Б. Альбертс, А. Джонсон, Д. Льюис и др. - Молекулярная биология клетки (djvu) (1129766), страница 594
Текст из файла (страница 594)
Химия белка определяется его поверхностной конформацией .............233 233 2.3.7. В цикле лимонной кислоты МАРН образуется при окислении ацстиль ных групп до СОг 2.3.8. В большинстве клеток синтез большей части АТР происходит за счет переноса электронов.. 3. 1. 1. Форма белка определяется последовательностью входящих в его состав аминокислот. 3.1.2. В результате фолдинга белок принимает конформацию с минимальной энергией 3.1.3.
Наиболсс распространенныс способы укладки полипсптидной цепи— зто а-спираль и 8.лист. 3.1.4. Бслковыс домены — зто тс блоки, из которых построены макромоле купы белков . 3.1.5. Лишь малая часть из множества возможных вариантов полипептидных цепей будет использована клеткой . 3.1.6. Белки можно подразделить на множество семейств......................... 3. 1.7.
По аминокислотным последовательностям можно выявить близкород ственные белки. 3.1.8. Нскоторыс бслковыс домены служат составными частями множества различных белков . 3.1.11. Крупныс белковые молекулы часто содержат более одной полипеп тидной цепи 3.1.12. Некоторые белки образуют длинные спиралевидные нити ............ 3.1.13. Молекулы многих белков имеют протяженную волокно-подобную форму 3.1.14. В полипсптидных цепях многих белков содержится удивительно много неструктурированных участков .. 3.1.15.
Внсклеточные белки нередко стабилизируются ковалентными по перечными межмолекулярными связями..................................... 3.1.16. Молекулы белка часто служат субъединицами для сборки довольно крупных структур. 3.2.3. Ключевые участки связывания лигандов можно выявить при сравнс нии аминокислотных последовательностей белков, входящих в одно семейство. 190 192 198 203 204 204 209 210 Содержание 235 3.2.5.
Особым многообразием отличаются участки связывания антител ....... 236 ............. 237 3.2.7. Ферменты — высокое пецифичные катализаторы............................... 238 3.2.8. Первый шаг фсрмснтативного катазиза — связывание субстрата ........ 240 3.2.9. Ферменты ускоряют реакции за счет избирательной стабилизации 246 катализ ... 246 3.2.!2.
Прочно связанные с белками небольшие молекулы придают белкам дополнительные функции .250 3.2.13. В ферментах со множественными каталитичсскими участками суб страты движутся по особым внутримолскулярным туннелям............ 252 3.2.!4. Мультифсрментные комплексы помогают увеличить скорость мста болизма в клетке.. . 254 3.2.15. Каталитичсскос действие ферментов регулируется самой клеткой......
255 256 258 260 3.2. 19. Аллостсричсский переход в аспартаттранскарбамоилазе изучен с точ постыл до отдельных атомов . 261 265 266 268 клеточные регуляторы .. .270 3.2.24. Рсгуляторные белки управляют активностью ОТР-связы-вающих 272 273 275 качивания молекул через мембраны .. ..
277 Заключение Задачи 290 Литература. .... 294 3.2.4. Одни белки связываются с другими белками через контактные поверх ности нескольких типов. 3.2.6. Мерой силы связывания служит константа равновесия переходных состоянии. 3.2.10. Ферменты могут одновременно испольэовать кислотный и основный 3.2.11. Лизоцим работает как типичный фермент 3.2.16. Аллостерическис ферменты обладают двумя и более взаимно влияю шими друг на друга участками связывания лигандов ............,......, 3.2.17. Два лиганда, участки связывания которых сопряжены, оказывают взаимное влияние на связывание с этим ферментом....
3.2.18. Симметричные бслковыс комплексы создают коопсративныс алло стсричсскис переходы. 3.2.20. Многие изменения в белках осуществляются за счет фосфорилиро 3.2.21. Все эукариотические клетки содержат богатый набор протсинкиназ и протеинфосфатаз 3.2.22. Регулирование Сбк- и Ягс-протеинкиназ показывает, каким образом белок может функционировать в качестве микрочипа . 3.2.23. Белки, которые связывают и гидролизуют ОТР, суть вездссущис белков, побуждая их к связыванию либо ОТР, либо ОРР 3.2.25. Небольшие движения в белках могут приводить к масштабным из мснениям 3.2.26. Движение в клетках обеспечивают моторные белки.......................
3.2.27. Связанныс с мембраной переносчики используют энергию для перс 3.2.28. Часто белки образуют крупные комплексы, из которых получаются настоящие белковыс машины 3.2.29. Бслковыс машины со взаимозаменяемыми деталями эффективно ис пользуют генетическую информацию .. 3.2.30. Активация белковых машин зачастую предполагает размещение их на специфических участках 3.2.31. Функционирование многих белков регулируется ковалснтной моди фикацисй 3.2.32.
В основе функционирования клетки лежит сложная сеть белковых взаимодействий.. 279 279 281 283 284 хй Содержание Глава 4.1 4. ДНК, хромосомы и геномы Структура и функция ДНК 302 4.1.1. Молекула ДНК состоит нз двух комплементарных цепей нуклсотндов .. 302 4.1.2. В структуре ДНК заложен сам механизм наследственности......... ..305 4.1.3. У эукариот ДНК заключена в ядре клетки ................. ...... ..308 Заключение 309 309 ..... 310 ... 312 содержать цснтромсру, две тсломеры и точку начала репликации ....... 322 4.2.7. В хромосомах молекулы ДНК сильно уплотнены........................ 323 4.2.8.
Основная структурная единица хромосомы эукариот — нуклсосома.... 324 4.3.1. Некоторыс ранние домыслы и предположения о структуре хроматина. 337 338 340 4.3.8. Хроматин в центромсрах раскрывает механизм образования особых структур разновидностями гистонов. 349 4.3.9. Структуры хроматина наследуются напрямую!..................................352 354 356 357 357 ЧАСТЬ И. ОСНОВНЫЕ ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕХАНИЗМЫ Хромосомная ДНК и ес упаковка в хроматиновое волокно 4.2.1. ДНК эукариот упакована в набор хромосом....... 4.2.2.
Хромосомы содержат длинные вереницы генов .. 4.2.3. Последовательность нуклсотидов генома человека показывает, каким образом расположены гены у людей 4.2.4. Сравнение геномов позволяет выявлять консервативные в эволюцион ном отношении области последовательности ДНК......................... 4.2.5. На протяжении жизни клетки хромосомы находятся в различных сос- тояниях 4.2.6. Каждая молекула ДНК, которая образует линейную хромосому, должна 4.2.9. Структура нуклеосомной кор-частицы показывает характер упаковки ДНК.
4.2.10. Нуклеосомы обладают динамичной структурой и часто подвергаются изменениям, катализируемым ЛТР-зависимыми комплексами перс стройки хроматина . 4.2.11. Нуклеосомы обычно упакованы в компактную хроматиновую фн бриллу. Заключение. Управление структурой хроматина. 4.3.2. Гетерохроматин высокоорганизован и необычайно устойчив к экс прессии генов. 4.3.3. Гистоны стержня ковалснтно модифицируются по множеству различ ных сайтов. 4.3А.
Хроматин приобретает дополнительное разнообразие за счет наличия сайт-специфичной замены гистонов на их минорные варианты 4.3.5. Вместе взятые, ковалснтныс модификации и разновидности гистонов образуют так называемый «гистоновый код», который помогает уста повить биологическую функцию .. 4.3.6. Комплекс код-считывающих и код-записывающих белков может рас пространять специфические модификации хроматина по хромосоме на большие расстояния 4.3.7.
Барьерные последовательности ДНК блокируют распространение ком плексов белков «чтение-запись» и тем самым разделяют соседствующие хроматиновые домены 4.3.10. Структуры хроматинаобусловливаютуникальные свойсгвахромосом эукариот Заключение . Глобальная структура хромосом 4.4.1. Хромосомы свернуты в крупныс петли хроматина..... 315 318 319 325 329 332 334 336 344 346 349 хш Содержание 359 364 365 366 368 371 373 375 376 4.5.2. Последовательности гсномов организмов двух видов различаются пропорционально промежутку времени, в течение которого они эво люционировали независимо друг от друга ................................ 377 379 расходятся структуры гсномов 381 4.5.5. Размер генома позвоночного отражает относитсльныс скорости при обретения и потсри ДНК в последовательности поколений........... 383 384 4.5.7.
Сравнение последовательностей ДНК многих видов позволяет выявлять важныс послсдоватсльности с неизвестной функцией....................... 385 4.5.8. Ускоренные изменения в ранее консервативных последовательностях могут помочь разгадать основополагающие этапы эволюции человека.. 387 Зада Лииг Глава 5 5.1. . 401 .404 .. 405 мутации должна . 406 .407 .. 408 5.2 лежит принцип .. 408 4.4.2. Политснныс хромосомы как ничто иное пригодны для демонстрации структур хроматина 4.4.3. Существует множество форм гстсрохроматина ....................... 4.4А. Петли хроматина становятся мснсс конденсированными во время экс прсссии расположенных в них генов..