Knudsen - A Biologists Guide to Analysis of DNA - 2002 (522916), страница 14
Текст из файла (страница 14)
Рша1!у, 1теер ш пппт1 йаг шКХА гв ап ппзгаЫе пю1есп1е. Меввепдегв аге ргодталппе6 тот епгуша6с дедгайат!оп апт1 Ьа1Г-1!чез оГ шеззепдегз чагу сопядегаЫу. Меввепдегз мч1й чету вЬотт Ьа1т-1!чез шау Ье 6!Ейск!т то ехтгаст ш гергобпс1Ые т!папбту. Т1шв, апу геди!акоп ш ехргезяоп оГ а депе тч1й а мету вЬотт Ьа!!'-Ие шау Ье ппровяЫе то т1етест абй втабвбса1 ядвйсапсе ВВ им/тяг/О/ч$ ОГ ехРяе$$/О/ч яиАгг$/$ ш а шейог! йаг ге1!ез оп гергоИис)ЫИгу. ТЬозе ипзгаЫе гпеззепдегз ччИ яшр1у печег раы а г-гея. 1п гасЬ ип1еы йе епгушаИс г1едгадапоп оГ шеззепаегз 1з згоррег! иппгесИаге1у айег ехггасгюп ог йе зашр1е аког ехашр!е, Ьу сооИпд )п 1щи)г! п)ггодеп), йеге 1з пог И!се!у го Ье апу ипзгаЫе шеззепдегз 1ей ш йе шКХА ехггасИоп.
ТЬозе шеыепцегз ич11 печет Ье Иегесгег) аз ргезепг )п уоиг ЬуЬг)йхаИоп ечеп йоиаЬ йеу шау Ьаче Ьееп ргезепс шз)г!е йе ИчшИ сеИ. Рог шКХА йас Ьы Ьееп ехггасгег! чч)гЬоиг ргорег саге со )пипесИаге1у згор аИ г)едгаг!аиоп ог" шеззепдегз, аИ йаг гз 1ей 1з го апа)уге апу сЬапдез )п ехргеззюп оГ яаЫе шеыепдегз. 10.! ВЕ!.АТ!ЧЕ ЧЕВЕЦ8 АВ80!.ЦТЕ ййА О!!АКТ!Р!САТ!Ой Моя оу й)з Ьоо)с Лаз Госизег! оп ге1аИче сЬапдез ш йе аЬипс!апсе ог а шеззепдег КХА. АЬзо1ше грьапИИсагюп гз а пшсЬ Ьагдег газ!с.
Ъои пеев го !спич~ Ьов ~чеИ еасЬ ргоЬе ЬуЬпйхез го 1гз гагдег ЬеГоге уои сап ые И го дес$исе апугЫпд аЬош йе аЬзо1иге сопсепггаИоп о!' шКХА ш гЬе сеИ. Опе арргоасЬ 1з го са!1Ьгаге еасЬ ргоЬе зег из)пд 1гпоюп сопсепггаИопз оГ йе)г сопезропйпд шКХА. ТЬаг 1з 1аЬог шгепяче 1Г уои аге мог)г)пд чч)гЬ гпапу йИегепг п1КХАв. !г 1з !ог йаг геазоп йаг пюя аЬзо!иге апа1уяз оГ шКХА Ьаз 1пп)гег! И- зе1г го йе г1егепшпаИоп оГ ччЬейег а рагИси1аг шКХА ъчы ргезепг ог пог. АИуше!г)х ш еаг1у чегяоп оГ йеи зойи аге шаг!е зисЬ а саИ Ьыег! оп ешр1г1саИу г!егеггшпег! ги1ез йаг га)ге шго ассоипг йе пшпЬег оГ РМ/ММ ргоЬе ра)гз вчйсЬ Ьаче а рояИче йИегепсе аЬоче а сегга)п йгезЬо!д, йе пшпЬег оГ РМ/ММ ргоЬе ра!гз ччЫсЬ Ьаче а пеИапче йИегепсе аЬоче а сегга)п йгезЬ- о1д, апг! йе ачегаИе 1од-гаИо оГ аИ ргоЬе рягз, 1оИ!РМ/ММ).
БсЬаг!г ег а!., (2000) Ьаче г!ече!оре6 а згапзИсз-Ьазег1 арргоасЬ го йе ргезепсе/аЬзепсе дегеппшаИоп. БгИ1, аИ уои сап зау 1з ччЬейег а сеггап шеыепдег КХА 1з аЬоче г1егесИоп йгезЬо1д ог пог. И' И 1з ядпрИсапг1 у аЬоче, уои шау Ье аЫе го зау и 1й Ь)ИЬ сопИг!епсе йас И 1з ргезепг. Виг 1г уои г)оп'с г1егесг а шеззепдег, уои саппог ги1е ош йаг И 1з ехргеззег! Ье1оч~ г1егесИоп Ипй.
10.2 РОВТНЕВ ВЕАО1й6 /)егесг/оп о/ а!гегпаг/че вр!/сто мг/г А/уутегпх сЬ/рв Ни, О. К., Маг!иге, Б. 3., МоЪючег, В., ЗаИгое, Т., Ва1аЬап, !)., ТЬошаз, У., апд Иапо, У. (2001). РгейсИпд зрИсе чапапг Иош РХА сЫр ехргезяоп г!аГа. 6епоте /!евеагсй 11:1237 — 1245. СепоСуртд СИрю 1)р го й1з ро1пг й1з гехг Ьаз сочегег) апа1уыз оГ ехргеззюп дага. СЫрз Гог депогур)пд аге а1зо ача11аЫе. 1пзгеад оГ шеазиппд пгКХА, йеу шеазпге 1)ХА.
Рог ехашр1е, а р53 сйр М ача11аЫе Гпнп АКушепчх Гог г1егесг1пд пшга6опз 1п йе 1)ХА оГ Ьцшап р53 гшпог зпргеззог депе. 1г доез зо ячй очег1арр)пд о11доз йаг еасЬ аге сотр1етепгагу го 20 Ьазе рапз оГ йе ТР53 депе (Р1дпге 11.1). ЕасЬ о11до 1з ргезепс 1п 5 чегяопз: йе сепгга1 пис1ео6де 1з е)йег ап А, С, б, Т ог 1з аЬзепг (а 1 Ьр де1ег1оп). Оп1у опе оГйезе йче о11доз сопезропг1з го йе чл!д суре (поппшгапг) чегяоп оГ йе ТР53 депе. ТЬе РСК ашрИег$, 1гадшепгед, 11погезсепс1у 1аЬе1ег$1)ХА Ггогп а раг1епг затр1е чч11 ЬуЬпйге го йе сотр1етепгагу ойдо Гог еасЬ рояг1оп ш йе депе апг1 Ь 1з йеп розяЫе го "ген" йе зег)пепсе оГ йе еппге депе апг1 дегеппше ччЬейег 1г гз есрла1 го йе мчи гуре ог поп ТЬеге аге зп11 1пшгаг1опз оГ йе асспгасу оГ гйз десепппипагюп (АЬгепй, ег а1., 1999; ччйшап, ег а1., 2000).
Опг 1аЬ Ьаз Ьееп ъчог)г1пд оп пеига1 пеочог1г-Ьазег$ зойваге гЬаг чч1!1 ппрюче йе дегепп1паг1оп. 11.1 ЕХАМР1.Е: МЕЦЙА1. МЕТ%0ЙКЗ РОЙ 6ЕМЕСН1Р РЙЕО!СТ)ОМ Хепга1 пегтчог1гз сап Ье ггашед го ргейсг 1)ХА зес)меосе Ьазег1 оп йе ЬуЬпйгагюп 1пгепяг1ез шеазпгед оп а сЬ)р деядпед Гог а зрес1йс депе (яр1с1сег, ег а1., 2001).
1с гег)п1гез а 1агде ггып)пд зег оГ 13ХА чч1й ассигасе1у деГеггп1пег1 зег1пепсе. 92 6ЕИОТУР!М6 СЫ)Р$ с . асхи ~ " Оеоотн РНА ?'С~С С ~).С~ С "С ~?-С СхгСх С хЬ хПС гоС~Ох Го Го С'х Го хсгОСх ? ИгосоС А С б Т Ре!с!гоп Сотр!етеагагу ргоЬег М)й)1е иис1еогЫе 12) !г сотр1етеигагу го Яеаиеисе ген !гот с)ир АСАСА Г19. 11.5 р53 депе пииаиоп апа)уыил сйр.
5Ьогчп Ь а вша1! агеа ог йе сйр аигуасе сопгашшд 25 йдегепг о!гдох г)еыдпег) го геаг) йе аециепсе о!5 пис1еог)оеа гп йе депе. ТЬе ойдо ргоЬеа !гег)исег) го 1епдй 11 гог с!апгу) гог еасЬ роя!гоп о)ггег гп йегг пиг)г))е пис! еогше 1?) го ассоипг 1ог йе 1оиг рохяЫе Ьахех аа гче!1 гЬе роя)Ь|1)гу ог а опе пис1еопс1е г)е1ег)оп 1пд1и).
Ву геайпд йе гпсепягу о1йе диогеасепсе аг еасЬ о!)до Ь В роаяЬ!е го геаг) гЬе РХА аег)иепсе. (Ехрепгпепг Ьу )ерре Яр!с)гег.) Хепга! пе!ччог15 япш!а!е хоше о! Йе!од!с йа! 1!еа Ьепеай йе хчау гп ччЬ!сЬ Ьгаш пепгопа соппппп!са!е чи)й еасЬ ойег со ргосеак !проппа!!оп. Хепга! пеггчог1са !еагл Ьу ад)паопд йе д!гепдгЬ5 од соппесдопа Ье!хчееп Йеш. !п сошрп!ег-япш1а!ед аггйс!а! пепга1 пе!гчог)ся а!допйпь аге ача!1- аЫе гог !еапппд Ьавед оп а 1еапппд хе! !Ла! ь ргезепгед !о йе аойччаге. 1п опг саде (Р!доге 11.2), йе пепга1 пе!хчог)с сопяяес1 оГ ап шрп! !ауег гчЫсЬ зачах ргекеп!ед гч!!Ь Йе шеаапгед !)погеасепсегп!епядек гог еасЬ оХ Йе геп ргоЬеь гьед !о де!ес! еасЬ роя!юп: Ьче хч!!Ь а сепгга1 ппс!ео!Ые оГ А, С, Сг, Т, ог де!е!юп оп йе аепае 5!гапд, апд йче и!Ь а сепсга! ппс!ео!Ые оГА, С, Сг, Т, ог де1едоп оп йе ап!!аепае а!гапд.
ТЬе оп!рпГ !ауег ь йеп гье11 го ргед!с! хчЬ!сЬ ппс!ео!Ые ь ргеаепс а! йе д!чеп роя!юп ш йе ТР53 депе. 1п Ье!гчееп йе !про! апд оп!рпг 1ауега ь а ЬпЫеп 1ауег чгЫсЬ регГоппа 11аса ргосеаяпд. ЯпсЬ а пепга1 пе!ччог1с сап йеп Ье !гашед Ьу ргедепдпд ехашр!ех пгагсЫпд !прп! алд оп!рп! — ТР53 депед ччЬеге йе аес)пепсе Ьаа Ьееп деСеглппед Ьу а!гегпадче гпеапя %Ьеп ггвпед, Ь сап ргед!с! йе пес)пепсе Ьадес! оп а сЫр. ТЫа шейод ь, Ьоогечег, аепядче !о !пЬопюдепеогь вашр1ед ччЬеге йе аег!пепсе !5 ашЬ!дпогь (%!)апап, е! а!., 2000), Ьесагье Ь ь а ппх!пге оГ !чао а11е1ея Ад ап ш!егекдпд аяде, ош пепга1 пе!ччог)с д!асочегед ап еггог ш йе 1аЬе1шд оГ шрп! дага дпппд ггашшд.
ТЬеге ччеге а Гечи роядопа ш йе радепг ша!епа! Йас йе пепга! пе!чиог1с соп1д по! 1еагп. С1окег шдресдоп рггнтнкн нюшка 1при! Ьауег аепье ь1гапг1 апг!кепке ьггапд А С О Т ' А С б Т ! НггЫеп Ьауег А С б Т Ои1риг Ьауег Яд. 11.2 г!епга! пегсгог!с. Ягогсп аге йе ппаа ш йе гпрпг !ауег, !г!гЫеп!ауег, апо оп!рог !ауег. АП ппгга гп опе !ауег аге соппесгег! алга аг!!пагаЫе апепдгаа го а!! ппгь ш йе аг!)асепг !ауег.
(р!апге Ьу Зерре яр!с!сег.) гечеа1ес$ (Ьа! й Ьас! с$егесгес$1споугп ягеа ог ро! ушогрЫкша гЬа! суе Ьад га!1ес) го! аЬе! соп ее!!у 1п гЬе гга!пшд с1ага (Бр(с)сег, е! а1., 2001). 11.2 ЕОВТНЕг! ВЕА0!Но АЬгепс!г, д. А., На1асЬпи, Я., СЬоуу, а. Т., %и, 1., На1асЬпп', Х., Уапд, Я. С., ЖеЬаде, д., )еп, 7., апг) дЫгапа!су, Р, (1999). КарЫ р53 вес!иепсе апа1уяа ш рйпигу !ипд сапсег ияпд ап о1гдопис!еогЫе ргоЬе аггау. Ргос.
Маг(. Асагс 5сг. стЯА 96:7382 — 7. Нас!а, а. О. (1999). Кекециепсшд апд пшгайопа! апа1уяа ияпд о!гдопис!еогЫе писгоаггауа (Кеу)ечг). Ага!. 6елег. 21(! Яирр1):42 — 7. Яргсдег, У. д., %йшап, Е, Ьи М. 1., Соп)оп-Сап)о С., Иго!ой, Т. Е, Вгипа1с, Я., апс1 КписЬеп, Я. (2001). Хеига! пегугог1с гга!пес! го ргес)!с! ТР53 депе вес)иепсе Ьааед оп р53. Мапиасг)р! аиЬш!!!ее!. Ж!)сшап, Е Р., Ьи, М. Ь., ТЬу!с!аег, Т., О1еаеп, Б. Н., Апс!егаеп, 1. Р., Согс)оп-Саге!о, С., апд Ишгой, Т. Е (2000).
Еуа1иайоп ог гЬе реггоппапсе о!" а р53 аециепс!пд ппсгоаггау сйр ияпд 140 ргечгоийу пес)иепсег) ЫагЫег Шшог аашр1ея С!гпп Огегп. 46:1555 — 61. $ОЬТ ЧГЯгГЕ гОН $ТАТт$ТГСА1. ЯГтЯоУ$т$99 таые 12. ! ехргеььтоп геат1тпзь ог Гопг зепех гп втх рапепц. Райеп! )Чг у1! Аг Вг Вг Оепе 90 110 190 210 290 310 190 210 390 410 590 610 90 110 110 90 120 80 200 100 400 90 600 200 З2.3.! Ехапгр1е: С!це!ег1п8 зз!ЗЬ С1це!Агау %е чт111 цзе а япа1! вшпг)агг) ехашр1е Гог с)агйу (ТаЫе 12.1). ТЫз сап Ье сопчеггег! 1пго гЬе !оппаг гес!ц)гег1 Ьу С!цвгАггау хч11Ь гЬе 1о1!очт)пк ачт)г зспрп аюк ККОГК(ргкпГГ"СспцМК.КЛККПВ1Г") 1 !!ог1т = 1;т ( тчг';т-~- -~) рггпгг" ее~а", зтт рггпгг" Ъа1п", зхтр)' ехаврге аехавргеск Ь!охч чте сап цзе С1цяАггау го ЫегагсЫса1!у с1цзгег кепез Ьаьег! оп чесгог апк1е Йвгапсе: сгитгягтау -г ехавргеск -и ехавргеск.вгх 1 -г ехавргеск.пев -сь г -са о -сц г -св г -со г ТЬе ьойчтаге Ьаз ргогЫсег! пчо 61ез: ехыпр1еСЕ.ппх сопгыпв гЬе г)1вгапсе шагпх апг! ехашр!еСЕ.печт соп1ашз а Хечг1с!г дезспрпоп оГ гЬе гевц!ппк Ггее.
Мов! Ггееч1ечтегь (РЬуйр'в дгачткгаш, ТгееЧ)ечг, его.) сап геаг! ЗЫз ГГЕЕ !ОППаг ацд Г)Гацт йГЕ ПЕЕ ГОГ уОц. ТЬЕ Гкзц11!ПК Г!Гацт1ПК 1В ЬЬОЧтц Ш Р)ацге 5.6. 12.4 ЗОРТУУАВЕ РОВ ЗТАТ!ЗТ1СА~ АМАЫ818 М1сговой Ехсе1 Ьаз зечега1 згайзйсз !цпс!1опз Ьцгй 1п, Ьш ап ечеп Ьепег сЬо1се 1в гЬе Егее, рцЫ1с-г!ошып К рас)гаке вЫсЬ сап Ье г!очтп1оаг!ед Гог !.)п)хЛ.пшх, Мас, апг1%1пг1охчз ьувгешь.е ТЫв вой1чаге сап Ье цзег1 !ог ггевг, А ггОЧА, рппс1ра1 сошропепг апа1уяз, с1цзгеппк, с1азяйсагюп, пецга1 пегчтог)гз, апг! пшсЬ гпоге.
12.4Л Ехатр!е: 8!аНейса1 Апа)уе)е зчИЬ В 1п Низ зесйоп чте чт111 цзе а япа11 вгапг)агг! ехыпр1е !ог с1ап!у (ТаЫе 12.2). ТЬеге аге Гоцг кепез, еасЬ шеавцгег! ш ях райепы, чгЫсЬ !а!1 шго гЬгее "Ппр:П» мвт-рто~ш.оть вогтммяи (ввоив я]чо пата рог]ьитв ТвЫе Г.в.х Ехргевв[оп говд[пав ог Еопг допев ]п в]х рваеппп Ра6еп[ Х2 А] А2 В[ В2 (3ЕПЕ 90 110 190 210 290 310 190 210 390 410 590 610 90 110 110 90 120 80 200 100 400 90 600 200 а Ь с (! Мех[ уоп Ьоог пр К (Ьу сурш8 йе 1епег К а[ йе ргогпрг) ап(1 геа(! ш йе 61е: датаг <- теай.таЬ1е("ехаар1е2") датаг[, 1] <- ав.спатастет(датаг[, 1]) Тх.4.
(Л ТЬеГ-геаг Неге !6 Ьо5ч уои 5чоп16 регГопп а Г-[ебг [о бее !Т8епеб (!!Кег 6!8п16сапг1у Ье[хчееп ра6епг са[е8огу А ап(! ра6еп[ са[е8огу В: 4 1оай 1гЬтату Еог Г-Гевт." 11Ьтату(стево) 4 Г-Гевт Еппст1оп: дет.рча1.стево <- Еипстгоп(датаг,гпдех1,1пдех2, датаЕ11тет=ах.пшпетгс)( Е <- Ешгстгоп(1) ( тетитп(т.тевт(дагаЕ11тет(датаг[1,1пдех1]), датаЕ11тет(датаг[1,1пдех2]))бр.на1ие) тетитп(варр1у(1:1епдтЬ(датаЕ[,1]),Е)) ) 4 са11 Еипсттоп ю1ЕЬ опт йата: рЧа1.стево <- дет.рчаг.ттевт(дасаЕ,4:5,6:7) 4 ртгпт тевп1тв оп всгееп (оп1у Еот а впе11 датавет 11хе тайв) ртгпт(сЬЕпд(датаг,рча1.гтевт)) Чг Ч2 ЧЗ Ч4 Ч5 Чб Ч7 рЧа1.стево 1 депе а 90 110 190 210 290 310 0.01941932 2 депе.Ь 190 210 390 410 590 610 0.00496281 3 депе с 90 110 110 90 120 80 1.00000000 4 депе.й 200 100 400 90 600 200 0.60590011 4 вогт оп Р-ча1ие апй ютгте то Е11е: огдетв <- отдет(рча1.стево) отдетед.йата <- сЬЕпд(датаг[отдетв,],рча1.тгевг[отдетв]) югтте(Г(ав.ааттгх(отдетед.дата)), псо1пвпв=.1епдтп(датаЕ)+1, са[е8опеб: поппа! (Х), 666еабе 6[а8е А, ап([ 666еабе 6[а8е В.
![](https://s.studizba.com/z.php?f=/templates/si/i/noavatar.png&w=100&h=100&t=1"){kind=avatar}
