Введение в биохимию (1050242)
Текст из файла
Глава 1. ВВЕДЕНИЕ
1.1.Предмет, задачи и методы биохимии.
Биологическая химия (биохимия) - это наука о веществах, входящих в состав живых организмов, и о химических превращениях одних биогенных веществ (т.е. веществ синтезируемых живой природой) в другие биогенные вещества. Иными словами, биохимия – это органическая химия биогенных веществ.
Биохимия изучает процессы, протекающие в организме как in vitro (в колбе), так и in vivo (в живых системах).
Методы анализа (определения) состава организма подразделяются на физические и химические.
Физические методы – это методы, неразрушающие изучаемый объект. Используются в основном спектральные свойства вещества. Разделы физической химии (физхимии), применяющиеся при исследованиях: термодинамика, кинетика, строения вещества.
Химический анализ подразделяется на качественный (из чего состоит данная биологическая проба или объект) и количественный (сколько этих веществ в объекте или пробе). Химический анализ – это аналитическая химия.
Например, при помощи количественного химического анализа было определено, что в человеке содержится около 10 кг сухого вещества.
1.2. Отличительные особенности живой материи.
Признаки живого объекта:
-
Самовоспроизводство (рост, развитие, размножение)
-
Умение обучаться
-
Сходство в строении (все состоит из клеток)
-
Сходство в химическом составе.
В биохимии вся совокупность химических превращений в живом организме объединена понятием - метаболизм, органические вещества неживого происхождения - абиогенные вещества, продукты метаболизма – биогенные вещества.
Биохимические превращения (метаболические процессы в организме) выполняют функции:
-
Снабжение химической энергией, за счет расщепления богатых энергией пищевых веществ;
-
Превращение молекул пищевых веществ в строительные блоки, используемые в последующих метаболических процессах для построения клеточных компонентов (макромолекул);
-
Сборку клеточных компонентов (белков, нуклеиновых кислот, липидов, полисахаридов и прочих);
-
Синтез и разрушение биомолекул, выполняющих специфические функции клетки.
Живые клетки поддерживают свою внутреннюю упорядоченность в динамическом стационарном состоянии за счет веществ и свободной энергии поступающей из внешней среды и преобразуемых в процессе метаболизма.
Для синтеза органических веществ в живых организмах используются неорганические вещества: вода, углекислый газ, аммиак. Различия между растениями и животными состоят в том, что у животных подобный синтез происходит в значительно меньших объемах, так как ряд веществ для синтеза в организм животных поставляются в «готовом» виде.
Животные способны синтезировать большое количество соединений жирного и ароматического рядов. Для синтеза углеводов в организме используются органические молекулы, имеющие в своем составе 3 атома углерода – молекулы молочной кислоты, пировиноградной кислоты, глицерина и т.п. Эти вещества получили название гликогенообразователей, т. к. в печени они легко используются для синтеза гликогена.
Из продуктов превращения углеводов в организме образуются жиры. Из промежуточных продуктов превращения углеводов и жиров синтезируются некоторые α-кетокислоты: щавелевоуксусная, α-кетоглютаровая, пировиноградная и другие. α-Кетокислоты, присоединяя аммиак, превращаются в соответствующие аминокислоты. Однако, в организмах животных происходит синтез не полного необходимого для жизнедеятельности набора аминокислот. Полный набор аминокислот, необходимый для образования белков синтезируется только в зеленых растениях. Животные организмы способны к синтезу только некоторых циклических соединений, например, холестерина (основным «строительным» материалом которого является уксусная кислота). Организм человека не может синтезировать «простую» молекулу, имеющую бензольное кольцо, но легко синтезирует гетероциклические соединения – производные пурина, пиримидина и пиррола. Источниками в синтезе пурина являются молекулы глицина, углекислого газа, муравьиной кислоты и глутамина. В синтезе пиримидина участвуют карбаминовая и янтарная кислоты.
Все живые организмы делятся на две группы в зависимости в какой форме способны усваивать поступающий из среды углерод.
Автотрофные клетки используют в качестве единственного источника углерода СО2 (углекислый газ), из которого они строят углеродсодержащие биомолекулы. К этой группе принадлежат фотосинтезирующие бактерии и клетки зеленых растений.
Гетеротрофные клетки получают углерод в виде достаточно сложных органических соединений, например, глюкозы. К ним относятся клетки высших животных и большинство микроорганизмов.
В биосфере автотрофы и гетеротрофы сосуществуют как участники единого цикла, при котором осуществляется непрерывный круговорот углерода и кислорода между животным и растительным миров. Источником энергии этого процесса является солнечная энергия.
Рис.1.2.1
Помимо углерода, кислорода и энергии, всем живым организмам необходим азот. Азот требуется для синтеза аминокислот, пуриновых и пиримидиновых оснований. Из 20 необходимых аминокислот человек получает «готовыми» только из пищи 10 - эти аминокислоты организм человека не способен синтезировать. Растения же все аминокислоты синтезируют из азота (газообразного) или неорганических его соединений. Поскольку, основное количество азота (80%) содержится в виде газообразного (N2), то все живые организмы в конечном итоге зависят от организмов, способных его фиксировать. Азот фиксируют, например, цианобактерии (сине-зеленые водоросли) – они ведут независимое существование, потому что полностью автотрофны, т.е. усваивают азот, углекислый газ и способны к фотосинтезу. Азотфиксирующие бактерии, как правило, живут в почве. Некоторые из них живут в виде симбионтов на корневых клубеньках растений. Нитрифицирующие бактерии окисляют аммиак до нитритов и нитратов, а денитрифицирующие вновь превращают нитраты в аммиак. Таким образом, углерод, кислород и азот совершают непрерывный круговорот.
Рис.1.2.2.
Все метаболические процессы – цепные процессы и их можно подразделить на цепи биосинтеза (анаболизма) и цепи деградации (катаболизма).
Цепные процессы (реакции) можно представить как:
А → В → С → Д и т. д..
Цепные реакции образуют сети, в которые входят как процессы ассимиляции (синтеза), так и диссимиляции (распада).
Ассимиляция – анаболизм – накопление, потребление, синтез. Связана с ростом и развитием.
Диссимиляция – катаболизм – выделение, распад, деструкция (химическое расщепление). Это все процессы старения организма и отмирания каких-либо органов в процессе жизнеднятельности, рассасывания.
Ассимиляционный процесс (анаболизм), диссимиляционный (катаболизм) – связаны между собой таким образом, что сохраняется постоянство внутренней среды в организме по всем ее показателям, для обеспечения нормальной жизнедеятельности в окружающей среде.
Динамическое постоянство внутренней среды (крови, лимфы, тканевой жидкости) и устойчивость основных физиологических функций (кровообращения, дыхания, терморегуляции, обмена веществ и т.д.) организма человека и животных называется гомеостазом.
Минимальный объем веществ необходимый, для поддержания жизни человека, находящегося в состоянии покоя, называется – основным обменом. Например, в организм человека для обеспечения основного обмена требуется вводить 100 грамм белка в сутки.
Клеточный метаболизм – это система ферментативных превращений как веществ, так и энергии, начинающихся от исходных веществ и завершающихся биосинтезом живой материи.
Ферменты – это простейшие единицы метаболической активности; каждый из них, как правило, катализирует какую-нибудь одну химическую реакцию. Поскольку, метаболические процессы – это путь последовательных превращений, то в можно говорить о мультиферментных системах, действующих совместно в определенной последовательности.
Большинство ферментов представляют собой растворимые в воде глобулярные белки, кроме того, каталитическими свойствами могут обладать и структурные белки клетки.
1.3.Клетки. Иерархия структур в организации клеток.
Живая природа является неоднородной целостной системой, которой свойственна иерархическая организация. Совокупность всех живых организмов и среды их обитания - биосфера.
Иерархию всего живого можно представить следующей схемой:
Биосфера
(область распространения жизни)
экосистема (биоценоз (сожительство видов), (открытая
в вещественном и энергетическом плане система)
↙ ↘
популяция 1 популяция 2 популяция 3 ... и т.д.
(совокупность особей одного вида)
особи → физиологические системы → органы, ткани,
клетки
органеллы
(субклеточные структуры (мембраны, митохондрии и т.п.))
молекулы биополимеров
(в том числе молекулы нуклеиновых кислот, в составе которых – гены, содержащие весь необходимый объем биологической информации).
Клетка является структурной и функциональной основой живых существ. Клеточная теория сформулирована Маттиасом Шлейденом, Теодором Шванном в 1838 г.
Современная клеточная теория включает следующие основные положения:
-
Клетка — основная единица строения и развития всех живых организмов, наименьшая единица живого.
-
В сложных многоклеточных организмах клетки дифференцированы по выполняемой ими функции и образуют ткани; из тканей состоят органы, которые тесно связаны между собой и подчинены нервным и гуморальным системам регуляции.
-
Клетки всех одноклеточных и многоклеточных организмов гомологичны по своему строению, химическому составу, основным проявлениям жизнедеятельности и обмену веществ.
-
Размножение клеток происходит путем их деления. Положения о генетической непрерывности относится не только к клетке в целом, но и к некоторым из ее более мелких компонентов — к генам и хромосомам, а также к генетическому механизму, обеспечивающему передачу вещества наследственности следующему поколению.
-
Многоклеточный организм представляет собой новую систему, сложный ансамбль из множества клеток, объединенных и интегрированных в системе тканей и органов, связанных друг с другом с помощью химических факторов, гуморальных и нервных (молекулярная регуляция).
-
Клетки многоклеточных тотипотенты, т. е. обладают генетическими потенциями всех клеток данного организма, равнозначны по генетической информации, но отличаются друг от друга разной экспрессией (работой) различных генов, что приводит к их морфологическому и функциональному разнообразию - к дифференцировке.
Иными словами: Практически все биохимические реакции (на 95%) протекают в клетке. Состав клеток определяет состав организма. Превращения, которые протекают в клетке, определяют жизнедеятельность организма.
В общем смысле структура – это совокупность элементов, связанных между собой. Например, совокупность клеток – определяет структуру организма и биоэнергетический процесс в организме осуществляется через совокупность клеток.
Клеточная структура – это совокупность элементов (органелл), входящих в состав клетки.
Современная клеточная теория исходит из того, что клеточная структура является главнейшей формой существования жизни, присущей как растениям, так и животным. Совершенствование клеточной структуры явилось главным направлением эволюционного развития как у растений, так и у животных, и клеточное строение прочно удержалось у большинства современных организмов.
Клетки подразделяются на два больших класса: прокариотические (ПК) и эукариотические (ЭК).
Рис. 1.3.1.
Термины «прокариот» и «эукариот» возникли от древнегреческого karyon - орех, зерно - ядро и обозначают «прокариот» - «до ядра» и «эукариот» - «с оформленным ядром».
Клетки прокариотического типа – морфологически не структурированы (цитоплазма и ядро не разделены мембранами). Из таких клеток состоят бактерии и сине-зеленые водоросли (цианобактерии).
Клетки эукаритического типа подразделяются на растительные и животные. Эукариотические клетки структурированы (все компоненты клетки отделены мембранами).
Между клетками прокариот и эукариот существует и множество иных различий. У большинства прокариот нет внутренних мембранных органелл, а у большинства эукариот есть митохондрии и хлоропласты. В соответствии с теорией симбиогенеза, эти полуавтономные органеллы - потомки бактериальных клеток. Таким образом, эукариотическая клетка - система более высокого уровня организации, она не может считаться целиком гомологичной клетке бактерии (клетка бактерии гомологична одной митохондрии клетки человека). Таким образом, гомология всех клеток свелась к наличию у них замкнутой наружной мембраны из двойного слоя фосфолипидов (у архебактерий она имеет иной химический состав, чем у остальных групп организмов), рибосом и хромосом - наследственного материала в виде молекул ДНК, образующих комплекс с белками. Это, конечно, не отменяет общего происхождения всех клеток, которое подтверждается общностью их химического состава.
Таблица 1.3.1. Клеточные органеллы, их строение и функции
Органеллы | Строение | Функции |
Митохондрии | Микроскопические органеллы, имеющие двухмембранное строение. Внешняя мембрана гладкая, внутренняя образует различной формы выросты – кристы. В матриксе митохондрии (полужидком веществе) находятся ферменты, рибосомы, ДНК, РНК. | Универсальная органелла является дыхательным и энергетическим центром. В процессе кислородного (окислительного) этапа в матриксе с помощью ферментов происходит расщепление органических веществ с освобождением энергии, которая идет на синтез АТР* на (кристах). |
Лейкопласты | Микроскопические органеллы, имеющие двухмембранное строение. Внутренняя мембрана образует 2–3 выроста. Форма – округлая. Бесцветны. | Характерны для растительных клеток. Служат местом отложения запасных питательных веществ, главным образом крахмальных зерен. На свету их строение усложняется, и они преобразуются в хлоропласты. Образуются из пропластид. |
Хлоропласты | Микроскопические органеллы, имеющие двухмембранное строение. Наружная мембрана гладкая. Внутренняя мембрана образует систему двухслойных пластин – тилакоидов стромы и тилакоидов гран. В мембранах тилакоидов гран между слоями молекул белков и липидов сосредоточены пигменты – хлорофилл и каротиноиды. В белково-липидном матриксе находятся собственные рибосомы, ДНК, РНК. | Характерны для растительных клеток органеллы фотосинтеза, способные создавать из неорганических веществ (CO2 и H2O) при наличии световой энергии и пигмента хлорофилла органические вещества – углеводы и свободный кислород. Синтез собственных белков. Могут образовываться из пластид или лейкопластов, а осенью перейти в хлоропласты (красные и оранжевые плоды, красные и желтые листья). |
Хромопласты | Микроскопические органеллы, имеющие двухмембранное строение. Собственно хромопласты имеют шаровидную форму, а образовавшиеся из хлоропластов, принимают форму кристаллов каратинондов, типичную для данного вида растения. Окраска красная, оранжевая, желтая. | Характерны для растительных клеток. Придают лепесткам цветков окраску, привлекательную для насекомых-опылителей. В осенних листьях и зрелых плодах отделяющихся от растений, содержатся кристаллические каротиноиды ?– конечные продукты обмена. |
Клеточный центр | Ультрамикроскопическая органелла немембранного строения. Состоит из двух центриолей. Каждая имеет цилиндрическую форму, стенки образованы девятью триплетами трубочек, а в середине находится однородное вещество. Центриоли расположены перпендикулярно друг другу. | Принимает участие в делении клеток животных и низших растений. В начале деления (в профазе) центриоли расходятся к разным полюсам клетки. От центриолей к центромерам хромосом отходят нити веретена деления. В анафазе эти нити притягивают хроматиды к полюсам. После окончания деления центриоли остаются в дочерних клетках. Удваиваются и образуют клеточный центр. |
Клеточные включения (непостоянные структуры) | Плотные в виде гранул включения, имеющие мембрану (например, вакуоли). | Содержат запасные питательные вещества. |
Органоиды движения | Реснички – многочисленные цитоплазмические выросты на поверхности мембраны. | Удаление частичек пыли (реснитчатые эпителии верхних дыхательных путей), передвижение (одноклеточные организмы). |
Жгутики – единичные цитоплазматические выросты на поверхности клетки. | Передвижение (сперматозоиды, зооспоры, одноклеточные организмы). | |
Ложные ножки (псевдоподии) – амебовидные выступы цитоплазмы. | Образуются у животных в разных местах цитоплазмы для захвата пищи, для передвижения. | |
Миофибриллы – тонкие нити до 1 см. длиной и больше. | Служат для сокращения мышечных волокон, вдоль которых они расположены. | |
Цитоплазма, осуществляющая струйчатое и круговое движение. | Перемещение органелл клетки по отношению к источнику света (при фотосинтезе), тепла, химического раздражителя. |
* - (латинская аббревиатура аденозинтрифосфата, в русской аббревиатуре - АТФ).
Характеристики
Тип файла документ
Документы такого типа открываются такими программами, как Microsoft Office Word на компьютерах Windows, Apple Pages на компьютерах Mac, Open Office - бесплатная альтернатива на различных платформах, в том числе Linux. Наиболее простым и современным решением будут Google документы, так как открываются онлайн без скачивания прямо в браузере на любой платформе. Существуют российские качественные аналоги, например от Яндекса.
Будьте внимательны на мобильных устройствах, так как там используются упрощённый функционал даже в официальном приложении от Microsoft, поэтому для просмотра скачивайте PDF-версию. А если нужно редактировать файл, то используйте оригинальный файл.
Файлы такого типа обычно разбиты на страницы, а текст может быть форматированным (жирный, курсив, выбор шрифта, таблицы и т.п.), а также в него можно добавлять изображения. Формат идеально подходит для рефератов, докладов и РПЗ курсовых проектов, которые необходимо распечатать. Кстати перед печатью также сохраняйте файл в PDF, так как принтер может начудить со шрифтами.