Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1150378), страница 13

Файл №1150378 Диссертация (Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики) 13 страницаДиссертация (1150378) страница 132019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 13)

Исходный образец и проскок анализировали методомМАЛДИ-МС. Как показано на рисунке 25, очень интенсивный сигнал 1568 Дадля фосфорилированного пептида VRYGDTKKVPQVST, присутствующий вмасс-спектре исходного образца и соответствующий сигналу аддукта (рис. 26,1), отсутствует в масс-спектре проскока (рис. 26, 2), сигнал 1652.8 Дафосфорилированного пептида LVRYTKKVPQVST присутствует, но имеетзначительно меньшую интенсивность, что свидетельствует о наличииспецифичного взаимодействия пептидов, модифицированных зоманом слантаном.83Рисунокгидролизат26.Масс-спектрысывороточногообразца,альбуминасодержащегочеловека,пептическиймодифицированногозоманом: 1 (снизу) – исходный образец; 2 (сверху) – проскок с сорбента.3.13.

ИсследованиесорбцииаддуктовФОВссывороточнымальбумином человека на хромите лантанаВ случае хромита лантана также был проведен эксперимент для сорбцииаддуктов ФОВ с белками. Так же, как и в случае стеарата лантана, экспериментпроводился с пептическим гидролизатом сывороточного альбумина человека,модифицированного зоманом. Одно и то же определяемое вещество в разныхэкспериментах позволяет сравнивать металл-хелатный сорбент на основеколлапсированных пленок стеарата лантана и металл-оксидный сорбент –хромит лантана.Гидролизат, как и в пункте 3.12, получен из белка, инкубированного сзоманом высокой концентрации 0,1 мг/мл (образец был получен от НИИГПЭЧ ФМБА России). Исходный образец и проскок анализировали методомМАЛДИ-МС.Какпоказанонарисунке27,интенсивныесигналы,присутствующие в масс-спектре исходного образца и соответствующие84сигналам аддуктов (рис.

27, 1), отсутствуют в масс-спектре проскока илипроявлены слабо (рис. 27, 2), что свидетельствует о наличии специфичноговзаимодействия пептидов, модифицированных зоманом с лантаном. Вспектрах после десорбции (рис. 27, 3-5) пики аддуктов снова обнаруживаются.Рисунок 27. Масс-спектры образца, содержащего пептический гидролизатсывороточного альбумина человека, модифицированного зоманом: 1 –исходный образец; 2 – проскок с сорбента; 3,4,5 – последовательная промывкаводным раствором аммиака, 50% раствором ацетонитрила в воде, раствором,содержащим 50% ацетонитрила и 0,1% ТФУ.853.14. Обоснование выбора сорбента для дальнейших исследованийВ литературе описано большое количество сорбентов для протеомногообогащения и анализа с иммобилизованными ионами металлов.

В качествеконкурентов предлагаются как металл-оксидные, так и металл-хелатныесорбенты. Каждый из этих подходов имеет свои плюсы и минусы, так металлхелатныесорбентыотличаютсябольшейселективностьюипредсказуемостью, в то время как металл-оксидные сорбенты менееподвержены воздействию агрессивных сред, света, тряски и зачастую прощесинтезируются. Коммерческие сорбенты, представленные на рынке, обычноиспользуют ионы титана и циркония. При этом показано, что ионы цирконияимеют низкое сродство к монофосфорилированным пептидам, а ионы титанамогут необратимо сорбировать белки.

Работы, в которых ионы лантанаиспользуются в металл-аффинной сорбции начали появляться в литературесравнительно недавно. Потому представляется перспективным исследованиесорбентов для жестких оснований на основе жесткой кислоты – иона лантана(III). Причем, интерес представляют и синтез оксидных сорбентов с ионамилантана, и создание металл-хелатных соединений.На основе экспериментов, проведенных в процессе охарактеризациисорбентов, можно сделать вывод, что каждый из разработанных сорбентовимеет свои преимущества:Для пленочного стеарата лантана можно отметить следующеиепреимущества:1.Простотаметодаполучениямонослоевстеараталантана,позволяющая получать сорбент непосредственно в лаборатории передпроведением металл-аффинного анализа.2.Дешевизна реактивов, необходимых для получения сорбента.3.Отсутствие побочных продуктов при получении монослоёв.864.Емкость сорбента на основе монослоев стеарата лантана,составляет 20мкг/15мг (по пептиду SSNGHV(pY)EKLSSI), что на 32% больше,чем заявлено у коммерческого Titansphere Phos-TiO (50мкг/50мг).Для хромита лантана можно назвать следующие преимущества:1.Большая удельная поверхность, по сравнению с пленочнымстеаратом лантана.2.Возможность проведения реакции в бытовой микроволновойпечке.Однако, каждый из сорбентов не лишен и минусов.

Недостаткомпленочного стеарата лантана в качестве сорбента является низкий уровеньвзаимодействия с фосфорилированными пептидами при низкой концентрациипептидов в образце, хотя взаимодействие с фосфонилированными пептидамипроходит успешно. К минусам хромита лантана можно отнести сложнуюформу агрегатов и невозможность получения дисперсии, состоящей изотдельных наночастиц. Кроме того, влияние хрома на металл-аффиннуюсорбцию описано слабо и требует отдельного исследования. В результатесравнения, в качестве металл-аффинного сорбента для фосфопротеомногоанализа был выбран пленочный стеарат лантана.3.15 Выделение аддуктов сывороточного альбумина человека с ФОВметодом металл-аффинной хроматографии на монослоях стеарата лантана(определение условий сорбции-десорбции)3.15.1 Определение условий сорбции фосфонилированных пептидов изпептическогогидролизатасыворочногоальбуминачеловека,модифицированного зоманом, на монослоях стеарата лантанаРанее было показано, что фосфонилированные пептиды следуетсорбировать из водного раствора со значением рН>8, так как это препятствуетнеспецифичной сорбции многих пептидов, в том числе фосфорилированных,увеличивает количество сорбированных фосфонилированных пептидов, что87приводит к повышению эффективности металл-аффинной экстракции именнофосфонилированных пептидов [107].

Поэтому сорбцию проводили вприсутствии водного раствора аммиака. Для проведения эксперимента былвыбранпептическийгидролизатсывороточногоальбуминачеловека,модифицированного зоманом (начальная концентрация белка – 1 мг/мл) свысоким содержанием аддуктов в образце (образец предоставлен НИИГПЭЧФМБА России, концентрация зомана при проведении модификации 0,1 мг/мл).МАЛДИ-МСанализпоказалнадежнуюидентификациюдвухфосфонилированных пептидов: VRYGDTKKVPQVS с МН+ 1567,8 Да иLVRYGDTKKVPQVS с МН+ 1680.9 Да. Идентификацию пептидов проводилипо отщеплению нейтральной частицы, соответствующей остатку зомана (рис.28, 29).Рисунок 28.

МАЛДИ масс-спектр образца, содержащего пептическийгидролизатсывороточногоальбуминазоманом.88человека,модифицированногоРисунок29.идентификацияфосфонилированныхпепидовпоотщеплению нейтральной частицы: 1 – пептид VRYGDTKKVPQVS; 2 – пептидLVRYGDTKKVPQVSДалее были приготовлены две спиновые колонки, содержащие 50 дм2(15мг) сорбента на основе монослоев стеарата лантана. В одну колонку былодобавлено 25 мкл гидролизата сывороточного альбумина человека с 75 мкл 2%водного раствора аммиака, во вторую – 50 мкл гидролизата с 50 мкл 2%водного раствора аммиака. После проведения сорбции проскок с колонкианализировали методом МАЛДИ-МС.

Как показано на рисунке 30, в первомпроскоке ни одного из фосфонилированных пептидов обнаружено не было, вто время как в проскоке со второй колонки наблюдается сигнал,соответствующий пептиду LVRYGDTKKVPQVS МН+ 1567,8 Да.Таким образом, было показано, что для проведения эффективнойсорбции и во избежание перегрузки сорбента, количество образца не должнопревышать 25 мкг в пересчете на начальную концентрацию белка на 50 дм 2(15мг) сорбента.89Рисунок 30 – МАЛДИ масс-спектр образца, содержащего пептическийгидролизатсывороточногоальбуминачеловека,модифицированногозоманом: 1 – гидролизат до проведения металл-аффинной хроматографии; 2 –проскок с колонки с нагрузкой 25 мкл гидролизата на 15 мг сорбента; 3 –проскок с колонки с нагрузкой 50 мкл гидролизата на 15 мг сорбента3.15.2Определение условий десорбции фосфонилированныхпептидов сыворочного альбумина человека, модифицированного зоманом, смонослоев стеарата лантанаКлассическая металл-аффинная хроматография, применяемая дляобогащения образцов пептидами предполагает в качестве десорбирующегоагента (элюента) использование водного раствора аммиака.

Но ранее былопоказано, что в этих условиях аддукты ФОВ с белками крови недесорбируются с металл-аффинных сорбентах (сорбенты, содержащие железо(III), титан (IV), цирконий (IV)). Тем более, что в ходе этой работы уже былопоказано, что фосфонилированные пептиды эффективно сорбируются на90монослоях стеарата лантана в присутствии аммиака. Следовательно, былонеобходимо подобрать элюент, в котором будут разрушаться связи междусорбентом и аналитом.

Характеристики

Список файлов диссертации

Разработка металл-аффинного сорбента на основе лантана для решения задач фосфопротеомики
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6384
Авторов
на СтудИзбе
308
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее