Диссертация (Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе), страница 10

PDF-файл Диссертация (Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе), страница 10 Биология (46085): Диссертация - Аспирантура и докторантураДиссертация (Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе) - PDF, страница 10 (460852019-06-29СтудИзба

Описание файла

Файл "Диссертация" внутри архива находится в папке "Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе". PDF-файл из архива "Экспрессия генов транскрипционных факторов LXRalpha, LXRbeta, PPARgamma и транспортера ABCA1 при атеросклерозе", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "биология" из Аспирантура и докторантура, которые можно найти в файловом архиве СПбГУ. Не смотря на прямую связь этого архива с СПбГУ, его также можно найти и в других разделах. , а ещё этот архив представляет собой кандидатскую диссертацию, поэтому ещё представлен в разделе всех диссертаций на соискание учёной степени кандидата биологических наук.

Просмотр PDF-файла онлайн

Текст 10 страницы из PDF

Равные количества белка макрофагальныхлизатов смешивали с 4х буфером Лаемли (200мМ Tris-HCl pH 6,8, 400 мМ βмеркаптоэтанол, 4 % додецилсульфат, 0,01 % бромфенол, 40 % гицерол (Laemmliet al., 1970) в соотношении 2 объема белка/1 объем буфера, после чего кипятили втечение 5 мин. при температуре 1000С. После кипячения пробы (5мкг на лунку), атакже маркер молекулярного веса (Thermo Fisher Scientific, США), наносились наполиакриламидный гель (SDS-PAGE) с последующим проведением электрофорезав 1Х трисглициновом буфере (5Х стоковый раствор содержит: 25мM Tris-HCl pH8,8, 250 мM глицина (pH 8,3), 0,1 % додецилсульфата). После этого сиспользованием прибора для полусухого переноса Semi-dry (Хеликон, Москва)проводился перенос белка с полиакриламидного геля наPVDF мембрану(Millipore, Massachusetts, США) с использованием буфера для переноса (39 mMглицина, 48 мМ Tris-HCl pH 8,8, 0,037 % додецилсульфата, 20 % метанола).

Далеесогласно молекулярному весу белка ABCA1 и β-актина мембрану разрезали иполученные фрагменты однократно промывали в растворе PBS, после чегопроизводили их «забивку» 5% разведенным в растворе PBS обезжиренным сухиммолоком в течение 1 часа при комнатной температуре. После «забивки» фрагментPVDF мембраны, содержащий ABCA1, инкубировали с первичными кроличьимиполиклональными антителами к ABCA1 (1:1000; ab7360, Abcam, Великобритания),а фрагмент PVDF мембраны, содержащий β-актин, с антителами к ß-актину(1:10000; ab8227, Abcam, Великобритания) в течение ночи при +4 0С. После этоготрижды промывали в холодном растворе PBS фрагменты мембраны иинкубировали их в течение 1 часа при комнатной температуре со вторичными63антикроличьими антителами, конъюгированными с пероксидазой хрена (1:3000;ab6721, Abcam, Великобритания).

Затем снова трижды промывали холодным PBS.Далее связанные с соответствующим белком на обоих фрагментах мембранывторичные антитела идентифицировали с использованием набора Amersham ECLPlusSystem(AmershamBiosciences,Великобритания)сиспользованиемфотопленки CEA (Швеция).Данные вестерн-блоттинга анализировали с помощью программы ImageJ(Версия 1.38a для Windows, http://rsb.info.nih.gov/ij/).

Содержание ABCA1нормировали к содержанию ß-актина.2.6 Статистическая обработка данных.Статистический анализ данных был проведен с использованием пакетапрограмм Statistica 6.0. Для качественных данных определяли частотывстречаемости в %. Проверку соответствия полученного распределения генотиповравновесию Харди-Вайнберга осуществляли при помощи непараметрическогокритерия χ2. Соответствие полученных данных нормальному распределениюпроверялось с помощью критериев Шапиро-Уилка или Колмогорова-Смирнова взависимости от размера выборки. Для сравнения количественных данныхиспользовали метод дисперсионного анализа ANOVA для нескольких групп инепараметрический метод U-теста Манна-Уитни.

Значения p<0.05 считалисьстатистически значимыми. Для определения относительного риска использовалипоказатель соотношения шансов (odds ratio, OR), рассчитываемый по формулеOR=××где a – количество пациентов, имеющих более редкую аллель, b – количествопациентов, не имеющих более редкую аллель, c – количество индивидуумов изконтрольной группы, имеющих более редкую аллель, d – количествоиндивидуумов из контрольной группы, не имеющих более редкую аллель.

Дляопределения корреляции между количественными характеристиками пользовалиськорреляционным анализом по Спирмену. Коэффициент корреляции r>0.5 при64р<0.05 означал положительную и статистически значимую корреляцию междупризнаками, а отрицательное значение r соответствовало обратной корреляции.Средние величины в тексте диссертации и в таблицах приведены в видесреднего значения ± стандартное отклонение.

В случае достоверных различийдополнительно приведены значения медианы (минимум – максимум).65Глава 3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕОбщая характеристика группы больных с атеросклерозом, подтвержденными представителей контрольной группы, приведена в таблице 3.Таблица 3Характеристика группы пациентов с атеросклерозом, подтвержденнымметодом ангиографии, и контрольной группыПараметрВозраст (лет)ВозрастпервыхклиническихГруппа пациентов сКонтрольнаяатеросклерозомгруппа(N=119)(N=300)51.41±6.2145.60±6.3047.87±7.05манифестаций (лет)Пол (%мужчин/%женщин)79/2163/37Курение (%)57.14*43.53ОХС, ммоль/л5.82±0.535.44±0.39Х-ЛПВП, ммоль/л0.93±0.11*1.17±0.09Сокращения:ОХС–общийхолестерин,Х-ЛПВП–холестеринлипопротеинов высокой плотности.Примечание: Данные представлены в виде M±SD, где M – среднее значение,SD – стандартное отклонение; N – объем выборки; *p<0.05.В таблице 3 представлены средние значения основных показателейлипидного обмена.

Проведенный нами сравнительный анализ содержанияхолестерина и его фракций в сыворотке крови больных и контрольной группы66соответствовал общепринятому определению состояния обмена липидов согласнорекомендациямВсероссийскогонаучногообществакардиологов(ВНОК)(Рекомендации ВНОК, 2009).У большинства пациентов с атеросклерозом отмечены традиционныефакторы риска развития заболевания – курение и пониженный уровень Х-ЛПВП.Данные показатели достоверно отличались от показателей лиц контрольнойгруппы (p<0.05).

Таким образом, подтверждается вклад в риск развитияатеросклероза таких факторов, как курение и снижение уровня антиатерогенногоХ-ЛПВП.В изучение молекулярных механизмов атеросклероза артерий особоевнимание уделяется исследованиям экспрессии генов липидного обмена вмакрофагах артериальной стенки, представляющих собой основной тип клеток,участвующих в образовании очагов поражения при атеросклерозе.Для оценки уровня мРНК генов PPARγ, LXRα, LXRβ, MMP-9 и ABCА1 иуровня белка ABCА1 в макрофагах, активированных M-CSF, были сформированыгруппа пациентов и контрольная группа. Общая характеристика группы больныхатеросклерозом, подтвержденным ангиографическим методом, и контрольнойгруппы, приведена в таблице 4.Поскольку мужской пол является фактором риска развития атеросклероза иССЗ нами была подобрана группа больных мужского пола (15 человек, 53.87+6.78лет) и контрольная группа, состоящая из 19 человек (52.05±6.05) также мужскогопола.Курение является одним из традиционных факторов риска развитияатеросклероза.

В таблице 4 представлены частоты курящих индивидуумов висследуемых группах. По данному показателю не было отмечено достоверныхразличий между исследуемыми группами.67Таблица 4Характеристика группы пациентов с атеросклерозом и контрольной группы,отобранных для изучения уровня мРНК генов PPARγ, LXRα, LXRβ, MMP-9 и ABCА1и уровня белка ABCА1 в макрофагах.ПараметрВозраст (лет)ВозрастпервыхклиническихГруппа пациентов сКонтрольнаяатеросклерозомгруппа(N=15)(N=19)53.87±6.7852.05±6.0547.73±4.33манифестаций (лет)Пол (%мужчин/%женщин)100/0100/0Курение (%)33.3331.58ОХС, ммоль/л4.75±1.174.84±1.11Х-ЛПВП, ммоль/л1.15±0.26*1.39±0.30Сокращения:ОХС–общийхолестерин,Х-ЛПВП–холестеринлипопротеинов высокой плотности.Примечание: Данные представлены в виде M±SD, где M – среднее значение,SD – стандартное отклонение; N – объем выборки; *p <0.05.При парном сравнении двух выборок – независимой группы здоровыхиндивидуумов и пациентов с атеросклерозом, выявлены статистически значимыеразличия в уровне Х-ЛПВП.

Средний уровень Х-ЛПВП был ниже в группе68больных, чем в контрольной группе (p<0.05). Однако средние уровни ОХС в плазмекрови не различались между исследуемыми группами.Современные клинические рекомендации рассматривают Х-ЛПВП как одиниз важнейших факторов кардиоваскулярного риска, мониторинг которогонеобходим для оценки качества гиполипидемических мероприятий (AdultTreatment Panel III of the National Cholesterol Education Programme, 2002). Внастоящее время снижение уровня Х-ЛПВП в плазме крови ассоциируется сповышением уровня Х-ЛПНП и Х-ЛПОНП в эндотелии артерий, нарушением ихтранспорта в гепатоциты, активацией продукции провоспалительных цитокинов,локальнымобразованиемпенистыхклеток,формированиемдисфункцииэндотелия. Показано, что все эти процессы влияют и на величины риска развитияатеросклероза.

При проведении гиполипидемических мероприятий наибольшаяроль отводится статинам, которые снижают образование холестерина и ЛПНП,увеличивают соотношение ЛПВП/ЛПНП. снижают включение холестерина всубинтиму сосудов. Однако было показано, что статины также могут снижатьэкспрессию гена ABCA1 в моноцитах и макрофагах у человека (Wong et al., 2008).Поэтому, нами были отобраны пациенты с атеросклерозом, которые не получалистатинов либо других гиполиподемических препаратов, для исключениявозможного изменения экспрессии исследуемых генов и уровень липопротеинов вплазме крови под влиянием данных препаратов.Задачей нашего исследования было изучение экспрессии генов PPARγ, LXRα,LXRβ, MMP-9 и ABCА1 в макрофагах, активированных фактором M-CSF.

Выборэтих параметров был продиктован тем, что они в значительной мере определяютхарактеристику липидного обмена в макрофагах и механизмы развитияатеросклероза.Ранее было показано, что фактор M-CSF действует на моноциты in vivo,стимулируяихдифференцировкувмакрофаги.Данныемакрофагихарактеризуются проатерогенным фенотипом, и именно этот подкласс макрофаговпреимущественно присутствует в атеросклеротических бляшках (Di Gregoli,69Johnston, 2012). Экспрессия M-CSF повышена в атеросклеротических бляшкахчеловека и животных (Clinton et al., 1992). Таким образом, инкубированиемоноцитов в течение 5 суток в присутствии M-CSF позволяет получить макрофагии исследовать экспрессию генов PPARγ, LXRα, LXRβ, MMP-9 и ABCА1 в условиях,приближенных к условиям in vivo.Микрофотографии моноцитов и макрофагов представлены на Рисунок 13.Популяциямоноцитовхарактеризоваласьзначительнымчисломклетоксферической и овальной формы, имеющих округлое темное ядро, а макрофагибыли представлены крупными клетками с выраженной адгезией на стекле изначительным присутствием полигональных клеток с множеством псевдоподий.Рисунок13.Дифференцировкамоноцитов,культивированныхвприсутствии М-CSF, в макрофаги.

а - Моноциты, культивированные 2 часа; б Макрофаги после 5 суток культивирования в присутствии M-CSF.3.2 Анализ вклада вариантов гена АВСА1 (R219K, 319ins<G, (-17)G>C) вразвитие атеросклерозаЧастоты вариантов гена АВСА1 (R219K (G655A), 319ins<G, (-17)G>C) вгруппе больных с атеросклерозом и в контрольной группе представлены в таблице705.

В исследуемых группах распределение генотипов гена ABCA1 находилось всоответствии с распределением Харди-Вайнберга.Таблица 5Частоты вариантов гена АВСА1 в группе пациентов с атеросклерозом, и вконтрольной группеВарианты гена АВСА1Группа пациентовКонтрольнаяс атеросклерозомгруппа ЧастотаЧастота аллелейаллелейn (%)n (%)RR60(50.4)150(50.0)RK52(43.7)131(43.7)KK7(5.9)19(6.3)f(R аллель)0.720.72f(К аллель)0.280.28CC68(57.1)156(52.0)CG44(37.0)131(43.7)GG7(5.9)13(4.3)f(G аллель)0.760.74f(С аллель)0.240.26NN101(84.9)224(74.6)NG+GG18(15.1)*75+1(25.4)f(N аллель)0.930.87f(Gаллель)0.070.13R219K(-17)G>CInsG319*p<0.05, OR (NG+GG vs NN) = 0.55, (95%ДИ: 0.35-0.86)В нашем исследовании показано, что в контрольной группе, которуюсоставили представители Санкт-Петербурга, частоты вариантов гена АВСА1(R219K, 319ins<G, (-17)G>C) были сопоставимы со значениями, полученными вевропейских популяциях (Zwarts et al., 2002; Jensen et al., 2007; Ma et al., 2011).71Различий в частотах вариантов R219K и (-17)G>C гена АВСА1 междугруппой пациентов с атеросклерозом и контрольной группой не было обнаружено(Таблица 5).В группе пациентов с атеросклерозом наблюдалось достоверное снижениечастоты варианта G319 гена АВСА1 по сравнению с контрольной группой (15.1% и25.4%, соответственно, р=0.03, df=1).

Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
5288
Авторов
на СтудИзбе
417
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее