Knudsen - A Biologists Guide to Analysis of DNA - 2002 (522916), страница 15
Текст из файла (страница 15)
ТЬа[ (пеапб йа[ еаеЬ са[е8огу Ьаб Ьееп тереса(е(М опсе. ТЬе (!ага Ко!1очч йе 6[ап(!ап! Топпаг ехсерг йаг йеге !6 по йпсгюп йебспр6оп. Рог боте апа1убеб йе ра6еп[!аЬе1 ич11 сопйбе йе бой)чаге, ЬЬГ Ь 16 еабу [о геточе. 1Г йе ехагпр!е аЬоче 16 (и йе 61е пате(! "еха(пр1е," )че сап сгеа[е а пе)ч 6!е па(пе(1 "ехатр!е2" чч!й йе рабепГ!аЬе!9 геточей вюа ']Ч]2 > 1' ехаар1е >ехалр1е2 $Е)г[ЧУЯЛЕ гОЛ $ТЯТ($Т]СЯЕ ЯИЯЕУ$($101 Е11е = "соево.оив") д(паче="по") ТЬе (!еГап!Г са]1 [о йе С.[ев[ йпс[Ьдп аввшпев ппее]па! чапапсе Ье[]чееп йе гчво рорп1апопв 1%е1СЬ'в г-[ев[).
М2А.!.2 ИЕ1!сохол Уоп сап рег!оппйе%!1сохоп [ев[шв[еае]ОГйе (- сев[ Ьу гер1асша йе са11 со [Ье (Яеы Ь]пспоп аЬоче ЧР]й а са11 [о йе «б]сох.(ев( Йпспоп. 12.4.1.3 АНО]ЕА Неге 18 Ьо)ч уоп ]чои1д регГопп ап А]."ОЧА оп йе ехагпр1е [о [ев[ гог аепев йаг ййег 51ашйсап[1у ш аг !еавг опе ОГ йе йгее сагеаопев Х, А, ап(1 В: 4 Вресггу саседоггев апб со1чппв Ьо1бгпд АндрЕЕЕ баса: сагедог1ев <- ав.гасгог(с("0","0","А","А","В","В")) ЕпдехандРЕЕЕ <- 2:7 4 АМОНА Еопсг1оп: дес.рча1.апона <- Еипсггоп(багаЕ,ЕпбехА11,Саседоггев, багаЕ11гег=ах.попеггс)! саседогеев <- ав.еассог(саседоггев) Е <- Еипсс1оп(1) гегигп(вовваагу( аоч(басае11гег(басаЕ[г,гпбехА11]) сагедогвев) ) [ [1)! [4: 5) [ [2) ] (1] ) 1 гесигп(варр1у(1:1епдса(басаЕ[,1)),Е)) 4 са11 СЬе Еппсг[оп юЕГЬ оиг дага: рчаг.апона <- дег.рна1.апоча(дагаг,гебехАчдпгее,сагедог[ев) 4 рг1пс гево1гв оп всгееп (оп1у Еог а впа11 басавес 11Ке савв) рггпг (сЬЕпб (дасаЕ, рча1.
апоча) ) Ч1 Ч2 Ч3 Ч4 Ч5 Чв Ч7 рча1.апона 1 депе.а 90 110 190 210 290 310 0.0017965439 2 депе.Ь 190 210 390 410 590 610 0.0002283540 3 депе с 90 110 110 90 120 80 1.0000000000 4 депе с] 200 100 400 90 600 200 0.5560965577 4 вогс оп Р-ча1ое апб аггее гевигсв Со Е11е: огбегв <- огбег(рча1.апоча) огбегеб.баса <- сЬгпд(басаг[огбегв,),рча1.апоча[огбегв)) мггсе(Г(ав.тасггх(огбегеб.с]аса)), псо1чппв< 1епдсЬ (баса Е ) +1, Е11е = "АМОЧА.оиг") с](паче="по") 1п аепега], Ь 16 Ьевг го рег!опп в[а[1впса! [евгв оп йе гачв Ачд1уЛ ча1пев [!пс1ийпд пеааг]че АЧ21ИГ ча1пев) !пвгеа(1 ОГ ГО1д СЬапде ча1иев ]ЧЬеге АЧ21У1йв Ье1о]ч 20 ог Ье1о]ч 0 Ьаче Ьееп с!]рред. 1!' уои аге аког]е!пд ]ч[й вроПее[ апаув 3ЧЬеге йеге 18 пшсЬ чапа[!оп Ье[чвееп в! Ыев 1[ ]пау Ье ЬеПег го регГопп йе в[аовоса! Сев[ оп йе ГО1д СЬапае е]епчее] 6 от йе ге(] ап(! дгееп сЬаппе!в ОГ еасЬ 81Ые.
Тгу Со рег!опп йе в]аовг[са! [евв оп Ьой аЬво1иге гог вогтиалк)зв(]ив мп огата ролмктз ча1иев апб 1о1б сЬапде апб сотраге йе геви1?в. ?381б1 апб !.опд 12001) абчоса(е !од-ггапв!оппаиоп оХ бага Ье1оге в!а?18?1са! апа1уяв. 12.4.1.4 РСА "гои сап реКогт а рппс1ра! соп?ропеп? апа1уяв оГ йе вате бага ав Го!!о]чв (по(е йаг йе йгвг го?ч оГ йе баса тивг сопгып 1аЬе18 оХ а1! раиепгв, Ьт по 1аЬе1 Гог йе депе 1бепийег): 1].Ьгату(яча) дата? <- геад.таЬ1е("ехаар1е" ) рса <- рг?псопр(дата!) впнпагу(рса) р1от(рса) Ьгр1от(рса) ТЫв ]ч11! ргобисе йе р1о( вЬоччп ш Р)доге 4.2 ш Яеспоп 4.1. ТЬе р1ог ЕЬоччп 1п Р1диге 4.3 ччав ргобисеб Ьу Ггапвров1пд йе ба(а та(пх ]ч1й йе сопипапб ((ая(80, Ьт РСА тау по? тчог1с Гог 1агде (гапвровеб та?пеев.
!2.4Л.Б СоггевролИелсе алв!ув!в ?тои сап регГопп а соггевропбепсе апа1уяв пшсЬ йе вате ччау ав уои регГопп а рппс1ра1 сотропепг апа1уяв: 1?Ьгагу(МХВВ) 1?Ьгагу(ача) дата? <- геад.таЬ1е("ехапр1е",Ьеадегее) ся <- соггевр(дата?,п?=2) р1от(св) !24Л.Ю С!(ЗЕВ!!!Саг!ОЛ ?тии СаП рЕКОПП )0 ПЕВГЕВГ ПЕ18ЬЬОГС1аВяйоаиОП ?ч1й сговв-ча11бапоп ияпд Ьи116п йпсбопв ш йе вгапбагб б1вп3Ьиг)оп оГ К. ТЫв 18 йе са1си!агюп йаг ?чав рег!Ьппеб Ког йе с!авяйсег ш ехатр1е 8.3: 1тЬгагу(с1авв) 1тЬгагу(яча) дата? <- геад.таь?е("дасаше",ьеадегтг) ]<пп.тагретв <- гасгог( с(гер("е", 23), гер("В", 8), гер("М", 12), гер("В", 20)) ) )<пп.сч(дата?, ]<пп.сагретв, Е=З, ртоьпгаие) Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е Е В В В В В В В В М М М М М М М М М М М М В В В М В В В В Е Е В В В В В В В В В К ТЬе ргеб1сгеб с1аввев 11ав( ьчо 1шев) брег гогот ?Ьове авядпеб !1сппхагдегв) Гог 1?чо ттогв, во ?Ыв с!авв|йса?1оп 18 97% соггесс.
12.4л.7 ивина! лег(чог!ге тье к рас1саде ьав а !Ьпс(1оп Гог сгаиппд а !ееб4ог?чагб пеига1 пе?]чог1с апб ившд йе Ггашеб пе(ччог10 Го ргейс? йе с1авв оГ ип1аЬе1еб ватр1ев. ТЬеве са1си1апопв )чеге регГоппеб 1ог йе пеига1 пег?чог10 геви1?в вЬо]чп ш ехыпр!е 8.3 ьч(й 1еаче-опе-оиг сговв-ча11бапоп: 1тЬтату(с1авв) 1?Ьгагу(ача) рса <- рг?псопр(дага?,согвгксе,всогевврвие) сапе <- рсаВвсотев (, 1: 10] гассета <- с1аяя. ?пд( с (гер ("е", 23), тер ("В" . 8), Соттег сга1 Ко~Маге Расйауею ТЬе ргечюив сЬартег 1шгодисет! йе 15шхЛ.1пих р1аг1опп апд воше атее зо1гмчаге ргодгяпз йаг сап регГопп а11 йе апа1узев т!езспЬет! ш й1з ЬооЕ.
БисЬ ап епч1гошпепг 1з пювг зи1гет1 аког Ыо!и!оппаг1сз мчог1т Ьесаиве 1г Ьав ип11ш1гет! !1ех1Ы1!гу. Хо РХА аггау апа1уяв гавЬв аге 1т1епг1са! апд уои пеед го га|1ог еасЬ апа1уяз го йе ргоЫеш ат Ьапй 'м1т1й !.1пих апд зоше зппр1е ргоигапишпи уои сап до йап Но немет, по! ечету Ыо1ои1вг чмапгз то деа! мч1й !.ших апт1 ргоигашпипд.
ТЬеге аге а1гегпаг1чез. Сошр1есе зойч аге рас1сааез !ог регГопшпд апа1уяз от" !)ХА ш1сгоаггау дага аге ачя1аЫе Гог М1сгозой 'ммшдомчз р1аг1оппз апд ойег р1агтоппз. 1 мм111 ЬПе11у шеи!!оп воше о!' йеш апд дезспЬе йе !ипспопа!1!у гЬаг йеу сиггепг1у 1пс1ит!е. ° А!туше!г!х Вага М!и!пд Тоо! ТЫз во!1чмаге огТегз зта6зпса1 апа1ув1в ав тче!! ав с1изгеппи апд ч1- зиа11хапоп от" АгТушегпх СтепеСЫр дага. 1г 1з 1псеигатет! ъчй !.!МЯ го ойег дага шападешепг от" 1агае чо1шпез о1 сЫр т1ата.
ТЬе рпсе 1з гагиегей аг 1агие рЬаппасеиг1са1 сошрашез. акр://юли.ай!уитетпх.сот ° АП'ушегг1х Ь1егА!Тх Ап оп1ше гевоигсе Йее1у ассевяЫе со А1гушеп1х сизгошегз, Ь 11п1тз ргоЬев оп АгТушеп1х СтепеСЫрз го риЫЫ ап<1 ргорпегагу датаЬазез, а11очмшд изегв го 1псеигаге т1ага апа1уяз антош йе1г ехргеввюп ехрепшепгя 'пир;нваю.пяаггх.сот 106 !06 СОММЕ/ГС/Яс БОЕГЧЧЯГ/Е РЯС/ГЯОЕЯ ° В!отах Сепе Ехргеявюп Апа!ув!в Би!ге С1ыгегв депев апб 1ийсв депев 1и ве1есгес1 с1ивгегв со тегаЬойс рагЬ- ваув.
Ргогеш шгегасйоп пегхчог1св оГсо-ехргеввеб депев аге Ыепбйеб Ггот а багаЬаве оГ ргоге1п паегасбопв Гог гЬе гевресйче огдашяп. Ыгр;//ввв.Ыопаах.бе ° Сепе1!а!а Ехргевв!оп!яг А войхчаге вувгет Гог огдашхайоптчЫе апа1уяв оГ ехргеввюп бага йош а чапе!у оГ р1агГоппв 1пс!иб!пд Айутегпх апб вроггеб сР1х1А апаув апб 6!гегв. Ехргевяоппа рег1оппв Ьас!сдгоипб зиЬггасгюп, вса1- шд, вгабвйса1 гевгв, с1изгеппд, бага ч1виайгайоп, апс! Ргопюгег веагсЬ|пд. ТЬе войхчаге 1в гагдегеб аг ЬюгесЬ !пбыгпев. 'аир://ввв.яепедага.сото/ ° 1пГогтах Хргевв!оп Ь1Т1 1троггв ехргезяоп баса ш а чапе!у о1 1оппагв, регГоппв поппайхагюп, с1ыгеппд, апб дгарЫса1 гергевепгагюп о1 бага.
1пГоппах а1во ойег Аггаурго Апа!угег со ргосевв вропеб аггау ппадев го ехргевяоп ча1иев. аир://вввбагоппах|пс.сот ° 1пчйгодеп Согрогав!оп КевСеп РаГЬхчаув А сотргеЬепв1че вег оГ гоо1в !ог гЬе апа!ув1в о1 гИйегепйа1 депе ехргевяоп ияпд писгоапау баса. 1таде апа1уяв, вгайвйса1 апа1уяз, с1ивгеппд, рагЬччау апа1уяв апб 1шЫпд го багаЬавез. Ьйр;//райвауахеаяеп.соуп/ ° Еюп Вювс!епсе аггауЯСО11Т Епсегрпвеаббе ехргевяоп с!ага апа1уяв беядпеб го Ьапб1е 1агде чо1- шпев оГ ехргеввюп бага. ТЬе войччаге шс1ибев яайвйса1 апа1уяв, с1изгеппд, апб чевиайхагюп гоо1в. 1пс1ибев багаЬаве о1 депе аппогаИоп.
Ыгр://ввв/Поп-Ыоас1епсе.сот/ ° Козе!во Кево!чег Сепе Ехргевяоп Рава Апа!ув!в дуввет ТЬе Ковепа Кево!чег 1в ап епсегрпвехчЫе депе ехргеввюп бага апа1- уяз вувгет гЬаг сотЬ!пев апа1уяв зойи аге, а Ыдй сарасйу багаЬаве, апб ЫдЬ-рег1оппапсе вегчег Ьагбхчаге го епаЫе ыегв го вгоге, гегг1ече, апб апа!ухе 1агде чо1шпев оГ депе ехргеввюп бага. К 1в ассезвес1 йот РС сИепгв.
ТЬе войваге шс1ибев вгайвйса1 апа1ув1в, йче гййегепг с1изгеппд а1допбипя, апб пшпегоы ч!виа1!хагюп гоо1в. ТЬе рпсе !в гагдегеб ас чегу 1агде рЬаппасеийса1 сотрашея. Ыгр;//вввхоаенаяо.соаИ ° Я!!соп Сепейсв Сепедрг!пд РегГоппв с1ыгеппд, ши1ИР1е ч1зиайхаг1опв, апб аппогагюп оГ ехргевяоп бага ргот ти!Ир!е зоигсез. й 1пс1ибез а геди!агогу веср1епсе зеагсп а1допйш. ТЬе рпсе 1з гагаесед аг вша11ег гевеагсЬ агопрв.
Ьыр;//вам.з!веаеась.сот ° Брогйге А шп1прпгрозе гоо1 Гог апа1укша апд ч1впа11а1па дага. Ьпр://и вв, ьрошге.соп~/ Мозг оГ йезе войвгаге рас1гааев пзе М1сговой %шбоюз. СепеБрппд 1в ача11аЫе ш а Мас1пговЬ чегз1оп ав юе!!. 1!В В1ВС!ОВВАРНУ печу депегаВоп о1 ргосеш с(асаЬаве веагсЬ ргодгагпв. !Чис!е!с Ас!1!в Яех 25:3389-3402 2 Апйс, Я., апс) С1ачепе, 1.