Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1145465), страница 66

Файл №1145465 Диссертация (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 66 страницаДиссертация (1145465) страница 662019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 66)

Этиизменения достаточно хорошо согласуется с результатами оптимизации структуры этихмолекул, которые предсказывают увеличение данных углов, соответственно, на 3.9° и 5.0°.Следует отметить, что небольшое завышение экспериментальных изменений этих торсионныхуглов по сравнению с расчетными данными (∆θ14α-15α = 1.8°, ∆θ14α-15α = 2.6°) может объяснятьсяневысокой точностью измерения вицинальных констант3J14α-15α и3J14α-15β, которыеопределялись из мультиплетной структуры сигнала протона 14α, имеющего дополнительноеуширение линий из-за дальних скалярных взаимодействий с протонами 7, 11α и 11β.Поскольку, согласно этим же расчетам, увеличение торсионных углов θ14α-15α и θ14α-15βодновременно должно приводить к небольшому уменьшению расстояния между протонами15β и протоном 7, а расстояние между протонами 15α и 7 в рассматриваемых стероидах приэтом сохраняется практически неизменным (r7-15α(36a) =2.411 Å, r7-15α(37a) =2.416 Å) исоставляет ~2.41 Å, то конформационное различие эквиленинов (36а) и (37а) может бытьпроверено также с помощью измерения относительных интегральных интенсивностей кросспиков 7/15α и 7/15β в их спектрах NOESY.На рисунке 4-41 показаны соответствующие фрагменты этих спектров и приведенырезультаты объемного интегрирования.

Они свидетельствуют о небольшом, но достаточнохорошо регистрируемом (погрешность измерения Sij/Sjj меньше 2%) различии в соотношениирасстояний r7-15α/r7-15β для сравниваемых стероидов: для эквиленина (36а) отношениеобъемных интегралов составляет S7-15α/S7-15β = 1 : 0.53 = 1.88 ± 0.07, а для эквиленина (37а) онооказывается заметно меньше: S7-15α/S7-15β = 1 : 0.63 = 1.59 ± 0.05. Следовательно,308экспериментальные данные находятся в качественном соответствии с результатами расчетов исвидетельствуют об уменьшении расстоянии r7-15β в стероиде (37а).Рис.

4-41. Фрагменты спектров NOESY (τm = 0.5 с) эквиленинов 1) – (36а) и 2) – (37а),содержащие кросс-пики 7/15α и 7/15β. Пределы их объемного интегрирования обозначеныовальными контурами, а цифрами (снизу) указаны значения их относительныхинтенсивностей. На фрагментах этих эквиленинов (слева) приведены расчетные (ММ+)значения межпротонных расстояний r7-15α и r7-15β.Для перехода на количественный уровень сравнения конформаций эквиленинов (36а) и(37а) в качестве эталонного было использовано расстояние r7-15α.Тогда в приближенииизотропной модели расчета в эквиленине (36а) расстояние r7-15β(36a) = (2.68 ± 0.02) Å, а вэквиленине (37а) – r7-15β(37a) = (2.61 ± 0.02) Å.

Сравнение полученных значений с расчетнымиданными (ММ+: r7-15β(36a) = 2.641 Å,r7-15β(37a) = 2.613 Å) свидетельствует о том, чтоэкспериментальное различие межпротонных расстояний в рассматриваемых стероидахоказывается несколько больше (~0.07 Å), чем предсказывают расчеты (0.028 Å).

Это в своюочередь согласуется с полученными выше результатами по оценке торсионных углов θ14α-15α иθ14α-15β, для которых также наблюдалось некоторое превышение экспериментальныхизменений этих геометрических параметров над соответствующими расчетными значениями.Таким образом, полученные данные дают основание для утверждения, что в стероидах (36а) и(37а) действительные конформационные различия в области кольца D более существенны,чем предсказывают результаты расчетного метода ММ+. 309Аналогичным образом было показано, что в 14α-аналогах эквиленинов (36а) и (37а)пространственное строение в области кольца С является практически одинаковым идостаточно хорошо соответствует результатам расчетных методов. Об этом, прежде всего,свидетельствуют одинаковый для всех этих стероидов набор скалярных констант междупротонами этанового фрагмента С11Н2-С12Н2 и одинаковое соотношение интенсивностейкросс-пиков 1/11α и 1/11β в спектрах NOESY.В эквиленинах (36) и (37) протоны 11β, 12α и 14α занимают псевдоаксиальнуюориентацию в кольце С, которое может быть охарактеризовано как “псевдокресло”.

Такаяконформация кольца С подтверждается, прежде всего, наличием пространственныхвзаимодействий в β-области этих молекул: 13-Ме/11β и 13-Ме/12β, и в их α-области: 12α/14α,а в случае стероидов (37) в α-области, кроме того, наблюдаются взаимодействия 12α/17α и14α/17α. В таблице 4-4 приведено сопоставление экспериментальных и расчетных значенийвицинальных констант 3JН-Н и торсионных углов θН-Н в кольце С эквиленина (37а).Таблица 4-4.Экспериментальные и расчетные (MM+, РМ3) скалярные константы 3JН-Н (Гц) и торсионныеуглы θ (град.) для эквиленина (37а).3 (расч.) *)θ(расч)J.3 (эксп.)(эксп.)*)№Нi-НjJθPM3MM+PM3MM+111α-12α7.7330.4321.7323.09.17.4211α-12β1.285.978.472.30.30.6311β-12α11.3215.4206.1205.09.311.1411β-12β7.6331.0322.8322.69.27.6*) – получено с использованием уравнения /2/, [91, β-эффект] .Эти данные свидетельствуют о лỳчшем соответствии экспериментальных величин 3J(эксп.)и θ(эксп.) результатам их расчета методом ММ+, чем методом РМ3.Это означает, что вэквиленине (37а) конформация этанового фрагмента С11Н2-С12Н2 в растворе является менее“заслоненной”, чем это предсказывают расчеты полуэмпирическим методом PM3.На рисунке 4-42а приведена ньюменовская проекция этого фрагмента, соответствующаярасчетам полуэмпирическим методом РМ3, и показан один из торсионных углов - θ`11β-12β (θ`= 360° - θ), который оказывается на 8.4° меньше, чем его экспериментальное значение θ`(эксп.)= 37.4°, полностью совпадающее с результатами расчетов методом молекулярной механикиММ+: θ`(ММ+) = 37.2°.310Рис.

4-42. а) – Ньюменовская проекция относительно связи С11-С12 и б) – межпротонныерасстояния r1-11α и r1-11β в эквиленине (37a).Дополнительнымподтверждениемобнаруженногонебольшогонесоответствияэкспериментальной и расчетной (РМ3) конформации кольца С служит аналогичноесопоставление данных по оценке соотношения межпротонных расстояний r1-11α и r1-11β.Согласно расчетам методом РМ3 конформации, например, эквиленина (37a), эти расстояниясоставляют, соответственно, 2.25 Å и 2.28 Å (Рис.

4-42б), что свидетельствует о почтиодинаковом расположении метиленовых протонов при атоме С11 по отношению кароматическому протону 1. При этом расчетное отношение расстояний (r1-11β/r1-11α)(РМ3) =1.013, которое должно приводить в спектре NOESY к соотношению интегральныхинтенсивностей (S1-11β/S1-11α)(РМ3) = 0.924. Однако, экспериментальное значение этогосоотношения оказывается значительно меньше и составляет 0.64, что свидетельствует о том,что действительное различие (∆r) между расстояниями r1-11α и r1-11β составляет не 0.03 Å, какэто предсказывает метод РМ3, а должно быть значительно больше: ~ 0.17 Å. Этой величинезначительно лучше соответствует расчетные данные, которые получены методом ММ+: r1-11α =2.25 Å, r1-11β = 2.34 Å, Δr = 0.09 Å.

Следовательно, сравнение межпротонных расстояний r1-11α иr1-11β, также как и сопоставление торсионных углов между вицинальными протонами в кольцеС, свидетельствует о менее “заслоненной” конформации этанового фрагмента С11Н2-С12Н2,чем это предсказывает метод РМ3.Дляэквиленина(37г),нарядусрассмотреннымивышеконформационнымиособенностями пространственного строения колец С и D, было сделано заключение опреимущественной ориентации пропильной группы при атоме С13. На рисунке 4-43априведены фрагменты спектра NOESY данного стероида, на которых указаны наиболеехарактерные пространственные взаимодействия протоновпропильного фрагмента -С18Н2-С18аН2-С18bН3, между собой и с ближайшими β-протонами колец С и D.

Из анализа этихвзаимодействий видно, что в наиболее выгодной конформации эквиленина (37г) протон 18`находится над кольцом D (см. кросс-пики 18`/15β и 18`/16β, которые из-за совпадения311сигналов протонов 15β и 16β перекрываются друг с другом), а протон 18`` располагается надкольцом С и имеет прямые диполь-дипольные взаимодействия с протоном 11β. В своюочередь протон 18а` оказывается пространственно сближенным с метильными протонами 17βацетоксигруппы, а протон 18а`` − с протонами 12β и 11β.Рис. 4-43.а) – Фрагменты спектра NOESY (τm = 0.5 c) эквиленина (37г) и б) – егопространственная структура, на которой стрелками указаны обнаруженные ЯЭО.Следует отметить, что для приведенной на рисунке 4-43б конформации эквиленина (37г)характерно также наличие пространственных взаимодействий протонов метильной группыС18bН3 как с соседними метиленовыми протонами С18аН2, так и с метиленовыми протонамиС18Н2, которые наблюдаются в виде соответствующих кросс-пиков в спектре NOESY.Учитывая все указанные пространственные взаимодействия, а также наличие в этом жеспектре кросс-пиков между вицинальными протонами 18`/18a` и 18``/18a``, можноутверждать, что в пропильной группе при атоме С13 стероида (37г) отсутствует свободноевращение вокруг простых связей С13-С18 и С18-С18а, а преимущественная пространственнаяориентация этого алкильного заместителя в растворе полностью соответствует результатамполуэмпирических расчетов конформации этой молекулы, которая показана на рисунке 4-43б.312Аналогичный вывод можно также сделать как на основании различия значенийвицинальных констант между протонами в этановом фрагменте С18Н2-С18аН2: 3J18`-18a` ≈ 3J18``18a``(~ 4.2 Гц) << 3J18`-18a`` ≈ 3J18``-18a` (~12.2 Гц), так и на основании сравнительно большихзначений дальних скалярных взаимодействий: 4J18`-12α = 1.2 Гц и4J18``-17α = 1.4 Гц.

В случаесвободного вращения вокруг простых связей С13-С18 и С18-С18а указанные вицинальныеконстанты из-за их усреднения должны были бы быть равными и соответствовать среднему ихзначению (~7.5 Гц), а дальние скалярные константы 4J18`-12α и4J18``-17α по той же причинедолжны были бы быть значительно меньше и составлять около (0.7 – 0.8) Гц.Как уже отмечалось выше, идентификация сигналов в ароматической области спектровЯМР13С эквиленинов в отдельных случаях достаточно сложна и идентификация сигналовчетвертичных атомов углерода с помощью метода COLOC (или HMBC) не всегда даетоднозначный результат. Причиной этого, может быть медленная продольная релаксация такихмагнитных ядер и/или недостаточно высокое цифровое разрешение двумерного спектра.Поэтому в работе в качестве альтернативного использовался одномерный корреляционныйметод INEPT-INADEQUATE, основанный на последовательном (“релейном”) переносеполяризации через скалярные константы 1JC-H и 1JC-C.

В результате такого эксперимента,сигналы четвертичных атомов углерода, находящихся в молекуле изучаемого эквиленинарядом с протонированными углеродными атомами, регистрируются в виде в противофазногодублета, образованного за счет их скалярного взаимодействия (1JC-C) с соседнимипротонированными атомами углерода. Поскольку величина скалярной константы 1JC-C всильной степени зависит от гибридизации взаимодействующих ядер углерода [362], а числососедних протонированных атомов различно, то это дает дополнительную возможность дляидентификации сигналов атомов С5, С8, С9 и С10, даже в случае незначительного различия иххимических сдвигов.На рисунке 4-44 показан пример использования релейного метода INEPT-INADEQUATEдля идентификации сигналов атомов C8, С9 и С5 в спектре ЯМР13С эквиленина (37б), вкотором различие химических сдвигов атомов С9 и 5С составляет всего 0.24 м.д.

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
Почему делать на заказ в разы дороже, чем купить готовую учебную работу на СтудИзбе? Наши учебные работы продаются каждый год, тогда как большинство заказов выполняются с нуля. Найдите подходящий учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6439
Авторов
на СтудИзбе
306
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее