Автореферат (Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей saccharomyces cerevisiae), страница 7
Описание файла
Файл "Автореферат" внутри архива находится в папке "Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей saccharomyces cerevisiae". PDF-файл из архива "Идентификация и анализ взаимодействия прионов и амилоидов в протеоме дрожжей saccharomyces cerevisiae", который расположен в категории "". Всё это находится в предмете "биология" из Аспирантура и докторантура, которые можно найти в файловом архиве СПбГУ. Не смотря на прямую связь этого архива с СПбГУ, его также можно найти и в других разделах. , а ещё этот архив представляет собой докторскую диссертацию, поэтому ещё представлен в разделе всех диссертаций на соискание учёной степени доктора биологических наук.
Просмотр PDF-файла онлайн
Текст 7 страницы из PDF
Более того, как показали нашиколлеги из лаборатории М.Д. Тер-Аванесяна, метод PSIA перспективен и дляисследования взаимодействия амилоидов. Используя этот метод, удалосьвыявить шесть белков, агрегация которых индуцируется в результатесверхпродукции в клетках дрожжей мутантной последовательности белка Httчеловека. Пять из этих шести белков содержат глутамин-аспарагинобогащѐнные последовательности, т.е. сходны по аминокислотнойпоследовательности с Htt и являются потенциально амилоидогенными.
Этиданные представлены в нашей совместной статье [Nizhnikov et al., 2014].Мы показали, что дрожжи S. cerevisiae являются удобной моделью,предоставляющейуникальныепреимуществадляисследованиявзаимодействий гетерологичных амилоидов in vivo. Белки PrP и Aβ припродукции в дрожжах формируют агрегаты, сходные по биохимическимхарактеристикам с агрегатами в мозге больных млекопитающих. Используяпреимущества, предоставляемые модельным объектом, нам удалось выявитьаминокислотные последовательности, ответственные за взаимодействиеагрегатов PrP с пептидом Aβ.ВЫВОДЫ:1. Взаимодействие прионов вызывает наследуемые изменения признаков:взаимодействие прионов [PIN+] и [SWI+] приводит к изменениюэффективности терминации трансляции.2. Прионизация Rnq1 и Swi1 вызывает появление новой функциональнойактивности этих белков: [PIN+] изменяет свойства прионных агрегатов[SWI+], а прионизация Swi1 вызывает супрессию нонсенс-мутации trp1289(UAG).3.
Разаботан и апробирован метод протеомного скрининга амилоидов,позволяющий выявлять и идентифицировать прионы и амилоиды различныхорганизмов.4. Выявлены белки, которые формируют детергент-устойчивые агрегаты вклетках дрожжей и являются кандидатами на роль функциональныхамилоидов.5.
Дрожжи S. cerevisiae являются адекватной моделью, предоставляющейуникальныепреимуществадляисследованиявзаимодействиягетерологичных амилоидогенных белков - в дрожжевой модельной системевыявлены короткие последовательности прионного белка млекопитающих,определяющие специфичность взаимодействия агрегатов PrP с пептидом Aβ.30Список работ, по теме диссертацииСписок статей1. Chernoff Y.O., Galkin A.P., Lewitin E., Chernova T.A., Newnam G.P., BelenkiyS.M. Evolutionary conservation of prion-forming abilities of the yeast Sup35 protein.// Mol Microbiol. – 2000.
– Vol. 35, № 4. – P. 865-76.2. Цапонина О.Е., Лада А.Г., Рубель А.А., Наволоцкая В.В, Петрова И.Т., ИнгеВечтомов С.Г., Галкин А.П. Аналз эффектов продукции гибридного белка АβSup35MC в дрожжах Saccharomyces cerevisiae. // Экологическая генетика. 2005. - Т. 3. - Вып. 1. С.
24-33.3. Галкин А.П., Миронова Л.Н., Журавлѐва Г.А. Инге-Вечтомов С.Г. Прионыдрожжей, амилоидозы млекопитающих и проблема протеомных сетей. //Генетика. - 2006. - Т. 42, №11. - С 102-141.4. Рубель А.А., Сайфитдинова А.Ф., Лада А.Г., Нижников А.А, Инге-ВечтомовС.Г., Галкин А.П. Дрожжевой шаперон Hsp104 регулирует экспрессию генов напосттранскрипционном уровне. // Молекулярная биология. - 2008.
- Т.42. №1. - С.123-130.5. Saifitdinova A.F., Nizhnikov A.A., Lada A.G., Rubel A.A, Magomedova Z.M.,Ignatova V.V., Inge-Vechtomov S.G., Galkin A.P. [NSI+]: a novel non-Mendeliannonsense suppressor determinant in Saccharomyces cerevisiae. // Curr Genet. –2010. – Vol. 56, № 5. – P. 467 - 478.6. Нижников А.А., Магомедова З.М., Сайфитдинова А.Ф., Инге-Вечтомов С.Г.,Галкин А.П. Выявление генов, кодирующих потенциально амилоидогенныебелки, участвующих в регуляции нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomycescerevisiae. // Экологическая генетика. – 2011. - Т.
