McCammon, Harvey - Dynamics of Proteins and Nucleic Acids (522918), страница 2
Текст из файла (страница 2)
Рог а 8$«еп ргогеш, йе ро!урергЫе сЬаш оГ еасЬ то!еси!е 1в Го!бег! сотрасг)у шго а сЬагассепвВс йгее йтепяопа! ягисгиге. А!йои8Ь йе геви1$1п8 япк$игев аге сотрйсагед, 1$ )в сопипоп! у оЬвегчег$ ГЬаГ йе расЫп8 г)епв1!у оГ йе ргоге)п сотропепгв 1в пеаг!у тах)т)хег$, виЬ)есг со йе гег)и)гетепс $Ьаг йове агтпо асЫ гевЫиев ч«ЫсЬ Ьаче а ГачогаЫе Ггее епег8у оГ 1пгегасгюп «агЬ «агег гепд го гета)п пеаг йе ргогеш вигГасе.
!и тапу сазев, Ь Ьав Ьееп рова!Ые го саггу оиГ Х-гау й)Ггасзюп в$иг$1ев оГ 8!оЬи! аг рго$е!пв ъчй Ьоипг)118апг)в (е.8., виЬвггаге апа!о8в). ТЬеве вгиг$1ев вЬочч $Ьаг йе Го!йп8 оГ а ргогет 1в висЬ йа$ $геу агап)по асЫв «лй сЬет)са!1у ас6«е 8гоирв аге вггаГе81са1!у !оса!ей 1п а ччеП-дейпед ' асВче вВе', иЬеге йе 8гоирв сап тгегасг ш а соогйпагег$ ГавЬюп «лгЬ йе 118апд. БисЬ вгийев Ьаче Ьееп 1пча!иаЫе 1п йе г)ече!ортепг оГ в!гас!ига! шзегрге$аВопв оГ ргогет Гипсйоп. Хис!е)с асЫв аге 11пеаг ро1утегв ч«Ьове топотег)с итгв аге пис!еогЫев. ТЬе в)хе оГйеве пю1еси!ев сочегв вечега! огг)егв оГта8п$$иг)е, Ггот !КО)А'в (ч«1$Ь гои8Ыу 75 пис!еогЫев, пю!еси!аг зче$8Ьгв агоипг$25000 апг$ епг$-$о-епг$!еп8йв оГ 1евв йап 10 пгп) го еисагуоВс РЬ)А'в.
рог $Ье 1а$$ег, йе яп8!е РЬ)А то!еси!е оГ а!аг8е сЬготовоте тау сопзаш Ъ!1!юпв оГ пис!еогЫев апг$ Ьаче а то!еси!аг чче18Ь$ оГ тоге йап 10". 1Г ехгепг)ед, висЬ а пю1еси!е мои!0 Ье вечега1 сепбтегегв 1п 1еп8й. А!йоиВЬ гКЬ)А'в г)о Ьаче ге! аВче!у сотрасг в$гисгигев, 1аг8е РЬ)А'в Ьаче ехгепйед, яопп)1)ге со1! соп68игаГ)опв а$ рЬувю!о81са! гетрегагиге, рН, апг$ юпк вггеп8$Ь.
ТЬяг Го!йп8 $пго вгаЫе, сотрасг ягисгигев $а и«о 1в дегеггп)пег! Ьу йе!г аввос)аг!оп «лгЬ а чаг)е$у оГ ргоге)пв апг$, Гог с!овег$ с)гси!аг ЕПЧА, Ьу вирегсойп8. Х-гау г$1ГГгасг)оп вгийев оп РХА 6Ьегв гечеа!ед йе пои с!авв)с г18Ь$-Ьапд доиЫе Ье!)са! всгиссигев оГ А- апг$ В-Р)ч)А $«$/а$воп Й Сг)с)г, 1953; Агпоя, Бт)гЬ Й СЬапдгаве)гагап, 1976).
Сгувга!! о8гарЫс в$иг$1ев Ьаче ипсочегег$ виЬ$$е вег)иепсе-г)ерепдепг чапабопв аЬои$ $Ьеве Ыеа1 ачега8е ягисгигев (ргабт, Кор)са, Рге~ч й Р)с)сегвоп, 1982; БЬа)йед ег а!., 1983), апг$ йеу Ьаче а1во гечеа!ег$ гЬаг аИегпаВп8 риг)пе-руг)т)ш)пе вег$иепсев сап, ипг)ег воте сопйг)опв, Гопп 1еГгЬапг)ед г)оиЬ)е Ье)кев ОЗгап8 ег а!., 1979). А чаг)еГу оГ пис!ек асЫ вггцсгигев о!Лег йап ятр1е г)оиЬ)е Ьейсев до ех)вЬ воте !гааз)епг апг$ 4 1пггогГисг1оп ойегв Ьет8 григе в1аЫе. ТЬеве 1пс!иде яп8!е в!гапка, Ьи!8ед 1оорв, Ьаггр)п !оорв, сгис)Гоппв, сагепапев, испо!в, апд ЬгапсЬев ш йе Яо«Ые Ье11са! в!гас!иге.
Риг)п8 йе рая 1еп уеагв, шсгеаяп8 а11епгюп Ьаз Ьееп Госивед оп йе купат)с авресГв оГ ргоГеш апд пис!е)с асЫ в!гас!иге апд Гипсгюп. 11 Ьаз !оп8 Ьееп 1пГеггед Ггот а чаг)езу оГ ехрептепга! зГийез йаг виЬззапба1 вггисгига! Яисгиагюпв оссиг ш йезе то1еси!ез, апд йаг 1Ьеве Яис1иа1юпв аге еввепГ)а! Со Ь~о!о81са! асбчЯу (11пбегв1гот-1.ап8 й БсЬе1!тап, 1959; КовИапд, 19бЗ; Ег)ва!1, 19б8).
!афпг)1 гесепг!у, йе ехасг па!иге оГ гЬе вггисгига! ЯисГиазюпв Ьав ргочеб е!ив)че. ТЬе гесеп! виг8е оГ !пгегезГ ш Ьюто!еси!аг купат)сз Ьав !аг8е!у Ьееп з11ти!а!ей Ьу йеогебса! вгиббев йа1 Ьаче ргочЫе6 а дегаЯед р)с!иге оГ 1Ье азот)с тогюп ш ргоге)пз апд, пюге гесепг!у, пис!е!с асЫв. ТЬезе йеогебса! вгиг)1ев аге йе ргипагу виЪ3ес1 оГ 1Ье ргезеп1 ЪооМ. ТЬе йеогебса! «огЬ шчо1чев а сотЬ)пагюп оГ тейос1з Ггот йеогебса1 сЬеписа! рЬуясв апд Ьюто1еси1аг в!гас!иге 1Ьеогу. ТЬе тегЬог)з Ггот сЬегшса1 рЬув)св 1пс1иде гесЬпщиев йаг Ьаче ргечоив!у Ьееп изей виссеввГи!!у го в1иду йе в1гис1иге апй а!от)с пю1юп ш депзе тагепа!в висЬ ав 1щиЫв апд во!Ыв. ТЬеве тейпов аге арргорг)аге ш Ые«оГ йе ЫЯЬ депя1у апд 1аг8е яке оГ ргогешв апд пис1е)с асЫв. А!оп8 «бй йе йеогебса1 дече!ортепгв, пе«ехрептепга! гесЬ- пщиев 1Ьас ргочЫе дегаЯег)1пв18Ьгв го Ь)ото!еси!аг купат)св Ьаче Ьесоте ача11аЫе.
!идеей, йе ргевепг гоЬивгпевв оГ 1Ыв Яе!д 1в!аг8е!у а геви)1 оГ йе 1п1егр!ау оГ тог)егп йеогебса! апб ехрептеп1а1 «ог)г. ТЬеогу Ьав виссеввГи!1у ргегЯс1ед а пшпЬег оГ Гипдатепга! ргорегбев висЬ ав йе ачега8е та8п11иде оГ а1опис йеппа1 ббзр1асетепгв, йе чапабоп оГйеве та8п)гидев 1Ьгои8Ьои1 а то!еси!е, апд 1Ье 1)те вса!ез оГ сеггап Йвр!асетепгв.
Кесепг ехрептепгв Ьаче ргевеп1ед пе«сЬа)!еп8ев йаг аге вбти!аЯп8 Гигйег йеогебса! «огас. ТЬе геви!гз асЫечеб дипп8 йе раз! Ге«уеагв апд йе Ьииогу оГ соггевропйп8 еЯогГв Гог зувгетпв висЬ ав 1щиЫв Ъой ви88ев! ГЬаг йе йеогебса1 «огЬ оп ргогешв апд пис!ек асЫв «п11 Ьесоте шсгеав)пц!у ворЫвг)са1ед аист ивеГи! 1п йе сот)п8 уеагз.
1.3 Ясоре оГ й1в ЬооЬ ТЬе пшпЬег оГ риЬИсагюпв оп купат)с аврес1в оГ Ьюто!еси!аг в!гас!иге апг) Гипсбоп 1в 8гоччш8 аг ап ехГгаоггЯпагу гаге. Ав вгагед ш йе ргеГасе, й)в Ьоо1с 1з по! тгепдед го рго«Ые ап а11-шс!ив)че саГа!о8ие оГ1Ыв асг)ч)гу. 1Г 1в, гайег, 1пгепйес$ Со ргочЫе а геавопаЫу ве! Гсопгатед !пггодисгюп го йе йеогегка) ГоипдаГюпв оГ йе зиЪ)есЬ апд го Ь18Ы18Ь1 а гергевепгаГ!че зе)есгюп оГ ппроггапГ йеогебса! геви!1в гч)ЯЯп ап 1пГе8гаГед Ггатеччог$с. ТЬе геас$ег тау «пвЬ 1о сопви11 гесепг геч)е«с асс!ев 1ог агЫ111опа) та1епа! (Сагеп', Раве!!а ег ОгаГгоп, 1979; осоре о) г)из Ьоо/г МсСапипоп й Кагр!ив, 1980а, 1983; Кагр!из й МсСапипоп, 198!а, 1983; 1еЫВ, !982; чап Сгппвгегеп й Вегепдвеп, !982; Соорег, 1984; ЕдЬо1гп ег а(., 1984; МсСапипоп, 1984; Вега й чоп Н)рре!, 1985; А11!воп, ХоггЬгир й МсСапипоп, 1986; Рпевпег й 1.ечу, 1986; Нагчеу, 1986; Кагр!пв й МсСапипоп, 1986; 1.ечу, 1986; 1ечу й Кеерегв, 1986; МсСапипоп, ХоггЬгир й А!1!хоп, 19866; Ресбгг й Кагр!из, 1986).
А пипгЬег ог" ехреПпгепга! гехи!гв аге а!во девсг!Ьед го !ПивггаГе ВЬе !урез ог" сага ача!1аЫе апд гЬе г!е8гее оГочег!ар гч!1Ь 1Ьеогеиса! Впг!!п8в. А8аш, ехсе11епг гечеъчв ГЬаг Госив оп ехреПпгепГа1 юог1с Ьаче гесепг!у Ьееп риЬВвЬед (Сига й КогЬ8еЪ, 1979; Ребсо!аз, 1979; %оодччагд й Н!1!оп, 1979; %г!1!!агав, 1980; Яагг1еЫсу, 1981; Кагр)ив й МсСапппоп, 198!а; РЫ11!рв, 1981; ЭеЬгиппег й Ггаиепге!бег, 1982; Н!11пвЫ й Кеплер!в, 1983; НиЬег й Веппегй 1983; Лапш й ччода1с, 1983; К!81ег й %!пгегпгеуег, 1983; БЬап1с, 1983; чч'а8пег, 1983; Веппеи й НиЬег, 1984; Соорег, 1984; ЕЙЬоЬп ег а1., 1984; Еп8!апдег й Ка11епЬасЬ, 1984; МкЫепдогГ, 1984; Регат й В!п8е, 1984; ТогсЫа, 1984; Гг)ейпап, 19856; В!п8е й РеМсо, 1985; Тегпег й Е!-8ауед, 1985). К'и! ег апгГ аг1иеоив яо!и! юпл !п гИИигИче ЬеЬаиог оГ ччагег шо1еси!ез ш гЬе ЪиИс воЬ епг апй !Иове ш Ьудгаг1оп 1ауегв пеаг шасгошо!еси!ея.
2Л '!ч'азег ав$ ая!иеоия во!извив 1п 1щиЫ ~чагег, ав ш ойег г!епяе шо1еси!аг яувгешв, ап ипроггап! в!гис!ига! <1егепп1папг 1в йе в!ге апд вЬаре оГ йе шгИчЫиа! пю!еси1ея. ч1)Ьеп гччо чагег пю!еси!ев арргоасЬ с!и!ге с!ояе!у, а вЬог1 гап8е Ъия вггоп81у гери!в!че Гогсе апвез Ггош йе очег!ар оГ йе1г е!ее!гоп с!оиИя. То а цоог! арргохипаИоп, еасЬ ччагег пю!еси1е сап Ье ГЬоиИЬГ го Ьаче а гери1я1че, ярЬеПса1 соге сепяегег! аГ йе оху8еп пис!еив. ТЬеве согев г!о по! аИочч йе оху8еп пис!е! оГ пчо ччагег пю1еси1ев Ю арргоасЬ гпоге с!ове1у йап аЪоиг 0.24 шп.
1п випр1е 1щиЫя, висЬ гери1в1че согев аге еввепИа1!у йе оп1у вягисяига! Иеяепшпапп Рог ехагпр!е, йе 1пяяапяапеоив в!гас!иге оГ !щиЫ ейапе 1в с!ове1у впш1аг го а гапг$ош депяе расЫп8 оГ ра!гв оГ очег!арр1п8 Ьагд врЬегев, юЬеге йе очег!арр1п8 врЬегев соггевропд со Ъопг!ег! шейу1 Игоирв.
г- - г %асег гв по! а вппр!е !щи!0, Ьоччечег. %агег шо!еси!ев Ьаче гИгесИопа1 аГггас11че 1и!егасИопв !Ьаг аге вггоп8 епоиИЬ го сошреге илгЬ йе гери1вюп оГ йе пю1еси! аг согез. ТЬе пюяг вгаЫе пю1еси1аг соп68игагюпв яГИ! ачоЫ очег!арр1п8 согея, Ъиг Ьаче ап ехрапг!ед я!гас!иге гЬа! ор6- пигев ГЬе аГГгасяюпв. ТЬеве аГГгасИче Гогсев аге оГ е!ес!гояГаяк ог18!и. РагИси!аг!у !шроггапг аге Ьудго8еп Ьопйп8 !и!егасгюпв. реп а Ьудго8еп агош !в соча!епг!ру Ъопдед !о оху8еп, п1гго8еп, ог сеггаш ойег е1ессгопе8аг1че асошв, йе ЬопгИп8 е!ее!гоп г!епв1гу 1в рагг!у вЫГгед опсо йе ЬеавИег агош.
ТЬе Ьудго8еп 1в 1еГг ччгЬ а в18п!Исаи! рапИа! роя111че сЬаг8е, апд сап арргоасЬ ойег агошв ге!аИче!у с!ояе1у Ьесаиве оГ !Ье г!гачгп-1п сЬагасяег оГ 1!в е!ее!гоп с!оид. БисЬ а Ьудго8еп йегеГоге Ьав а ге1аИче!у вггоп8 е!ес1гоя!аИс агггасИоп Гог оху8еп ог пИго8еп а!ошв илгЬ раг6а! пе8аИче сЬаг8ев.
ТЬеве аг!гасИче ш!егасИопв аге гегшес$ Ьудго8еп Ъопг!я; СЬе гпо!еси!е ог 8гоир чгИЬ Дк Ьуя!хапни 1в геГеггег! со ° .ьуа з ь'~~ -. аар ~- .»-р,.р'~ ЬуЫЮ Ь~ ~~ .НЬ6 В Маца~ И ~Му 1шроггапС го1е 1и вЬар1п8 гЬе вггис!иге оГ аг!иеоив вувгешв Ьесаияе йеяе шгегасг!опв орегаге оп!у и4!ГИп паггочч Иеошеспс гап8ев. ТЬе г!опог апг1 ассергог шияг Ье ии!ге с1ове, апИ йе Ьуг!го8еп сап по! Ье гоо Гаг ой' йе Ипе Ъегччееп йе е1есггопе8аИче аяошв йаг И 1ш$гв. Рог а рюг оГ ччагег шо!еси1ев чч1!Ь а Ипеаг Ьуг!го8еп Ъопг$, йе шахппшп вяаЪ1ИгаИоп 1в аЪоиг 20 !с!/шо! чгЬеп йе оху8епв аге верагагед Ьу 0.28 пш; йе 1пгегасг!оп арргоасЬея лего Гог оху8еп верагаИопв Игеагег йап 0.4 пш. тье е1есггопк соп08игаг1оп оГ гье оху8еп агош ш Н,О Ьав вр' 'ггЬгег апв! ациеоив зо!ийолв Щ. 2.2. %агег вггисгигев оЬвегчед ш воте сгувга81пе Ьуг!гагев (уейгеу, !984). Охудепв аге ас гЬе чегпсев, апд гЬе во!!д апй йавЬед !гаев гергевепг Ьудгодеп Ьопг1в.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
