McCammon, Harvey - Dynamics of Proteins and Nucleic Acids (522918), страница 40
Текст из файла (страница 40)
То сапу ои| |Ье Ыиш!а|юп, ча1иез аге сЬовеп Гог Т, йе деягед |ешрега1иге, апд ч, |Ье теап Ггег!иеису ипгЬ ччЫсЬ еасЬ рагЕс1е ехреп'- епсев а згосЬавг!с со!11з!оп. ТЬе ргоЬаЬ!!!1у |Ьас апу рагбси!аг рагдс1е зи!Гегз а со1!идоп !и |Ье |ипе ш|егча1 дг Ы ч !г. ТЬе |ипез а| вЫсЬ еасЬ рагдс!е !в |о ви!Гег а со!сиоп сап Ье де|епшпед ия!п8 гапдот пшпЬегв со са1си1а|е |Ье !п|егча1я Ьегччееп виссевз!че со!!Ыюпв, подп8 гЬая |Ыв !з 190 Аррепйх 3 а Роввоп ргосевв, во 1Ьаг !Ье ргоЪаЫ111у йвгпЬцгюп Гцпсбоп Гог йе !еп8!Ь оГ йе ш!егча1, г, 1з г(1в!пЪцгед ехропепба11у. Р(г) = че "' ТЬе ятц!акоп 1в вгаггед Ъу авя8п(п8 1п1!(а! рояВопв апд че!осйев ав ш а поппа! Ггее пю!есц1аг дупаписв гцп, апд 1Ье ег)цагюпв оГтоВоп аге 1пве8га!ед цп6! !Ье ите оГ 1Ье йгв! згосЬавВс сойыюп. ТЬе рагВс!е вц(Гег(п8 йе со1!1в)оп 1в 8)чеп а пеи че1осЬу, сЬозеп а1 гапдот Ггот !Ье Во1Гхгиапп гВзгпЬцВоп а! !егпрега!цге Т.
ТЫв швгапгапеоцз сЬап8е оГ пютепвцт г)сев по! а!Тес! йе 1пв1апвапеоцв ров(вюпв ог че!ос(11ев оГ йе овЬег рагв)с!ев 1п йе вуз1ет. ТЬе ег!цаВопв оГ тороп аге !пве8гавед цп61 йе йпе Гог йе пех! со111вюп, апд 1Ыв ргосевз оГ вЬогг Ггее гцпв (пгеггцр1ег! Ьу (пв!апвапеоцв че!осТу геавв18птепгв )з гереагег( ГЬгоц8Ь- оц! йе г(цгагюп оГ1Ье зипц!акоп, Нов вЬоц!д ч, !Ье Ггег)цепсу оГ вгосЬавВс со1!1яопз, Ье сЬовеп? Апдегвеп (1980) Ьав вЬоччп Фас ч В !пчегве!у ргороггюпа! со )ч1, юЬеге )ч' В йе пшиЬег оГ рагВс1ев 1п !Ье вув1ет, ассоггВп8 1о йе ге!а!юпвЫр (А3.1) ччЬеге ч, чгоц16 Ье йе со! Ввюп Ггег(цепсу 1Г йе ватр1е соп!а)пег( оп! у опе рагбс1е, Рог тасгото!есц!аг вувгетв, йе раг!1с!ев аге а1отв (ог ех1епйед а1отв), апд йе со!1ыюп Ггес)цепсу Гог апу рагВсц!аг а!от 1в оп йе огдег оГ!Ье Ггеццепсу оГсоча1еп1 Ъопд ч)Ъгаг(опв,).е.
ч, ж 10" в '. Рог а 1ур(са1 тасгото!есц!е цл!Ь а пю!есц!аг ч~е!8Ы оГ аЬоц1 10', )ч' (з оГ !Ье огдег оГ 1000 Ьеачу агота, апд ч В аЬот 1 рв. ТЫв В ап аигасбче со(псЫепсе, Ьесацве !п тапу то1есц!аг купат)св йпц!агюпв, йе !1те азер Аг 1в оп йе огдег оГ 0.001 рв. Сопвег!цеп11у, аС еасЬ Гппе вгер опе а!от Ы сЬовеп аг гапдот Гог а ввосЬавбс со!!(яоп. Очег а репог1 оГ1 рв (1000 йпе вгерв), еасЬ а!от ца!1 вцйег ап ачега8е оГ опе со1Ивюп, аз гейнц)ген. ТЫз вате ргосег1цге сап 8епега!1у Ье ива оп вув1етв сопгашш8 Ггот ! 00 1о 10000 а!отв цц!Ьоц! вегюцв еггог, Ьесацве 1Ье !аг8е пшпЬег оГ агота 8цагапгеев !Ьа! гИГегепсев ЬеИчееп епветЫе ачега8ев цл1! Ье япа1! (МсЯцагг(е, ! 976).
Ап а11егпаВче те!Ьод, гйе го Вегепдвеп ег а1. (1984), соцр1ев йе вув!ет го а Ьай чч1юве гет регаГцге !в Т, Ьу гевсайп8 а!1 авопис че! осЬ)ев аг еасЬ 1!те в!ер. ТЬе че1осВу и )в вса!ег) Го а ча1це )с, и Ьеге 2 = 1+ — (Т,/Т вЂ” 1) й 2тг 1п йВ ехргевяоп, Аг В !Ье юге оГ 1Ье йпе вгер, тз, )в а сЬагасгепзВс ге!ахаГ)оп 1!те, апд Т В йе )пвгапГапеоцв Гетрегатге.
1Г опе ргеГегв Го Мо/еси1аг Йупаткя 191 гег)шге гЬе сЬап8е (п гешрегагиге рег гипе вгер го Ье ехасг!у ециа! го (Т, - Т)3г/гг, опе сап иве ТЬе адчапГа8е оГ й!в ргосег)иге очег йаг оГ Апг!егзоп (1980) (я йаС йе вггеп81Ь оГ соир1(п8 сап Ье сЬовеп (Ьу сЬооз)п8 йе ча!ие оГ гг) го зшг гЬе пеесЬ оГ а 8)чеп арр!!сагюп. Оп йе огЬег Ьапг), йе з)ши1аг!оп с)сея по! соггезропд ехасг!у го апу оГ 1Ье вгапйагд гЬеппойупапис епяешЫев.
АЗ.З Мо1еси!аг купат!ся аг сопзгаиг ргеввиге 1п а поппа! гпо!еси1аг г)упаписз з)пш!а0оп чг(гЬ гереапп8 Ьоипдагу сопг)1г!опв, гЬе чо!шпе (з Ье!д йхег), еЬегеаз аг сопзгапг ргеввиге йе чо!шпе оГ йе вувгеш Г)исгиагев. То 1пс!иг)е йе чо1шпе аз а йупаш!с чапаЫе, йе ег)иапопя оГпюг)оп аге г)егепп)пег) )п ап апа!уяв оГ а вувгеш 1п ччЫсЬ йе ровЬюпв апс( шошепга оГ а!1 йе рагг)с1ев аге яса1ед Ьу а Гасгог ргороггюпа! го йе сиЬе гоог оГ йе чо!шпе оГ гЬе вувгеш (Апг)егзоп, 1980). 1Г гче йепоге йе чо1шпе 1; йе геви111п8 ег)иагюпя, гчЫсЬ гер!асс ег)иагюпв (4.15) апй (4.16), аге, Гог еасЬ геа! асош Ь г, = р„/т;+ Р'гв/3 Ф,=Х~Рц — 1 р,/3 МЁ = — ос+(~ (Р, Р,)/т, — Е гц ГГ'(гц))/(3 В') аЬеге ЕГ гергеяепгз йе г(ег)чаг(че оГ гЬе рогепг!а! илй гевресг го йе ровЫоп оГ агою 1, апг) 1'" = — (!п !') д г)г 1п йезе ег1иавюпв, йе зашя аге Го Ье са!си!а!а аз Го!!оччз. 1п йе яесопд ег)иаг!оп, гЬе випппаг)оп 1з очег а!1 ча1иев оГ/ ~ 1, апд йе пипипшп ипа8е сопчепг)оп Ы Го!!сие8Ь Гог а 81чеп ча!ие оГ/, гЬе ра)гаазе ц' !пгегас6оп )я оп! у сопзЫегед Ьегчгееп агош 1 апг( аЫсЬечег !з с!овезг го 1Ь йе геа1 агош/ ог йе с!свез! ппа8е оГ агош/.
ВогЬ вшпв 1п гЬе гЫгд е9иа6оп аге (а(геп оп1у очег геа1 азота, апг) ГЬе весопг) зшп !в оп1у са!си!аяег) Гог ча1иев оГ/ > 1. ТЬ!в ь Го 8иагапяее йаГ чо!шпе ()исвиаГ)опв гейесГ йе ппЬа!апсе дие го йе ехгегпа! ргеявиге и апд йе ргеввиге апяп8 Ггош 192 Аррегц(!х 3 1пгегагоппс 1пгегаспопв мч!Ып гЬе чо1шпе.
