Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150378), страница 15

Файл №1150378 Диссертация (Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики) 15 страницаДиссертация (1150378) страница 152019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 15)

39, 1) и надежно детектируются в элюате (рис.39, 2), что было подтверждено при проведении анализа методом тандемноймасс-спектроскопии (рис. 40).Рисунок 39. МАЛДИ-масс-спектры после проведения сорбции образца,содержащего пептический гидролизат сывороточного альбумина человека,модифицированного зоманом на монослоях стеарата лантана, нанесенных намишень: 1 – проскок, 2 – элюат 0,5% водным пиперидином с 0,015% ПФОСК.100Рисунок 40. Идентификация фосфонилированных пепидов в элюатепосле проведения металл-аффинного анализа на мишени: 1 – пептидVRYGDTKKVPQVS; 2 – пептид LVRYGDTKKVPQVSТаким образом, с применением разработанного металл-аффинногосорбента был успешно проведен анализ образца, содержащего пептическийгидролизатсывороточногозоманом,непосредственноальбуминанаспектрометрического анализа.101человека,мишенимодифицированногодляМАЛДИ-масс-3.16 Исследование возможности выделения методом металл-аффиннойхроматографии аддуктов холинэстеразы с ФОВ3.16.1 Исследование сорбции и десорбции бутирилхолинэстеразылошади, модифицированной RVx, методом атомно-силовой микроскопииКакбылопоказанонапредыдущейстадииэкспериментасиспользованием метода АСМ (п.

2.3.3), сорбция и десорбция бычьего казеинапри использовании в качестве сорбента монослоев стеарата лантана проходитвусловияхклассическойбутирилхолинэстераза,металл-аффинноймодифицированнаяхроматографии.ФОВ,посвоейОднако,структуреотличается от казеина: во-первых, казеин имеет в своем составе значительноеколичество остатков фосфорной кислоты, в то время как информации офосфорилировании бутирилхолинэстеразы нет, только в случае модификацииостатком ФОВ появляется сайт фосфонилирования; во-вторых, в глобулахказеина фосфорные группы находятся на поверхности, а активный центрбутирилхолинэстеразы – в центре молекулы (в кармане). Поэтому,представлялось немаловажным исследовать возможность взаимодействияполноразмерной бутирилхолинэстеразы с сорбентом.

Для исследования вкачестве контроля использовали образец, содержащий бутирилхолинэстеразулошади в нативной форме. Эксперимент провели по методике, описанной в п.2.3.3, результаты представлены на рисунке 41, а, б. На микрофотографияхпоказано, что в условиях классической металл-аффинной хроматографиибутирилхолинэстераза успешно сорбируется и десорбируется с монослоевстеарата лантана.

По всей видимости, в данном случае взаимодействие белкас металлом сорбента проходит через многочисленные кислороды серинов итирозинов, содержащихся в молекуле белка. При использовании в качествеобразца бутирилхолинэстеразы, модифицированной остатком RVx, десорбцияв растворе аммиака не происходит (рис.

41, в, г). Особенно наглядно этопоказано в эксперименте с разрушением крупных агломератов белка путеминкубирования образца в додецилсульфате натрия/SDS (рис. 41, д, е).102Микрофотографии до десорбции и после практически идентичны. Наосновании проведенного эксперимента можно сделать вывод, что монослоистеарата лантана могут быть использованы для выделения полноразмернойбутирилхолинэстеразы из биологических образцов различной природы.3.16.2 Исследование возможности выделения аддуктов холинэстеразы сзоманом методом металл-аффинной хроматографии на монослоях стеараталантанаИсследование возможности выделения методом металл-аффиннойхроматографии аддуктов холинэстераз с ФОВ проводили на примеретриптическогогидролизатабутирилхолинэстеразылошади,модифицированной зоманом, с помощью разработанного сорбента на основестеарата лантана.

Выбор объекта исследования был обусловлен тем, чтононапептидбутирилхолинэстеразычеловека,содержащийсайтфосфонилирования и образующийся в процессе пепсинолиза не дает сигналапри анализе методом МАЛДИ-МС, а триптический пептид – имеет слишкомбольшую массу.В то же время, триптический пептид бутирилхолинэстеразы лошади,содержащий серин-198, способный присоединять остаток зомана, имеет МН+2199.17 Да, что делает его удобным объектом исследования.103Рисунок 41. Исследование взаимодействия бутирилхолинэстеразылошадисмонослоямистеараталантанаметодомАСМ:а,б–бутирилхолинэстераза лошади (50х50мкм), в, г – бутирилхолинэстеразалошади, модифицированная RVx (50х50мкм), д, е – бутирилхолинэстеразалошади, модифицированная RVx после инкубирования в 1% SDS (20х20 мкм).Слева – после сорбции в 0,1% ТФУ, справа – после десорбции в 5% аммиаке.104Полученный из НИИ ГПЭЧ ФМБА России образец триптическогогидролизата бутирилхолинэстеразы лошади был проанализирован методомМАЛДИ-МС для поиска и идентификации аддуктов белка с зоманом.

Стоитотметить, что концентрация бутирилхолинэстеразы составляла 0,1 мг/мл впересчете на белок, что в 10 раз ниже, чем концентрация белка вэкспериментахссывороточнымальбуминомчеловека.Результатыпредставлены на рисунке 42. Как показано на рисунке, в масс-спектренаблюдаютсясигналысоответствующие:1–нативномупептиду,содержащему серин-198 SVTLFGESAGAASVSLHLLSPR; 2 – пептиду,содержащему остаток зомана и имеющему разницу в массах с нативным в 162ДаSVTLFGESHPinacolylMPAAGAASVSLHLLSPR,где"PinacolylMPA"соответствует обозначению "GD"; 3 – пептиду, содержащему остатокметилфосфоновой кислоты (продукт старения остатка зомана) и имеющемуразницу в массах с нативным в 78 Да SVTLFGESMPAAGAASVSLHLLSPR.Рисунок 42. Фрагмент МАЛДИ масс-спектра, содержащий сигналы аддуктовбутирилхолинэстеразцы лошади с зоманом и метилфосфоновой кислотой.105Рисунок 43.

Идентификация аддуктов бутирилхолинэстеразцы лошади сзоманом и метилфосфоновой кислотой:1 – пептид SVTLFGESHPinacolylMPAAGAASVSLHLLSPR;2 – пептид SVTLFGESMPAAGAASVSLHLLSPR.Для идентификации аддуктов был проведен МАЛДИ-МС-МС анализ.По отщеплению нейтральной частицы зомана (пинаколил) с получениемсостарившейсяформыаддуктабылополностьюдоказаноналичиесоответствующих модификаций у пептидов (рис. 43).Так как в масс-спектре были обнаружены сигналы, соответствующие каксостарившейся, так и несостарившейся формам аддуктов, было сделанопредположение, что пептид, модифицированный остатком метилфосфоновойкислоты,можетпроявлятьсвойства,подобныефосфорилированнымпептидам. Поэтому была добавлена стадия элюирования 0,5% воднымпиперидиномацетонитриломилишьсзатем0,1%ТФУ.сорбентПослеобрабатывалипроведения70%воднымметалл-аффиннойхроматографии элюаты анализировали методом МАЛДИ-МС, результатыпредставлены на рисунке 44.106Эксперимент полностью подтвердил предположение о схожестивзаимодействия сорбента с аддуктом с MPA и с фосфорилированнымипептидами.Рисунок 44.

МАЛДИ-масс-спектры элюатов с монослоев стеараталантанатриптическогогидролизатабутирилхолинэстеразылошади,модифицированной зоманом (А – выделенная область, соответствующаясигналамаддуктовSVTLFGESHPinacolylMPAAGAASVSLHLLSPRиSVTLFGESMPAAGAASVSLHLLSPR): 1 – проскок с колонки; 2 – 0,5% водныйпиперидин; 3 – 70% водный ацетонитрил с 0,1% ТФУ.3.16.3 Сравнение специфичных свойств монослоев стеарата лантана скоммерчески доступными металл-аффинными сорбентамиИзвестно, что коммерческие металл-аффинные сорбенты, такие какTitansphere Phos-TiO, Supel-Tips Ti (Supelco) и т.д.

имеют специфичность какк фосфорилированным, так и к фосфонилированным пептидам. В случаесорбента, разработанного в ходе данной работы, ярко выражено наличие болеевысокого уровня специфичности к несостарившимся аддуктам белков крови сФОВ, по сравнению с аддуктами с MPA и фосфонилированными пептидами.107Основные результаты1. Получены и охарактеризованы мономолекулярные пленки на основестеарата лантана. Показана возможность их использования в качестве сорбентов,как перенесенных методом погружения пластины монослоев на основе стеараталантана, так и коллапсированных монослоев.2.

Золь-гельметодомсприменениеммикроволновогоизлучениясинтезирован дисперсный хромит лантана. Определена структура агрегатов,размер частиц. Показана применимость в качестве металл-аффинного сорбента.3. Изучена структура поверхности хромита лантана и коллапсированныхмонослоев на основе стеарата лантана методами сканирующей электронноймикроскопии. Определена удельная поверхность сорбентов: 15,5 м2/г для хромиталантана, 14 м2/г для коллапсированных монослоёв на основе стеарата лантана.Характеристики сорбента коллапсированных монослоёв на основе стеараталантана приведены в приложении.4. Оптимизированы условия сорбции и десорбции фосфорилированныхпептидов коллапсированными монослоями на основе стеарата лантана.5. Определена сорбционная ёмкость коллапсированных монослоев наоснове стеарата лантана по пептиду SSNGHV(pY)EKLSSI (20 мкг/мг).6.

Доказана пригодность коллапсированных монослоев на основе стеараталантана для использования в качестве селективного металл-аффинного сорбентадляфосфорилированныхфосфорилированныхипептидов.Показанафосфонилированныхвозможностьпептидовизвыделенияпептическогогидролизата альбумина человека.7. Доказана возможность селективного выделения аддуктов зомана спептидами сывороточного альбумина человека на коллапсированных монослояхна основе стеарата лантана.8. Доказанавозможностьвыделенияаддуктовполноразмернойбутирилхолинэстеразы с RVx на коллапсированных монослоях на основе стеараталантана.108Список сокращенийАСМ – атомно-силовая микроскопия,АХЭ – ацетилхолинэстераза,БЭТ – теория Брюнера-Эммета-Теллера,ВЭЖХ-УФ–высокоэффективнаяжидкостная хроматография сультрафиолетовым детектированием,ДЛФО – теория Дерягина, Ландау, Фервея, ОвербекаМАЛДИ – матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация,МС – масс-спектроскопия,НИИ ГПЭЧ ФМБА – Научно-исследовательский институт гигиены,профпатологии и экологии человека федерального медико-биологическогоагентства.ПАВ – поверхностно-активное вещество,ПЛБ – пленки Ленгмюра-Блоджетт,ПФОС – перфтороктановая сульфокислота,СЭМ – сканирующая электронная микроскопия,ТНЗ – точка нулевого заряда,ТФУ – трифторуксусная кислота,ФОВ – фосфорорганические вещества.109ПриложениеХарактеристики сорбента на основе коллапсированных монослоевстеарата лантанаОписание продуктаВнешний вид: белая творожистая массаУдельная масса: 0.029 ± 0.003 г/дм2Изоэлектрическая точка: 3,3 ед.

рНУдельная поверхность 14 м2/гХимический составОсновное структурное звено: La(C17H35COO)2+Условия храненияПод слоем воды при температуре от +40С до +300ССорбционная емкость20 мкг/мг по пептиду SSNGHV(pY)EKLSSIСпецифичное вз-е с дафосфонилированнымипептидамиХимическаяводадаустойчивость0,1 % трифторуксусная кислотада0,1 % муравьиная кислотада2 % уксусная кислотада5 % аммиакда0,5 % пиперидинда0,5 % триэтиламинда70 % ацетонитрил (менее 3 минут)да/нет100 % ацетонитрилнет100 % метанол (менее 3 минут)да100 % этанол (менее 3 минут)да100 % изопропанолда0,015% ПФОСК в 0,5% пиперидинедатетрахлорметаннетгексан (и другие предельные растворители)нетминеральные кислотынет110Список литературы1. Sabik, L.M.E, Abbas, R.A, Ismail, M.M, El-Refaei, S.

Характеристики

Список файлов диссертации

Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее