Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150381), страница 16

Файл №1150381 Диссертация (Разработка новых металл-аффинных сорбентов, содержащих железо(III), для решения задач фосфопротеомики) 16 страницаДиссертация (1150381) страница 162019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 16)

Было показано, что ФОС, в томчисле и зарин, способны взаимодействовать с белками крови [111], в том числе ссывороточнымальбумином,чтофосфонилированныхбелков,афосфонилированныхпептидовприводитпосле(содержащихкобразованиюферментативногоостатокэфирааддуктовгидролиза–иметилфосфоновойкислоты), которые могут являться долгоживущими маркерами интоксикации ФОС.В последние годы успешно проводится разработка методик извлечения избиообразцов фосфонилированных пептидов с использованием метода металлаффинной хроматографии. Одним из применяемых в этих целях сорбентов являетсякоммерческий гель PHOS-Select Iron Affinity Gel (Sigma Aldrich), содержащийжелезо(III). Ранее в работах [112, 113] была показана возможность выделения аддуктовфосфорорганических соединений с сывороточным альбумином методом металлаффинной хроматографии на указанном сорбенте, однако, информация относилась ктакимФОС,какпараоксониRVx,овыделенииаддуктовсдругимифосфорорганическими соединениями данные отсутствовали.

Поэтому представлялосьинтересным показать возможность селективного извлечения фосфонилированныхпептидов на разработанных МХС Fe(III) и МОС Fe(III) на примере ранее неисследованного аддукта.Известно, что основной мишенью для присоединения зарина к молекулеальбумина является тирозин-411 [114], соответственно, в пептическом гидролизатесывороточногоальбуминачеловека,модифицированногозарином,могут93присутствовать два пептида 1638.9 Да (LVRYзаринTKKVPQVST) и 1525.8 Да(VRYзаринTKKVPQVST), содержащие тирозин-411, модифицированный остаткомзарина (сдвиг массы относительно нативных пептидов составляет 120 Да). Следуетотметить низкую интенсивность сигналов этих пептидов в масс-спектре исходногообразца (рисунок 36.А).

Это обусловлено соотношением 1:100 между количествамимодифицированного зарином сывороточного альбумина человека и нативного.LVRYзаринTKKVPQVSTВБVRYзаринTKKVPQVSTАРисунок 36 – Масс-спектр образца, содержащего гидролизат сывороточного альбуминачеловека, обработанного зарином в концентрации 0.1 мг/мл: А – до металл-аффиннойхроматографии; Б – после металл-аффинной хроматографии на МХС Fe(III)(элюирование 0.5% водным раствором пиперидина); В – после металл-аффиннойхроматографии на МОС Fe(III) (элюирование 15% ПФОС в 0.5% водном растворепиперидина)94После проведения металл-аффинной хроматографии на сорбенте МХС Fe(III) (п.2.6.5) и масс-спектрометрического анализа методом МАЛДИ (п.

2.7.1) в масс-спектрахэлюата (0.5% водный раствор пиперидина) были надежно детектированы сигналы,соответствующие двум указанным выше аддуктам (рисунок 36.Б). Аналогичныерезультаты были получены и при использовании МОС Fe(III), элюирование проводили15% ПФОС в 0.5% водном растворе пиперидине (рисунок 36.В).Наличие модификации в пептидах было доказано методом тандемной массспектрометрии по отщеплению нейтральной частицы (рисунок 37).Рисунок 37 – Определение наличия модификации остатком зарина в фрагментныхмасс-спектрах пептида LVRYзаринTKKVPQVSTСледует отметить, что практически полное отсутствие примесных сигналовсвидетельствует о высоком уровне специфичности МХС Fe(III) к фосфонилированнымпептидам.Таким образом, показана возможность селективного выделения аддуктов заринаспептидамисывороточногоальбуминачеловекаметодомхроматографии на новых сорбентах, содержащих железо (III).металл-аффинной95Основные результаты41Впервыепоказанавозможностьиспользованияколлапсированныхмонослоев- пленок Ленгмюра-Блоджетт на основе стеарата железа(III) – МХС Fe(III) –в качестве сорбентов для металл-аффинной хроматографии.2Впервые золь-гельсинтезом,методом с совместным самораспространяющимсяиндуцированныммикроволновымизлучением,былиполученынаноразмерные структуры на основе оксида железа(III) – МОС Fe(III).

Установлено,что размер полученных частиц составляет 20-50 нм. Показана возможность ихиспользования в качестве металл-аффинных сорбентов.3Изученыструктурыповерхностисорбентовметодомсканирующейэлектронной микроскопии. Определены физико-химические свойства полученныхструктур МХС Fe(III) и МОС Fe(III): удельная поверхность (15 и 60 м2/гсоответственно), изоэлектрическая точка (рН 3.5 и 5.5 соответственно).4Определена сорбционная емкость МХС Fe(III) и МОС Fe(III) по пептидуSSNGHV(pY)EKLSSI (0.035 и 0.019 мкмоль/мг соответственно), изучены изотермысорбции белка казеина быка (casein Bos Taurus) и фосфорилированных пептидов,показано, что они соответствуют теории Ленгмюра.5Оптимизированы условия выделения фосфорилированных пептидов с цельюповышения селективности анализа.

