Главная » Просмотр файлов » Диссертация

Диссертация (1145465), страница 19

Файл №1145465 Диссертация (Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР) 19 страницаДиссертация (1145465) страница 192019-06-29СтудИзба
Просмтор этого файла доступен только зарегистрированным пользователям. Но у нас супер быстрая регистрация: достаточно только электронной почты!

Текст из файла (страница 19)

Указанные различия в пространственном строениистероидов (4a) и (4в) были также подтверждены результатами оценок межпротонныхрасстояний r1-11α и r1-9α (Рис. 2-29). Использование для этой цели экспериментальных оценокрасстояний r7α-15α и r7α-15β, как это было сделано при сравнении пространственного строениястероидов (3a) и (3б), в данном случае оказывается невозможным из-за сложности объемногоинтегрированиясоответствующихкросс-пиков,обусловленнойсильносвязанностьюгеминальных протонов 15α и 15β в спектре ЯМР 1Н стероида (4в). На рисунке 2-29а приведенспектр NOESY (τm= 0.5 c) стероида (4в), молекула которого показана на рисунке 2-29в.

Дажена качественном уровне, хорошо видно, что кросс-пики 1/9α и 1/11αимеют различнуюинтенсивность: S1-9α < S1-11α. В то же время для стероида (4a) их интенсивности (Рис. 2-29б)сопоставимы между собой: S1-9α ≈ S1-11α. На рисунке 2-29г приведены графики зависимостей отвремени смешивания τm отношений объемных интегралов Sij/Sii кросс- (Sij) и диагонального(Sii) пиков для пространственных взаимодействий 1/9α и 1/11α в стероиде (4в), которые были86получены в результате проведения 8-ми экспериментов NOESY с временами смешивания τm =0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.5, 0.6, 0.7 и 0.8 с.

При этом сумма релаксационной задержки D1, временивыборки данных AQ и времени смешивания τm сохранялась постоянной - 2.2 с. Это позволилос высокой точностью определить значения соответствующих скоростей кросс-релаксации: σ19α= (42 ± 3)10-3 с-1 и σ1-11α = (80 ± 4)10-3 с-1, и оценить величину отношения расстояний r1-9α /r1-11α =(σ1-11α /σ1-9α )1/6 = 1.113 ± 0.025.

Это же отношение, полученное на основании оптимизациигеометрии молекулы (4в) методом РМ3, составляет 1.112. Таким образом, наблюдаетсяхорошее совпадение экспериментальных и расчетных данных, которое находится в пределахпогрешности измерений.Рис. 2-29. Фрагменты спектров NOESY (τm = 0.6 c) стероидов (4в) – (а) и (4a) – (б). в) пространственная структура молекулы (4в), на которой стрелками указаны межпротонныевзаимодействия, использованные для количественных оценок соответствующих расстояний.г) – определение скоростей кросс-релаксации σ1-9α и σ1-11α с помощью зависимости Sij/Sjj отвремени смешивания τm.87Для того, чтобы перейти к абсолютным значениям межпротонных расстояний в качествеэталонного было выбрано расстояние между протонами 1 и 2, которое по данным метода РМ3в стероиде (4в) составляет 2.48 Å.

Экспериментальное значение скорости кросс-релаксации σ12,полученное аналогичным (как и для σ1-9α и σ1-11α) графическим способом, составляет (61 ±2)10-3 с-1. Тогда можно вычислить, что r1-9α = 2.48(61/42)1/6 = (2.64 ± 0.05) Å, а r1-11α =2.48(61/80)1/6 = (2.37 ± 0.03) Å. Полученные абсолютные значения расстояний r1-9α и r1-11α вданном случае в пределах погрешности измерений совпадают с их расчетными (PM3)значениями, которые, соответственно, равны r1-9α(PM3) = 2.61 Å и r1-11α(PM3) = 2.35 Å.Для стероида (4в) аналогичным образом были получены экспериментальные оценки ещепяти других расстояний.

При этом в спектре NOESY (Рис. 2-29а) для интегрирования быливыбраны лишь отдельно расположенные неперекрывающиеся кросс-пики. Результаты этихоценок для стероида (4в), а также для двух других стероидов (4a) и (4б), вычисленные врезультатеобработкиданных,соответственно,10-тии4-хспектровNOESY,зарегистрированных при различных временах смешивания приведены в таблице П2-7 (см.приложение П2) На рисунке 2-30 для трех 17аβ-ацетокси-6-окса-D-гомо-8α-аналоговстероидных эстрогенов (4a), (4б) и (4в) приведены 7 видов корреляционных зависимостеймежпротонных расстояний, полученных на основе различных экспериментальных (ЯМР, РСА,РСА+) и расчетных (РМ3, MM+) методов.

Они позволяют сделать оценку точности данныхЯМР по сравнению с другими методами. В качестве критерия использовался коэффициенткорреляции (r) и среднеквадратичное отклонение (sd). Количество расстояний, измеренныхметодом ЯМР, для каждого из стероидов различно (от 8 до 13, всего 31) и для их определенияиспользовался калибровочный метод (rэт. = r1-2 = 2.48 Å) и анизотропная модель расчета.В первых 4-х корреляциях (см.

на рисунке 2-30 графики 1-4) данные ЯМРпоследовательно сравниваются с результатами методов РМ3 (1) и MM+ (2) и с данными РСА,которые приводятся в двух вариантах: без дополнительной оптимизации геометрии молекулыпосле определения координат ее углеродного скелета (РСА, график 3) и с дополнительнойоптимизацией методом ММ+ при фиксированных координатах углеродного скелета (РСА+,график 4). Нужно отметить, что при сравнении данных ЯМР с расчетными методами РМ3 иММ+ погрешности всех измерений не превышают ±5% измеряемой величины, а параметр sdнаходится в пределах от 0.053 до 0.034 Å.

При сравнении данных ЯМР с результатами РСА(см. 3 на рис. 2-30) обнаружено, что для стероидов (4б) и (4в) за пределы погрешности ±5%выходят, соответственно, 5 и 3 измерения. Однако, после дополнительной оптимизациигеометрии указанных молекул методом ММ+ корреляция расстояний r(ЯМР)↔r(PCA+) для всехстероидов значительно улучшается: sd – уменьшается, r – возрастает (см.

4 на рис. 2-30).88Рис. 2-30. Корреляционные зависимости экспериментальных и расчетных данных (Табл. П2-7)по оценке межпротонных расстояний в стероидах (4a) – (4в). 1 – ЯМР ↔ РМ3, 2 – ЯМР ↔ММ+, 3 – ЯМР ↔ РСА, 4 – ЯМР ↔ РСА+, 5 – ММ+ ↔ РМ3, 6 – ММ+ ↔ РСА, 7 – ММ+ ↔РСА+. Для корреляций 1 – 4 использовались данные ЯМР, полученные при использованиисоответствующего калибровочного расстояния r1-2.89Впоследних3-хкорреляцияхрезультатыоценокмежпротонныхрасстояний,полученные методом ММ+, сравниваются с данными РМ3, РСА и РСА+. Эти корреляциисвидетельствуют о том, что их точность сопоставима между собой и лежит в тех же пределах,что и данные ЯМР.

Также как и при сравнении с данными ЯМР, наблюдается улучшениехарактеристик корреляций между данными ММ+ и РСА после дополнительной оптимизациипоследних с помощью метода ММ+ при фиксированной геометрии углеродного скелета.Учитывая, что среднеквадратичное отклонение ни в одной из корреляционныхзависимостей не выходит за пределы ±0.1 Å можно считать, что при измерениях расстоянийдо 3.0 Å точность оценок их величин с помощью ЯМР и анизотропной модели расчета нехуже±0.1 Å.Это не превышает ±5% погрешности измеряемой величина, котораяпунктирными линиями показана на корреляционных графиках рисунка 2-30. Таким образом,полученные результаты свидетельствуют о хорошем (в пределах ±5%) совпаденииэкспериментальных ЯМР-данных в растворе, с данными других методов.

Это позволяетутверждать, что пространственное строение изученных 17аβ-ацетокси-6-окса-D-гомо-8αаналогов стероидных эстрогенов (4) в жидкости является “жестким” и в пределахпогрешности измерений совпадает с их молекулярной структурой в кристалле.Поскольку идентификацию сигналов протонированных ядер13С стероидов (3) и (4)удобнее всего проводить на основе результатов отнесений сигналов в соответствующихспектрах ЯМР 1Н (Табл. П2-5 в приложении П2), то эта процедура чаще всего сводилась кпоиску кросс-пиков Нi/Ciв одном из двумерных гетероядерных13С-1Н корреляционныхспектров, использующих перенос когерентности через прямую константу 1JC-Н. Чаще всего, вкачестве таковых использовались спектры c инверсной регистрацией: HSQC с развязкой и/илибез развязки от ядер углерода. Поскольку эти разновидности гетероядерных спектров имеютнизкую разрешающую способность по оси F1(13C), проводилась раздельная регистрацияароматической и алифатической областей этих спектров.

Это, как правило, оказывалосьдостаточным, чтобы дифференцировать сигналы углеродных ядер, разность химическихсдвигов между которыми превышала 1 м.д. В случае невыполнения этого условияиспользовалось дополнительное сокращение спектральной ширины регистрируемого участкауглеродного спектра (до 20-25 м.д.). При этом не попавшие в этот интервал сигналыпоявлялись в виде отраженных кросс-пиков, что практически не осложняло процедуру ихидентификации, но разрешающая способность по F1 становилась почти в 2 раза лучше.Именно такой прием был использован для точной идентификации в области 24.0 – 27.5 м.д.пар сигналов атомов С11, С17 и С15, С16 в спектре ЯМР 13С стероида (4в), разница химическихсдвигов между которыми составляла всего 0.1 и 0.13 м.д., соответственно (Рис.

Характеристики

Список файлов диссертации

Пространственное строение и внутримолекулярная динамика модифицированных аналогов стероидных гормонов на основе данных спектроскопии ЯМР
Свежие статьи
Популярно сейчас
Как Вы думаете, сколько людей до Вас делали точно такое же задание? 99% студентов выполняют точно такие же задания, как и их предшественники год назад. Найдите нужный учебный материал на СтудИзбе!
Ответы на популярные вопросы
Да! Наши авторы собирают и выкладывают те работы, которые сдаются в Вашем учебном заведении ежегодно и уже проверены преподавателями.
Да! У нас любой человек может выложить любую учебную работу и зарабатывать на её продажах! Но каждый учебный материал публикуется только после тщательной проверки администрацией.
Вернём деньги! А если быть более точными, то автору даётся немного времени на исправление, а если не исправит или выйдет время, то вернём деньги в полном объёме!
Да! На равне с готовыми студенческими работами у нас продаются услуги. Цены на услуги видны сразу, то есть Вам нужно только указать параметры и сразу можно оплачивать.
Отзывы студентов
Ставлю 10/10
Все нравится, очень удобный сайт, помогает в учебе. Кроме этого, можно заработать самому, выставляя готовые учебные материалы на продажу здесь. Рейтинги и отзывы на преподавателей очень помогают сориентироваться в начале нового семестра. Спасибо за такую функцию. Ставлю максимальную оценку.
Лучшая платформа для успешной сдачи сессии
Познакомился со СтудИзбой благодаря своему другу, очень нравится интерфейс, количество доступных файлов, цена, в общем, все прекрасно. Даже сам продаю какие-то свои работы.
Студизба ван лав ❤
Очень офигенный сайт для студентов. Много полезных учебных материалов. Пользуюсь студизбой с октября 2021 года. Серьёзных нареканий нет. Хотелось бы, что бы ввели подписочную модель и сделали материалы дешевле 300 рублей в рамках подписки бесплатными.
Отличный сайт
Лично меня всё устраивает - и покупка, и продажа; и цены, и возможность предпросмотра куска файла, и обилие бесплатных файлов (в подборках по авторам, читай, ВУЗам и факультетам). Есть определённые баги, но всё решаемо, да и администраторы реагируют в течение суток.
Маленький отзыв о большом помощнике!
Студизба спасает в те моменты, когда сроки горят, а работ накопилось достаточно. Довольно удобный сайт с простой навигацией и огромным количеством материалов.
Студ. Изба как крупнейший сборник работ для студентов
Тут дофига бывает всего полезного. Печально, что бывают предметы по которым даже одного бесплатного решения нет, но это скорее вопрос к студентам. В остальном всё здорово.
Спасательный островок
Если уже не успеваешь разобраться или застрял на каком-то задание поможет тебе быстро и недорого решить твою проблему.
Всё и так отлично
Всё очень удобно. Особенно круто, что есть система бонусов и можно выводить остатки денег. Очень много качественных бесплатных файлов.
Отзыв о системе "Студизба"
Отличная платформа для распространения работ, востребованных студентами. Хорошо налаженная и качественная работа сайта, огромная база заданий и аудитория.
Отличный помощник
Отличный сайт с кучей полезных файлов, позволяющий найти много методичек / учебников / отзывов о вузах и преподователях.
Отлично помогает студентам в любой момент для решения трудных и незамедлительных задач
Хотелось бы больше конкретной информации о преподавателях. А так в принципе хороший сайт, всегда им пользуюсь и ни разу не было желания прекратить. Хороший сайт для помощи студентам, удобный и приятный интерфейс. Из недостатков можно выделить только отсутствия небольшого количества файлов.
Спасибо за шикарный сайт
Великолепный сайт на котором студент за не большие деньги может найти помощь с дз, проектами курсовыми, лабораторными, а также узнать отзывы на преподавателей и бесплатно скачать пособия.
Популярные преподаватели
Добавляйте материалы
и зарабатывайте!
Продажи идут автоматически
6392
Авторов
на СтудИзбе
307
Средний доход
с одного платного файла
Обучение Подробнее