Главная » Просмотр файлов » Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_3

Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_3 (1123315), страница 16

Файл №1123315 Osnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_3 (Д. Нельсон, М. Кокс - Основы биохимии Ленинджера в 3-х томах) 16 страницаOsnovy_biokhimii_Nelson_i_Kokh_tom_3 (1123315) страница 162019-05-10СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 16)

Другие ферменты используют химическую энергик> АТР для перестановки нуклеосом на ДНК (табл. 28-2); третьи изменяют состав гистонов в нуклеосомах. Лцетилирование и деацетилирование гистонов играет очень важную роль в процессах активации хроматина. Как отмечалось выше, 1>)-концевые домены гистонов в ядре нуклеосомы обычно обогащены остатками 1.уэ и Агй.

В ходе транскрипции гистон НЗ метилируется (под действием специфических гистонметилаз) по остатку 1уз" в нуклеосоме вблизи 5'-конца кодируя>щей области и по остатку 1узэь' внутри кодирующей области. Метилирование облегчает связывание гистонацетилтрансфераз (НАТ вЂ” от англ. ЬЫопе асету11>иггэ)гпгзез), которые ацетилируют определенные остатки лизина.

Цитоплазматические НАТ (тип В) ацетилирук>т вновь синтезированные гистоны до того, как они поступают из цитоплазмы в ядро. Последующее встраивание гистонов в хроматин после репликации облегчается шаперонами гистонов: САг1 для НЗ и Н4 и 1чАР1 для Н2А и Н2В (см. табл. 24-2). В тех участках, где хроматин активируется для транскрипции, гистоны нуклеосом далее ацетилируются под действием ядерных НАТ (тип Л). Ацетилирование многочисленных остатков 1уз в )Ч-концевых доменах гистонов НЗ и Н4 может уменьшать сродство к ДНК всей нуклеосомы. Ацетилирование специфических остатков 1.уз играет клк>чевую роль во взаимодействиях нуклеосом с другими белками. Когда транскрипция гена больше не нужна, в ходе общего процесса сайленсинга (отключения) генов, который возвращает хроматин в транскрипционно неактивное состояние, под действием гистондеацетилазной (НРАС вЂ” от англ, л(з1опе >геасегу1азез) активности ацетилирование нуклеосом в этом участке ослабевает.

Наряду с удалением определенных ацетильных групп происходит новая ковалентная модификация гистонов, Некоторые ферментные комгяексос катализируюнсие секзаниые с трзнскрнпциеи ыруктурные изменения кроматина ~п кт; и, н кы нн и ~ ) 1Н ~ ыит ом Л мо~ый ы ю, и ы Мт.и!стясно~тин1тн ~онмн сН н',', ..'з.Л Нс ',!: ~н н,г!~ ~ с~ус [260] Часть П1.

28. Регуляция экспрессии генов ключевые роли в подготовке участка хроматина к активной транскрипции. Некоторые представители третьего семейства комплексов, я тлгК1, участвуют в связывании варианта гистона П2А7 с транскрипционно активным хроматином. Некоторые представители других семейств преобразующих хроматин ферментов осуществляют перегруппировку нуклеосом в хроматине в процессе сайленсинга (отключения) генов, Общий результат перестройки хроматина — повышение доступности участка хромосомы и его «мечение» (химическая модификация) для облегчения связывания и действия транскрипционных факторов, регулируютцих экспрессию гена (или генов) в этой области. Многие зукариотические промоторы подвергаются положительной регуляции Как уже отмечалось, эукариотические РНК-полимеразы имеют небольшое сродство к своим промоторам (или не имеют его совсем), поэтому инициация транскрипции почти всегда зависит от действия многочисленных активаторных белков.

Одна важная причина явного доминирования положительной регуляции кажется очевидной — сохранение ДН1< внутри хроматина обеспечивает недоступность большинства промоторов, поэтому в отсутствие других регуляторных механизмов гены не экспрессируются.

Структура хроматина делает одни промоторы более доступными, чем другие, и рспрессоры, которые связываются с ДНК и предотвращают доступ РНК-полимеразе (отрицательная регуляция) просто не нужны. Использование положительной регуляции объясняется и другими факторами, главным образом, двумя: гигантским размером эукариотического генома и более высокой эффективностью положительной регуляции по сравнению с отрицательной регуляцией. В крупных геномах высших эукариот не- специфическое связывание регуляторных белков с ДНК становится серьезной проблемой. Кроме того, с увеличением размера генома повышается вероятность того, что отдельные специфические последовательности случайно могут оказаться в ненадлежащем месте. Специфичность активации транскрипции может быть повышена, если каждый белок-регулятор сначала связывает специфическую последовательность ДНК, а затем уже образует активационный комплекс с другими белками.

В многоклеточном организме среднее число регуляторных участков для каждого гена, по-видимому, не менее пяти. Необходимость связывания нескольких регуляторных белков со специфическими последовательностями ДНК значительно снижает вероятность случайного функционального совпадения всех задействованных участков связывания. В принципе подобная стратегия может реализоваться и для многочисленных элементов отрицательной регуляции, но тут играет роль вторая причина преимущественного использования положительной регуляции.

Эта вторая причина — более высокая эффективность положительной регуляции. Для отрицательной регуляции -29 000 генов человеческого генома каждая клетка должна была бы постоянно синтезировать такое же количество различных репрессоров (или намного больше, если каждый промотор регулируется несколькими элементами) в достаточно высокой концентрации, чтобы обеспечить специфичное связывание каждого «ненужного» гена.

При положительной регуляции большинство генов обычно находится в неактивном состоянии (т. е. РНК-полимеразы не связываются с промоторами), и клетка синтезирует только белки-активаторы, необходимые для транскрипции группы генов, необходимых в данное время.

Несмотря на эти аргументы, в эукариотах (от дрожжей до человека) все-таки встречаются примеры отрицательной регуляции, как мы увидим в дальнейшем. ДНК-связывающие активаторы и ко-активаторы способствуют сборке основных факторов транскрипции Продолжая наше исследование регуляции экспрессии генов эукариот, рассмотрим взаимодействия между промоторами и РНК-полимеразой П (Ро! П), ответственной за синтез эукариотических мРНК. Хотя многие (но не все) промоторы Ро! П содержат '1"А'1'А-бокс и !пг (инициатор) в стандартных позициях (см. рис.

26-9), они сильно различаются и по числу, и по расположению дополнительных последовательностей, необходимых для регуляции транскрипции. В высших эукариотах эти дополнительные регуляторные последовательности называют энхансерами, а в дрожжах— ! 282] Часть П1.

28. Регуляция экспрессии генов действуют такие активаторы? В болыпинстве случаев, по-видимому, расположенная между этими последовательностями ДНК образует петлю, в результате чего различные белковые комплексы приходят в непосредственный контакт. Образованию петли способствуют некоторые негистоновые белки, которые в большом количестве содержатся в хроматине и неспецифическим образом связываются с ДНК. Эта группа белков с высокой электрофоретической подвижностью в полиакриламидном геле (НМС вЂ” от англ. Ь!8Ь тоЫ!грдгоир; рис.

28-29) играет важную роль в ремоделировании хрома- тина н активации транскрипции. Ко-активаториые белковые комплексы. В большинстве случаев лля протекания транскрипции требуются дополнительные белковые комплексы. Были проведены биохимические и генетические исследования некоторых важных комплексов регуляторпых белков, которые взаимодействуют с Ро! П. Эти ко-активаторныс комплексы действуют как посредники между активаторами и комплексом Ро! П. Эукариотический ко-активатор состоит из 20 — 30 или более полипептидов, собранных в белковый комплекс, называемый медиатором (рис.

28-29). Многие из 20 полипептидов серлцевины этого комплекса высококонсервативны у разных видов организмов от грибов до человека. Дополнительный комплекс из четырех субьелиниц может взаимодействовать с медиатором и подавлять инициацию транскрипции. Медиатор прочно связывается с С-концевым доменом (СТ()) самой крупной субъединицы Ро! П. Медиаторный комплекс необходим как для базовой, так и для регулируемой транскрипции с промоторов полимеразы П; он также стимулирует фосфорилирование СТО под действием основного транскрипционного фактора ТН1Н. Активаторы транскрипции взаимодействуют с одним или несколькими компонентами медиа- торного комплекса, причем в строго определенных местах, различных для разных активаторов. Ко-активаторные комплексы функционируют в области ТАТА-бокса или поблизости.

Описаны и другие ко-активаторы, способствующие транскрипции одного или нескольких генов. Некоторые функционируют в паре с медиатором, а лругие в системах без медиаторов. ТАТА-связывающий белок. При сборке преинициаторного комплекса (Р1С вЂ” от англ. ргет!гга!!оп сотр!ех) в области ТАТА-бокса типичного промотора Ро! П первым присоединяется ТАТА-связывающий белок (ТВР— от англ. ТАТА-!этг1!я8ргоге!и). В полный комплекс входят основные факторы транскрипции ТГПВ, ТЕПЕ, ТН1Е ТЕПН, Ро! П и, возможно, ТЕНА. Однако этого минимального преинициаторного комплекса часто недостаточно для инициации транскрипции, если же промотор скрыт внутри хроматина, преинициаторный комплекс обычно вообще не образуется.

Характеристики

Тип файла
DJVU-файл
Размер
9,35 Mb
Тип материала
Предмет
Высшее учебное заведение

Список файлов книги

Свежие статьи
Популярно сейчас
Зачем заказывать выполнение своего задания, если оно уже было выполнено много много раз? Его можно просто купить или даже скачать бесплатно на СтудИзбе. Найдите нужный учебный материал у нас!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6487
Авторов
на СтудИзбе
303
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее