Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1145465), страница 29

Файл №1145465 Диссертация (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 29 страницаДиссертация (1145465) страница 292019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 29)

Наиболее вероятной причиной этого является недостаточноточное определение значения константы 3J11β-12β для 8α-аналога (6a), в протонном спектрекоторого сигналы этих протонов имеют близкие химические сдвиги (δ11β(6a) = 1.62 м.д., δ12β(6a)= 1.74 м.д.) и перекрываются другими сигналами. Поэтому, определение константы 3J11β-12β(6a)в данном случае было сделано на основании F1-разреза двумерного спектра HSQCnd,разрешающая способность которого сравнительно невелика. Таким образом, сравнительныйанализ вицинальных констант в этановом фрагменте Н2С11-С12Н2 В-нор-8α-аналога (9) и 8αаналога (6a) позволяет сделать заключение о том, что конформация в первом из этих134стероидов имеет небольшие (в пределах 2.0° – 3.0°), но вполне регистрируемые отличия посравнению со вторым, которые связаны с изменением строения кольца В.Для наглядности на рис.

2-65 представлены результаты сравнения пространственногостроения стероидов (9) и (6a), полученные на основе использования карплусовскойзависимости, в виде нескольких различных графиков: а) - корреляции экспериментальных ирасчетных абсолютных значений констант 3Jij и торсионных углов θij для стероидов (9) и (6a),б) – корреляции экспериментальной (○) и расчетной (●) зависимости 3J = ƒ(θ) в области 0° < θij< 360° и 25° < θij < 70°, в) – корреляции экспериментальных и расчетных относительныхвеличин вицинальных констант ∆3Jij и торсионных углов ∆θij (1 - для полного набора данных,приведенных в табл.

2-8, 2 – без учета данных для 3-х пар протонов: 6(7)α-8α, 6(7)β-8α и 9α11β).Сравнение абсолютных (Рис. 2-65а) и относительных (Рис. 2-65в) величин скалярныхконстант и торсионных углов свидетельствует о существенном улучшении соотношениямеждуэкспериментальнымиирасчетнымизначениямивслучаеиспользованияотносительных величин и рассмотрения только тех данных, которые не включаютдополнительные факторы кроме зависимости величины константы 3JH-H от торсионного углаθН-Н и электроотрицательностей заместителей в этановых фрагментах. Особенно это хорошовидно при сравнении корреляций ∆Jэксп ~ ∆Jрасч и ∆θэксп.

~∆θрасч., полученных для полногонабора данных (n = 9, рис. 2-65в‒1)) и при уменьшении их числа за счет устранения “плохих”точек (n = 6, рис. 2-65в–2). При этом, несмотря на уменьшение числа использованных данныхи сокращение динамического диапазона, для которого проводилась линейная аппроксимация,наблюдается уменьшение среднеквадратичных отклонений как для вицинальных констант (с0.43 Гц до 0.32 Гц), так и для торсионных углов (с 5.2° до 1.8°). Приведенные в таблице 2-8 ина рисунке 2-65 данные по экспериментальной и расчетной оценке 3JН-Н и θН-Н для В-нор-8α- и8α-аналогов (9) и (6a) свидетельствуют о том, что в интервале 25° < θН-Н < 70° (Рис. 2-65б)соотношение между ними может быть аппроксимировано линейной зависимостью 3JН-Н = A +BθН-Н.

Следует отметить, что при раздельной линейной аппроксимации экпериментальных ирасчетных данных и устранении одной “плохой” точки для пары протонов 6α и 8α в стероиде(9) наблюдается небольшое уменьшение коэффициента пропорциональности В:3 эксп.= (13.23±0.29) - (0.170±0.006) θэксп. (n = 9, r = 0.996),3 расч.= (13.05±0.26) - (0.166±0.005) θрасч. (n = 9, r = 0.997).JJПри этом параметры А и В в экспериментальной и расчетной зависимостях в пределахточности их оценок совпадают, а среднеквадратичное отклонение уменьшается и составляетвсего 0.15 Гц.

Следовательно, полученная эмпирическим путем линейная аппроксимация135карплусовской зависимости 3J = ƒ(θ) для интервала 25° < θН-Н < 70° может быть использованадля оценки торсионных углов (в указанных пределах) в других стероидных молекулах. Рис. 2-65. а) и в) - Корреляционные зависимости экспериментальных и расчетных (РМ3)вицинальных констант 3JН-Н и торсионных углов θН-Н и их относительных различий ∆3J и ∆θдля стероидов (9) и (6а). б) – Общая (слева) и локальная (справа) зависимость 3J = ƒ(θ) дляэкспериментальных (○) и расчетных (●) данных (подробности см.

