Диссертация (1145941), страница 24

Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 24)

Экспрессия генов MtKNOX1-10 на разных этапах развитияклубеньков.159Приложение 2. Выравнивание последовательностей генов IPT из уникальнойгруппы с большим сходством.160161162163164165Приложение 3. Экспрессия генов IPT на разных этапах развития клубенька.Изэтихгенов,экспрессияMedtr7g028880,Medtr7g707170,Medtr6g045287/Medtr6g045293 на 3-4 пороговых цикла (Ct) отличается от Ct дляводы.ЗначенияCtдляMedtr2g075100,Medtr3g020740,Medtr3g020760соответствуют значениям Ct для воды (отсутствие специфичной экспрессии).

Дляостальных генов MtIPT из “уникальной группы” – отсутствует сигналфлуоресценции при анализе ПЦР в реальном времени.Приложение 4. Экспрессия генов LOG на разных этапах развития клубенька.166Приложение 5. Динамика экспрессии KNOX3, LOG1/2 и IPT3/5 в ходе развитияклубеньков.167Приложение 6. Уменьшение экспрессии генов LOG_1g_60 (А), RR4 (Б) иLOG_7g_90 (В) на фоне интерференции РНК гена MtKNOX3 в трансгенныхкорнях (*** соответствует P value < 0.001).Приложение 7. Дот-Блот анализ сред после культивирования трансформантов P.pastoris содержащих полноразмерные последовательности KNOX3 и лизатовклеток.168Приложение 8.

Схематическое изображение структуры генов LOG2, IPT3 ирасположение в них предполагаемых сайтов-мишеней.169Приложение 9. EMSA с помощью последовательности из первого интрона генаLOG2 (А) и также с последовательностями в промоторе гена IPT3 (Б и В),содержащий мотив TGAC и гомеодомен KNOX3. 1. биотинилированный ДНК, 26. Биотинилированная ДНК вместе с разными концентрациями белка (KNOX3HD, 8, 4, 2, 1 и 0.5 µg), 7. биотинилированная ДНК вместе с 2 мкг белка и 2000xнемеченой ДНК (конкурент), см. материалы и методы.170Приложение 10.

Результаты EMSA (Б) и SPR (А) для отрицательного контроля,последовательность poly A-T.Приложение 11. Экспрессия генов IPT в листьях в ответ на инокуляцию урастений дикого типа. На рисунке представлены результаты двух биологическихповторностей (А и Б).171Приложение 12. Экспрессия генов KNOX в листьях в ответ на инокуляцию урастений дикого типа. На рисунке представлены результаты двух биологическихповторностей (А и Б).172Приложение 13. Экспрессия генов IPT в корнях суперклубенькообразующегомутанта sunn-3 (результат второй биологической повторности).173Приложение 14.

Экспрессия генов KNOX в корнях суперклубенькообразующегомутанта sunn-3 (результат второй биологической повторности).174Приложение 15. Последовательности праймеров, использованных для анализаэкспрессии генов.geneForward primerReverse primer5’-ATGCAGATC/TTTTGTGAAGAC-Ubi5’-ACCACCACGG/AAGACGGAG-3’3’MtACTIN5’-ACGAGCGTTTCAGATG-3’5’-ACCTCCGATCCAGACA-3’5’-5’-11*MtKNOX1EF128056**Medtr2g02439 ATTCATTCAATGGAGGGTAGTT-3’TTTTGAAAGCATGATAGAAGAGGT-03’5’-5’-MtKNOX2EF128057**Medtr1g01708 GAAGCGTTGACACTGGCACATC-TGGAAAATAGAAGCAACAGACACT03’-3’MtKNOX3EF1280585’-TGCACCAAACTCCCCTAAGAT-5’-TTCCTAAAACAAAAAGACTAA-3’**Medtr1g01296 3’05’-5’-MtKNOX4EF128059**Medtr5g01107 AGTGTACTGTAGACCCTCCAATG-ACCACACCTAATAATAACAACAGA-03’3’MtKNOX5EF1280605’-5’-TCGTTATCAAGCATGCCCT-3’**Medtr3g10640 GGTTCCCAATCCTCCGGTCAATG0G-3’MtKNOX6EF1280615’-**Medtr5g08586 CATGTGCAAGCCATTCCCTATG-3’5’-GAAAAATCAACCGTTATGCCCA3’0MtKNOX7XM_00361315’-5’-GGGTTTGTCTTGCTTCTTTTGGA-35AACTGCTTCTGATGATGGTGGTG-3’Medtr5g03372 3’0MtKNOX8XM_00359115’-CGCAACTCACCCTCTTTATCCA-733’5’-GCTTTCACGCCCTATTTCTTCA-3’Medtr1g084060MtKNOX9Medtr4g11654 5’-5’-CTCTCTGCCTGCTCGTCTTCA-3’1755TTATGTTCTTTTGCTGTGTGCCTTXM_0036095C-3’2MtKNOX1Medtr2g46124 5’-5’-CTCTGCTTGGTCATCTTCATCGT-003’TTGCTAATGCTAATGGTGTTGTGG-3’5’-CCGACAACACAGGAAACGAAA-Medtr1g11059MtIPT105’-TCGCCACCCTCTTCCCTTAC-3’3’5’-GTGTCGGGTGCTGTTGCTT-3’5’-GTAGCCATCGTCGCCTGTTC-3’Medtr4g11733MtIPT205’Medtr1g07254 TCCTCCAAATCACCAAACATAAAMtIPT30A-3’5’-CGCCCATCACCAACACTACA-3’5’-GCCACCGAAACGCACCTTA-3’5’-ATTCCCTGTCCCACCACCTC-3’Medtr2g02214MtIPT405’Medtr4g05511 AGATGACTCGACGGATGATTTGAMtIPT503’5’-AACTTTGCTGGGAAGAACACCA3’5’-MtIPT9Medtr2g07812 CAGTTGGTGGTAAAAGCAGGTGA5’-CCGAAAAGCAGAAGGAGGTGA-03’-3’5’-Medtr3g02676 CGTGTCTCTGCCTATTCTCTTTCC0Medtr2g0751005’-TCCTTTTGTGTTGTCTGCTCCA-3’A-3’5’GAGTGGATGAAATGGTTGAGGGT5’-GCATCATCAATGCCACTTTTCTT--3’3’5’-GAAGGGCTATTGGGGTTCCT-3’5’-CCTTGCTTGGCTTAATCACGC-3’Medtr7g028880Medtr7g4071705’CGCATCACATATTAGGCATCATCA-3’5’-TGAAATGGCTGGGTCCTCAA-3’5’-TGTTCGATTCCGCATCACTT-3’5’-CCTGCCTCTACCATTTCATCG-3’Medtr7g024250Medtr6g04528 5’-TGGTTGAGTCAGGGATGGTTG73’5’TTTGGTTTTTCTGATAGCTTCGGC-3’Medtr3g01159 5’-5’-TCGGATCTTCGAGAGTTGATTT1760GACGTGTCTTTGCCTATTCTATG-3’3’Medtr3g01982 5’-TGTCACCAATAAGGTGCAGGA0Medtr3g019900Medtr3g019980Medtr3g0201003’5’-GAGCCAAATAAAACAGCAATCG3’5’TCAATTCCACATCATATACTAGGC5’-CTGCCGCAACCATTTCAC-3’ATC-3’5’5’-TACAACGGGAACTGGGAAGA-CATTTTGAGTTATGAGGTCTAAAGC3’C-3’5’GAGGACCCAACTATTGCATTTCG3’5’-TCCGCACCAGGTACAAAGAA-3’Medtr3g02074 5’-CGTTGTTCAATTCCTCATCATC0Medtr3g0207603’5’-CCCCAACCATCTCATCAACTC-3’5’AAAAATTAGTTGACGACCCAGT3’5’-CTTTTGTGTTGTCTGCTCCA-3’5’Medtr7g02423 TTCAATTCCACATCCATTTTATTC0MtLOG15’-ACTCAAGCTCTGCCTCAACCA-3’AA-3’Medtr7g10129 5’0.15’-TGTCATCGCAACAACGGAAA-3’GGGGATATGGAACTCTGGAGGA3’MtLOG2MtLOG3Medtr1g06426 5’-5’-0.1TAACTGGTGAAACGGTGGGAGA-CCAACTCTTTTGATGTAGGTGCTGA3’-3’Medtr4g05874 5’-ATTGGTTTGATGGGGTTGGTTT- 5’-AGCTCTTTTGTTGATGGTGCAGA0.1MtLOG43’3’Medtr3g11371 5’-5’-GTTCTTCGAGGGTGCCATATCC-0.13’ACGCATCTGTGTTTATTGTGGTAGC-3’MtLOG5Medtr1g10524 5’-TCAACGCCTCTTTTCTCCATCA0.1MtLOG63’5’-CAGACCCACACTACCACCTCCA3’Medtr1g01583 5’-5’-0.1GGTGGAAGTGTTGGATTGATGG-AAGTTCTTTGGCTGATGAAGCTGA-3’3’177LOG_MedMedtr3g04154 5’-GGTTTCCATTTTTGCGTTGAGG-tr3g0415403’5’-TGACCTTTTCACAGTCCATTCGT3'0MtRR4*Medtr5g03648 5’-ATGCTTTTGTTCCGGGTTTA-3’5’-CTGCACCTTCCTCCAAACAT-3’0MtCLE12Medtr4g07963 5’-5’-0ACCTGGTGAAAGCCTATCTCCTG-3’CAACGTCTCTTGCATGAGTTAATGG-3’MtCLE13Medtr4g07961 5’-5’-***0CCGAAGCCTTCTACAGAAACACG-TCTTGGTGGTGATCTTCCATTATGC-3’3’Medtr2g09112 5’-GCAAGCTCGTACTCTCCAACC53’Medtr2g09112 5’05’-TGTTGATTTGCATCCTCGTG-3’5’-GGGTCAGGCCCTTGAGGACTA-3’CCATTGAGAGCAACAAAGAGAACATC-3’Medtr2g43780 5’05’-CCTGTTTGAGATGGGGTTTGG-3’GCCAAGAAGAGGAGCAACGAG-3’Medtr2g01544 5’-CGTTGGTGTTGGTGTTGGTGT55’-CAATGGTGCCTTGGATCTGG-3’3’Medtr4g08785 5’-5’-CGTTTTCCACCTTCTTCTTCTGG-03’GACACGACATCTGAACCCAACA3’*Последовательности праймеров MtActin11 и MtRR4 были взяты из GonzalezRizzo et al., 2006** Последовательности праймеров MtKNOX1-6 были взяты из Giacomo et al., 2008*** Последовательности праймеров MtCLE13 были взяты из Mortier et al., 2014178.

Характеристики

Список файлов диссертации