Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1145464), страница 6

Файл №1145464 Автореферат (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 6 страницаАвтореферат (1145464) страница 62019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 6)

Использование количественныхоценок этих и других межпротонных расстояний, полученных с помощью ЯЭО, и ихсравнение с данными РСА или расчетных методов являлись основнымдоказательством при идентификации этих стероидов. На рисунке 13 показанапроцедура определения скоростей кросс-релаксации σij с использованиемзависимостей абсолютных (а) и относительных (б) интенсивностей кросс-пиков вспектрах NOESY стероида (13) от времени смешивания τm.

Во втором случаеэкспериментальная погрешность определения σij для наиболее короткого эталонногорасстояния r12α-12β = 1.77 Å составляет ±1.5%, а для расстояния r1-12α = 3.02 Å ‒ ±5.7%.Это должно обеспечивать экспериментальную погрешность определения расстоянийне хуже ±0.5% и ±2.0%, соответственно. Однако, эти погрешности не являютсяопределяющими точность ЯМР-расстояний.

Это видно при сопоставлении ЯМРданных, полученных с использованием изотропной (Рис. 13-в) и анизотропной (Рис.13-г) моделей расчета, с расстояниями, полученными методом MM+.Рис. 13. Зависимости а) – абсолютных (Sij) и б) – относительных (Sij/Sii) интегральныхинтенсивностей кросс-пиков в спектрах NOESY стероида (13) от времени смешивания τm.Корреляция экспериментальных (ЯЭО) и расчетных (ММ+) межпротонных расстояний дляв) – изотропной и г) – анизотропной моделей обработки ЯМР-данных.Хорошо видно, что выбор в качестве эталонного.

расстояния между геминальнымипротонами при атоме С12, радиус-вектор которого имеет полярный угол βэт. = 35°, вслучае использования анизотропной модели расчета приводит к относительнонебольшому, но вполне заметному улучшению всех параметров, характеризующихлинейную корреляцию между данными ЯМР и ММ+ (параметры линейнойкорреляции А + ВХ, r и sd приведены на рисунках 13-в и 13-г).На рисунке 14-в показана корреляция ЯМР-расстояний в В-нор-D-гомо-9β-аналогеэстрогенов (15), пространственная структура которого приведена на рисунке 14-б, сданными РСА, которые были предварительно оптимизированы методом ММ+ прификсированных координатах тяжелых атомов (С, О).

Межпротонные ЯМРрасстояния были получены с использованием в качестве эталонного расстояниямежду протонами 1 и 2, которое имеет небольшой (около 15º) полярный угол βэт.,а анизотропный вклад в точность определения расстояний был вычислен длярасчетного (ММ+) параметра анизотропии диффузии D║/D┴ = 3.7. Особенностью22процедуры определения расстояний в стероиде (15) было повторение (до 4-х раз)регистрации спектров NOESY с одинаковым значением τm (τm = 0.2, 0.3, 0.4 и 0.5 с) ипоследующим усреднением полученных результатов.

Это было вызванонеобходимостью точного интегрирования наиболее слабых по интенсивности кросспиков, соответствующих расстояниям более 3.0 Å.Рис. 14. а) – Фрагменты спектра NOESY (τm = 0.5 с) стероида (15) и б) - пространственнаяструктура этой молекулы, на которой двойными стрелками указаны все обнаруженные ЯЭО.в) ‒ Корреляция межпротонных ЯМР-расстояний, полученных с помощью анизотропноймодели расчета, с данными РСА, оптимизированными методом ММ+.Таким образом, согласно полученным результатам, только одно из 24-х расстоянийоказалось за пределами погрешности ±5%.

Это расстояние r6α-14α и оно на 8% большесоответствующих данных РСА. Все остальные значения, включая r1-9β, r1-12α и r4-6β,которые превышают 3.0 Å, вполне соответствуют данным РСА. К этому нужнодобавить, что в спектре NOESY стероида (15), кроме указанных выше наиболеехарактерных для 9β-аналогов эстрогенов пространственных взаимодействий, хорошовидны также кросс-пики между сигналом 13β-метильной группы и сигналамипротонов 8β и 9β. Однако, из-за подвижности метильных протонов этивзаимодействия не могут быть использованы на количественном уровне.Использованиескалярныхконстантдлясравнительногоизученияпространственного строения D-гомо- и В-нор-D-гомо-9β-аналогов эстрогенов былопроведено на примере сопоставления для 9β-аналогов (12) и (15) относительныхрасчетных и экспериментальных вицинальных констант ∆3J = 3J(15) ‒ 3J(12) иторсионных углов ∆θ = θ(15) ‒ θ(12) (Рис.

15). Совершенно очевидно, что наиболеесущественные различия между пространственными структурами сравниваемыхстероидов имеются в области сочленения колец B и C. Однако, использованиеодинаковой карплусовской зависимости для шестичленного и пятичленного кольца Вможет приводить к дополнительным ошибкам при расчете ∆3J и ∆θ. Поэтому для23сопоставлениябылииспользованы 5 вицинальныхконстант (3J9β-11α, 3J9β-11β, 3J11α-12α,3J11α-12β, 3J11β-12β) между протонами,находящимися в циклогексановомкольцеСсравниваемыхстероидов. Несмотря на то, чторазличиясоответствующихРис. 15.

Корреляции относительных эксперименторсионных углов не превышаеттальных и расчетных различий а) – вицинальных8º, а различия вицинальныхконстант ∆3JH-H и б) – торсионных углов ∆θН-Н дляконстант находятся в пределахстероидов (12) и (15).±1.0 Гц, наблюдается хорошаякорреляция между экспериментальными и расчетными данными.Другим примером использования скалярных констант для сравнительногоконформационного анализа 9β-аналогов (12) и (15) является сопоставление величиндальней константы 4J1-9β, которая зависит от ориентации протона 9β по отношению кплоскости ароматического кольца А.

Торсионный угол Н9β-С9-С10-С1 для стероида(12) согласно расчетам (ММ+) составляет 83.7°, а для В-нор-D-гомо-9β-аналога (15)он равен 88.9°. При точном определении константы 4J1-9β для этих стероидов былообнаружено полное соответствие с результатами расчетов: 4J1-9β(12) = (1.27±0.02) Гц,4J1-9β(15) = (1.43±0.02) Гц.3.2. 13α-Аналоги эстрогеновПространственное строение 13α-аналогов стероидных эстрогенов в растворе былоисследовано на примере изучения стероидов (16) – (18).

Отличительнойособенностью протонных спектров этихмолекул является их крайняя сложность из-заналичия большого числа сильносвязанныхспиновых систем, поэтому основные усилиябылипредпринятывнаправленииидентификации сигналов с привлечениемгомо- и гетероядерных корреляционныхметодов спектроскопии ЯМР и активногоиспользованиясимуляцииразличныхспиновых подсистем. В результате для всех13α-аналогов были получены полные наборыпротонных и углеродных химических сдвигов,скалярных констант 2-6JH-H и обнаруженынаиболее важныедля доказательствапространственного строения этих соединений пространственные взаимодействия(ЯЭО). Например, для доказательства принадлежности стероида (16) к 13α-аналогамэстрогеновдостаточнопроанализироватьсовокупностьпространственныхвзаимодействий протонов метильной группы в положении 13 с окружающимипротонами (Рис. 16).Прежде всего, взаимодействие 13-Ме/14α однозначно свидетельствует оцис-сочленении колец С и D, а кросс-пики 13-Ме/12α и 13-Ме/12β, также как13-Ме/14α и 13-Ме/15α, доказывают экваториальное положение этой метильнойгруппы в кольце С и соответствующую пространственную ориентацию 5-членного24кольца D.

Кроме того, для стероида(16) характерна пространственнаясближенность протонов 9α, 14α и7α, 14α. Помимо этого, в спектреDQF-COSY обращают на себявнимание крайне слабые кросспики, соответствующие дальнимскалярнымвзаимодействиямW-типа протонов 13α-метильнойРис. 16. Конформация молекулы 13α-аналога группы с протонами 14α и 16α, аэстрогенов (16), на которой двойными стрелками также между ними.На рисунке 17-а в качествепоказаны пространственные взаимодействия,обнаруженные в спектре NOESY.примерапоказанапроцедураанализа спектра 13α-аналога (16) спомощью симуляции подспектра одной из сильносвязанных систем (16α, 16β и 15α),находящейся в области 2.05 ‒ 2.45 м.д., где располагаются сигналы 6-ти протонов.Рис. 17. а) 1. ‒ Симуляция подспектра сильносвязанных протонов 16α, 16β и 15α, 2. ‒фрагмент экспериментального спектра ЯМР 1Н и б) ‒ корреляции экспериментальных ирасчетных торсионных углов θH-H и вицинальных констант 3JH-H 13α-аналога эстрогенов (16).Полученные с помощью симуляции спектров сильносвязанных систем и методовCOSY-DQF, J-COSY и HSQCnd экспериментальные данные по оценке всех значенийвицинальных констант 3Jijэксп.

между протонами в кольцах В, С и D стероида (16)были использованы для определения соответствующих торсионных углов θijэксп.. Этипараметры были сопоставлены в виде корреляционных зависимостей с ихрасчетными значениями 3Jijрасч. и θijрасч. (Рис. 17-б), полученными на основанииоптимизации геометрии этой молекулы методом ММ+. Результаты такогосопоставления свидетельствуют о достаточно высоком уровне соответствия междуэкспериментальными и расчетными значениями торсионных углов θH-H (sd = 2.7º) ивицинальных констант 3JH-H (sd = 0.41 Гц).3.3. D-Гомоаналоги эстрогенов природного рядаПространственное строение стероидных эстрогенов природного ряда было изученона примере D-гомоаналогов (19), (20) и 6-окса-D-гомоаналога (21).

Посколькупространственное строение колец В и С стероидов природного ряда (19) и (20) ирассмотренных выше 13α-аналогов эстрогенов во многом совпадает, то протонныеспектры этих стероидов имеют много общего, поэтому, также как для 13α-аналогов,анализ мультиплетной структуры сигналов протонов кольца В в спектрах ЯМР 1Нстероидов (19) и (20) проводился с помощью комбинированного использованияданных корреляционных спектров (COSY-DQF, NOESY, HSQCnd, J-COSY) и25симуляции подспектров сильносвязанных протонов с учетом всех других (включаядальние) скалярных взаимодействий.Результаты этого анализа дают полный набор скалярных констант междупротонами колец А и В, который практически совпадает с аналогичными данными,которые были получены для 13α-аналогов эстрогенов.Наиболее надежным доказательством принадлежности стероидов (19) – (21) кприродному ряду является набор пространственных взаимодействий междупротонами, который был получен в результате анализа их спектров NOESY.

Вкачестве примера на рисунке 18 с помощью двойных стрелок показаны всепространственные взаимодействия в молекуле 6-окса-D-гомоаналога (21),обнаруженные в виде кросс-пиков вспектре NOESY.Наиболееважнымидлядоказательстваявляютсяпространственные взаимодействияв β-области этой молекулы междупротонами метильной группы приатоме С13 и ближайшими к нейаксиальными протонами 11β, 8β,15βи17β,атакжесэкваториальным протоном 12β.Рис. 18.Конформация 6-окса-D-гомоаналога Между этими β-протонами такжевзаимодействияэстрогенов природного ряда (21), на которой наблюдаютсядвойными стрелками показаны обнаруженные в 12β/11β, 11β/8β, 8β/15β и 15β/17β,которые характерны для структурыспектре NOESY взаимодействия.стероида (21).Не менее существенным подтверждением строения этой молекулы служатобнаруженные пространственные взаимодействия в ее α-области: 9α/12α, 9α/14α,9α/7α, 12α/14α, 7α/14α, 14α/16α, 14α/17aα, 16α/17aα и 17аα/12α.Совокупность всех перечисленных пространственных взаимодействий однозначносвидетельствует о том, что кольца С и D находятся в конформации “кресло”, а самстероид (21) имеет “транс”-“транс” сочленение колец В/C и C/D и, следовательно,принадлежитприродномуряду.Изперечисленныхпространственныхвзаимодействий были выбраны 10 пар протонов, для которых были измереныскорости кросс-релаксации σij и с помощью калибровочного метода сделаны оценкимежпротонных расстояний (Рис.

19). В качестве эталонного расстояния было выбранозначение 2.45 Å между вицинальными протонами 1 и 2 в ароматическом кольце А.В процедуру обработки данных входил учет анизотропии вращательной диффузиипри параметре анизотропии D║/D┴ = 10.26Рис. 19. Корреляция межпротонных ЯМР-расстояний,полученныхспомощьюанизотропной модели расчета, с данными а) ‒ РСА иб) ‒ метода ММ+.Полученные результаты ЯМР-измерения межпротонных расстояний в стероиде(21) хорошо (в пределах ±5%) согласуются с данными РСА (Рис. 19-а) и срезультатами расчетного метода ММ+ (Рис. 19-б).3.4 9β,14β-Аналоги эстрогеновПринадлежность стероидов (22) и (23) к 9β,14β-аналогам эстрогенов была доказанас помощью количественных оценок скалярных констант и качественных оценокмежпротонных расстояний.

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6363
Авторов
на СтудИзбе
310
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее