Льюин (Левин) - Гены - 1987 (947308), страница 243
Текст из файла (страница 243)
1О. РНК-полимеразы -транскринционный аппарат юютки . Что представляет собой РНК-полимераза? Субъединичная структура бактериальной РНК- полимеразы . Сигма-фактор контролирует связывание РНК- полимеразы с ДНК . Рабочий цикл сигма-фактора Минимачьный фермент синтезирует РНК . Функции субьединиц минимаяьного фермента РНК-нолимеразы фатов, возможно, являются «минимальнымн» ферментами Сложные эукариотические РНК-полимеразы Рекомендуемая литература . Промоторы: самгы инициации траискрипнни .
Определение стартовой ~очки !и ч!чо и 1п чпго Сайт связывания РНК-полимеразы Консервативная последовательность в про- моторах Е. сей Промоторные мутации, усиливающие и ос- лабляющие экспрессию генов Основные точки контакта в промоторе . Узнавание промоторов и расплетание двой- ной спирали ДНК Позитивная регуляция работы промогоров Возможные консервативные последователь- носэи для РНК-полимеразы П . Системы транскрипции щ ч!!го и !и Ичо В системе ш и!го РНК-полимераза П функ- ционирует правильно . Промоторы РНК-полимеразы П многоком- понентны .
Промотор РНК-полимеразы П! расположен в самой транскрипционной единице Рекомендуемая литература . Системные переключеыня ныщзннрования траис- крмпцни Спорообразование Сигма-факторы, специфические лля различных стадий фаговой инфекции Для каждого сигма-фактора может существо- вать своя собственная консервативная после- довательность — 35 и — 10 Новая фагоспецифическая РНК-полимераза Рекомендуемая литература .
Терминяция н антнтермниацнв Обнаружение терминаторов в системе !п ч|гго Существуют р-зависимые и р-независимые терминаторы Немного об инвертированных повторах . Достигнув полиндрома, минимальный фермент приостанавливается Как работает фактор р? Мутации по гену фактора р Механизм антитерминации, контролируемый фаговым геномом Антитерминация зависит от определенных сайтов в ДНК Существуют ли дополнительные субьединицы у РНК-полимеразы? Трудности в изучении терминации у эукариот Рекомендуемая литература .
ЧАСТЬ 1У. КОНТРОЛЬ ГЕННОЙ ЭКСПРЕССИИ У ПРОКАРИОТ 14. Опером на примере оргаыизацни лактозных генов 541 Оглавление 221 222 178 178 222 178 180 224 224 181 225 181 182 184 184 185 186 187 188 226 . 227 228 229 229 Гл 188 230 190 191 231 232 191 232 234 234 236 192 194 196 Глава 19.
Исследование ДНК 236 197 200 236 238 241 242 201 201 203 243 244 245 204 205 Глава 205 206 248 250 207 208 252 254 208 255 2!О 213 255 2!4 216 258 218 262 264 266 219 220 Индукция и репрессии контролируется ма- лыми молекулами Кластеры генов регулируются координиро- ванно Регуляторный ген контролирует структурные гены Контролирующая система оперона . Конститутивные мутации определяют действия репрессора Функция оператора Иис-доминантна В промоторе или гене репрессора могут встречаться неиндуцибельные мутации Каким путем репрессор блокирует транс- крипцию? Контакты в операторе Взаимодействие субъединиц репрессора . Репрессор-белок, связывающийся с ДНК .
Отделение репрессора от ДНК . Накопление излишков репрессора, Парадокс индукции . Рекомендуемая дитература . ава 15. Системы контроля: средства регуляции оперонов Различия между позитивным и негативным контролем Триптофановый оперон является репрессибельным Модификация координированной регуляции Триптофановый оперон контролируется с помощью аттенуации . Аттенуация контролируется с помощью альтернативных вторичных структур Широкое распространение явления аттенуапии Репрессия может иметь место для множества покусов Арабинозный оперон находится под двойным контролем Сложная организация регуляторной области ага-оперона .
Двойной промотор галактозного оперона . Катаболитная репрессия способствует преимущественному использованию глюкозы Аутогенный контроль трансляции рибосомных белков . Аутогенный контроль и сборка макромолекул Неблагоприятные условия определяют строгий ответ Рекомендуемая литература . Глава 16. Лнтический каскад и лизогенняя репрессия Литический цикл состоит из отдельных стадий Литическое развитие подвержено каскадной регуляции Образование кластеров генов с родственными функциями у фатов Т7 и Т4 О том, как фаг лямбда осуществляет свой литической каскад Лизогения поддерживается благодаря аутогенному циклу . Репрессор- димер с различными доменами Репрессор связывается кооперативно в каждом операторе Как запускается синтез репрессора? Для литической инфекции необходим аитирепрессор Чувствительный баланс: лизогения против лизиса .
Рекомендуемая литература . ЧАСТЬ У. СТРОЕНИЕ ГЕНОМА ЭУКАРИОТ 176 177 Глава 17. Геномы зукариот: множество иоследователь- ностей . Парадокс величины С характеризует разли- чия в размерах геномов Кинетика реассоциацни зависит от генети- ческой сложности последовательностей ДНК Эукариотические геномы состоят из после- довательностей нескольких типов .
Размер генома можно оценивать по слож- ности неповторяющейся ДНК Геиомы эукариот содержат повторяющиеся последовательности . Умеренно повторяющаяся ДНК состоит из множества различных последовательностей . Члены семейств повторяющихся последова- тельностей сходны, но не идентичны . Участки умеренно повторяющейся ДНК чере- дуются с участками неповторяющейся ДНК Рекомендуемая литература . ! 88 Глава 18. Структурные гены: как оин представлены в мРНК Являююя ли структурные гены уникаль- ными или повторяющимися'.
Большая часть структурных генов относится к неповторяющейся ДНК Сколько уникальных генов экспрессируется'! Оценка числа генов по кинетике реакции, определяемой концентрацией РНК Уровни экспрессии генов сильно различаются Перекрывание популяций мРНК Рекомендуемая литература . Любая последовательность ДНК может быть клонирована в бактериях Получение химерной ДНК Получение ДНК-копий на матрице мРНК Выделение из генома индивидуальных генов Клонирование всей ДНК генома (ашотган») с образованием библиотек генов Эукариотические гены могут экспрессироваться в бактериях с образованием белка Рекомендуемая литература .
20. Структурные гены! внугренняв организация 245 Обнаружение прерывистых генов с помощью электронной микроскопии Рестрикционное картирование прерывистых генов Характеристика фрагментов геномной ДНК Гены имеют самое разнообразное строение и размеры Интроны генов, кодирующих рРНК и тРНК Интроны -неповторяющнеся и быстро эволю- ционирующие компоненты генома На границах экзон-интрон имеется канони- ческая последовательность .
Интрон одного гена может быть экзоном другого гена Интрон, который может кодировать регуля- торный белок . Сложные локусы имеют очень большие раз- меры и участвуют в регуляции Как появились прерывистые гены? Рекомендуемая литература . 542 Оглавление 267 авя 21 301 268 268 302 269 302 270 272 305 306 272 308 308 273 274 РНК: ПРОЦЕССИНГ 309 Глава 25 310 275 311 276 311 277 278 313 279 280 314 315 317 280 22 23 Глава 281 Глава 26 317 282 318 320 282 321 322 287 288 288 324 325 Глава 289 289 328 331 290 Глава 331 332 333 335 336 291 292 336 337 341 342 343 344 344 347 297 Г.тяня 298 Глава 24 298 298 348 349 ЧАСТЬ Ч1.
КЛАСТЕРЪ1 СХОДНЫХ ПОСЛЕДОВА- ТЕЛЬНОСТЕИ ДНК Структурные гены: организация родственных генов Множество типов глобинов . Гены глобинов организованы в виде класте- ров Неравный кроссинговер приводит к перестрой- ке кластеров генов Многие формы и-талассемии — результат не- равного кроссинговера Новые гены, образующиеся при б-формах тачассемии Кластеры генов подвержены постоянным пе- рестройкам Эволюционное древо глобиновых генов . Дивергенция нуклеотидных последовательно- стей указывает на различие путей эволюции организмов . Два типа дивергенций последовательностей ДНК Использование часов для изучения эволю- ции генов глобина Механизмы, обеспечивающие сохранение в геноме функционально активных последова- тельностей Псевдогены — тупики эволюции Семейства генов обычно кодируют белки, богато представленные в клетке Рекомендуемая литература .
Гемомы клеточных органелл Гены органелл не подчиняются законам Мен- деля Геномы органелл представляют собой коль- цевые молекулы ДНК В органеллах экспрессируются нх собствен- ные гены . Митохоццриальный геном дрожжей имеет большие размеры Компактная организация генома митохондрий млекопитающих ДНК некоторых органелл участвует в процес- се рекомбинации . Перестройки митохондриальной ДНК дрожжей Рекомендуемая литература .
Сходство в различия кластеров тандемных генов Гены гистонов образуют повторы . Разнообразие кластеров тандемных генов гнс- тона рРНК и тРНК кодируются повторяющимися генами . Тандемио повторяющаяся единица включает оба рРНК гена Некоторые рРНК-гены располагаются не в хромосомах . О нетранскрибирующихся спейсерах и промо- торах 55-гены и псевдогены перемежаются Эволюционная дилемма . Бактериальные рРНК-гепы и тРНК-гены вхо- дят в состав одних и тех же оперонов .
тРНК-гены могут быть организованы в виде кластеров Рекомендуемая литература Организация простых носледовательмостей ДНК Семейство А1п Обращенные повторы мгновенно ренатури- руют Высокоповторяюшаяся ДНК образует сател- литную ДНК Сателлитная ДНК часто располагается в об- ласти гетерохроматина Сателлитная ДНК членистоногих состоит из очень коротких идентичных повторов . Сателлнтная ДНК млекопитающих состоит из иерархически организованных повторов Реконструкция этапов эволюции сателлитной ДНК Различия в существующей в настоящее время повторяющейся единице сателлитной ДНК Роль неравного кроссинговера Фиксация при кроссинговере может обеспе- чивать существование идентичных повторов Рекомендуемая литература .
ЧАСТЬ ЧП. СОЗРЕВАНИЕ 275 Образование стабильной РНК путем разреза- ния н подравнмванмя предшественника Фосфодиэфирные связи могут расщепляться с обеих сторон РНКаза П! «вырезаеть ранние мРНК фага Т7 из полицистрониого продукта транскрип- ции Рибосомные РНК образуются из своих пред- шественников под действием РНКазы П1 . Сайты расщепления при созревании эукариоти- ческой рРНК тРНК разрезаются и подравниваются несколь- кими ферментами Рекомендуемая литература . Механизмы свлайсмнга РНК Сплайсинг дрожжевой тРНК включает раз- резание и сщивание Необычный сплайсинг рРНК Теггийутева .
РНК как катализатор: расширение понятия биохимического катализа . Реакция сплайсинга РНК осуществляется в определенной предпочтительной последова- тельности Границы сплайсинга могут быть взаимоза- меиаемыми Мутации в канонических последовательностях могут влиять на сплайсинг Участвуют ли в сплайсинге малые ядерные РНК7 Рекомендуемая литература Регуляция процессинга РНК гяРНК имеет большие размеры и нестабильна мРНК образуется из гяРНК Значение полиаденилирования . гяРНК устроены более сложно, чем мРНК Осуществляется ли регуляция на посттранс- крицционном уровне? . Модели регуляции экспрессии генов . Роль клеточных полипротеинов Рекомендуемая литература . ЧАСТЬ ЧП1.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