9, №4. - С. 79-86.7. Рубель А.А., Коржова В.В., Сайфитдинова А.Ф., Антонец К.С., ИнгеВечтомов С.Г., Галкин А.П. Белок PrP и пептид амилоид бета взаимодействуютв дрожжах Saccharomyces cerevisiae // Экологическая генетика. // 2012. - Т. 10,№1. - С. 74-80.8. Nizhnikov A.A., Magomedova Z.M., Rubel A.A., Kondrashkina A.M., IngeVechtomov S.G., Galkin A.P. [NSI+] determinant has a pleiotropic phenotypicmanifestation that is modulated by SUP35, SUP45, and VTS1 genes.
// Curr Genet. –2012. – Vol. 58, № 1. – P. 35 - 47.9. (А) Нижников А.А., КондрашкинаА. М., Антонец К.С., Галкин А.П..Сверхэкспрессия генов, кодирующих аспарагин-глутамин обогащенныетранскрипционные факторы, вызывает нонсенс-супрессию у дрожжейSaccharomyces cerevisiae. //Экологическая генетика.-2013. -Т.11, №1.-С.
49-59.10. (Б) Нижников А.А., А.М. Кондрашкина, А.П. Галкин. Взаимодействиедетерминанта [NSI+] с генами SUP35 и VTS1. // Генетика. - 2013. - Т.49, - №10,С. 1155-1164.3111. Rubel A.A., Ryzhova T.A., Antonets K.S., Chernoff Y.O, Galkin, A.P.Identification of PrP sequences essential for the interaction between the PrP polymersand Aβ peptide in a yeast-based assay. // Prion. – 2013. – Vol.7, № 6. – P. 469 - 476.12. Кондрашкина А.М., Антонец К.С., Галкин А.П., Нижников А.А.Прионоподобный детерминант [NSI+] Saccharomyces cerevisiae снижаетэкспрессию гена SUP45.
// Молекулярная биология. – 2014. - Т.48.- С.790-796.13. Nizhnikov A.A., Alexandrov A.I., Ryzhova T.A., Mitkevich O.V., DergalevA.A., Ter-Avanesyan M.D., Galkin A.P. Proteomic Screening for Amyloid Proteins.// PLoS One. – 2014. – Vol. 9, № 12. - e116003.Глава в монографии: Инге-Вечтомов С.Г., Галкин А.П., Сопова Ю.В., РубельА.А. Прионы, "белковая наследственность" и эпигенетика. В кн: ред.
ЗакиянС.М., Власов В.В., Дементьева Е.В. Монография «Эпигенетика». Новосибирск:Изд-во СО РАН. 2012. с. 481-496. ISBN 978-5-7692-1227-7Патент Российской Федерации на изобретение № РФ - 2294964.: ГалкинА.П., Цапонина О.Е., Рубель А.А. Наволоцкая В.В., Лада А.Г., Петрова И.Т.,Смирнов А.Ф., Инге-Вечтомов С.Г. «Гибридный ген PCUP1-Aβ-SUP35MC дляанализа факторов, регулирующих продукцию, агрегацию и дисагрегациюпептида амилоид бета человека в дрожжевой системе». Приоритет изобретения03.11.2004. Регистрирация в реестре 10.03.2007.
Срок действия: до 03.11.2024.БЛАГОДАРНОСТИЯ хочу поблагодарить коллектив кафедры генетики и в особенностисотрудников лабораторий генетики животных и физиологической генетики, гдемне посчастливилось работать. Благодарю руководителей и сотрудников ЦКП«Хромас» и «Развития молекулярных и клеточных технологий».Личную благодарность я хочу высказать С.Г. Инге-Вечтомову, О.В.Иовлевой, А. Ф. Смирнову, П.А. Зыкину, Ю.В. Соповой, а также людям,принимавшим непосредственное участие в этой работе: А.А. Рубелю, О. А.Цапониной, А.Г. Лада, З.М. Магомедовой, А.Ф. Сайфитдиновой, А.А.Нижникову, К.С.
Антонцу, Т.А Рыжовой, С.П. Задорскому и К.В. Волкову.Отдельную благодарность я выражаю коллективу Санкт-Петербургскогофилиала ИОГен РАН им. Н.И. Вавилова, в котором я работаю уже почти десятьлет. Благодаря созданию филиала, к сорока годам я, работая в России, впервыеполучил полную ставку, что позволило мне сосредоточиться на научной работе.Я благодарен своей жене С.А.
Галкиной и маме Е.А. Галкиной за помощьи поддержку.32Подписано в печать 02.11.2015 Формат 60х84 1/16 Цифровая Печ. л. 1.8Тираж 100 экз.Заказ № 47/10печать____________________________________________________________________Типография «Фалкон Принт»(197101, г. Санкт-Петербург, ул. Большая Пушкарская, д. 54, офис 2,сайт: falconprint.ru).