в тексте).136О различии в пространственном строении 8α- и В-нор-8α-аналогов стероидныхэстрогенов свидетельствуют также результаты количественных оценок межпротонныхрасстояний, полученные с помощью измерения ЯЭО. Для В-нор-8α-аналогов характерноувеличение (~ на 0.3 Å) расстояний между протоном 1 и протонами 9α и 11α.Экспериментальные значения этих расстояний, например для стероида (9), составляют: r1-9α =2.82 Å, r1-11α = 2.86 Å, что хорошо согласуется с расчетными данными (РМ3: r1-9α = 2.86 Å, r1-11α= 2.89 Å).

Следует также указать на различное соотношение между этими расстояниями: для8α-аналогов r1-11α < r1-9α (например, для стероида (6a): r1-11α(ЯМР) = 2.41 Å, r1-9α(ЯМР) = 2.53 Å), адля В-нор-8α-аналогов наблюдается обратное соотношение: r1-11α ≥ r1-9α.Не менее характерным при переходе от 8α-аналогов к В-нор-8α-аналогам являетсяизменение соотношения между расстояниями r4-6α и r4-6β: для первых из них r4-6α > r4-6β, а длявторых ‒ r4-6α < r4-6β. Даже на качественном уровне сравнение интегральных интенсивностей(Sij) кросс-пиков 4/6α и 4/6β в приведенном на рисунке 2-62б спектре NOESY В-нор-8αаналога (9) подтверждает это соотношение (S1-6β : S1-6α = 1 : 1.4). Экспериментальная оценкаабсолютных значений этих расстояний для указанного стероида составляет: r4-6α = 2.88 Å и r46β= 3.05 Å, а расчетная (РМ3) ‒ r4-6α = 2.85 Å и r4-6β = 3.13 Å.

Следует добавить, чтоприведенные экспериментальные оценки расстояний в стероиде (9) были сделаны наосновании одного спектра NOESY, полученного при τm = 0.5 c, а в качестве эталонного былоиспользовано расчетное (РМ3) расстояние между протонами 1 и 2: r1-2 = 2.49 Å.Более широкий набор экспериментальных данных по измерению межпротонныхрасстояний был получен для в В-нор-D-гомо-8α-аналогов (11б) и (11в) – для 9 и 14 парпротонов, соответственно.

Для этого были использованы результаты определения скоростейкросс-релаксации между ними, полученные для каждого из стероидов на основанииизмерения нестационарных ЯЭО в 8 спектрах NOESY, зарегистрированных с разнымивременами смешивания τm в интервале от 0.2 до 1.2 с.

При расчете межпротонных расстоянийrij в стероиде (11б) в качестве эталонного использовалось значение 1.79 Å междугеминальными протонами 17α и 17β, а в случае стероида (11в) – 2.32 Å между вицинальнымипротонами 8α и 9α. Число измеренных в каждом случае расстояний определялосьвозможностью точного объемного интегрирования соответствующих кросс- и диагональныхпиков.Оценки межпротонных расстояний, полученные методом ЯМР для стероидов (11б) и(11в), и соответствующие их расчетные значения приведены в таблицах 2-9 и 2-10соответственно.137Таблица 2-9.Экспериментальные (ЯЭО*)) и расчетные (ММ+, РМ3) межпротонные расстояния rij (Å) в Внор-D-гомоаналоге (11б)**).№ Нi - HjЯЭОMM+PM3β, град.

(τc/τэтc)1/6 ***) ЯЭО(β) ∆r, %∆rβ, %1 9α-8α2,252,322,37720,992,233,13,92 9α-11α2,312,432,44850,9852,355,23,33 9α-14α2,622,842,89231,0852,848,404 9α-12α2,532,752,73281,0752,728,71,15 8α-14α2,112,292,29221,0852,298,506 8α-15α2,502,542,54301,0752,641,6-3,97 17α-17β****) 1,791,791,77601.01,79008 17α-16α2,462,442,45521,0152,49-0,8-2,09 17β-16β2,602,472,45840,9852,56-5,0-3,6*) – Использовались спектры NOESY, полученные при τm = 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.7, 0.8 и 1.0 с.**) – Экспериментальные данные указаны для значения эталонного расстояния 1.79 Å (ММ+) исоответствуют усреднённым значениям приведенных объемных интегралов: (Sij/Sii + Sij/Sjj)/2.***) – Использовалось значение D║/D┴ = 10.****) – Эталонное расстояние.Таблица 2-10.Экспериментальные (ЯЭО*), РСА) и расчетные (ММ+, РМ3, Ab Initio) межпротонныерасстояния rij (Å) в В-нор-D-гомо-аналоге (11в)**).№ Нi - HjЯЭОMM+PM3β, град.

(τc/τэтc)1/6 ***) ЯЭО(β)Ab Initio РСА11-22,292,442,492.462.45261,0962,5121-9α2,522,802,842.852.85201,1032,7834-6β2,823,033,183.103.05261,0963,0844-6α2,462,712,802.752.68251,0982,6951-11α2,742,902,962.983.07321,0802,9668α -9α****)2,322,322,372.342.49781.02,3278α -6α2,482,402,382.352.34701.02,4889α -11α2,362,422,442.402.31841.02,36915β -6α2,62,792,762.722.80181,1122,891017β-17α1,701,771,771.781.79421,0421,77118α -14α2,112,282,302.302.27321,0812,28129α -12α2,482,782,732.512.46321,0812,68136α -15α2,742,882,702.722.99251,0993,01148α -15α2,362,532,532.552.32401,0472,47*)– Использовались спектры NOESY, полученные при τm = 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6, 0.8, 1.0 и 1.2 с.– Экспериментальные данные указаны для значения эталонного расстояния 2.32 Å (ММ+) исоответствуют усредненным значениям приведенных объемных интегралов: (Sji/Sii + Sji/Sjj)/2.***)– При расчете поправочного коэффициента, учитывающего влияние полярного угла β,использовалось экспериментальное значение D║/D┴ = 12, полученное на основе метода HOESY (см.рис.

1-9 и текст для соединения (VI)).****)– Эталонное расстояние.**)На рисунке 2-66 представлены корреляции между экспериментальными и расчетными(ММ+) величинами rij для сферической и анизотропной моделей обработки ЯМР-данных.138Рис. 2-66. Сравнение экспериментальных (ЯЭО) и расчетных (ММ+) межпротонныхрасстояний в В-нор-D-гомо-8α-аналогах эстрогенов (11б) и (11в), с использованием а) сферической и б) - анизотропной моделей расчета.

Пунктирными линиями показаноотносительное отклонение ±5%, ● – эталонное расстояние. в) - пространственные структурыэтих молекул, на которых стрелками указаны измеренные расстояния. г) – фрагменталифатической области спектра NOESY (τm=1.0 с) стероида (11б), на котором прямоугольнойрамкой отмечены кросс-пики, использованные для количественного определения 9-тимежпротонных расстояний.Из сопоставления корреляционных зависимостейсферическоймоделирасчетанезависимоотследует, что при использованиивыбораэталонногорасстояния139экспериментальные значения r(ЯЭО) в среднем оказываются более короткими по сравнению срезультатами их расчета методом MM+. При этом коэффициент пропорциональности В междуэкспериментальными и расчетными данными для стероидов (11б) и (11в) оказываетсяпрактически одинаковым (~ 0.84).

Это совпадение объясняется сопоставимыми значениямиполярных углов β для эталонных расстояний в каждом из стероидов. Поэтому неудивительно,что при использовании аксиально-симметричной (анизотропной) модели расчета для каждогоиз стероидов наблюдается заметное и примерно одинаковое улучшение всех параметров,характеризующих корреляции между экспериментальными и расчетными данными.Таким образом, использование анизотропной модели расчета межпротонных расстоянийв стероидах (11б) и (11в) на основе ЯЭО позволяет получать более точные значения rij,которые в пределах ±5% совпадают с результатами их расчета методом ММ+. Сопоставлениеданных ЯМР с результатами других методов расчета (PM3, Ab Initio) или данными РСА,представленных в таблице 2-10, приводит к аналогичным выводам.

В свою очередь хорошеесовпадение (в пределах ±5%) экспериментальных и расчетных межпротонных расстоянийсвидетельствует о жесткой структуре углеродного скелета рассмотренных D-гомо-В-нор-8αаналогов эстрогенов и о соответствии конформации этих молекул расчетным данным ирезультатам РСА.Доказательство пространственного строения стероида (11д), имеющего два метильныхзаместителя в положении 17, оказывается значительно более сложной задачей по сравнению срассмотренными стероидами (11б) и (11в).

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
А знаете ли Вы, что из года в год задания практически не меняются? Математика, преподаваемая в учебных заведениях, никак не менялась минимум 30 лет. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6418
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее