Автореферат (Исследование микробиоты кишечника при болезни Паркинсона), страница 5

Былополучено, что микробиота пациентов с БП характеризовалась функциональной избыточностьюотносительно генов, входящих в метаболический путь синтеза бутирата из предшественникаацетил-КоА по сравнению со здоровым контролем. Кроме того, в метагеноме кишечникапациентов с БП по данным реконструкции снижалась представленность генов, входящих вметаболические пути продукции витаминов В12, В2 и В3 по сравнению с лицами группыконтроля и другими неврологическими заболеваниями; увеличивалось содержание генов,ассоциированных с синтезом В6 и К, по сравнению с пациентами с другими неврологическимизаболеваниями.В рамках работы подобран оптимальный перечень биомаркеров и математическая модель, вкоторой классифицирующий алгоритм позволяет определять пациентов с болезнью Паркинсонапо составу кишечной микробиоты с чувствительностью 91,30%, специфичностью 91,67% приточности в 91,49%.

В результате проведенной работы было показано, что особенноститаксономической композиции кишечной микробиоты потенциально пригодны для проведениядиагностики БП.Выводы1) У пациентов с болезнью Паркинсона и лиц с другими неврологическими заболеванияминаблюдаетсяснижениетаксономическогоразнообразиякишечногосообществамикроорганизмов по сравнению со здоровым контролем.2) Микробиота кишечника при болезни Паркинсона характеризуется изменением впредставленности групп микроорганизмов, ассоциированных с продукцией короткоцепочечныхжирных кислот (бактерий родов Succinivibrio, Acetanaerobacterium, Anaerococcus, Peptoniphilus,бактерий видов Eubacterium cylindroides, Bifidobacterium breve и Bifidobacterium bifidum),условно-патогенных бактерий (бактерий родов Desulfovibrio, Cloacibacillus, Sphingomonas,Enterococcus, Klebsiella и бактерий вида Staphylococcus epidermidis), микроорганизмов свысокой степенью конкордантности (бактерий порядков RF39, ML615J-28, SHA-98, бактерийрода Christensenella и археев рода Methanobrevibacter) и микробов с потенциальнымипробиотическими свойствами (бактерий родов Bifidobacterium, Lactobacillus, Oxalobacter).3) В микробиоте кишечника при болезни Паркинсона по данным реконструкциифункционального потенциала отмечается увеличение представленности генов, связанных ссинтезом бутирата из ацетил-КоА по сравнению со здоровым контролем; снижаетсяпредставленность метаболических путей, связанных с продукцией витаминов В12, В9, В2 и В3,по сравнению с лицами группы здорового контроля и группой сравнения; а также17увеличивается содержание генов, ассоциированных с продукцией витаминов В6 и К, посравнению с пациентами с другими неврологическими заболеваниями.4) Создана математическая модель для классификации пациентов с болезнью Паркинсона,основаннаянаприменениибайесовскогоклассификатораиучетеинформацииопредставленности микроорганизмов родов Christensenella, Methanobrevibacter, Leuconostoc,Enterococcus, Catabacter, Desulfovibrio, Sphingomonas, Yokenella, Atopobium, Fusicatenibacter,Cloacibacillus, Bulleidia, Acetanaerobacterium и Staphylococcus в микробиоте кишечника.

Вмодели достигнуты показатели точности 91.49%, чувствительности 91.30% и специфичности91.67%.Перечень работ, опубликованных по теме диссертации1) Петров, В.А. Исследование микробиоты кишечника при болезни Паркинсона / В.А. Петров// Проблемы медицинской микологии. -2016. -Т 18, № 2. -с.

1022) Petrov, V.A. Gut microbiota in case of Parkinson's disease and other neurological pathologies:comparative study / V.A. Petrov, V.M. Alifirova, I.V. Saltykova, Y.B. Dorofeyeva, A.V. Tyakht, E.S.Kostryukova, A.E. Sazonov // The International Symposium Systems Biology and Biomedicine. –2016. – P. 236.3) Петров, В.А. Сравнительный анализ кишечной микробиоты при болезни Паркинсона идругих неврологических заболеваниях / В.А. Петров, В.М.

Алифирова, И.В. Салтыкова, И.А.Жукова, Н.Г. Жукова, Ю.Б. Дорофеева, А.В. Тяхт, И.А. Алтухов, Е.С. Кострюкова, М.А.Титова, Ю.С. Миронова, О.П. Ижболдина, М.А. Никитина, Т.В. Перевозчикова, Е.А. Файт, А.Э.Сазонов // Бюллетень сибирской медицины. – 2016. – Т. 15, №. 5. –С. 113–125.4) Алифирова, В.М. Взаимосвязь эмоционально-аффективных нарушений и микробиоты упациентов с болезнью Паркинсона / В.М. Алифирова, Н.Г. Жукова, И.А. Жукова, Ю.С.Миронова, В.А. Петров, О.П. Ижболдина, М.А. Титова, А.В.

Латыпова, М.А. Никитина, Ю.Б.Дорофеева, И.В. Салтыкова, А.В. Тяхт, Е.С. Кострюкова, А.Э. Сазонов // Вестник РАМН*. –2016. – Т. 71, №. 6. –С. 427-435.5) Алифирова, В.М. Возможная роль микробиоты желудочно-кишечного тракта в патогенезеболезни Паркинсона / В.М. Алифирова, Н.Г. Жукова, И.А. Жукова, А.В. Латыпова, М.А.Титова, Ю.С. Миронова, О.П. Ижболдина, М.А. Никитина, В.А. Петров // Журнал неврологиии психиатрии им.

CC Корсакова*. – 2016. – Т. 116, №. 11. – С. 174-179.6) Тяхт, А.В. Связана ли микрофлора кишечника с болезнью Паркинсона? / А.В. Тяхт, В.М.Алифирова, Н.Г. Жукова, И.А. Жукова, А.В. Латыпова, Ю.С. Миронова, В.А. Петров, О.П.Ижболдина, М.А. Титова, М.А. Никитина, Е.С. Кострюкова, Ю.Б. Дорофеева, И.В. Салтыкова,А.Э. Сазонов // Бюллетень сибирской медицины. – 2016. – Т. 15, №. 5. –С. 134–146.187) Кострюкова, Е.С.

Обонятельная дисфункция и изменение микробиоты как ранниенемоторные проявления болезни Паркинсона / Е.С. Кострюкова, В.М. Алифирова, Н.Г. Жукова,И.А. Жукова, О.П. Ижболдина, В.А. Петров, Ю.С. Миронова, А.В. Латыпова, М.А. Никитина,М.А.

Титова, А.В. Тяхт, Ю.Б. Дорофеева, И.В. Салтыкова, А.Э. Сазонов // Бюллетеньсибирской медицины. – 2016. – Т. 15, №. 5. –С. 66-74.8) Petrov, V.A. Analysis of Gut Microbiota in Patients with Parkinson’s Disease / V.A. Petrov, I.V.Saltykova, I.A. Zhukova, V.M. Alifirova, N.G. Zhukova , Yu.B. Dorofeeva, A.V. Tyakht, B.A.Kovarsky, D.G. Alekseev, E.S. Kostryukova, Yu.S. Mironova, O.P. Izhboldina, M.A. Nikitina, T.V.Perevozchikova, E.A. Fait, V.V. Babenko, M.T. Vakhitova, V.M. Govorun, A.E. Sazonov // Bulletinof experimental biology and medicine.

– 2017. – Vol. 162, №. 6. – P. 734-737.9) Свидетельство о гос. регистрации программы ЭВМ № 2017611956. «Паркинсондиагностика» / В.М. Алифирова, Ю.Б. Дорофеева, И.В. Салтыкова, А.Э. Сазонов, А.В. Тяхт,И.А. Алтухов, В.А. Петров, Н.Г. Жукова, И.А. Жукова. - № 2017611956, заявл. 7 декабря 2016,опубл.

14 февраля 2017.10) Свидетельство о гос. регистрации БД № 2018620323. База данных значимости родовмикроорганизмов микробиоты кишечника человека по отношению к дифференциальнойдиагностике болезни Паркинсона / В.А. Петров, В.М. Алифирова, Н.Г. Жукова, И.А. Жукова,Ю.Б. Дорофеева. - № 2018620323, заявл. 16 ноября 2017, опубл. 21 февраля 2018.*-в списке ВАК на момент выхода статьиСписок условных сокращенийАцетил-КоА – ацетил-коэнзим АБП – болезнь ПаркинсонаДНК – дезоксирибонуклеиновая кислотаВЗК – воспалительные заболевания кишечникаОТЕ – операционная таксономическая единицаПЦР – полимеразная цепная реакцияGLM – обобщенная линейная модельNB – наивный байесовский классификаторNNET – искусственная нейронная сетьPLS – регрессия методом частичных наименьших квадратовSVM – машина опорных векторов16S рРНК – 16S рибосомальная рибонуклеиновая кислота19.