Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1145465), страница 33

Файл №1145465 Диссертация (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 33 страницаДиссертация (1145465) страница 332019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 33)

Расч. Эксп. Расч.1 8β-9β4.0 307.2 306.0 4.26.3 325.0 319.0 7.3 2.33.113.017.8*)2 6α-8β3.5 297.9 303.4 2.6 < 0.5 267.4 ~266 0.47 -3.0 -2.13 -37.4 -30.53 6β-8β*) 3.5 53.8 56.6 4.06.3 26.1 42.39.3 2.85.3 -14.3 -27.7**4 8β-14α 11.8 183.1 190.6 12.1 11.3 168.0 164.4 11.6 -0.5 -0.5-26.2 -15.15 9β-11α2.3 290.9 296.0 1.6 ~2.0 283.3 294.0 0.9 -0.3 -0.7-2.0-7.66 9β-11β4.9 46.2 49.1 5.46.1 38.1 42.87.0 1.21.6-6.3-8.17 11α-12α 3.5 303.2 302.5 3.64.6 306.3 308.2 4.2 1.10.65.73.18 11α-12β 3.5 58.8 56.9 3.2 ~2.861.9 60.82.6 -0.7 -0.63.93.19 11β-12β 3.6 303.2 303.2 3.64.3 306.8 306.8 4.3 0.70.73.63.6*)Для стероида (12) нумерация протонов в кольце В отличается от указанной: соответственно, 7α-8β и7β-8β.

Поэтому в тексте для обозначения констант или торсионных углов используются скобки:например, J6(7)α-8β.**)Использовано значение для B-нор-D-гомо-9β-аналога (14), поскольку величина экспериментальнойконстанты J8β-14α, измеренная в спектре ЯМР 1Н стероида (15) на сигнале 8β (Рис. 3-8а), занижена на 0.7Гц из-за эффектов сильносвязанности протонов 14α и 15β. Это было проверено с помощью симуляцииспектра 4-х спиновой системы протонов 8β, 14α, 15α и 15β.При анализе полученных данных следует учитывать, что большинство значенийэкспериментальных констант 3Jэксп.

было получено на основании их измерения в двумерныхспектрах DQF-COSY (Рис. 3-8б) и/или HSQCnd, цифровое разрешение которых по оси F2невелико и составляло около 0.3 Гц. Это в первую очередь относится к константам для Dгомо-9β-аналога (12), спектр ЯМР 1Н которого в данном отношении оказывается наиболеесложным. В частности, перекрывание сигналов протонов 7α, 8β и 11β в области 1.8 – 2.0 м.д. искалярное взаимодействие первых двух из них не позволяют из спектра DQF-COSY получитьточную количественную оценку константы 3J8β-9β, поскольку кросс-пики 9β/8β и 9β/11βперекрываются,амультиплетнаяструктурапервогоизнихотражаетскалярное156взаимодействие сильносвязанных протонов 8β и 7α.

Из-за частичного перекрыванияскалярносвязанных протонов 14α и 15β похожие проблемы возникают и при оценке величиныконстанты3J8β-14α.Поэтомуболееэффективнымспособомявляетсяиспользованиепреимуществ регистрации протонных сигналов, находящихся при изотопах атома улерода-13.В качестве примера на рисунке 3-9 приведенфрагмент спектра HSQC без развязки от ядер13С для протона 8β при атоме углерода С8,находящегося в β-состоянии и имеющего,соответственно, бóльшую (на 1JC-Н/2) частоту,чем сигнал этого протона, находящийся вспектре ЯМР 1Н при 1.83 м.д.На F1-разрезе этого сигнала хорошовиднаегомультиплетнаяструктура,которая может быть описана как дублетРис.

3-9.Фрагмент спектра HSQCndстероида (12) и определение значения константы 3J8β-14α из мультиплетной структурыкросс-пика С8/8β, соответствующего βсостоянию атома углерода-13 в положении 8.квартетов. Точность измерения вицинальной константы 3J8β-14α = 11.8 Гц в этом случаедостаточно высока и составляет около ±0.3 Гц. Результаты сравнительного анализаэкспериментальных и расчетных вицинальных констант и соответствующих имторсионных углов (табл. 3-3) для стероидов (12) и (15) приведены также на рисунке 310а,б в виде корреляционных графиков.

Справа (Рис 3-10в,г) показаны корреляции дляэкспериментальных и расчетных относительных изменений этих параметров ∆J = J(15) J(12) и ∆θ = θ(15) - θ(12). Прежде всего, следует отметить, что при сравнении абсолютныхзначений скалярных констант 3J (а) для D-гомо-9β-аналога (12) наблюдается лучшеесоответствие экспериментальных и расчетных данных (r = 0.988, sd = 0.46 Гц) посравнению с аналогичным сопоставлением для В-нор-D-гомо-9β-аналога (15): r =0.960, sd = 0.94 Гц.

Совершенно очевидно, что это происходит из-за значительногоотличия параметров использовавшейся карплусовской зависимости [91, β-эффект] отоптимальных их значений для 5-ти членного кольца В.Аналогичные выводы можно сделать и на основании сравнения экспериментальных ирасчетных значений торсионных углов, корреляционные зависимости которых и параметрыкорреляции (А, В, r и sd) приведены на рисунке 3-10б. При этом наиболее чувствительнымпараметром, характеризующим точность определения расчетных значений торсионного угла157(θijрасч.) для стероида (15) является среднеквадратичное отклонение (sd), которое для негоравно 6.9 °, а для стероида (12) оказывается почти в 2 раза меньше и составляет 3.6 °.Наиболее простым способом определения “плохих” точек в наборе данных для в В-норD-гомо-9β-аналога (15) является сопоставление относительных значений ∆J и ∆θ, корреляциикоторых показаны на рисунке 3-10в, а для уменьшенного набора (n = 5) представлены нарисунке 3-10г.

На этих рисунках отмечена пара протонов 6β-8β, находящихся в кольце В и длякоторых наблюдается максимальное расхождение расчетных и экспериментальных значений3J и θ. При сравнении полного и уменьшенного наборов данных хорошо видно, что устранение4-х точек, соответствующих скалярным взаимодействиям 6β/8β, 6β/8α, 8β/9β и 8β/14α (● - нарисунке 3-10в), наблюдается существенное улучшение корреляции между относительнымирасчетными и экспериментальными значениями ∆J и ∆θ. Прежде всего, следует отметитьзначительное уменьшение среднеквадратичного отклонения (sd):для ∆J:sd(n=9) = 0.71 Гц →для ∆θ:sd(n=9) = 7.6 °sd(n=5) = 0.37 Гц→ sd(n=5) = 1.9 °Рис. 3-10.

Корреляционные зависимости экспериментальных и расчетных а) – вицинальныхконстант 3JH-H и б) – торсионных углов θН-Н для стероидов (12) и (15), а также ихотносительных различий (∆J = J(15) – J(12), ∆θ = θ(15) – θ(12)) в этих стероидах для двух наборовэкспериментальных и расчетных пар данных: в) – n = 9 и г) – n = 5.Этирезультатысвидетельствуютотом,чтоиспользованиесопоставленияотносительных величин расчетных и экспериментальных значений вицинальных констант 3J иторсионных углов θ оказывается корректным лишь при сравнительно небольших измененияхпространственногостроениямолекулы.Оставшиесянарисунке3-10гпятьточексоответствуют парам протонов 9β-11α, 9β-11β, 11α-12α, 11α-12β и 11β-12β, величинаскалярного взаимодействия между которыми определяется конформацией кольца С, котораялишь незначительно отличается в стероидах (12) и (15).15816,16-диметил-В-нор-9β-аналог (15), благодаря метильным заместителям в положении16 и соответствующему сравнительно простому спектру ЯМР 1Н, оказался крайне удобнымобъектом для количественного определения межпротонных расстояний с помощью методаNOESY.

Лишь две пары протонов (17α, 17β и 14α, 15β), сигналы которых находятся,соответственно, в области спектра 1.3 – 1.5 м.д. и 0.9 – 1.1м.д. (Рис. 3-1),образуютсильносвязанные системы АВ-типа. Поэтому в спектре NOESY (Рис. 3-11а) удалосьидентифицировать более 20-ти кросс-пиков, интенсивности которых были использованы дляоценкимежпротонныхрасстояний,которыепоказаныдвойнымистрелкаминапространственной структуре этой молекулы, приведенной на рисунке 3-11б. Кроме того, длякачественной оценки пространственной структуры молекулы стероида (15) достаточноинформативными оказываются прямые взаимодействия протонов метильных групп приатомах С13 и С16 с ближайшими к ним протонами колец В, С и D, такие как 13-Me/8β, 9β, 12β и16α-Ме/14α, 15α, 17α, 17аα и другие.Рис.

3-11. а) – фрагменты спектра NOESY (τm = 0.5 с) стероида (15) и б) - пространственнаяструктура этой молекулы, на которой двойными стрелками указаны обнаруженные прямыепротон-протонные взаимодействия (ЯЭО).Процедура получения экспериментальных значений межпротонных расстояний встероиде (15) с помощью определения скоростей кросс-релаксации практически не отличаласьот описанной выше для стероида (13) схемы получения и обработки нескольких спектров159NOESY при разных временах смешивания (τm = 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8, 0.9 и 1.0 с) инеизменности периода между повторениями при накоплении сигнала (AQ + D1 + τm = 2.2 с).Единственное различие, связанное со сложностью точного интегрирования наиболее слабыхкросс-пиков (для rij > 2.8 Å), заключалось в повторении и последующем усреднении данныхдля четырех первых экспериментов с наиболее коротким значением параметра τm.

Например,данные для τm = 0.5 с были получены после усреднения результатов обработки 4-х одинаковозарегистрированных спектров NOESY. В качестве эталонного расстояния было выбрано егозначение13 между протонами 1 и 2. Таким образом, удалось получить скорости кроссрелаксации (σij) для 24-х межпротонных расстояний rij и провести сравнение большогомассива экспериментальных данных ЯМР с результатами расчетных методов (ММ+, РМ3, Abinitio) и данными РСА. Результаты этого сопоставления представлены в таблице П3-3 (см.приложение П3) и показаны в виде корреляционных зависимостей на рисунке 3-12.Основной целью сопоставления экспериментальных (ЯМР, РСА) и расчетных (ММ+,РМ3, Ab initio) данных по межпротонным расстояниям в стероиде (15) является установлениехарактера расхождений между оценками расстояний, полученными с помощью этих методов.Поэтому достаточно большой набор данных ЯМР (24 значения rij), который удалось получитьдля стероида (15), и широкий диапазон их изменения (1.7 Å < rij < 3.4 Å) позволяют надеятьсяна хорошую достоверность результата такого сопоставления.

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее