отзыв на автореферат к.б.н. Абдуллатыпова А.В. (1102337)

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла

отзыв на автореферат диссертации Толстовой Анны Павловны «АНАЛИЗ ДАННЫХ АТОМНО-СИЛОВОЙ МИКРОСКОПИИ С ПОМОЩЬЮ КОМПЬЮТЕРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ», представленной на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.02 — биофизика По результатам работы было опубликовано 2 статьи в рецензируемых журналах, 1 статья в нерецензируемом журнале, 1 публикация в сборнике трудов и 11 публикаций в материалах тезисов российских и международных конференций, что свидетельствует о хорошей апробации работы и ее высокой научной значимости.

Несмотря на сделанные замечания, диссертационная работа Толстовой А. П. удовлетворяет требованиям, предъявляемым к кандидатским диссертациям, и ее автор заслуживает присуждения ученой степени кандидата физико-математических наук по специальности 03.01.02 — «биофизика». Кандидат биологических наук, младший научный сотрудник Института фундамуяфлвнвгх.'Й)зс)блем 30,11.2015 биологии РАН ,:~' .;А' '4' 'Ф' Абдуллатыпов Азат Вадимович Г "-' '::. Ф~.~~й~дм:,~~~3. ик~л»; Представленный автореферат, характеризуя содержание и структуру исходной диссертационной работы Толстовой А.П., дает ясное представление о проблематике, актуальности, целях и конкретных задачах исследования. Работа посвящена применению методов компьютерного моделирования для уточнения данных, полученных методом атомно-силовой микроскопии.

Для моделирования были выбраны следующие объекты и процессы; 1) п70-субъединица РНК-полимеразы Езсйег1сЬ1а сой и ее олигомеризация в фибриллу; 2) синтетическая молекула бтарййе шой11ег (ОМ) и ей адсорбция на поверхность графита; 3) лизоцим куриного яйца и его адсорбция на поверхность слюды 4) фибриноген и его адсорбция на поверхность слюды. Автор успешно провел моделирование олигомеризации а70-субъсдиницы РНК- полимеразы, а также предложил модель образования фибриллы этого белка вида «бусина на нити», что вносит существенный вклад в понимание процесса олигомеризации белков и формирования фибрилл из глобулярных белков. Это может помочь в том числе и в исследовании фундаментальных принципов образования фибрилл амилондного типа.

Моделирование адсорбции лизоцима на поверхность слюды также вносит вклад в исследование образования амилоидных фибрилл. Помимо этого, работа автора позволила проводить коррекцию данных, полученных методом атомно-силовой микроскопии, то есть, внести поправки на ряд артефактов эксперимента. Достоверность полученных результатов не вызывает сомнений„выводы соответствуют поставленным задачам и обоснованы, Несмотря на высокий уровень работы, следует сделать ряд замечаний. Во-первых, из автореферата не ясно. чем лимитировалось время вычисления молекулярной динамики. Во- вторых, хотелось бы узнать, почему в одних случаях было выбрано силовое поле ОР1.В, а в других — силовые поля АтЬег99 и СНАКММ27.

Также работа не лишена опечаток и стилистических ошибок. .

Характеристики

Тип файла PDF

PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.

Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.

Список файлов диссертации