Аг еасЬ вгер оГ йе йупаш(сз, г8в!апсев Гог гереаВп8 Ьоши$агу сопрйюпв аге гевса1ей зо гЬа! гЬе выпр1е ргеввиге Ьав йе соггес! ча1ие, ТЬеге аге гччо рагашегегз !Ьаг шцзг Ье дегегш(пей аг йе оцгяе! оГ Йе з(шц!агюп, а апй М. ТЬе Гоппег гв вппр!у гЬе ргеввиге аг иЫсЬ Йе в)шц)аг(оп 1з го Ье сагПед оиЬ чгЫ1е М сап Ье 1пгегргегег) ав йе енес!(че таза оГ а р(в!оп гЬаг аррйев гЬе ргезвиге а.
ТЬе гга)есгогу ачега8ев са!сц1агег( Ггот гЬе яппи!аВоп чч1!1 Ье (пг)ерепдепг оГ М аз 1оп8 аз М 1в йшге апд роз!11че, апд апу ча!це оГ М сап Ье изей 1Г а1! гЬаг 1в го Ье десепп)пей 1з а зес оГ ес(ш11ЪПшп ачега8ев. 1Г, Ьоеечег, ап ассцгаге гергевеп!аВоп оГ йе зузгеш Висгиайопз 1я дез)ген, Ь 1в ипроггапг го сЬоове а рЬув(са11у арргорПаге ча1ие Гог М.
%Ы)е по ргес(ве Гоппи!агюп (в ача11аЫе Гог гЬе зрес(6сагюп оГ М (На)1е 8г ОгаЬеп, 1980), а ча1ие сап Ье дегеггп(пей Ьу !Па! апд еггог Ьу Го11ои(п8 йе ргевсПрВоп гЬаг М зЬои10 Ье сЬояеп висЬ гЬаг Йе Йпе вса1е Гог Йе 8 цсгиаг!опв !и Йе чо1цтпе 1з гои8Ыу ег!иа1 го У! г)1ч(г)ег( Ьу гЬе вреед оГ вопим Ы Йе Вшд (Апдегзеп, 1980).
То чепГу гЬаг йе пшпеПса! шге8гагюп оГ гЬе ег(цагюпв оГ шо!!оп !з Ье(п8 соггес0у сагг(ед оиг ш й(в вувгеш, 11 вЬои!г) Ье погег) гЬаг гЬе г)цап!!гу гЬаг )в сопяегчед 1я йе Напи!гоп)ап сошровег) оГ !еппв Гог гЬе Ыпег(с апд рогепВа! епег8у оГ йе рагВс!ев в!1Ып йе чо!шпе, р!ив Йе )г)пег(с апс$ рогепВа1 епег8у оГ Йе р(в!оп. ТЫз Напц!гоп(ап 1в Н = Яв Х, (Р, Р,/т,)+ Х Иги)+ЯвМР+аУ 1п йе ехргевзюп, Ъой вшпв аге са!си!а!ей оп! у очег геа! рагВс!ез; йе весопд вцш 1в а8ып са!си!агег( оп1у очег ча!иез оЦ > ~', во И 1в ег)иа1 го йе гога! 1пгегагош(с рогепВа! епег8у. ()пг(ег воше Ыгсшпзгапсев, Йе ргеч(сиз а18оП!Ьпг Ьав а гепйепсу го ргогЫсе овс111агогу ЬеЬач)ог 1п гезропзе го ргезвиге сЬап8ев.
Ап а1гегпаВче ргосег(иге гезса!ез йе соогг(1пагез оГ еасЬ а!от аг еасЬ гппе вгер (Вегепдвеп ег а!., 1984). ТЬе агош)с соогйпаге, х, апг) йе сЬагасгеПзВс йзгапсе Гог гереаВп8 Ьоипг)агу сопйг(опз, й, аге геяса1ег( го ча!иев ггх апд гхГ, гевресВче!у, цЬеге ,!г к= ! (о Р)~ гр Неге,,й (в Йе в(яе оГ йе !(ше ягер, гр !з а сЬагасгег!зис ге1ахагюп !!ше, апг) Р, 1в Йе ргевзиге оГ йе ехгегпа! сопвгап! ргевзше Ьа!Ь.
ТЬе 1пзгапгапеоив ргеввше сап Ье са1си1агед аз Го!!оигс 2Г 1 1 г~, ЗУ( 2 я<~ КЕРЕКЕХСЕБ АЬо!а, Е. Е., Вегпвге(п, Р. С. й Кое!в)е, Т. Р. (!985). 'ТЬе ргоге(п Паш Ьап1с.' 1п Мо1еси!аг 1)улит(сз алП Ргогет Бггис1иге, ед. Х. Неппапв, рр. 167 — 9. СЬаре! НП1: (Хтчегв(гу оГ ЫоггЬ СагоПпа. АПат, б. й Ое!Ьг0с1с, М. (1968). 'КеПисПоп оГ йтепяопа!пу !п Ь(о!о86са! ййияоп ргосеввев.' 1п Бггиспта! СЬетиггу алВ Мо!еси(аг В!о!о8у, ег!в. А.
КгсЬ й )4. Оач(г)воп, р. 198. Бап Ргапс)зсо: Ргеетап. АПатв, О. Х. (1979). ' Сотригег вили!агюп оГ юпге вувгетв: ТЬе йвгогПп8 е1Тесгв оГ 1Ье Ьоипдагу сопйг!опв.' СЬетгса! РЬуысз Гаггегз, 62, 329. А8гпоп, Ы. й Норйе!й Х. Х. (1983). 'СО Ь)пйп8 го Ьегпе ргосе(пв: А пюс1е1 Гог Ьап4ег ЬНПЬг йвгпЬиПопв ап6 в(озч сопГоппаПопа! сЬап8ев.' Уоигла( оГ СЬелнса1 РЬуясз, 79, 2042. А!а8опа„б., бЬ(о, С. й КоПтап, Р. А.
(1985). ' Молве Саг(о ыпш!аПопв оГ 1Ье во1чаПоп оГ ГЬе йтеПьу! рЬоврЬасе атоп.' Хоигла( о/ гЬе Ателсал СЬелиса1 Юос(агу, 107, 2229. А!Пег, В. Х. й %а(пзчпПЬ1, Т. Е. (1960). 'Бгийев !п гпо!еси!аг г)упаш(св и. ВеЬачПог оГ а япаП пшпЬег оГ е!авПс врЬегев.'.Гоигла! оГ СЬетгса! РЬуз(сз, 33, 1439. А!е(свапг)гоч, 1. 11. й бо!6апв)п), ч'. 1.
(1984). 'Оп Пге Перепйепсе оГ гЬе гаге сопвгапг оГ ап е!егпепгагу сЬеписа! ргосевв!п 1Ье 1апеПс ге8(оп оп ГЬе ч!асов!гу оГ 1Ье тейшп.' СЬелиса1 РЬуйсз, 87, 455. АП!воп, Б. А., бапп, б, й МсСапппоп, Х. А. (1985а). 'Били!аПоп оГ 1Ье ййиыоп-сопггоПед геасПоп Ьепчееп вирегохи1е апд язрегохи1е йвпшгаве.
и Бипр!е пюйе!в.' В1оро(утет, 24, 1323. АП(воп, Б. А. й МсСапипоп, Х. А. (1984а). 'Тгапврогз ргорегПев оГ п8!6 ап0 ПехВПе гаасгогпо!еси!ев Ьу Вгоилиап с)упапйсв япш!аг(оп.' Вюро!утеш, 23, 167. АПВоп, Б. А. й МсСапипоп, Х. А. (1984Ь) 'Ми!Пыер Вгои п(ап булат(св: АррПсаПоп го вЬогг зчоппИге сЬа(пв.' Вюро1утегз, 23, 363. АП(во, Б. А. й МсСапипоп, Х.
А. (1985). 'Хуупат)св оГ виЬягаге Ь|пйп8 го соррег ппс вирегохгйе йвпппавеу Хоитла) оГ РЬупса1 СЬетиггу, 89, 1072. АПьоп, Б. А., ЫоггЬгир, Б. Н. й МсСапипоп, Е А. (1985Ь). 'Ехгеп0е6 Вгозчшап купат(св оГ ййив(оп сопггоПед геасПопв.' Хоигла1 оГ СЬет(са! РЬупсз, 83, 2894. 194 196 1!е1егелсея %Ивоп, 1. А., Соггап, Р. Н., РиПЬ, А.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
