Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_3 (1123315), страница 5
Текст из файла (страница 5)
Яппи. Вегг В!осйет. 71, 133 — 163. Обзор свойств и функций более десяти известных Д Н К-пол имераз зукариот. 1пйапг, С. 8з О'0оппеП, М. (2006) ТЬе гср1кабоп с1атрГоайой тасЬс пс ас чогй ш Йс Йгсс с1ова! пя оГ Ис. Хаг. Ветс Мо!. Се!! Вго!. 7, 751-761. Катада, К., НописЫ, Т., ОЬяшп1, К., Яитатого, Х., А Моп1саиа, К. (1996) Бсгиссиге о1 а гер1касюп-сегввасог ргосет сотр1ехед зч1сЬ 0ХА. Хивге 383, 598 — 603.
О структуре комплекса Тия-Тег. Коо!, Е. Т. (2002) Асйче я!се ЬВЬспсяя апс1 яи(сясгасе ГК сп 0ХА гер)кас!оп. Аппп. Всчс ВюгЬет. 71, 191-219. Прекрасный обзор, носвягценный молекулярным основам точности ДНК-полимеразы — геометрии пар оснований и образованию волородных связей. О'0оппе11, М. (2006) Кер(Шоте агсййессиге апг1 дупапися ш Екйепсйш со!с 7. В!о!. Сйет. 281, 10,653 — 10,656. Очень хороший обзор реакций в рспли кати в ной вилке. ЯПЬпап, В.
(2005) Ог(8!и гесойп!с!оп апд Йс сЬгоспояове сус1е. ЕЕВ5 Еет 579, 877 — 884. Хороший обзор но инициации репликации ДНК у эукариот. Ренирацня Д11К Ве8)еу, Т. !. 8 Бвпяоп, Е. О. (2003) АйсВ вуясегу яо1чед: охЫабче девейу(асюп оГ Х1-всйуЬЫспгпе апд ХЗ-вейу!сусоясне агЫисся Ьу а йгесс гечсгяа! все 1гапшв. Тшиг)я Вюсйеш. 5сй 28, 2-5. Егхйегйег,,с.
Р А Вегйег,,!. М. (2006) Ечо)иСюпагу ге1айопяйсря апд яспзссига1 весЬапШтя о1 ААА+ ргосеспя. Алии Веи Всорйуя. Вето!. 5ггисг. 35, 93 — 114. РпедЬегй, Е. С., БясЬЬаЬег, Р 1... 8 Кш(сег, С. (2001) Еггаг-ргопе 0ХА ро)утегаяея: поче1 яспксигся авг1 Йе Ьепейся о1 спргдейсу. Сей 107, 9 — 12. боойпап, М. Е (2002) Еггог-ргопе герасг 0ХА ро)увегаяея сп рго!сагуосея апд еийагуосея. Алли. Вегс Вгосйепь 71, 17-50. Обзор свойств ДНК-полимераз, число которых продолжает расти. Кипйе!, Т. А. А Епе, О.
А. (2005) 0ХА гпшвассЬ герагг. А пни. Леи Вюсйет. 74, 681-710. ЫпдаЫ, Т. й 4Чоод, К. О. (1999) с1иайсу сопсго1 Ъу 0ХА гера!с. 5аепсе 286, 1897 — 1905. Магией, 1..,!. 8 Р1аятагая,,!. Р (2001) Епдойепосся 0ХА давайе апд пшсабоп. Тгелг)я Селе!. 17, 214-221. Вапсаг, А. (1996) 0ХА ехсшюп гера!г. Лили. Вегс В!осйеаь 65, 43 — 81.
Вигген, М. О., ВппСЬ, В. Т., бодоу, Ъ'. б., 8 Ъайсег, б. С. (2000) ТЬе 505 геяропяе: гесепс ЫЫПЬЙ шсо ипш0С-дерспг!спс висайепея(я апд 0ХА дапзайе со(егапсе. Алли. Веи Селе!. 34, 479 — 497. ЪЧ!яоп, О. М. ЬН 8 ВоЬг, Ч. А. (2007) ТЬе гпесЬапкя ойюяе ехсшюп герагг, апс1 !ся ге(асгоп со ай!пй апс1 йяеаяе. 0АгА Вераш 6, 544-559. Вгоод, К. О., М!ссЬей, М., Зйоигоя,,!., 8 НпдаЫ, Т. (2001) Н ивап 0ХА герагг Вепея. 5смтке 291, 1284 — 1289.
Что расшифровка синома человека позволила узнать о репарации ДНК. !зскоиГииснцнп,'!! Н( Сох, М. М. (2001) Нсясодса( очегч(езч: яеагсЫпй 1ог гер1кабоп Ье!р сп ай о1 Йе тес р1асея. Рве. Мас!. АсаН. 5сй !!5А 98, 8173 †81. О том, как было показано, что рскомбицация участвует в репарации репликативной вилки. Сох, М.
М. (2007) Кейп)асюп о1 Ьассепа( КесА ргосесп йг псНоп. Сгй. Вегс Ввйеш. Мо!. Вю!. 42, 41 — 63. Сга!8, Х. Е. (1995) ()п!су сп сгапяродс(оп геассюпя. 5сгелсе 270,253 †2. бейегС, М. (2002) Ч(0)) гесовЬгпасюп: КАО ргосеспя, герасг 1ассогя, апд гейи1аНоп. Аппп. Лец В!осйепс 71, 10!в 132. бппйеу, Х. О. Е, ЪЧЫСеяоп, К. Е., А Кке, Р А. (2006) МесЬапшвя оГ Все-яресгйс гесовЬ!пайоп. Алли. Веп Вюслеш. 75, 567-605. Найег, В. 81 ВЬепасс, О.,!. (1997) Тгапярояйюп апд яссеярессйс гесотЬспасюп: аг1арйп8 0ХА сис-апд-раясе весЬа- 1! по ! Часть 111.
25. Метаболизм ДНК пгяпх го а табе гу о1 8епег)с геаггапйевепгх. ЕЕМ5 М!сгпЬ!о!. Легг 21, 157-178. Нап!1оп1, О. В. (2006) Тгапхрохпхове дунаю!сх апг$ гсйн!агюп !и Тп10 ггапзрояноп. Спг. Веп ВгосЬет. Мой В!иЬ 41, 407-424. Дствльнос описание олнпго нз хорошо нсслслованных бвктсрнвльных транс«озонов. Ф.пвеггй Я. Ь. 6, Сох, М. М. (2002) ТЬс Ьасгспа! КесА ргогип апд гйс гесшпЬшагюпа! (З14А гера~г о1'згайсг) гср!!саг!оп 1ог!гя А пни. Кв«В)всЬет.
71, 71-100. Рапнев, К 4 НаЬег, Я. Е. (1999) Мн!пр)с рвгйхиауь п1 гегопг- Ь!паг!оп !пг)нсег! Ьу г(о«Ые-зггвпг! Ьгезхх ш 5агяЬавтдсез гг тг таг. М!сшЬ!о!. Мо). Вю(. лег~. 63, 349 — 404. 8!пя1егоп, М. К., 1)!11!пяйав, М. Я., бано)ег, М., Кота!- схуйохивЬЬ Я. С., 8 %!81еу, 1). В. (2004) Сгузга( хггнсгнгс о( КссВС1) спхуп~е гсисв)з в пзас!зве 1«г рнюсхяп8 РЫА Ь ген ЫМп гиге 432, 187 — 193. Ъап 1)пупе, С. 1). (2001) А зггпсгнга! тсв о! Сгс-!ох р ягсх!тсйс ггсхх«Ьшвгюп. Лини. Вгш Вюрйух. В!отиЬ Вггигя 30, 87 — 104. Удв шый структурный анализ системы сайт-спсцнфнчсской рсхомбннацнн. Вопросы и задачи 1.
Выводы из эксперимента Мезельсона — Сталя. Эксперимент Мезельсона — Сталя (рис. 25-2) доказывает, что ДНК в клетках Е. сой претерпевает полуконсервативнукз репликацию. В «дисперсиошппзь модели репликации цепи родительской ДНК расщепляются на участки случайной длины, затем связываются с фрагментами заново реплицированной ДНК, что приводит к образованикз дуплексов. Объясните, почему результаты эксперимента Мезельсона и Сталя исключают такую модель.
2. Анализ репликации ДНК с помощью тяжелых изотопов. Кулыуру Е. сой, растущую на среде с "')ЧН„С1, переносят на среду, содержащун> ыЫН,С!, где клетки делятся три раза (т. е. численность клеток возрастает в восемь раз). Каково молярное соотношение гибрилной ДНК ('з)Ч вЂ” '")Ч) к легкой ДНК (ыЫ-ыЫ) в образовавшейся кульгуре? 3. Репликация хромосомы Е. сой. Хромосома Е. со1г содержит 4 639 221 и, н.
а) Сколько витков двойной спирали раскручивается при репликации хромосомы Е. сой? б) Исходя из сведений, представленных в данной главе, определите, сколько времени потребуется для регпикации хромосомы Е, сой при 37 'С, если две репликативные вилки начинают движение в точке начала репликации? Допустим, гго скорость репликации составляет 1000 и, н.ггс. В этих условиях клетки Е. сой делятся каждые 20 мин. Возможно ли это? в) Сколько (примерно) фрагментов Оказаки образуется при репликации хромосомы Е.
сой? Какие факторы гарантируют правильную сборку многочисленных фрагментов Оказаки в новукз ДНК? 4. Состав оснований ДНК, образованных на одноцепочечных матрицах. Оцените состав оснований всей ДНК, синтезированной ДНК- полимеразой па матрицах из эквимолярной смеси двух комплемептарцых цепей бактериофага фХ174 (кольцевые молекулы ДНК). Состав оснований одной цепи: А — 24,7Ж; О— 24,1ьо! С вЂ” 18,5ьо! Т вЂ” 32,7,ш Какое попущение необходимо сделать, чтобы ответить на этот вопрос? 5.
Репликация ДНК. Корпберг с коллегами ипкубировали растворигиые экстракты Е. сой со смесью г)АТР, г1ТТР, с)ОТР и с)СТР меченных з'Р по а-фосфатным группам. Через некоторое время инкубационнукз смесь обрабатывали трихлоруксусной кислотой, которая осаждает ДНК, но не осаждает нуклеотиды-предшественники. Осадок собирали и по количеству радиоактивной метки в осадке определяли количество предшественников, встроившихся в ДНК.
а) Если из инкубационной смеси удалить один из четырех предшественников, будет ли радиоактивная метка обнаружена в осадке? Поясните ответ. б) Может ли "Р вклк>чаться в состав ДНК, если метку содержит только г)ТТР? Поясните ответ. в) Будет ли обнаружена радиоактивность в осадке, если метку "Р включать в !)- или у-фосфатные, а не в а-фосфатные группы? Поясните. Вопросы и задачи ) з и ~ ) 6. Химия репликации ДНК. Все ДНК-полимеразы синтезируют новую цепь ДНК в направлении 5'- 3'. В определенном смысле репликация антипараллельных цепей ДНК-дуплекса была бы проще при наличии второго типа полимераз, способных синтезировать ДНК в направлении 3'- 5'.
В принципе два типа полимераз могли бы координировать синтез ДНК без тех сложных механизмов, которые требуются для репликации отстающей цепи. Однако таких 3'- 5' синтезирующих ферментов не обнаружено. Предложите два возможных механизма синтеза ДНК в направлении 3'. 5'. Одним из продуктов в обоих случаях был бы пирофосфат. Осуществимы ли эти механизмы в клетке? Почему да или почему нет? (Поьк сказка. Можете предположить существование предшественников ДНК, которых нет в современных клетках.) 7. Лидирующая и отстающая цепи. Составьте таблицу, в которой сравните репликацию лидирукнпсй и отстающей цепей ДНК у Е. сой.
Перечислите названия и функции предшественников, ферментов и других необходимых белков. 8. Функция ДНК-лигазы. Некоторые мутанты Е. сой содержат дефектную ДНК-лигазу. Бели такие мутанты обработать зН-меченым тимином и осадить полученную ДНК в градиенте плотности щелочной сахарозы, появляются две радиоактивные полосы.
Одна соответствует высокомолекулярщй фракции, другая низкомолекулярной фракции. Объясните эти данные. 9. Точность репликации ДНК. Какие факторы увеличивают точность репликации во время синтеза лидирующей цепи ДНК? Можно ли ожидать, что отстающая цепь будет образовываться с такой же точностью. Поясните свой ответ. 10. Важная роль ДНК-топоизомераз в репликации ДНК.
Раскручивание ДНК, например, при репликации влияет на плотность сверхспирализацин ДНК. В отсутствие топоизомераз ДНК перед репликативной вилкой была бы перекручена, поскольку позади вилки ДНК раскручена. Бактериальная репликативная вилка останавливается, когда плотность сверхспиратизации (о) ДНК перед вилкой достигает величины ч-0,14 (см. гл. 24). Двунаправленная репликация плазмиды размером 6000 п.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
