Frenkel, Smit - Understanding molecular simulation - 2002, страница 11

А рег(ест!у ассер!аЫе тпе!Ьос( Еог сгеа6щ а !па1 с1(яр1асетпеп! !я !о ас(с( гапйотп пшпЬегя ЬеЕънееп — Лгг2 апс( +съ!2 то ЕЬе х, и, апс( к соогд!па!ея оЕ !Ье пю1еси1аг сеп1ег оЕ пъаяя: х — > хт + Л (КапŠ— 0.5) у,' — ~ г1! + Л (КапŠ— 0.5) г — ! тъ + Л (КапŠ— 0.5), (3.3.1) ънЬеге КапЕ аге гапс1отп пшпЬегя итиЕогпйу с(!я!г!Ьи!ес( Ьепчееп 0 апс( 1. С1еаг1у, !Ье течетье 66а1 пюче !я ес!иа11у ргоЬаЫе (Ьепсе, съ !я яупипе!пс).в !Аге аге поъч Еасес1 ън!!Ыи о с)иея6опя: Ьоъч 1агКе яЬои1с( ъче сЬоояе Л? апс( яЬои)с( ъне а!!етпр! Ео июне а11 раг6с1ея я!пъи1гапеоия|у ог опе а! а !ипе? !и 6те 1а!!ег саяе ъче яЬои1г( рте!с ЕЬе пю1еси1е !Ьа! Ея !о Ье пъочес( ат гапс1отп Ео епяите !Ьа! !Ье ипс(ег1у!пК Маг)ъоч сЬаш гепъа!пя яупипетт!с, А11 вАЬЬоиВЬ а!гповг а1! риЫЬЬес1 МС ппт!аьопв оп а!опас апг! пю1еси1аг вуя!етв яепега!е !г!а! гтир!асетепгв т а сиЬе сеп!егег1 агоипс1 ГЬе опята! сеп!ег о! гпат родоп, 1Ыв Ь Ьу по теапв Ьге оп1у рова!Ы1!ту, ьопге!!тея, й !я пюге сопчеп!еп! !о Вепега1е гпа! точея гп а врЬепса1 чо1ипге, апс1 Н Ь пот ечеп песетагу !Ьа! !Ье с1!втпЬииоп о! Гпа! гпочев !п висЬ а чо!тпе Ье ипиопп, ав!опя ав Ь Ьав тчегя!оп яупипеггу.

Рог ап ехатр!е о! а саяе ъчЬеге агю!Ьег вагпр1!пв всЬепге !в рте!егаЫе, вее геь !551. С)саргет 3. Моп1е Сот!о Б|вги1а1готсв ойъег Ейгпдв Ьетд есрла!, ъче вЬои1й сЬоове !Ье пюв! ей!слеп! ватр1|пд ргосейиге. Вис, 1о ЕЬЬ епй ъче тив! йгвЕ с!ейпе ъчЬа! ъче теап Ьу ефсЬгг! ватр!гггд. 1п чегу чадие !еппв, ватрйпд Ь ей1с1еп! й 6 д|чев уои доос1 ча1ие Еог пюпеу. Соой ча1ие |п а япш1а6оп соггевропсЬ !о ЬлдЬ всайвйса! ассигасу, апд "пюпеу" Ь ятр1у гтговеу: !Ье топеу ЕЬа! Ьиув уоиг сотри!ег йте апс1 ечеп уоиг оъчи 6те. Рог !Ье ва1се оЕ !Ье агдитеп1, ъче аввшпе !Ье ачегаде всгеп6йс ргодгаиипег Ь роог!у раЫ.

|и ЕЬа! саве ъче Ьаче !о ъчоггу оп1у аЬоис уоиг сотри1ег Ьис1де|.г ТЬеп ъче сои!6 иве !Ье Ео11оъч|ид дейп|йоп оЕ ап орйта| ватр!|пд всЬете: а Моп|е Саг!о ватр)тд всЬете сап Ье сопвЫегей орЕ|та1 й 6 у|е1дв ЕЬе 1оъчев! в|а|Ь6са1 еггог лп 1Ье с|иап- 6!у !о Ье сотри|ес| Еог а д|чеп ехрепсИиге оЕ сотрийпд Ьис!де!. |3виайу, сотри6пд Ьийде! Ь ес|шча1еп! 1о СР|| Шпе. Ргот !Ьъв с1ейт6оп 6 Ь с1еаг 1ЬаЬ |и рппс!р1е, а ватрйпд всЬете тау Ье орйта1 Еог опе срлап6!у Ьш по! Еог апо!Ьег. Ас|иа!!у, ЕЬе ргесейид с!еЕ- !и|бои гв а11 Ьи! иве1евв 1п ргасйсе (ав аге товЕ дейп16опв).

Рог плв!апсе, 6 Ь )ив! по! ъчог1Ь Ейе ейог! 1о теавиге !Ье еиог ев!ипа!е |п Ейе ргеввиге Еог а пшпЬег оЕ 61ЕЕегеп1 Моп!е Саг1о ватр1ъпд всЬетев 1п а веиев оЕ гипв оЕ йхес| !епд!Ь. Ноъчечег, 6 Ь геавопаЪ|е !о аввшпе |Ьа1 ЕЬе теап-вс|иаге еггог гп 1Ье оЬвегчаЫев 1в |пчегве1у ргорог6опа1 Ео !Ье пшпЬег оЕ ипсогге1агес1 сопйдига6опв ч|в|!ей т а д|чеп атоип! оЕ СР|3 6те. Апс1 1Ье пшпЬег оЕ |пс|ерепс|еп! сопйдига6опв чЬйед Ь а теавиге Еог Ейе с!Ь!апсе сочегес1 |и сопйдига6оп врасе.

ТЬЬ виддевЬ а тоге гпападеаЫе, а!Ьей гауйег ас1 Ьос, си|егюп 1о ев1ипа!е ЕЬе е|йсгепсу оЕ а Моп!е Саг1о вагпр!лпд всЬете: !Ье вшп оЕ Ейе вс|иагев оЕ а1! ассер|ес1 !па! 6Ьр1асетепгв йчЫес) Ьу сотри6пд !ипе. ТЬЬ срлапй!у вЬои!6 Ье йвйидшвЬес| Егот !Ье теап-вс!иагей йвр1асетеп! рег ипй оЕ сотрийпд 6гпе, Ьесаиве !Ье 1айег с|иапй!у доев Ео О |и !Ье аЬвепсе оЕ с$!ЕЕияоп (е.д., |п а во|Ы ог а д1авв), ъчЬегеав !Ье Еоппег с1оев по!. |.1япд йЬ сгйепоп 6 Ь еаву !о вЬоъч ЕЬаЕ Еог япш1а6опв оЕ сопйепвей рЬавев Н Ь ивиайу айчЬаЫе 1о регЕопп гапдот 6Ьр1асетепЬ оЕ опе раг6с1е а! а !ипе (ав ъче вЬа!1 вее 1а!ег, Ейе ясиас|оп Ь с||ЕЕегеп! Еог согге!асей с|ЬР1асетеп!в).

То вее ъчЬу гапйот япд1е-раг6с1е точев аге ргеЕеггес1, сопвЫег а вув!ет оЕ )ъ| врЬеиса! раг6с1ев, |п!егас6пд !ЬгоидЬ а ро!епйа1 епегду Еипсйоп ЕЕ|ггл ). Турка!!у, ъче ехрес! 1Ьа! а 1иа1 точе ъчй! Ье ге)есгес1 |Е |Ье ро!еп6а| епегду оЕ ЕЬе вув|ет сЬапдев Ьу пшсЬ !поте !Ьаи |се Т. А! 1йе вагпе !ппе, ъче !гу Ео та1се йъе Моп!е Саг!о !г|а! в|ерв ав 1агде ав Ь ровяЪ|е ъчИЬои! Ьачтд а ъ.егу 1оъч ассер!апсе. А 6Ьр1асетеп! !Ьа| ъчои|д, оп ачегаде, д!че г|ве !о ап |псгеаве о! |йе роСепйа1 еиегду Ьу )свТ ъчои1й в611 Ьаче а геавопаЫе ассер!апсе. |и !Ье саве оЕ а ыпд1е-раг6с1е Ег)а! точе, ъче гВ!!!1, лче авоо!г1 а!геаа !Ъаг И Ь по! ъчогвпчва!е го арепг1 а !ог о1 ипге г|ече!ор1пВ а 1апсу согпроъайопа! асвегпе 1Ъас лч!!1 Ъе оп!у плагВпгаПу Ъе Пег 1Ъап ехяапя а|плр1ее асЪеплеа, пп!еаа уопг ргоВгаго гч!П плп чету опеп апгс ареег! Ь гплс1а!.

3.3 Тг(а! Мочев ЕЬеп Ьаче = О+ Е(и) Л ',. + (2(Л'), (з.з.г) ъчЬеге Ейе апд1е Ьгас)се!в с(епоге ачегартц очег йъе епветЫе апс1 ЕЬе Ьоп'- лопга! Ьаг с1епогев ачегаупд очег гапс1от Епа1 точев. ТЬе весопс1 с1епча6че оЕ ЕЕ Ьав Ьееп аЬвогЬес1 Епго ЕЬе Еипсйоп Е(ЕЕ), ЕЬе ргес!ве Еопп оЕ ъчЫсЬ с1оев по! сопсегп ив Ьеге. 1Е ъче поъч ес)иаге (ЬЕЕ) оп ЕЬе 1еЕЬЬапс1 яс1е оЕ ес)иабоп (3.3.2) Ео 1св Т, ъче йпс1 ЕЬе Ео1!оьч!пй ехРгевЯоп Еог Ьзф Л.,' =) втли). (3.3.3) 1Е ъче абетр! Ео п1оче Х раг6с1ев, опе а! а Еипе, тов! оЕ йъе сотригайоп !пчо1чес1 гв вреп! оп ЕЬе еъ а1иа6оп оЕ ЕЬе сЬапде Еп рогепг!а! епегду.

Аввит!пй Ейа! ъче иве а пефЬЬог 1!в! ог а япи1аг рте-вач!пц йеч!се (вее Аррепс1!х Р), Ейе Еога1 Е!те вреп! оп еча1иаг!пд Ейе рогепба! епегду сЬапде Ев ргорогйопа1 Ео п)ъ1, ъчЬеге и Ев Ейе ачегайе пшпЬег оЕ !пгегасбоп раг!пегв рег то1еси1е, ТЬе вит оЕ ЕЬе теап-вс)иагед с(1вр1асетепгв М11 Ье ргорог6опа1 Ео )ъ!Лг2 - М)свТ/Е(ЕЕ). Непсе, ЕЬе теап-вс)иагес( с1!вр)асетеп! Рег ипй оЕ СР(Е 6тпе ъчй! Ье ргорогйопа! Ео !св ТДп Е(ЕЕ) ).

Ь)оъч виррове Ейа! ъче Егу Ео тпоче а11 раг6с!ев а! опсе. ТЬе сов! т СРЕЗ 6гпе Ы11 в6!1 Ье ргорог6опа1 Ео пМ. Виг, ив!пй ЕЬе вате геавотпй ав !и ес!иа6опв (3.3.2) апс1 (З.З.З), ъче евйтаге ЕЬа! ЕЬе вшп оЕ ЕЬе теап-вс!иагес1 с(!вр1асетепгв !в япа1!ег Ьу а Еасгог! /)ъ). Непсе Ейе !о!а! еЕйс!епсу ъчй! Ье с1оъчп Ьу !Ыв вате Еасгог. ТЫв випр1е агаитеп! ехр1а1пв ъчЬу тов! яти1аЕогв иве в!пй1е-рагг!с1е, гаЕЬег Ейап со!1ес6че Епа1 пючев. И !в !трог!ап! !о поге йъа! ъче Ьаче аввитпед ЕЬа! а со11ес6че МС Ейа! пюче сопв!в!в оЕ Х Епс)ерепс(еп! !г!а! с!!вр1асетепгв оЕ ЕЬе рагйс1ев.

