CBRR2757 (677123), страница 2

Файл №677123 CBRR2757 (Клонирование и анализ генов легких цепей иммуноглобулинов стерляди) 2 страницаCBRR2757 (677123) страница 22016-07-31СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 2)

Îáîçíà÷åíèÿ: - ñèãíàëüíûå îëèãîìåðû.




Ðèñ. 3. Ñõåìà ðàñïîëîæåíèÿ îëèãîíóêëåîòèäíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòåé, çàäåéñòâîâàííûõ â ñàéòñïåöèôè÷åñêîé ðåêîìáèíàöèè â êàïïà ëîêóñå ìëåêîïèòàþùèõ. Ýòè ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ôëàíêèðóþò ñ 3‘ ñòîðîíû VL ñåãìåíò è ñ 5’ ñòîðîíû JL ñåãìåíò. Âî âðåìÿ ðåêîìáèíàöèè ãåïòàìåð è íîíàìåð îäíîãî èç VL ñåãìåíòà îáúåäèíÿþòñÿ ñ ãåïòàìåðîì è íîíàìåðîì îäíîãî èç JL ñåãìåíòà. Ýòî äåëàåò âîçìîæíûì ñîåäèíåíèå VL è JL ñåãìåíòîâ áåç íàðóøåíèÿ ðàìêè òðàíñëÿöèè (Aguilera et al., 1987; Hesse et al., 1989).

Îáîçíà÷åíèÿ: - ñèãíàëüíûå îëèãîìåðû.

Ïîñëåäîâàòåëüíîñòü, â êîòîðîé ðåêîìáèíèðóþò ëîêóñû L-öåïåé, ñòðîãî óïîðÿäî÷åíà âî âðåìåíè. Ïîêàçàíî, ÷òî ïåðâûìè ïåðåñòðàèâàþòñÿ ëîêóñû êàïïà òèïà, ïðè÷åì åñëè â îäíîé õðîìîñîìå ïåðåñòðîéêà îêàçàëàñü íåôóíêöèîíàëüíîé, òîåñòü íå ïðèâåëà ê ïîÿâëåíèþ ïîëíîöåííîãî ãåíà, òî ðåêîìáèíàöèÿ ïðîèñõîäèò â êàïïà ëîêóñå íà ãîìîëîãè÷íîé õðîìîñîìå.  ñëó÷àå ïîâòîðíîé àáîðòèâíîé ïåðåñòðîéêè àíàëîãè÷íî ïðîèñõîäÿò ïåðåñòðîéêè â ëÿìáäà ëîêóñàõ. Åñëè â êëåòêå íåïðîäóêòèâíî ïåðåñòðîèëèñü âñå ÷åòûðå ëîêóñà, òî îíà ïðåâðàùàòñÿ â 0-êëåòêó è ïîäâåðãàåòñÿ àïîïòîçó. Åñëè æå ïåðåñòðîéêà îäíîãî èç ëîêóñîâ ïðèâåëà ê îáðàçîâàíèþ ôóíêöèîíàëüíîãî ãåíà, òî ðåêîìáèíàöèÿ îñòàëüíûõ ëîêóñîâ áëîêèðóåòñÿ. Äåòàëè ìåõàíèçìà áëîêèðîâàíèÿ íåèçâåñòíû, îäíàêî óñòàíîâëåíî, ÷òî íåîáõîäèìûì óñëîâèåì äëÿ íåãî ÿâëÿåòñÿ òðàíñêðèïöèÿ ïðîäóêòèâíî ïåðåñòðîåííîãî ãåíà.  ðåçóëüòàòå â êàæäîì èíäèâèäóàëüíîì ëèìôîöèòå ñèíòåçèðóåòñÿ òîëüêî îäèí òèï L-öåïåé, êàïïà èëè ëÿìáäà, è ýêñïðåññèÿ ãåíà ïðîèñõîäèò òîëüêî íà îäíîé èç äâóõ ãîìîëîãè÷íûõ õðîìîñîì. Ýòè ôåíîìåíû, íàçûâàåìûå èçîòèïè÷åñêèì è àëëåëüíûì èñêëþ÷åíèÿìè ëåæàò â îñíîâå êëþ÷åâîãî ïðèíöèïà ôóíêöèîíèðîâàíèÿ èììóííîé ñèñòåìû - ïðèíöèïà êëîíàëüíîé ñåëåêöèè (Ïîë, 1987; Strob, 1987).

 îðãàíèçìå ìëåêîïèòàþùèõ ãåíåðèðóåòñÿ ñâûøå äåñÿòè ìèëëèîíîâ âàðèàíòîâ àíòèòåë, õîòÿ â ãåíîìå ñîäåðæèòñÿ çíà÷èòåëüíî ìåíüøåå êîëè÷åñòâî ãåííûõ ñåãìåíòîâ, êîòîðûå ìîãóò ó÷àñòâîâàòü â ôîðìèðîâàíèè âàðèàáåëüíûõ äîìåíîâ.  ñëó÷àå L-öåïåé, îñíîâíûì èñòî÷íèêîì ðàçíîîáðàçèÿ ÿâëÿåòñÿ êîìáèíàòèâíîå ñî÷åòàíèå V è J ñåãìåíòîâ. Äîïîëíèòåëüíûì èñòî÷íèêîì ÿâëÿåòñÿ ñìåùåíèå ðåêîìáèíàöèîííîé ðàìêè â ìåñòå èõ ñîåäèíåíèÿ. Êðîìå òîãî, V ãåííûå ñåãìåíòû ìîãóò îáìåíèâàòüñÿ ó÷àñòêàìè ÄÍÊ ñ ïñåâäîãåíàìè ïîñðåäñòâîì ãåííîé êîíâåðñèè. Î÷åíü ñóùåñòâåííûé âêëàä â ðàçíîîáðàçèå ñïåöèôè÷íîñòåé àíòèòåë âíîñèò ñîìàòè÷åñêîå ìóòèðîâàíèå âàðèàáåëüíûõ ãåííûõ ñåãìåíòîâ â ñàéòàõ, ó÷àñòâóþùèõ â ôîðìèðîâàíèè àíòèãåíñâÿçûâàþùåãî öåíòðà. Ñîìàòè÷åñêîå ðàçíîîáðàçèå ãåíåðèðóåòñÿ ïðè âòîðè÷íîì èììóííîì îòâåòå ïóòåì âêëþ÷åíèÿ ãèïåðìóòàöèîííîãî ìåõàíèçìà â êëåòêàõ ïàìÿòè â çàðîäûøåâûõ öåíòðàõ ëèìôàòè÷åñêèõ óçëîâ (Tonegawa 1983; Roitt et al., 1993).

ÃÅÍÎÌÍÀß ÎÐÃÀÍÈÇÀÖÈß È ÝÊÑÏÐÅÑÑÈß ÃÅÍΠL-ÖÅÏÅÉ ÈÃ Ó ÍÈÇØÈÕ ÏÎÇÂÎÍÎ×ÍÛÕ

Õðÿùåâûå ðûáû.

Ãóìîðàëüíûé èììóííûé îòâåò â âèäå ñïåöèôè÷åñêèõ àíòèòåë îáíàðóæèâàåòñÿ òîëüêî ó ïîçâîíî÷íûõ. Íàèáîëåå ïðèìèòèâíûìè âèäàìè, ó êîòîðûõ îáíàðóæåíà ñïîñîáíîñòü ñèíòåçèðîâàòü ÈÃ, ÿâëÿþòñÿ õðÿùåâûå ðûáû. Ïðåäñòàâèòåëè òðåõ îñíîâíûõ òàêñîíîâ (àêóëû, ñêàòû è õèìåðû) ïðîäóöèðóþò àíòèòåëà â îòâåò íà ââåäåíèå øèðîêîãî ñïåêòðà àíòèãåíîâ. Îäíàêî, â îòëè÷èå îò ìëåêîïèòàþùèõ, ãåòåðîãåííîñòü ñûâîðîòî÷íûõ àíòèòåë ó õðÿùåâûõ ðûá âûðàæåíà î÷åíü ñëàáî. Êðîìå òîãî, ó íèõ íå îáíàðóæåíî ñîçðåâàíèå èììóííîãî îòâåòà - ïðè âòîðè÷íîì ââåäåíèè àíòèãåíà ñïåêòð àíòèòåë íå ìåíÿåòñÿ (Flajnik, 1996). Ðåçóëüòàòû èññëåäîâàíèé ïîñëåäíèõ ëåò ïðîäåìîíñòðèðîâàëè, ÷òî îðãàíèçàöèÿ ãåíîâ Èà ó õðÿùåâûõ ðûá òàêæå èìååò ÿðêî âûðàæåííûå îñîáåííîñòè.

Ó õðÿùåâûõ ðûá îáíàðóæåíû ãåíû òðåõ òèïîâ L-öåïåé, ëîêàëèçóþùèåñÿ â ðàçíûõ ëîêóñàõ. Â êàæäîì ëîêóñå ãåíûå ñåãìåíòû îðãàíèçîâàíû â êëàñòåðû, èìåþùèå ïî îäíîìó V, J è C ãåííîìó ñåãìåíòó (ðèñ. 4). Òàêèõ êëàñòåðîâ ñîäåðæèòñÿ íåñêîëüêî äåñÿòêîâ èëè äàæå ñîòåí â îäíîì ëîêóñå íà ðàññòîÿíèè 12-15 òïí äðóã îò äðóãà (Rast et al., 1994).

Ãåíû ïåðâîãî òèïà íàéäåíû ó ðàçíîçóáîé àêóëû (Heterodontus francisci) (Shamblott and Litman, 1989) è ìàëîãî ñêàòà (Raja erinacea) (Anderson et al., 1995). Ó àêóëû êëàñòåðû èìåþò ðàçìåð 3-6 òïí. V è J, J è C ãåííûå ñåãìåíòû ðàçäåëåíû ïðèìåðíî 0,5 è 4 òïí ñîîòâåòñòâåííî. Ó ñêàòà V è J ñåãìåíòû ñëèòû â çàðîäûøåâîé ÄÍÊ.

Ãåíû âòîðîãî òèïà îáíàðóæåíû ó ïÿòíèñòîé õèìåðû (Hydrolagus colliei) (Maisey, 1984), ïåñ÷àíîé àêóëû (Carcharhinus plumbeus) (Hohman et al., 1992; Hohman et al., 1993), ðàçíîçóáîé àêóëû è ìàëîãî ñêàòà (Ó âñåõ èçó÷åííûõ âèäîâ â êëàñòåðàõ ýòîãî òèïà V è J ãåííûå ñåãìåíòû ñîåäèíåíû óæå â çàðîäûøåâîì ãåíîìå. V è C ãeííûå ñåãìåíòû ðàçäåëåíû 2-3 òïí.








Ðèñ. 4. Ñõåìà ñòðîåíèÿ ëîêóñîâ ãåíîâ L-öåïåé ÈÃ ó àêóëû.

Îðãàíèçàöèÿ ãåíîâ ó àêóëû èìååò êëàñòåðíûé òèï. Êàæäûé êëàñòåð èìååò ðàçìåð 3 - 6 òïí è ñîäåðæèò ïî îäíîìó VL, JL è CL ãåííîìó ñåãìåíòó.

Îáíàðóæåíî òðè òèïà ãåíîâ L-öåïåé ÈÃ. Ëîêóñû ãåíîâ ïåðâîãî è òðåòüåãî òèïîâ èìåþò ñõîæóþ îðãàíèçàöèþ.  ýòîì ñëó÷àå VL è JL, JL è CL ñåãìåíòû ðàçäåëåíû ïðèìåðíî 0,5 è 4 òïí ñîîòâåòñòâåííî (À) (Rast et al., 1994).

 ëîêóñå ãåíîâ âòîðîãî òèïà VL è JL ñåãìåíòû ñîåäèíåíû óæå â çàðîäûøåâîì ãåíîìå (Á).

Òðåòèé òèï ãåíîâ L-öåïåé íàéäåí ó àêóëû-íÿíüêè (Gynglimostoma cirratum) (Greenberg et al., 1993) è ðàçíîçóáîé àêóëû (Rast et al., 1994).  êëàñòåðàõ ýòîãî òèïà V è J, J è C ãåííûå ñåãìåíòû ðàçäåëåíû, êàê è â êëàñòåðàõ ïåðâîãî òèïà, ïðèìåðíî 0,5 è 4 òïí ñîîòâåòñòâåííî. V è J ãåííûå ñåãìåíòû ôëàíêèðóþòñÿ ñàéòàìè ñïåöèôè÷åñêîé ðåêîìáèíàöèè ñî ñïåéñåðàìè 12 è 23 ïí, ÷òî ñîîòâåòñòâóåò êîíôèãóðàöèè ñïåéñåðîâ â ëîêóñàõ êàïïà òèïà ìëåêîïèòàþùèõ. Ïî ïåðâè÷íîé ñòðóêòóðå ãåíû òðåòüåãî òèïà òîæå íàèáîëåå áëèçêè ê ãåíàì êàïïà òèïà âûñøèõ ïîçâîíî÷íûõ (ãîìîëîãèÿ ïî àìèíîêèñëîòíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè ñîñòàâëÿåò îêîëî 60%).

Ãåíû ýòèõ òðåõ òèïîâ èìåþò ìåæäó ñîáîé íèçêóþ ñòåïåíü ãîìîëîãèè:40-50% ïî íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè Ñ ñåãìåíòîâ è 50-60% ïî ïîñëåäîâàòåëüíîñòè V ñåãìåíòîâ (Hohman et al., 1993).

Ïîëó÷åííûå äàííûå ïîêàçûâàþò, ÷òî ó õðÿùåâûõ ðûá èìååòñÿ î÷åíü áîëüøîå êîëè÷åñòâî ãåííûõ ñåãìåíòîâ. Îäíàêî ñïåöèôèêà îðãàíèçàöèè ãåíîâ èñêëþ÷àåò êîìáèíàòèâíîå ñî÷åòàíèå ñåãìåíòîâ. Âñå ðàçíîîáðàçèå àíòèòåë ó õðÿùåâûõ ðûá ôîðìèðóåòñÿ òîëüêî çà ñ÷åò ýêñïðåññèè áîëüøîãî êîëè÷åñòâà êëàñòåðîâ.

Äàííûå î íóêëåîòèäíûõ ïîñëåäîâàòåëüíîñòÿõ èç ðàçíûõ ëîêóñîâ âûÿâèëè íèçêóþ ãåòåðîãåííîñòü ãåíîâ (85-95%), ÷òî óêàçûâàåò íà îòñóòñòâèå ñîìàòè÷åñêîãî ìóòàãåíåçà (Rast et al., 1994).

Êîñòèñòûå ðûáû.

Àíàëèç ñûâîðîòî÷íûõ àíòèòåë ïåùåðíîãî ñîìèêà (Ictalurus punctatus) ïîêàçàë íàëè÷èå òðåõ òèïîâ L-öåïåé ñ ðàçëè÷íûìè ìîëåêóëÿðíûìè ìàññàìè: 26, 24 è 22 êÄà. Äâà âèäà àíòèòåë ìûøè, 3F12 è 1G7, çàõâàòûâàþò áîëåå 90% îò îáùåãî êîëè÷åñòâà èììóíîãëîáóëèíîâ â ðåàêöèè èììóíîïðåöèïèòàöèè. Ïðè ýòîì 3F12 àíòèòåëà ñâÿçûâàþòñÿ ñ ìîëåêóëàìè, ñîäåðæàùèìè L-öåïè ìàññîé 24 è 22 êÄà, à 1G3 àíòèòåëà ñ äðóãîé ñóáïîïóëÿöèåé, ñîäåðæàùåé L-öåïè ìàññîé 26 êÄà. Íà îñíîâå ýòèõ äàííûõ L-öåïè ðàçäåëÿþò íà äâà êëàññà, íàçûâàåìûå F è G (Lobb et al.,1984).

Ãåíîìíàÿ îðãàíèçàöèÿ ëîêóñà L-öåïåé G òèïà èìååò êëàñòåðíûé òèï (ðèñ. 5). Â êàæäîì êëàñòåðå ñîäåðæèòñÿ ïî îäíîìó J è C ñåãìåíòó è äâà V ñåãìåíà. Âàðèàáåëüíûå ãåííûå ñåãìåíòû ðàñïîëîæåíû âñåãäà â ïðîòèâîïîëîæíîé òðàíñêðèïöèîííîé ïîëÿðíîñòè ê J è C ñåãìåíòàì . Â ðÿäå ãåíîìíûõ êëîíîâ îäèí V ñåãìåíò ðàñïîëàãàëñÿ ñ 3' ñòîðîíû îò C ãåííîãî ñåãìåíòà. Ðàçìåð êëàñòåðà ðàâåí ïðèìåðíî 3 òïí, ðàññòîÿíèå ìåæäó êëàñòåðàìè îêîëî 6 òïí (Ghaffari and Lobb, 1993; Bengten, 1994).

Õîòÿ ãåíû L-öåïåé ñîìèêà èìåþò íèçêóþ ãîìîëîãèþ ñ ãåíàìè äðóãèõ ïîçâîíî÷íûõ (40-50% ïî íóêëåîòèäíîé ïîñëåäîâàòåëüíîñòè), èõ ìîæíî îòíåñòè ê êàïïà òèïó âûñøèõ ïîçâîíî÷íûõ, òàê êàê ñõîäñòâî ïî ïåðâè÷íîé ñòðóêòóðå ñ ëÿìáäà òèïîì íèæå. Êðîìå òîãî, êîíôèãóðàöèÿ ñïåéñåðîâ èìååò õàðàêòåð êàïïà òèïà: 12 ïí ñïåéñåð àññîöèèðîâàí ñ V, 23 ïí ñïåéñåð ñ J ñåãìåíòîì (Ghaffari and Lobb, 1993).

Ó ðàäóæíîé ôîðåëè (Oncorhynchus mykiss), ïðåäñòàâèòåëÿ äðóãîãî ñåìåéñòâà êîñòèñòûõ ðûá, òàêæå îáíàðóæåíû äâà òèïà L öåïåé (Daggfeldt et al., 1993). Îäèí èç íèõ (L1) âûñîêîãîìîëîãè÷åí G òèïó ñîìèêà ïî ñòðóêòóðå V è C îáëàñòåé è ñîîòâåòñòâóþùèé ëîêóñ èìååò ñõîäíóþ îðãàíèçàöèþ.

Ïî-âèäèìîìó, ó ýòèõ âèäîâ îáúåäèíåíèå V è J ñåãìåíòîâ ïðîèñõîäèò òîëüêî çà ñ÷åò èíâåðñèé ñ âîññòàíîâëåíèåì åäèíîé ïîëÿðíîñòè òðàíñêðèïöèè. Ðàçíîîáðàçèå âàðèàáåëüíûõ äîìåíîâ îáðàçóåòñÿ â ðåçóëüòàòå êîìáèíàòèâíîãî ñî÷åòàíèÿ V è J ñåãìåíòîâ â ïðåäåëàõ îäíîãî êëàñòåðà. Íå èñêëþ÷àåòñÿ, ÷òî â ïåðåñòðîéêè ìîãóò âîâëåêàòüñÿ è ñîñåäíèå êëàñòåðû.

Èíòåðåñíîé îñîáåííîñòüþ êîñòèñòûõ ðûá ÿâëÿåòñÿ î÷åíü âûñîêàÿ ïðîïîðöèÿ ìÐÍÊ, ïðåäñòàâëÿþùåé òàê íàçûâàåìûå ñòåðèëüíûå òðàíñêðèïòû (Ghaffari and Lobb, 1993). Ýòè òðàíñêðèïòû âêëþ÷àþò â ñåáÿ òîëüêî Ñ-ñåãìåíòû è ôëàíêèðóþùèå èõ 5’è 3’-íåòðàíñëèðóåìûå ó÷àñòêè. Êîëè÷åñòâî ñòåðèëüíûõ òðàíñêðèïòîâ ó ñîìèêà è ôîðåëè â 5 ðàç ïðåâûøàåò êîëè÷åñòâî ïîëíûõ VJC-òðàíñêðèïòîâ.




Характеристики

Тип файла
Документ
Размер
135 Kb
Тип материала
Предмет
Учебное заведение
Неизвестно

Список файлов реферата

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
7021
Авторов
на СтудИзбе
260
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее