Biokhimia_T1_Strayer_L_1984 (1123302), страница 62
Текст из файла (страница 62)
Хен шресть оГ Ьроьошез, ВюсЬпп. ВюрЬуь. Асга, 457, 259 302. Розге 6., Иновал 6.6. (едь.), 1977. Оупапнс Аьреся о1 Сей БшГасе Огквпяа1юп, Ногй-Нойапд. (Содержит статьи, оосвяшенные динамике мембран, иммунологии клеточной поверхности, а также изменениям белков клеточной поверхности в проиессах раста и злокачественного перерохтдення.) Тап/отд С., 1980. ТЬе НудторЬоЬк Ейк1 ! Гоппагюп о1 Мкейез апд Вю!оиса( МешЬгапеь, 2пд ед., Вопросы и задачи ш(с!скору, Нынче, 257, 28-32.
(Впервые полученное изображение мем. бранного белка.црн разрешении 7 А отчетлива видны трансмембранно расположенные спирали.) (lлктп Р.Н. Т., Непдетьае Я., 1975. Мо1еси1аг ь!гисшге дегеппша!юп Ьу е1есггоп пнсгоьсору оГ ипяа(пед стих!вайс зресипепь, 1. Мо). Вю1., 94, 425-440. (Описание обшего подкода для экспериментального определения структуры мембранных белков, обраэуюших высокоупорядоченные двумерные структуры.) Мпнбрава эрптропита Бтес8 Т.Г... 1974. ТЬе огйапяадоп о1 ргогетпь ш 1Ье Ьиптап гед Ыоод сей шешЬгапе, 1. Сей Вю1., 62, 1- 19 Матсдт! К Т., Гитйтаут и., Татка М., 1976.
ТЬе гед сей пюпьтапе, Апп. Ксь. ВюсЬеш., 45, 667-698. Ьтесх Т. 1., 1978. Тье Ьапд 3 ргогетп о1 1Ье Ьишап гед сей шешЬгапе: а геээев. 1. Биргатпо1. гитис!, 8, 3!1 324 Сиитетическтт и реконструированные мембраны ЩетяЬег Б., Раскег Е. (тв.), 1974. МетЬодь (п Епзупю(обу, го1. 32, Асадепис Ргея. (Содержит прекрасные статьи по методам пзучени» мембран, в том числе по технике получения модельных и реконструированных мембран.) Оатяои А., Рапдеябггд Е А., ЕИптан М. Н., Монга( М.. 1979.
!псогрога1юп оГ шешЬгапс ргош(пь тп1о (агйе яп81е Ьг!ауег гезк)еь, 3. Сей Вю)., 81, 446-452. Яасят Е., 1977. Регьрсс1иез апд !ппйадопь о1 геьо1игюпь-гесопь1пипоп ехрепшепгь, 1. Биргашо!. Бггисг., 6, 215-228. 4. Коэффициент диффузии Р жесткой сферической молекулы задается уравнением Р = йТ(бтп) г), где г) — вязкость растворителя, г-радиус сферы, й †констан Больцмана (1,38 10 ъ эрг/град), Т вЂ абсолютн температура Чему равен коэффициент диффузии при 37"С белка массой 100 кДа в мембране, эффективная вязкость которой составляет 1 пуаз(1 пуаз= 1 эрг с/смз)? Какое в среднем расстояние проходит этот белок за 1 мкс, 1 мс, 1 с? Предположим, что белок является негидратированной, жесткой сферической частицей с плотностью 1,35 г»»смз. 5.
Корнберг и Мак-Коннелл (К.Р. Коп»бегй, Н. М=.МсСоппе11, 1971) исследовали поперечную диффузию фосфолипидов в двуслойной мембране, используя парамагнитный аналог фосфатндилхолина, так называемый снинмеченный фосфатидилхолин: Труппа оксида азота (МО) в спин-меченном фосфатидилхолине дает четкий парамагнитный резонансный спектр. Если в присутствии восстанавливающих а~сигов, например аскорбата, соединения оксида азота превращаются в амины, то этот спектр исчезает. Путем обработки ультразвуком и последующей очистки методом гель-фильтрации были получены липидные пузырьки, состоящие из фосфатиднлхолина (95"»,') и спин-меченного аналога (5/). Наружный диаметр этих липосом составлял около 250 А.
Спустя несколько минут после добавления аскорбата амплитуда парамагнитного резонансного спектра снижалась до 35"»,' первоначального уровня. После добавления второй аликвоты аскорбата не происходило заметных изменений спектра на протяжении нескольких минут, однако далее амплитуда этого остаточного спектра затухала по экспоненте с полупериодом б,5 ч.
Как объяснить эти изменения амплитуды парамагнитного спектра? О Н,С вЂ” <СН ), — С вЂ” Π— СН Н»С вЂ” <СН )»» — С вЂ” Π— СН О СН, О Н»С вЂ” Π— Р— Π— СН» — СН» — и — Н вЂ” О О- СН Глава 2 а) Фенилнзотиоцианат. 6) Дансилхлорид. в) Мочевнна; Р-меркаптоэтанол для восстано- вления дисульфилов.
г) Химагрипснп. л) Смаг. е) Тридснн. а) 3; 6) !2; в) 4,28; г) 9,8; д) 2,4. 0,01; 0,1; 1; 1О; !00. 477 А (318 остатков на цепь; 1,5 А на остаток) Каждый аминокислотный остаток, за исключе- нием С-концевого, при реакции с гидразинам лает гилразил. С-концевой остаток можно иден- тифицировать по тому признаку, что он лает своболную аминокислоту. а) Примерно ь 1 б) Два пептила. Боковая цепь 8-аминоэтилцнстенна схожа с бо- ковой цепью лизина; единственное различие за- «лючается в том, что в молекуле 8-аминозтилци- стеина вместо метиленовой группы стоит атом серы.
Нативная «анфармация инсулина-термодина- мически не самаа стабильная форма. ()бсуждс- нне этого вопроса см. в равд. 359. 2. 4. 5. 8. Глава 3 а) 2,96.!О " г. б) 2,7! 10е молекул. в) Нет. Если бы гемоглобин находился в ниле кубических кристаллов, то в одном эрнтроцпте умещалось бы 3,22 1О' молекул. Следовательно, реальная плотность упаковки гемоглобина в эритропите составляет 84% ат максимально возможной.
2,65 г (или 4,75 10 * моль) Ре. а) У человека 1,44 !О г г (449.!О моль) О на 1 кг мышц. У кашалота 0,144 г (4,49 10 моль) Оз на ! кг мышц. б) 128. а) Примерно -1-!бири РН 2, + 4 при РН 7 и ь 2 при РН 9. б) Примерно 10. Однако имеет место взаимодействие титрующихся групп, поэтому лсйстви- 2. 3. ОТВЕТЫ НА ВОПРОСЫ И ЗАДАЧИ тельная изоэлектрическая точка равна 8,2 Этот вопрос блестяще разбирается в статье 8ЬЬе 5.1., Напаша С« 1. Н., Ппгд Р, а. Н., Внюьеш!«ггу, 13.
2967 (1974). а) Три пептида, состоящие нз остатков от 1 до 55, от 56 до 131 и от !32 ло 153, б) Короткие «-спирали мало стабильны в во- дном растворе. В миоглобине они стабилизиро- ваны третичными взаимодействиями. [мы)Д 18 — — ' — — = 18ро — 18Р [МЬГ 3 зе' а) 8 = 20 с атше лена» [Мь) [Оз1 Аеппеплениа [МЬЬП,) К„,ш„ 6) Средняя пропал:кительнасть равна 0,05 с (величина, обратная 8, ). азшепленв» ' Раствор миоглобина 1 мг(мл (масса миоглобина= 17,8 «Да соответствует «онцеитрапии 5,62-10 ' М. Светопоглощение этого раствора при длине оптического пути 1 см со. стаял яет 0,84, что соответствует отношению )с )1, равному 6,96. Следовательно, через раствор проходит 14,4;2 падающего света.
Главе а) Увеличит. 6) Снизит. в) Снизит. г) Снизит сролство к кислороду. а и б) Свяжется меньше Н'. Инозитолгексафосфат. а) АУ = 0,977 — 0,323 = 0,654, б) ДУ = 0,793 — 0,434 = 0,359. а) РК снизится. б и в) РК увеличится. Дополннтельнав метияьна» группа препятствует перемещению атома железа в плоскость порфирииа при оксигенировании. Это молельное саелииение имитирует Т.состояние гемоглобина. Интересное обсуждение этого вопроса можно найти в статье СоПшап У. Р., Вгапшап 3.1., Пах«ее К. М., На!Ъаг Т. а., бш)юь К. 8., Ргас.
На!. Асад. 8с), 75, 564 (1978). а) Да. Клп пл(лвгКА)=2.10 ' м. б) Наличие А повышает связывание В н аналогично присутствие В повышает сввзыванне А. 2. 3. 4. Ответы аа вопросы в задача 225 Глава 6 4. Глава 5 2. 3 2(«зрбх) - «збз ь збу р/(8) 226 Окскл углерода, присоединившись к одному тему, изменяет сродство к кислороду других гамов в той же молекуле ! смог лобина. В частности, СО повышает сродство гемоглобина к «нслороду н тем самым снижает «олнчество О,, высвобождаемое в тхаггш. Ох«Ил угЛерода оказывает стабллнзнруюшее действие на «арактерястнкн четвертнчной структуры окснгемоглобнна.
Другими словами, СО нмлтнрует О, в качестве аллостернческого эффектора. а) Транспорт максимален прн К = 10 М. В общем случае етранспорт достигает макскмума прн К=)УЬ ь . б) Максимальный пе(жнос кислорода прн Р, = 44,7 торр, что значительно выше, чем 26 торр †величи, характерная для физиологических условий. Следует подчеркнуть, что в этом расчете не учнтываются аооператквность связывання н эффек~ Бора.
а) Лизин нлн аргяннн в положении 6. б) Прн РН 8 этот гемоглобин будет двигаться к аноду медленнее двух другнх гемоглобинов, поскольку у него нанменыпий общий отрицательный зарял. а) НЬС; б) НЬП; в) НЬ); г) НЬН. Муга«Ил гена «влияют на все трн гемоглобина. поскольку зтн гемоглобнны имеют соответственно следуюшпе субъеднннчные структуры: «збз, «зЬ« и «зуз Мутации генов !), Ь и у скажут. ся только на одном нз тнпов гемоглобина.
Реакция протекает быстро по сравнению со временем проведения электрофореза. Разделение «,« н «з«5 в электРнчсском поле сдвигает Равновесно' Реакции вправо. Дезокся-НЬА содержит комплементарный участок н поэтому может прнсоеднннться к волокну левекен НЬБ. Дальнейпэее удлинение волокна булет уже невозможным, так «ак в концевой моле«уле деюксл-НЬА нет липкого участка.
Свойственная лезокснгемоглобнну А водоролная связь между аспартатом н тлрознном в участке «, «,-контакта отсутствует а гсмоглабине Кешшеу (с. 100). Следовательно, лезокснформа этого мутантного гемоглобнна должна легче днссопннрааать на днмеры, чем нормальный гемоглобин. С другой стороны, окснгенированные формы обоих гемоглобннов лнссопннруют примерно алннаково, поскольку указанная водородная связь не участвует в стабнлизалнн нн того, нл другого гемоглобина.
Часть 1 Конформации и динамика а) 31,1 1О ' моль б) 5.10 ' моль. в) 622 с а) Да. К =5,2 10 еМ. М б) !' =6,84.10 '" моль. а«с в) 337 с а) В отсутствие ннглбнтора а« =47,6 И«моль(мнг! а К =1,1 1О ' М. В прн- М сутсэвнн ингнбнтора У не меняется, а капуа е шая.а К = 3,1 1О ' М. ы б) Конкурентное ннгнбнрованне. в) 1,1 1О зМ. г) / =0,243 н 7 =0,488. д) В отсутствие ингнбнтора Г = 0,73, а в прн- сутствнн 2 1О э М ннгнбнторв У = 0,49.
Соот- 88 ношение этих аслнчн, равное 1,49, эквнвалентно соотношению скоростей реакция в тех же усло- внах. а) Р =9,5 мкмоль(мнн. К =1,1 1О з М, ммс М так же «ак н в отсутствне ннгнбнтора. б) Неконкурегп нос. а) 2,5 10 з М. г) 0,73 как в присутствии, так а в отсутствне ангнбнтора. а) 1'= 1' — (у
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
