Диссертация (1174210)

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла

Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждениевысшего образования«Красноярский государственный медицинский университетимени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого»Министерства здравоохранения Российской ФедерацииНа правах рукописиНаркевич Артём НиколаевичАВТОМАТИЗИРОВАННАЯ БАКТЕРИОСКОПИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКАТУБЕРКУЛЕЗА03.01.09 – Математическая биология, биоинформатикаДиссертация на соискание ученой степенидоктора медицинских наукНаучный консультант:доктор медицинских наук, профессорВиноградов Константин АнатольевичКрасноярск – 20192ОГЛАВЛЕНИЕВВЕДЕНИЕ ......................................................................................................................

5ГЛАВА 1 ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР.......................................................................... 131.1. Эпидемиологическая ситуация по туберкулезу и подходы к его выявлению вРоссийской Федерации .............................................................................................. 131.2. Применение компьютерных, математических технологий и анализ цифровыхизображений в медицине ........................................................................................... 181.3. Разработка системы автоматизированного анализа изображений ................ 231.3.1. Предобработка и сегментация цифровых изображений ...........................

241.3.2. Параметризация объектов на изображениях .............................................. 311.3.3. Распознавание объектов на изображениях ................................................. 351.3.4. Анализ изображений для выявления туберкулеза ..................................... 40ГЛАВА 2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ .......................................................................

472.1. Материалы исследования ................................................................................... 472.2. Методы исследования......................................................................................... 512.2.1. Этап 1 .............................................................................................................

512.2.2. Этап 2 ............................................................................................................. 592.2.3. Этап 3 ............................................................................................................. 632.3.4. Этап 4 ............................................................................................................. 68ГЛАВА3СЕГМЕНТАЦИЯИЗОБРАЖЕНИЙМОКРОТЫ,ЦИФРОВЫХОКРАШЕННОЙМИКРОСКОПИЧЕСКИХПОМЕТОДУЦИЛЯ-НИЛЬСЕНА ................................................................................................................... 713.1Применениесуществующихметодовдлясегментациицифровыхмикроскопических изображений мокроты, окрашенной по методу ЦиляНильсена...................................................................................................................... 713.2.

Разработка методов сегментации цифровых микроскопических изображениймокроты, окрашенной по методу Циля-Нильсена .................................................. 763.2.1. Модифицированный алгоритм пороговой бинаризации .......................... 7733.2.2. Алгоритм сегментации с использованием математической моделиискусственной нейронной сети .............................................................................

853.2.3. Алгоритм сегментации с использованием самоорганизующейся картыКохонена ................................................................................................................ 1023.2.4. Алгоритм сегментации с использованием вейвлет-преобразования .... 1093.3. Сравнение работы алгоритмов сегментации цифровых микроскопическихизображений мокроты, окрашенной по методу Циля-Нильсена ........................

121ГЛАВА4ИЗУЧЕНИЕПАРАМЕТРОВОБЪЕКТОВНАЦИФРОВЫХМИКРОСКОПИЧЕСКИХ ИЗОБРАЖЕНИЯХ МОКРОТЫ, ОКРАШЕННОЙ ПОМЕТОДУ ЦИЛЯ-НИЛЬСЕНА ................................................................................... 1254.1.Морфометрическаяицветоваяхарактеристикакислотоустойчивыхмикобактерий как объектов на цифровых изображениях мокроты, окрашенной пометоду Циля-Нильсена ............................................................................................ 1254.2.

Отбор признаков объектов для последующего использования при ихраспознавании........................................................................................................... 1364.3. Отбор признаков на основе их информативности ......................................... 1414.4. Сравнение методов отбора признаков для идентификации объектов нацифровых изображениях микроскопических препаратов ................................... 147ГЛАВА 5 РАЗРАБОТКА МАТЕМАТИЧЕСКИХ МОДЕЛЕЙ РАСПОЗНАВАНИЯОБЪЕКТОВ НА ЦИФРОВЫХ МИКРОСКОПИЧЕСКИХ ИЗОБРАЖЕНИЯХМОКРОТЫ, ОКРАШЕННОЙ ПО МЕТОДУ ЦИЛЯ-НИЛЬСЕНА ........................

1535.1. Использование логистической регрессии для классификации объектов нацифровых изображениях микроскопических препаратов мокроты, окрашеннойпо методу Циля-Нильсена ....................................................................................... 1535.2. Использование деревьев классификации для распознавания объектов нацифровых микроскопических изображениях мокроты, окрашенной по методуЦиля-Нильсена ......................................................................................................... 1575.3.

Использование искусственных нейронных сетей для распознавания объектовна цифровых микроскопических изображениях мокроты, окрашенной по методуЦиля-Нильсена .........................................................................................................

1604ГЛАВА 6 АВТОМАТИЗИРОВАННАЯ СИСТЕМА БАКТЕРИОСКОПИЧЕСКОЙДИАГНОСТИКИ ТУБЕРКУЛЕЗА ............................................................................ 1706.1. Схема работы и требования к аппаратной части программно-аппаратногокомплексаавтоматизированнойбактериоскопическойдиагностикитуберкулеза ............................................................................................................... 1706.2.Прототипаппаратнойчастипрограммно-аппаратногокомплексаавтоматизированной бактериоскопической диагностики туберкулеза .............. 1736.3. Схема работы и требования к программной части программно-аппаратногокомплекса бактериоскопической диагностики туберкулеза ............................... 1766.4.Прототиппрограммнойчастипрограммно-аппаратногокомплексаавтоматизированной бактериоскопической диагностики туберкулеза ..............

184ЗАКЛЮЧЕНИЕ ........................................................................................................... 197ВЫВОДЫ ..................................................................................................................... 208ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ..................................................................... 210СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ .............................. 212СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ...........................................................................................

214СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА ................................................. 256Приложение А ............................................................................................................. 267Приложение Б .............................................................................................................. 2725ВВЕДЕНИЕАктуальность темы исследования. Процесс диагностики большого числазаболеваний осуществляется с использованием микроскопической техники. Так,микроскопия применяется в диагностике онкологических, эндокринных иинфекционных заболеваний [81, 98, 203]. Одним из заболеваний, при диагностикекоторого также применяется микроскопическое исследование, является туберкулезлегких [92].

Бактериоскопическое исследование, на предмет наличия в мокротепациентов кислотоустойчивых микобактерий, является практически единственнымдоступным для общей лечебной сети методом выявления больных туберкулезомбактериовыделителей.Однако качество бактериоскопической диагностики туберкулеза в клиникодиагностических лабораториях общей лечебной сети остается не на должномуровне. Это связано, в первую очередь, с довольно длительной и рутиннойметодикойпросмотрамикроскопическихпрепаратов,согласнокоторойнеобходимо на одном препарате мокроты просмотреть от 20 до 300 полей зрения,при этом у каждого пациента с подозрением на туберкулез необходимо провестиданноеобследованиеукомплектованностьтрехкратнокадрами[92].Во-вторых,склинико-диагностическихтем,чтообщаялабораторийвучреждениях общей лечебной сети, по данным некоторых авторов, составляет 63%,а врачами-бактериологами – чуть более 50% [126].

Характеристики

Тип файла PDF

PDF-формат наиболее широко используется для просмотра любого типа файлов на любом устройстве. В него можно сохранить документ, таблицы, презентацию, текст, чертежи, вычисления, графики и всё остальное, что можно показать на экране любого устройства. Именно его лучше всего использовать для печати.

Например, если Вам нужно распечатать чертёж из автокада, Вы сохраните чертёж на флешку, но будет ли автокад в пункте печати? А если будет, то нужная версия с нужными библиотеками? Именно для этого и нужен формат PDF - в нём точно будет показано верно вне зависимости от того, в какой программе создали PDF-файл и есть ли нужная программа для его просмотра.

Список файлов диссертации