Показано, что добавление перфтороктановойсульфокислоты к элюенту приводит к улучшению десорбции фосфорилированныхпептидов с разработанных сорбентов и, соответственно, повышению степени ихизвлечения.6Показанавозможностьиспользованияразработанныхсорбентоввфосфопротеомном анализе, исследованы специфичность и селективность сорбентов напримере фосфорилированных триптических пептидов казеина быка и синтетическихпептидов,фосфорилированнымпоразличнымаминокислотам.Показано,чторазработанные сорбенты обладают высокой селективностью и могут быть примененыдля анализа биологических образцов.7Впервые показана возможность селективного выделения аддуктов зарина спептидамисывороточногоальбуминачеловекахроматографии на сорбентах, содержащих железо (III).методомметалл-аффинной96Список сокращенийБЭТ – метод Брюнера–Эммета–ТеллераВЭЖХ – высокоэффективная жидкостная хроматографияВЭЖХ-МС – высокоэффективная жидкостная хроматография с массспектрометрическим детектированиемВЭЖХ-УФ – высокоэффективная жидкостная хроматография сультрафиолетовым детектированиемМАХ – металл-аффинная хроматографияМОАХ – металлоксидная аффинная хроматографияМОС – металл-оксидный сорбентПАВ – поверхностно-активное веществоПФОС – перфтороктановая сульфокислотаМХС – металл-хелатный сорбентТрис – трис(гидроксиметил)аминометанТФУ – трифторуксусная кислотаЭДТА – этилендиаминтетрауксусная кислотаCID – collision induced dissociationDHB – 2,5-dihydroxybenzoic acid, 2,5-дигидроксибензойная кислотаIDA – iminodiacetic acid, иминодиуксусная кислотаIMAC – immobilized-metal affinity chromatographyМАЛДИ –матрично-активированная лазерная десорбция/ионизацияNTA – nitrilotriacetic acid, нитрилотриуксусная кислотаTOF – time-of-flight, времяпролетный97Список литературы1Leitner A.

Phosphopeptide enrichment using metal oxide affinity chromatography// Trends in Analytical Chemistry – 2010. – Vol. 29, N 2. – P. 177–185.2Batalha I.L., Lowe C.R., Roque A.C.A. Platforms for enrichment ofphosphorylated proteins and peptides in proteomics // Trends in Biotechnology. – 2011. –Vol. 30, N 2. – P. 100-110.3Рожкова Е.А., Краснов И.А., Суходолов Н.Г., Иванов Н.С., ПодольскаяЕ.П., Янклович А.И., Краснов Н.В. Исследование свойств наноструктур (пленокЛенгмюра-Блоджетт), содержащих ионы железа, и определение их состава спривлечением методов масс-спектрометрии // Научное приборостроение.

– 2008. –Т.18, № 4. – С. 54-61.4Селютин А.А., Колоницкий П.Д., Суходолов Н.Г., Шрейнер Е.В., КрасновН.В., Подольская Е.П. Синтез и характеризация нанорегулярных сорбентов на основеоксида циркония // Научное приборостроение. – 2013. – Т.23, №1. – С. 115-122.5Machida M., Kosako H., Shirakabe K., Kobayashi M., Ushiyama M., Inagawa J.,Hirano J., Nakano T., Bando Y., Nishida E., Hattori S. Purification of phosphoproteins byimmobilized metal affinity chromatography and its application to phosphoproteome analysis// FEBS J. – 2007. – Vol. 74, N 6. – P. 1576-1587.6Li B., Schopfer L.M., Hinrichs S.H., Masson P., Lockridge O. Matrix-assistedlaser desorption/ionization time-of- flight mass spectrometry assay for organophosphorustoxicants bound to human albumin at Tyr411 // Analytical Biochemistry.

– 2007. – V. 361. –P. 263–272.7Porath J., Carlsson J., Olsson I., Belfrage G. Metalchelate affinitychromatography. A new approach to protein fractionation // Nature. – 1975. – V. 258. – P.598–599.8Knecht S., Ricklin D., Eberle A. N., Ernst B.

(2009). Oligohis-tags: Mechanismsof binding to Ni2+ -NTA surfaces // J. Mol. Recognit. – 2009. – V. 22. – P. 270–279.9Walsh P. S., Metzger D. A., Higuchi R. Chelex 100 as a medium for simpleextraction of DNA for PCR-based typing from forensic material // BioTechniques. – 1991. –V. 10. – P. 506–513.9810Takeda N., Matsuoka T., Gotoh M. Potentiality of IMAC as sample pretreatmenttool in food analysis for veterinary drugs // Chromatographia.

Характеристики

Список файлов диссертации

Разработка новых металл-аффинных сорбентов, содержащих железо(III), для решения задач фосфопротеомики
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6451
Авторов
на СтудИзбе
305
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее