Диссертация (1174340), страница 23
Текст из файла (страница 23)
Результаты ДНК-скрининга не должны рассматриваться в отрыве от результатовдругих клинических тестов. В частности, при выявлении пороков развития плода спомощью УЗИ, необходимо проведение медико-генетического консультированиядля решения вопроса о возможном назначении инвазивных диагностическихпроцедур вне зависимости от результатов ДНК-скрининга.8. Результаты ДНК-скрининга должны интерпретироваться врачом акушеромгинекологом или врачом-генетиком. В случае неблагоприятных результатов ДНКскрининга консультация врача- генетика обязательна.142Приложение 2Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининга анеуплоидий плода покрови матери методом высокопроизводительного секвенированияКлинические рекомендацииОбразец информированного согласияПОЛНОЕ НАИМЕНОВАНИЕ УЧРЕЖДЕНИЯНАЗВАНИЕ СТРУКТУРНОГО ПОДРАЗДЕЛЕНИЯИнформированное согласие на исследование«Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг анеуплоидий по крови матери»Я, __________________________________________________________________________,дата рождения (день, месяц, год) ________________________,паспорт (серия, номер) ________________________, кем выдан ___________________________________________________________________ когда выдан «____» ______________г.,проживающая по адресу ________________________________________________________,контактный телефон __________________________________,срок беременности ______________,мой вес______кг,мой рост ________см.Я проинформирована о назначении, возможностях и ограничениях неинвазивногопренатального ДНК-скрининга анеуплоидий у плода по крови матери, в том числе:- ДНК-скрининг по крови матери предназначен для выявления женщин с высокимриском наличия анеуплоидий у плода и не заменяет диагностические инвазивные тесты.- В случае выявления хромосомных нарушений с помощью ДНК-скрининга по кровиматери необходимо проведение подтверждающих диагностических инвазивных процедур.При этом важно учитывать, что прерывание беременности по медицинским показаниям(хромосомная патология плода) разрешено до 22 недель беременности (Приказ МинздраваРоссии от 12 ноября 2012г.
№ 572н).- Пренатальный ДНК-скрининг анеуплоидий по крови матери не предназначен длявыявления микроаномалий хромосом, мозаицизма, полиплоидии, структурных аномалийхромосом, моногенных и других генетических заболеваний, не связанных санеуплоидиями.- При наличии в семье ранее выявленных наследственных патологий можетпотребоваться назначение иных видов скрининговых тестов или проведение пренатальнойдиагностики с целью исключения конкретных заболеваний.
В этом случае необходимопроконсультироваться с врачом-генетиком.- Отсутствие у плода нарушений по данным неинвазивного пренатального ДНКскрининга по крови матери не гарантирует отсутствие анеуплоидий как поисследованным, так и по другим хромосомам.143- Точность выявления разных анеуплоидий отличается (для 21-й и 18-й хромосомвыше, чем для 13-й и половых хромосом).- При низкой доле внеклеточной плодовой ДНК в крови матери получениерезультатов может оказаться невозможным. В этом случае необходима консультацияврача, в том числе для решения вопроса о проведении повторного исследования илиинвазивной диагностики.- Сдача крови осуществляется натощак в сроки беременности с 10-11 до 17акушерских недель; проведение исследования на более поздних сроках допускаетсятолько на основании коллегиального решения врача акушера-гинеколога, врача-генетика,врача лабораторного генетика.- Перед сдачей крови необходимо избегать повышенной физической активности, т.к.она может приводить к снижению доли внеклеточной плодовой ДНК.- Полученная в ходе исследования информация может быть в обезличенном видеиспользована медицинским учреждением для научных исследований в порядке,регламентированном ФЗ от 27.07.2006г.
№152-ФЗ «О персональных данных».Я понимаю всю информацию, содержащуюся в данном документе. Я имелавозможность задать все интересующие меня вопросы и получила удовлетворившие меняответы. Ознакомившись с вышеуказанной информацией, на проведение неинвазивногоДНК-скрининга по крови матери согласна.Пациент (Ф.И.О.) _____________________________ Подпись ______________________Подтверждаю, что пациент ознакомился с представленной информацией и расписался вмоем присутствии.Медицинскийработник (Ф.И.О.) _______________________________ Подпись______________________Дата «____» ___________ 20____г.144Приложение 3Образец сопроводительного документа-направления на исследованиеПОЛНОЕ НАИМЕНОВАНИЕ УЧРЕЖДЕНИЯНАЗВАНИЕ СТРУКТУРНОГО ПОДРАЗДЕЛЕНИЯНаправление на исследование«Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг анеуплоидий по крови матери»Ф.И.О.
пациента_______________________________________________________________Номер карты_________________Направивший врач_______________________________Наличие информированного согласия на исследование (да, нет)_________Дата рождения (день, месяц, год) ________________________Рост __________смВес _________ кгСрок беременности (акушерский) _____ недель _____ днейКоличество плодов ______Беременность (нужное подчеркнуть):наступила самопроизвольно / в результате применения ВРТ / суррогатное материнствоПредполагаемые нарушения на основании других исследований (УЗИ, биохимическогоскрининга и т.п.), если имеются ____________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________________Дата забора крови (день, месяц, год) ______________Время забора крови _____ час _____минФ.И.О. и подпись лица, проводившего забор крови_________________________________Указанные выше сведения и мои данные на пробирках верны._________________________ (подпись пациента)145Приложение 4Образец клинического лабораторного заключения (пример 1)ПОЛНОЕ НАИМЕНОВАНИЕ УЧРЕЖДЕНИЯНАЗВАНИЕ СТРУКТУРНОГО ПОДРАЗДЕЛЕНИЯ«Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг анеуплоидий по крови матери»Ф.И.О.
пациента_______________________________________________________________Название направившего учреждения______________________________________________Номер карты_________________Направивший врач_______________________________Наличие информированного согласия на исследование ________________Возраст ______ полных летИндекс массы тела (ИМТ) _______ кг/м2Срок беременности _____ недель _____ дней (на момент забора крови).Количество плодов ______Самостоятельная беременность или в результате экстракорпорального оплодотворения(ЭКО) ____________________________Предполагаемые нарушения на основании других исследований (УЗИ, биохимическогоскрининга и т.п.), если имеются_____________________________________________________________________________Материал получен «____» ___________ 20____г.ЗАКЛЮЧЕНИЕФракция плодовой ДНК составляет 7% (выше 4%, порога чувствительности метода).Вероятность анеуплоидий по хромосомам 21, 18, 13, атакже численных нарушений по половым хромосомам:Дата «____» ___________ 20____г.<0,02%.Врач: ________________________________Примечание: Если данным методом нарушений у плода не выявлено, нельзя полностьюисключить анеуплоидии как по исследованным, так и по другим хромосомам.
Методимеет ограничения, в частности, невозможность выявления микроаномалий хромосом,мозаицизма, полиплоидий, структурных аномалий хромосом, моногенных и другихгенетических заболеваний, не связанных с анеуплоидиями.146Приложение 5Образец клинического лабораторного заключения (пример 2)ПОЛНОЕ НАИМЕНОВАНИЕ УЧРЕЖДЕНИЯНАЗВАНИЕ СТРУКТУРНОГО ПОДРАЗДЕЛЕНИЯ«Неинвазивный пренатальный ДНК-скрининг анеуплоидий по крови матери»Ф.И.О. пациента_______________________________________________________________Название направившего учреждения______________________________________________Номер карты_________________Направивший врач_______________________________Наличие информированного согласия на исследование ________________Возраст ______ полных лет Индекс массы тела (ИМТ) _______ кг/м2Срок беременности _____ недель _____ дней (на момент забора крови).Количество плодов ______Беременность наступила самопроизвольно или в результате экстракорпоральногооплодотворения (ЭКО) ____________________________Предполагаемые нарушения на основании других исследований (УЗИ, биохимическогоскрининга и т.п.), если имеются__________________________________________________Материал получен «____» ___________ 20____г.ЗАКЛЮЧЕНИЕФракция плодовой ДНК составляет 9% (выше 4%, порога чувствительности метода).Установлен высокий риск трисомии по хромосоме 21 (выше 95%).Рекомендована консультация врача-генетика с целью назначения пренатальнойдиагностики методом кариотипирования.Дата «____» ___________ 20____г.Врач: ________________________________147Заключение по многопллодной беременнностиПриложение 6ФГБУ "НМИЦ АГП им.
В.И.Кулакова" Минздрава РоссииМосква, ул.Акад. Опарина, д.4, тел.8(495) 531-44-44Отделение клинической генетики8-495-438-24-10ЗАКЛЮЧЕНИЕ ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ИНВАЗИВНОЙ ПРЕНАТАЛЬНОЙДИАГНОСТИКИ № ____Ф.И.О.: XXXXXXXXXXXXXXXX Дата рождения: XXXXXX1982 Возраст: 36 летАмбулаторная карта №: 61242/18 И.Б.Диагноз:Беременность 9-10 недель в 36 лет трихориальная триамниотическая. В анамнезенеразвивающаяся беременность двойня в сроке 5- 6 нед., без выскабливания (2016). O30.1С целью определения кариотипа плода, в первом триместре произведено тритранабдоминальных хориоцентеза под контролем ультразвукового исследования.По клеткам хориона прямым методом установлены кариотипы плодов.1.
Кариотип плода 46, ХУ,9phнормальный мужской кариотип, расположение гетерохроматинового района хромосомы 9в коротком плече (вариант нормального полиморфизма) (1 правый плод из тройни).2. Кариотип плода 46, ХУ,9phнормальный мужской кариотип, расположение гетерохроматинового района хромосомы 9в коротком плече (вариант нормального полиморфизма) (2 средний плод из тройни).3. Кариотип плода 47, ХХ,+21несбалансированный женский кариотип, трисомия по 21 хромосоме(3 левый плод из тройни).Врач-лабораторный генетик________________________ Бугай Т.В.Заведующий отделением клинической генетикид.м.н., профессор________________________ Бахарев В.А.12.09.2018148Приложение 7Лабораторное заключение по результатам ДНК-скринингаНомер образца ЛИС:k734Характеристика плазмы:плазма чистая без примесей18,20Количество ДНК, полученное привыделении, в нг:Баркод (IonXpress):IonXpress_1Количество входящей ДНК, в нг ( > 2):7,28Концентрация библиотеки ДНК на участке150-350 п.н., в pM ( > 200 pM):7 625,00Количество ридов после удаления ПЦРдупликатов ( > 5 000 000):5824683Генетический пол плода:мужскойДоля плодовой ДНК по Y-хромосоме14,1( > 4%):Доля плодовой ДНК по 21-хромосомеДоля плодовой ДНК по SNP ( > 4%):4,60%10.6(6.4-22.0)-1,02Соотношение X/YT-score 13 хромосома ( < 4):-0,9T-score 18 хромосома ( < 4):-2,4T-score 21 хромосома ( < 4):4,5Результаты исследования:Анализируемый образец содержит ДНК с МУЖСКИМ генотипом.Высокий риск трисомии по 21-й хромосоме.149Приложение 8Лабораторное заключение по результатам ДНК-скринингаНомер образца ЛИС:k734BХарактеристика плазмы:плазма без примесейКоличество ДНК, полученное привыделении, в нг:35.40Баркод (IonXpress):003Количество входящей ДНК, в нг ( > 2):7.79Концентрация библиотеки ДНК научастке 150-350 п.н., в pM ( > 200 pM):6738Количество ридов после удаления ПЦРдупликатов ( > 5 000 000):4005475Генетический пол плода:мужскойДоля плодовой ДНК по Y-хромосоме14,35%( > 4%):Доля плодовой ДНК по 21 хромосоме:Доля плодовой ДНК по SNP ( > 4%):4,85%17.9(6.4-19.2)Соотношение X/Y-0,87T-score 13 хромосома ( < 4):-0,5T-score 18 хромосома ( < 4):-0,9T-score 21 хромосома ( < 4):7,0Результаты исследования:Анализируемый образец содержит ДНК с МУЖСКИМ генотипом.Высокий риск трисомии по 21-й хромосоме.150Приложение 9Лабораторное заключение по результатам ДНК-скринингаЗависимость нормированного покрытия от GC состава:Отклонение покрытия хромосом от референсных данных:151БлагодарностиВзаключениехочувыразитьглубокуюблагодарностьипризнательность моим научным руководителям Трофимову ДмитриюЮрьевичуиКаретниковойвысоквалифицированнуюпомощьНаталииАлександровненаэтапахвсехзавыполнениядиссертационной работы.Также хочу выразить искреннюю благодарность и признательностьсвоим коллегам Шубиной Екатерине, Мукосей И.С., Гольцову А.Ю.,Крашенинниковой Р.В., Сибгатуллиной Д.Б., Ступко О.К., Бугай Т.В.,КочетковойТ.О.,Бахареву В.А.,ЕкимовуЗарецкой Н.В.,А.Н.,ТюнинойАндроновойТ.Ю.,Н.В.,СаделовуИ.О.,БыстрицкомуА.А.,Донникову А.Е., руководителю 2-го акушерского отделения патологиибеременности Тетруашвили Н.К.
и сотруднику отделения Ким Л.В.,руководителюпатолого-анатомическогоотделенияЩёголевуА.И.исотруднику отделения Ляпину В.М., всему коллективу ФГБУ "НМИЦ АГПим. В.И. Кулакова".Отдельно выражаю благодарность за неоценимую помощь и поддержкудиректору Центра Сухих Геннадию Тихоновичу и председателю обществаакушеров-гинекологов Серову Владимиру Николаевичу."Работа поддержана Министерством образования и науки РоссийскойФедерации(соглашениеRFMEFI60715X0136)."№14.607.21.0136,идентификаторпроекта.