отзыв на автореферат д.ф.-м.н. Галзитскои О.В. (1102336)

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла

ОТЗЫВ на автореферат диссертации Толстовой Анны Павловны «Анализ данных атомно-силовои микроскопии с помощью компьютерного моделирования» на соискание ученой степени кандидата физика-математических наук по специальности 03.01.02 — «Биофизика» Доктор физико-математических наук, Руководитель группы био информатики Федерального государственного бюджетного учреждения науки Института белка Российской академии наук (ИБ РАН), г.

Пущино, ул. Институтская д.4, 142290, тел. 8903б75015б, о аЫ1йче а. го1гез.ги, въяве.рго1гез.гп. сана Валериановна ,.""Ъ. ' ОВМФ ',~фФ тская Ок 2015 Галзи 26.11. В автореферате Толстовой А.П. описаны результаты исследования п остранственной структуры белков а~~-субъединицы РНК-полимеразы Е. сой, Р тр фибриногена человека и лизоцима из куриного яйца методами молекулярной динамики и атомно-силовой микроскопии (АСМ).

В первом случае Толстова А.П. получила модель двух димеров о~~-субъединицы, а также исследовала влияние ионной силы на структуру свободной о7О-субъединицы. Для второго белка, фибриногена, Толстова А.П. построила модель адсорбции на различные поверхности, на которых по данным АСМ белок принимает разную пространственную структуру. На основе моделирования и АСМ- сканирования белка лизоцима Толстова А.П. разработала методику сравнения данных АСМ и молекулярной динамики. Суть ее в том, чтобы имитировать зондовое сканирование модели адсорбированного белка, а затем сравнивать модельное и экспериментальное изображения АСМ. Большое внимание было уделено вопросам применимости метода молекулярной динамики к совместной трактовке данных с данными АСМ, Для этого Толстова А.П. провела ряд дополнительных экспериментов.

Замечания по автореферату. Нельзя назвать фибриллой комплекс, состоящий из двух димеров (Рис.б). На рисунке 4 отсутствует рисунок (б), а на рисунке 7 вместо Д приводится рисунок Г. В автореферате не сказано какой рдЬ файл был использован для моделирования лизоцима и фибриногена. Актуальность работы состоит в том, что предложен метод совместного анализа данных атомно-силовой микроскопии н молекулярной динамики, который позволяет уточнить структуру нерасшифрованных областей белка. Все основные результаты Толстовой А.П. получены впервые, выводы обоснованы и заслуживают высокон оценки. Материалы диссертации были представлены на международных конференциях, основные результаты опубликованы в 15 работах, в том числе в 2 статьях из списка ВАК.

Диссертация Толстовой А.П, является законченным научным трудом н соответствует всем требованиям ВАК для квалификационных работ на соискание ученой степени кандидата физико-математических наук. .

Характеристики

Тип файла PDF

PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.

Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.

Список файлов диссертации