных онкомутациях генов, кодирующих белки в Р!ЗК сигнальном пути». Данная задача может быть решена только экспериментальными методами на модельных организмах и в результате клинических испытаний. Развиваемы в данной работе теоретические методы могут использованы только на начальных этапах разработки лекарственной терапии и на этапе обоснования молекулярных механизмов ее эффективности. Автору следовало сформулировать эту задачу более конкретно с учетом теоретического характера всей диссертации.
2. Также вызывает вопросы с первым положением, выносимые на защиту, которое сформулированы неясно: «Компьютерная модель сигнальных систем клетки для исследования влияния онкомутаций на эффективность лекарственных препаратов и изучения молекулярных механизмов возникновения резистентности к антираковым лекарственным препаратам, ингибирующим ЕВК и РИК сигнальные пути для различных линий раковых клеток». В данной формулировке отсутствуют указания на отличительные признаки развиваемой модели, что вызывает вопросы о ее соответствии целям и задачам работы.
3. В шестой главе проводится сравнение теоретических результатов по действию ЛП с экспериментальными данными, которые получены ВРРА методом. Видно, что экспериментальные данные содержат большие экспериментальные ошибки и высокий уровень шума. Вызывает сомнение использование подобных экспериментальных данных для валидации модели и интерпретации полученных результатов.
Необходимо было выбрать более надежный экспериментальный метод, например, общепринятый вестен блотинг. Бсть ряд недостатков при оформления текста: 1. При оформлении графиков автор смешивает использование русских и английских терминов, что нарушает единый стиль диссертационной работы. 2. В тесте диссертации и автореферата допущено много опечаток, что порой затрудняет восприятие работы.
Отмеченные выше недостатки являются либо редакционными, либо связаны с неточными формулировками и не снижают общей высокой оценки диссертационной работы. Общая оценка диссертационной работы: Диссертационная работа Гольцова А.Н. является междисциплинарным исследованием в области разработки системных методов компьютерного моделирования сигнальных клеточных путей и их приложения к исследованию эффективности лекарственных препаратов в персонализированной онкоткрапии.
К достоинствам работы можно отнести использование обширного экспериментального материала, полученного с использованием широкого арсенал теоретические и экспериментальных методов биофизики, молекулярной и клеточной биологии, генетики, биотехнологии и фармакологии. Экспериментальные данные использовались на всех этапах теоретического исследования, начиная с разработки компьютерных моделей, их валидации и заканчивая этапом применения разработанных моделей к исследованию эффективности комбинированной терапии в онкологии.
Поученные автором теоретические результаты по исследованию действия лекарственных препаратов и предложенные им биомаркеры их эффективности были проверены в экспериментах на различных моделях раковых опухолей и в клинических испытаниях на онкологических пациентах, что в полной мере подтвердило надежность полученных Гольцовым А.Н. результатов. Близкое сотрудничество автора с молекулярными биологами, биохимиками и биотехнологами в процессе работы над диссертацией показывает, что разработанные методы компьютерного моделирования находят непосредственное применение в экспериментальных, клинических и биотехнологических исследованиях, направленных на разработку эффективных стратегий лечения в онкологии. В частности, развитые методы и полученные результаты применены к исследованию действия ЛП на различных экспериментальным моделям раковых опухолей: на популяция различных клеточных линий рака яичников с различными онкомутациями и раковых опухолях в ксенотрансплантатных мышей, выращенных с помощью биотехнологических методов.
Несомненно развитые в работе методы системного анализа и полученные автором результаты найдут свое приложение в разработке новых лекарственных препаратов, комбинированной онкотерапии и фармацевтической биотехнологии. Обобщая вышесказанное и учитывая новизну, теоретическую и практическую значимость полученных результатов и их достоверность, считаю, что представленная к защите диссертационная работа Гольцова А.Н.
отвечает требованиям Положения о присуждении ученых степеней в Московском Государственном Университете имени М.В. Ломоносова, предъявляемым к диссертациям на соискание ученой степени доктора физико-математических наук, а ее автор заслуживает присуждения искомой степени по специальностям 03.01.02 — «Биофизика», 03.01.08 — «Биоинженерия». Официальный оппонент Декан факультета биотехнологии и биологии Заведующий кафедрой биотехнологии, биоинженер Мордовского государственного университета им. Н. д.б.н., профессор Ревин Виктор Васильевич .
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
