Главная » Просмотр файлов » Автореферат

Автореферат (1145464), страница 5

Файл №1145464 Автореферат (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 5 страницаАвтореферат (1145464) страница 52019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 5)

значения на рисунке 10-а)и данными ЯМР: в стероиде (3a) r1-9α < r1-11α, а в стероиде (3б) наблюдается обратноесоотношение: r1-9α > r1-11α. Если в каждом из стероидов выбрать расстояние r1-9α вкачестве эталонного, то получим ЯМР-расстояния: r1-11α(3а) = 2.56 Å, r1-11α(3б) = 2.30 Å,которые меньше их расчетных значений лишь на 0.02 и 0.03 Å, соответственно.Аналогичным образом для стероидов (3a) и (3б) были полученыэкспериментальные оценки расстояний между протоном 7α и протонами 15α и 15β.Исходными данными здесь являлись отношения интегральных интенсивностей:(S7α-15β/S7α-15α)(3а) = 2.8, (S7α-15β/S7α-15α)(3б) = 0.7, на основании которых быливычислены отношения экспериментальных расстояний в этих стероидах:(r7α-15α /r7α-15β)(3a) = (2.8)1/6 = 1.187, (r7α-15α /r7α-15β)(3б) = (0.7)1/6 = 0.942.18Рис.

10. а) и б) – Ньюменовские проекции по связям С3-С2 и С10-С9 и в) – фрагментыспектров NOESY (τm = 0.5 c) стероидов (3a) и (3б). Цифрами под контуром интегрированияуказаны относительные интегральные интенсивности кросс-пиков 1/9α и 1/11α.Если в качестве эталонного выбрать расстояние r7α-15α, то получим: (r7α-15β)(3a) =2.20 Å, (r7α-15β)(3б) = 2.47 Å, что оказывается меньше их расчетных значений на 0.14 и0.16 Å , соответственно. В данном случае интерес представляют не абсолютныезначения расстояний, а их относительные различия, поскольку проводится сравнениестероидов (3а) и (3б) между собой.

Следовательно, на основании данных поизмерению ЯЭО можно утверждать, что по сравнению со стероидом (3a) стерическиевзаимодействия метильной группы в положении 7β в стероиде (3б) приводят кконформационным изменениям в области сочленения колец В и С, результатомкоторых является уменьшение межпротонного расстояния r1α-11α(ЯМР) на 0.26 Å иодновременное увеличение расстояния r7α-15β(ЯМР) на 0.27 Å. Это практическисовпадает с соответствующими данными метода РМ3: уменьшение расстоянияr1α-11α(РМ3) на 0.25 Å и увеличение расстояния r7α-15β(РМ3) на 0.29 Å.Определение межпротонных расстояний с точностью не хуже ±5% открываетвозможность обнаружения быстрых в шкале времени ЯМР равновесныхконформационных превращений.

В качестве примера решения такой задачи нарисунке 11-а представлено сопоставление с данными полуэмпирического метода РМ3экспериментальных ЯМР-расстояний в 7α-метил-6-окса-8α-аналоге эстрогенов (1б),полученных с использованием изотропной модели расчета. В качестве эталона быловыбрано расстояние 2.48 Å между ароматическими протонами 1 и 2, для которогополярный угол между радиус-вектором r1-2 и главной осью молекулы (1б) составляетоколо 10°.Рис.

11. а) – Корреляция экспериментальных (ЯЭО) и расчетных (РМ3) расстояний и б) конформационный обмен в стероиде (1б). Конформеры (А) и (В) показаны в ньюменовскойпроекции по связи С7-С8. Цифрами указаны расчетные значения соответствующихмежпротонных расстояний r7β-15β и торсионных углов Н7β-С7-С8-Н8α.19Несмотря на использование изотропной модели расчета, полученные результатысвидетельствуютохорошемколичественномсоответствиимеждуэкспериментальными и расчетными значениями межпротонных расстояний. Толькодля трех (r9α-11α, r7β-11β и r7β-15β) из восьми расстояний относительное отклонениепревышает ±5% от измеряемой величины.

Поскольку практически все отклонения(кроме ∆r9α-14α и ∆r7β-15β) имеют положительный знак (т.е. rij(ЯЭО) > rij(PM3)), то они могутбыть объяснены влиянием анизотропии диффузионного движения, которое привыборе эталонного расстояния с небольшим полярным углом β должно приводить кзавышенным оценкам тех расстояний, для которых этот угол существенно больше.Например, для расстояний r9α-11α и r7β-11β, которые имеют наиболее завышенныеэкспериментальные значения (на 6.1 и 5.0%, соответственно), полярные углы β9α-11α иβ7β-11β составляют ~80º и ~70°, соответственно.Совершенноочевидно,чтоаналогичноеобъяснениезаниженногоэкспериментального значения расстояния r7β-15β оказывается невозможным, посколькуучет анизотропного фактора при β7β-15β ≈ 30° должен приводить к обратному эффекту– к дополнительному уменьшению этого расстояния примерно на 2%.

Влияниеспиновой диффузии или эффекты скалярной релаксации в условиях, когда ωоτс << 1,могут приводить только к его увеличению, поэтому единственной причинойзаниженного расстояния r7β-15β является динамический процесс, связанный с быстрымв шкале времени ЯМР обменом между двумя (А) и (В) конформерами: (А) (В).В этом случае наблюдаемое значение расстояния r7β-15β является усредненным повремени и определяется как населенностями конформеров РА и РВ, так и значениямиэтого расстояния в каждом из них. Наиболее вероятным вариантом такого обмена длястероида (1б) является изменение конформации кольца В, в результате которогопроисходит изменение псевдоэкваториальной ориентации 7α-метильной группы напсевдоаксиальную (рис.

11-б). При этом протон 7β из псевдоаксиальной ориентации восновном конформере (А), в котором r7β-15β(A) = 3.36 Å, переходит впсевдоэкваториальное положение в минорном конформере (В). Этот приводит кзначительному уменьшению расстояния r7β-15β(В), которое по данным метода РМ3составляет 2.37 Å. Поскольку наблюдаемое расстояние <r7β-15β(ЯЭО)> = 2.9 Å, то дляуказанных граничных его значений в конформерах (А) и (В) была сделана оценканаселенности минорного конформера: РВ ≈ 19%.

Эта величина из-за нелинейногохарактера зависимости <r7β-15β> = ƒ(РВ) определена с большой погрешностью(+12, -8 %), а использование для этой же цели значения наблюдаемой константы<3J7β-8α > = 10.3 Гц и расчетных значений 3J7β-8α(А) = 11.2 Гц, 3J7β-8α( В) = 7.35 Гц даетсопоставимый результат: РВ = 23.4%.Точность определения населенности минорного конформера с помощью ЯЭОзначительно повышается при оценке небольших (менее 10%) значений РВ и приувеличении разницы расстояний в конформерах (А) и (В). На рисунке 12 в качествепримера приведены основные доказательства конформационного обмена (А) (В) встероиде (5б) в виде увеличения суммы констант 3J6β-7α и 3J6β-7β на 0.6 Гц приповышении температуры от 20 до 60 ºС (Рис.

12-1) и обнаружения кросс-пика 6β/11βв спектре NOESY (Рис. 12-3), интегральная интенсивность которого примерно в 3раза больше его расчетного значения для конформера (А). Это соответствуетэффективному расстоянию <r6β-11β> = 3.4 Å, которое на 0.7 Å меньше, чем егорасчетное значение для доминирующего конформера (А).На рисунке 12-4 показан графический способ определения соотношениянаселенностей PA и РВ с помощью построения нелинейной зависимости <r> = ƒ(PA) и20полученного эффективного расстояния <r6β-11β>.

Этот способ дает при 20 °Сследующее соотношение конформеров: PA : РВ ≈ 98 : 2. Поскольку экспериментальнаяпогрешность оценки расстояния <r6β-11β> не превышает ±5% от измеряемого значения(на рисунке 12-4 погрешность определения расстояния ±5% показана пунктиром), тотогда точность определения населенности минорного конформера (B) должна бытьменьше ±1%. Таким образом, точная оценка населенности минорного конформера (В)стероида (5б) составляет 1.7 % (+0.9, ‒0.7 %).На основании сравнения экспериментальных значений константы 3J6β-7α длястероидов (5а) и (5б) при 20 ºС (Рис. 12-1) можно объяснить их различиеприсутствием конформера (В) в растворе стероида (5б), поэтому величину константы3J6β-7α(5а) = 2.3 Гц можно использовать в качестве значения для константы 3J6β-7α(5б) вдоминирующем конформере (А), а для минорного конформера(В) можноиспользовать расчетное значение 13.06 Гц.

Тогда населенность РВ, полученная наосновании наблюдаемой величины <3J6β-7α(5б)> = 2.7 Гц, составляет 3.7%.Рис. 12. 1. ‒ Сигнал протона 6β в спектре стероидов а) ‒ (5а) и б,в) ‒ (5б) при температураха, б) ‒ 20 ºС и в) ‒ 60 ºС. 2. ‒ Конформационный обмен в стероиде (5б), на которомстрелками показаны пространственное взаимодействие 6β/11β и скалярное взаимодействие6β/7α, а цифрами для конформеров (А) и (В) даны расчетные величины расстояния r6β-11β иконстанты 3J6β-7α в Гц. 3. ‒ Фрагмент спектра NOESY стероида (5б), на котором кросс-пик6β/11β выделен окружностью.

4. ‒ Оценка населенности конформеров с помощьюзависимости < r6β-11β > = f(PA).Таким образом, использование ЯЭО и скалярных констант приводит ксопоставимым результатам.Глава 3.Конформационный ЯМР-анализ других изоаналогов эстрогеновПроверенная на 8α-аналогах эстрогенов методология конформационного ЯМРанализа была использована при изучении особенностей пространственного строенияи внутримолекулярной динамики 5-ти других изоаналогов эстрогенов. Характерныепримеры их исследования и обсуждение системы доказательств принадлежности копределенному изоряду, составляет содержание следующих 5-ти разделов.3. 1.

9β-Аналоги эстрогеновПространственное строение 9β-аналогов стероидных эстрогенов в растворе былоисследовано на примере изучения четырех стероидов (12) – (15). Для этих стероидовхарактерны следующие пространственные взаимодействия в β-области с участиемпротона в положении 9: 9β/7β, 9β/8β, 9β/11β и взаимодействие 9β/11α, а также крайнеслабое прямое взаимодействие с протоном 1.21Одновременно с этим в спектре NOESY наблюдается достаточно интенсивныйкросс-пик 1/12α, свидетельствующий о большей сближенности соответствующихпротонов по сравнению с 8α-аналогами эстрогенов.

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6376
Авторов
на СтудИзбе
309
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее