Отзыв официального оппонента 1 (1097592), страница 2
Текст из файла (страница 2)
В пятой главе представлены результаты по исследованию механизмов перепрограммирования сигнальных систем в результате действия антираковых лекарственных препаратов и обсуждается механизм этого процесса, но не проведено моделирование самого процесса, приводящего к дополнительной экспрессии ЕгЬВЗ рецепторов. Автору следовало включить модель генетической регуляции, развитой в четвертой главе, для количественно описания механизма перепрограммирования. 2.
Также в шестой главе отсутствует количественно описание предложенного механизма возникновение окислительного шока в клетках прн ингибированни клеточных рецепторов. Автору также следовало бы расширить модель пугем включения описания генетической регуляции, развитой в четвертой главе, для количественно описания механизма подавления экспрессии фактора транскрипции ХКР2 . 3. В работе уделено мало внимания обсуждению численных методов, использованных авторам при решении систем нелинейных дифференциальных уравнений и при выполнении процедур согласования параметров модели с экспериментальными данными.
В данной диссертационной работе, посвященной компьютерному моделированию, необходимо было дать краткое описание использованных численных методов, 4. При исследовании осцилляторных режимов в МАРК киназной сигнальной системе автор не приводит область параметров, в которой система теряет устойчивость и испытывает бифуркацию рождения цикла. Автору следовало провести бифуркационный анализ модели сигнальной системы и определить области неустойчивости динамической системы. Замечания по оформления диссертации и автореферата: 1. В диссертации не приводится полная система дифференциальных уравнений для разработанной модели сигнальной системы с окончательным набором кинетических параметров сигнальных белков н рецепторов, определенных в работе.
Для целостного изложения разработанного подходов необходимо было привести окончательную модель в приложении к диссертации. 2. В диссертации и автореферате допущено много опечаток и неточностей, в том числе в формулировках задач, положений, выносимых на защиту, и выводах.
Сделанные замечания являются скорее пожеланиями по дальнейшей работе„чем существенными недостатками работы и не снижают общей высокой оценки полученных результатов н всей диссертационной работы в целом. Заключение по диссертации. Диссертационная работа Гольцова А.Н. представляет собой дальнейшее развитие компьютерных методов системной биологии и их приложения к исследованию динамических свойств клеточных сигнальных систем в раковых клетках при действии лекарственных препаратов. В работе разработаны следующие новые методы и подходы к исследовании нелинейной динамики сигнальных сетей в норме и патологии: метод расчета и анализа выходных характеристик сигнальных систем клетки; анализ изменения чувствительности сигнальных систем при нх генетической модификации; концепция перехода «чувствительность-резистентность», вызванного онкомутацнями в сигнальных системах; метод исследования осцилляторных режимов в сигнальных путях при нарушении генетической регуляции; метод анализа репрограмирования сигнальных систем в результате действия лекарственных препаратов, а также методы преодоления резистентности сигнальных систем путем комбинированного действия лекарственных препаратов.
В результате приложения развитых методов к реальным проблемам онкотерапии автором были исследованы механизмы действия ряда лекарственных препаратов и предложены биомаркеры их эффективности в зависимости от типа онкомутацнй в раковых клетках. Проведенные эксперименты и клинические исследования, выполненные экспериментальной группой, сотрудничающей с автором, подтвердили надежность разработанных методов и результатов, полученных автором. По своему объему и уровню, новизне, актуальности решаемой проблемы, достоверности, научной и практической значимости диссертационная работа А.Н.
Гольцова полностью отвечает требованиям Положения о присуждении ученых степеней в Московском Государственном Университете имени М.В. Ломоносова, предъявляемым к диссертациям на соискание ученой степени доктора физико-математических наук, а ей автор безусловно заслуживает присуждения искомой степени по специальностям 03.01.02 — «Биофизиками, 03.01.08 — «Биоинженерия». Официальный оппонент доктор физико-математических наук, ведущий научный сотрудник Отдел полимеров, Институт химической физики нм, Н.Н. Семенова РАН, Москва 21, О9,2О17 Савин Александр Васильевич Адрес; Учреждение Российской академии наук Институт химической физики им.
Н.Н.Семенова РАН, 119991 Москва, ул. Косыгина 4, т. +7 495 939-7139, Б-пю1: азат1п~фсепгег.с1грй.газхп .
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