Ав ъчй! Ье с(!всиввес( !п вес6оп 14.2, е(йс(еп! со((есйче МС точев сап Ье сопв!гисгес1 ЕЕ ЕЬе Епа! сйвр!асетепгв оЕ ЕЬе Епсйч)йиа! Раг6- с1ев аге по! сЬовеп тйерепйепйу. !ъ)ехЕ, сопв!с1ег ЕЬе сЬо1се оЕ ЕЬе рагатегег Л ъчИсЬ с1еЕегпипев ЕЬе в(ге оЕ ЕЬе Ег)а! пюче, Ноъч 1агйе вЬои16 Л Ьег 1Е й !в чегу !агре, 6 !в !йе1у ЕЬа! 6ъе геви16пд сопййигайоп ъчй1 Ьаче а ЬЕеЬ епегду апс1 ЕЬе Епа! гпоче ъчй! РгоЬаЫу Ье ге)есгес(. ЕЕ й Ев чегу вта!1, ЕЬе сЬапде Еп роЕеп6а1 епегду !в ргоЬаЫу япа11 апс( товЕ тпочев ъчй! Ье ассергес(. 1п ЕЬе 16егаЕше, опе ойеп йпйв ЕЬе тувЕег!оив вгагетеп! ЕЬа! ап ассерЕапсе оЕ арргох(таге!у 50% вЬои16 Ье орйта1.

ТЫв вгагетеп! !в по! песеввап1у Егие. ТЬе ор6- тит ассерЕапсе га6о !в ЕЬе опе ЕЬа! 1еас(в Ео ЕЬе тов! еЕйс!еп! ватр1тд оЕ сопЕ!Вигайоп врасе. !Е ъче ехргевв еЕйс!епсу ав теап-вс)иагес( с(!вр1асетеп! рег СР!.1 6те, 6 !в еаву Ео вее ЕЬа! с(!ЕЕегеп! Мопге Саг1о сос(ев ъч!11 Ьаче с16(егеп! ор6та1 ассерЕапсе га6ов. ТЬе геавоп Ев ЕЬаЕ И та1сев а сгис(а1 сИЕегепсе ъчЬеЕЬег йъе атоип! оЕ сотрийпй гес!и(гес( Ео Еев! ъчЬеЕЬег а Ег)а1 С)га гег 3. Мопге Саг!о 5!ти1агюпв <йг > О) о о Гщиге 3.4: (1е(!) Турка! с!ерепс1епсе о( гЬе гпеап-яс(иагес( йвр1асегпепг о( а раг!к!е оп гЬе ачегаде в!ге Л о( гЬе !па1 пюче, (г!дЬ!) Турка1 с(ерепс(епсе о( ГЬе сопгрига6опа! сов! о( а 64а! гпоче оп !Ье я!ер-я!ге Л.

Рог соп6пиоив ро!еп6а!в, гЬе сов! !в сопвгап6 гчЬ1!е (ог Ьагй-соге ро!епба)в Ы с(есгеаяев гар!6!у гч!гЬ 6ге в!ве о( гЬе !па1 пюче. гпоче !в ассер!ес( с(ерепс(в оп гЬе тадп!!ис(е о1 гЬе точе (яее раисе 3.4). 1п !Ье сопчеп6опа1 Ме!горо!!я ясЬегпе, а11 соп6пиоия !и!егас6опв Ьаче го Ье сотри!ес! Ье(оге а пюче сап Ъе ассергес( ог ге!ес!ед. Непсе, (ог сопбпиоия рогеп6а1я, 6ге апюип! о(сотри!акоп с1оев по! с1ерепс1 оп !Ье в!ге о( а !па1 точе. 1п соп!гав!, (ог ыпш!а6опв о( пю1еси1ев ччйЬ Ьагс1 гери1ыче согея, а точе сап Ье ге!ес!ес( ав яооп ав очег1ар иг!!Ь апу пе!еЬЬог !в бе!ес!ей 1п !Ьа! саве, а ге)ес!ес( пюч е !я сЬеарег !Ьап ап ассер!ес1 опе, апс1 Ьепсе !Ье ачегаде сотри6пе 6впе рег !па! пюче еоев с(огчп ав 1Ье в!ер в!ле !я !псгеаяей Ав а геви11, гЬе ор6та! ассер1апсе га6о 1ог Ьагйсоге вуя!епгя гв арргесгаЫу 1огчег !Ьап (ог вув!епгя вч!гЬ соп6пиоия гп!егас6опв. Ехасбу Ьочч пшсЬ с(ерепс(в оп гЬе па!иге о! !Ье ргоегат, !п раг6си1аг оп игЬе!Ьег 6 !в а яса1аг ог а чесгог сос(е (гп !Ье 1а!!ег саяе, Ьагд-соге яув!ешв аге ггеа!е6 пшсЬ Ь)се соп6пиоия яувгегпя), оп Ьоъч гЬе !п1оппабоп аЬои! пефЬЬог 1!я!я !я я!огес1, ап6 ечеп оп гЬе сотри!а6опа! "сов!" о1 гапс(огп пшпЬегя ап6 ехропеп6- а6оп.

ТЬе сопяепяив веегпв !о Ье гЬа! (ог Ьагй-соге яуя!епгв !Ье орбпипп ассер!апсе га!ю !в с!ояег !о 20 !Ьап 1о 50%, Ьи! 6ия !в !ия! апогЬег ги1е о( 1ЬшпЬ !Ьаг яЬои16 Ъе сЬес(сес(.~ А йя6псг йвас(чап!аде о( 1Ье е(1!с(епсу сгбегюп йвсияяес( ргечюия|у !в гЬа! Ь с(оея по! а1!оъч ив !о с(е!есг гчЬегЬег !Ье вагпр1!пе о( сопйеига6оп ярасе !я егдо6!с, То Га(се а ярес61с ехатр1е, виррове 6гаГ оиг вув!ет сопя!я!в о( а пшпЬег о( раг!к1ея !Ьа! аге ггаррес1 гп сИ(егеп! ро!еп6а1 епегеу пип- в!п весиоп г4.3.1, гче в!гоге !гоге, ечеп!п с!ге саве о! соп6пиоив рогепг!а!в, !Г !в роев!!г!е Го ге!ес! спа! пгочев Ьегоге а!! !пгегасс!опв Ьаче Ьееп еча!иасег!.

гЧ!г!г васа а вапгр!!пя вс!гепге, !!ге г!!вг!псС!оп Ъепчееп !!ге вапгр!|пя о! !гагг!-сове апс! сопгишоив рогепг!а!в а!! Ьиг с!!варреагв. 3.3 Тг(а! Мочев ппа. С1еаг1у, ъче сап вагпр1е ЕЬе ч!с!пйу оЕ ЕЬеве пнп(гпа с!ийе ъчей апй в66 Ьа че Ео!а11у !пас(ег(иаге вагпрйпВ оЕ ЕЬе ъчЬо1е оЕ Ейе сопВВига6оп врасе. А сгйепоп Ейа1 ъчои!6 с(еЕес! висЬ попегдогйсйу Ьав Ьееп ргоровес( Ьу МоипЕагп апс1 ТЬ!пппа1а! (5б). ТЬеве аиЕЬогв сопвЫег ЕЬе с(!ЕЕегепсе Ьепчееп 6ъе чапапсе оЕ ЕЬе 6гпе ачегаде оЕ ЕЬе (рогепг!а!) епегВу оЕ а11 рагбс1ев. 1 е! ив с(епоге Въе Еипе ачегаВе оЕ ЕЬе епегВу оЕ раг6с!е 1 Еп Е!гпе ийегча1 с Ъу е; (ъ): Апд 6ъе ачегаВе в!пд1е-раг6с!е епегду Еог 6нв !п1егча! Ев В е(т) вв — ~ е;(Е].