Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150378), страница 14

Файл №1150378 Диссертация (Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики) 14 страницаДиссертация (1150378) страница 142019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 14)

Основа металл-аффинной хроматографии – донорноакцепторное взаимодействие между металлом сорбента и кислородамифосфорной группы, поэтому в качестве элюентов были выбраны: 0,5% водныйпиперидин, показавший свою эффективность для железосодержащегосорбента (PHOS-Select™ Iron Affinity Gel (Sigma Aldrich)); 0,5% имидазол(ранее нами не применяемый); водный раствор ацетонитрила (30%, 50%, 70%),десорбирующий фосфонилированные пептиды [107]. Контроль десорбциипроводили методом МАЛДИ-МС. Эксперимент показал, что водные растворыпиперидина, имидазола и 30% водный раствор ацетонитрила не элюируютаддукты с сорбента, в то время, как в масс-спектрах, соответствующихэлюатам 50% и 70% водного ацетонитрила, присутствуют искомые сигналы,но недостаточной интенсивности по отношению к сигналам неспецифичносорбированных пептидов (рис.

31). Стоит отметить, что использование вкачестве элюента смеси 0,5% пиперидина в 70% ацетонитриле не улучшаетэлюированиеаддуктовссорбента.Образецэлюата70%воднымацетонитрилом был передан для количественного анализа (НИИ ГПЭЧ ФМБАРоссии), который показал, что при однократной обработке с сорбентаэлюируются примерно 25% сорбированных аддуктов, что потребовалооптимизации методики элюирования.91Рисунок 31. МАЛДИ масс-спектр образца, содержащего пептическийгидролизатсывороточногоальбуминачеловека,модифицированногозоманом: 1 – масс-спектр гидролизата до проведения металл-аффиннойхроматографии; 2 – проскок с колонки; 3 – элюат с колонки 70% воднымацетонирилом.3.15.3 ИсследованиевозможностидесорбцииаддуктовФОСссывороточным альбумином человека с сорбента путем разрушения структурымонослоевПри исследовании монослоев стеарата лантана было показано, чтонеполярные растворители (гексан) способны их полностью растворить.

Намибыло сделано предположение, что такая процедура способна привести кулучшению десорбции аддуктов. Во-первых, нарушение структуры монослоядолжно снизить силу взаимодействия между аналитом и ионами металлов, вовторых – выделение пептидов в этом случае можно провести по принципужидкость-жидкостной экстракции.92Сорбцию аддуктов из пептического гидролизата сывороточногоальбумина человека, модифицированного зоманом, проводили в условиях,описанных выше (методика представлена в п.

1.3.1). После промывки сорбентоставили на воздухе для испарения остатков воды, после чего в спиновуюколонку добавили гексан до полного растворения монослоев (методикапредставлена в п. 1.3.2). Затем к раствору добавили 100 мкл воды и надежнозакрытую колонку энергично встряхивали в течение 1 минуты дляперемешиваниядвухфазовойсистемы(методжидкость-жидкостнойэкстракции). После чего открытую колонку оставили до полного испарениягексана и перехода стеарата лантана в твердое состояние, что позволиловодную фазу отделить с помощью центрифугирования. Затем, образец былпроанализирован методом МАЛДИ-МС (рис.

32).Рисунок 32. МАЛДИ масс-спектр образца, содержащего пептическийгидролизатсывороточногоальбуминачеловека,модифицированногозоманом: 1 – масс-спектр гидролизата до проведения металл-аффиннойхроматографии; 2 – проскок с колонки; 3 – водная фракция после разрушениясорбента; 4 – фракция ацетонитрила после разрушения сорбента.93Было показано, что в водной фазе действительно содержатся искомыеаддукты, (пептид VRYGDTKKVPQVS, пептид LVRYGDTKKVPQVS). Послечего перерастворенный сорбент обработали 70% водным растворомацетонитрила. МАЛДИ-МС анализ элюата показал, что такая обработкапозволяет значительно улучшить извлечение аддуктов из образца.3.15.4Оптимизация методики металл-аффинной хроматографииПри использовании 70% водного ацетонитрила в качестве элюента намибыло показано, что элюирование проходит с эффективностью 25%.

Былосделано предположение, что добавка кислоты к такому элюенту можетулучшить эффективность. Предыдущие эксперименты показали, что такиесильные донорные соединения, как пиперидин и имидазол, не позволяютэффективно элюировать аддукты ФОВ с сывороточным альбумином человекас монослоев стеарата лантана. Причиной этого, возможно, являетсянедостаточность их донорной силы. Известно, что сильные кислоты Льюиса,к которым относится лантан, кроме кислорода, входящего в состав фосфорнойгруппы, имеют высокое сродство к атомам фтора. Поэтому в качестведесорбирующего агента было выбрано соединение, имеющие в своем составекак атомы кислорода (входящие в состав сульфогруппы), так и значительноеколичество атомов фтора, а именно перфтороктановая сульфокислота(ПФОСК) (рис.

33). Такое строение молекулы позволило предположить, чтодобавление ПФОСК к элюенту, уже показавшему свою эффективность,позволит улучшить десорбцию аддуктов с сорбента. Кроме того, мы сделалипредположение, что добавление ПФОСК к пиперидину также должноповлиять на эффективность элюирования аддуктов с сорбента.94Рисунок 33. Структурная формула перфтороктансульфоновой кислоты.Соответственно, было предложено три схемы элюирования дляулучшения десорбции аддуктов с сорбента (рис. 34). Поскольку была показанаэффективность разрушения сорбента для десорбции аддуктов, то послепроведения элюирования в соответствии со схемой, была добавлена стадияразрушения сорбента, чтобы проконтролировать полноту десорбции.Рисунок 34. Схема оптимизации десорбции аддуктов зомана ссывороточным альбумином человека с монослоев стеарата лантана.Результаты оптимизации методики по этой схеме представлены нарисунке 35.

Сигналы, соответствующие аддуктам, были найдены в массспектрах всех трех фракций. При этом, добавка перфтороктансульфоновой95кислоты к элюенту заметно улучшает элюирование, а перерастворениесорбента позволяет десорбировать дополнительное количество искомыхфосфонилированных пептидов.В случае реализации схемы II результаты очень близки к первомуэксперименту (рис. 36).

Точно также в масс-спектрах всех трех фракций былиобнаружены сигналы аддуктов, но, в отличие от схемы I, добавка ТФУ кэлюенту не приводит к значительному улучшению элюирования аддуктов ссорбента.Лучший результат был получен при обработке сорбента растворомпиперидина с добавкой ПФОСК (схема III). Для этого элюата были полученысамые интенсивные масс-спектры (рис. 37). Кроме того, после перестворениясорбента в гексане сигналы в масс-спектрах, соответствующие аддуктам,практически отсутствовали.Рисунок 35. Масс-спектры элюатов с монослоев стеарата лантана,полученных по схеме I: 1 - 70% водный ацетонитрил, 2 - 70% водныйацетонитрил в 0,1%ТФУ, 3 – 70% водный ацетонитрил в 0,1%ТФУ послеперерастворения сорбента в гексане.96Рисунок 36 – Масс-спектры элюатов с монослоев стеарата лантана,полученных по схеме II: 1 - 70% водный ацетонитрил 0.015% добавкойПФОСК, 2 - 70% водный ацетонитрил с 0.015% добавкой ПФОСК в 0,1%ТФУ,3 – 70% водный ацетонитрил с 0.015% добавкой ПФОСК в 0,1%ТФУ послеперерастворения сорбента в гексанеРисунок 37 – Масс-спектры элюатов с монослоев стеарата лантана,полученных по схеме III: 1 – 0,5% водный пиперидин с 0.015% добавкойПФОСК, 2 – 70% водный ацетонитрил с 0.015% добавкой ПФОСК в 0,1% ТФУпосле перерастворения сорбента в гексане97Все результаты по отработке и оптимизации по отработке иоптимизации десорбции сведены в таблицу 5.Таблица 5.

Эффективность элюентов, используемых для проведенияметалл-аффинного анализа на монослоях стеарата лантанаЭлюент (способМассы пептидов, m/zдесорбции)пептического гидролизатоальбумина человека,модифицированного зоманом1567,91680,92% аммиак--0,5% имидазол--0,5% пиперидин--70%: ацетонитрил--70%: ацетонитрил с++++++++ПФОСК70%: ацетонитрил сПФОСК в 0,1% ТФУРазрушение сорбентагексаном с последующейобработкой 70%: ацетонитриломРазрушение сорбентагексаном с последующейобработкой 70%: ацетонитриломс ПФОСК и 0,1% ТФУ983.15.5ПослеМеталл-аффинная хроматография на МАЛДИ мишенипроведениясорбцииобразца,содержащегопептидысывороточного альбумина человека, модифицированного зоманом, частьсорбента извлекли из спиновой колонки при помощи шпателя вместе сматрицей CHCA и нанесли на мишень для МАЛДИ-МС анализа, затем снялисоответствующийспектр,накоторомбылинайденысигналы,соответствующие искомым аддуктам (рис.

38). Это позволяет проводитьидентификацию аддуктов без проведения десорбции, сокращает время иколичество реактивов необходимые для пробоподготовки.Рисунок 38. МАЛДИ-масс-спектр монослоев стеарата лантана послепроведениясорбцииобразца,содержащегопептическийгидролизатсывороточного альбумина человека, модифицированного зоманомДалее было решено провести металл-аффинную хроматографиюнепосредственно на МАЛДИ-мишени. Небольшую часть коллапсированныхмонослоев стеарата лантана нанесли на мишень, на сорбент наносили 2 мкл99пептическогогидролизатасывороточногоальбуминачеловека,модифицированного зоманом (1 мг/мл в пересчете на белок) и 2 мкл 2%водного раствора аммиака, 30 с пипетировали и оставили на 10 минут.

Дляоценки проскока, жидкую фракцию собирали и наносили в другую ячейкумишени для дальнейшего анализа. К сорбенту добавили 2 мкл 2% аммиака дляпромывки, пипетировали, фракцию удаляли. Для проведения десорбции ксорбенту добавили 2 мкл водного раствора пиперидина с 0,015% ПФОСК,пипетировали и добавляли 1,5 мкл раствора матрицы CHCA. МАЛДИ-массспектрометрический анализ показал, что сигналы, соответствующие аддуктам,отсутствуют в проскоке (рис.

Характеристики

Список файлов диссертации

Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
308
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее